Heatmap: Cluster_86 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
26.15 7.01 25.03
121.7 80.67 104.04
Ehy_g00286 (CAM6)
204.94 108.09 196.31
8.61 1.31 6.03
34.11 6.36 20.83
Ehy_g00471 (ARA4)
24.65 10.18 21.18
10.07 1.0 7.79
8.47 3.3 6.12
Ehy_g00732 (GOS12)
48.2 32.7 44.07
7.71 1.05 5.14
Ehy_g01123 (PDI8)
22.81 15.99 21.55
Ehy_g01151 (GMD2)
34.66 15.77 33.26
Ehy_g01207 (EXL5)
22.02 2.52 17.35
3.48 0.53 2.37
13.44 6.92 13.48
Ehy_g01863 (ARF3)
87.41 55.09 80.21
120.49 35.55 96.43
Ehy_g02057 (RABA1f)
39.04 22.04 37.24
40.42 13.2 34.99
19.09 11.28 15.9
5.02 1.76 4.08
Ehy_g02301 (UGE2)
9.17 1.62 8.67
9.5 2.62 8.07
Ehy_g02330 (AAC3)
125.97 74.95 111.63
14.92 2.54 11.91
Ehy_g02695 (MEKK1)
7.97 3.39 6.51
Ehy_g03096 (CAM6)
20.72 7.85 20.32
144.2 70.65 130.36
32.78 12.07 25.35
64.2 26.61 57.32
Ehy_g03508 (UPS1)
5.98 1.66 3.69
Ehy_g03634 (P44)
49.24 31.2 44.95
Ehy_g03692 (AGT2)
23.5 3.12 19.82
Ehy_g03796 (BRIZ2)
6.46 4.23 6.23
7.48 4.27 6.74
15.39 4.6 10.39
228.74 76.88 209.67
Ehy_g04201 (ELF5A-3)
15.57 6.81 12.59
118.58 69.0 104.41
59.72 8.29 50.34
Ehy_g04322 (ATMP2)
105.67 74.91 94.73
Ehy_g04357 (MCA1)
28.73 14.12 26.52
183.84 36.92 143.81
7.85 2.47 7.25
9.77 1.77 7.46
4.87 0.13 2.51
108.26 4.2 60.91
Ehy_g05486 (SWEET4)
5.79 0.34 3.35
196.13 122.29 164.2
6.49 0.74 3.12
31.34 17.78 30.81
Ehy_g05729 (GSR 1)
393.11 96.81 301.69
Ehy_g05844 (EDA39)
41.05 19.64 35.09
Ehy_g05849 (Deg1)
1.92 0.89 1.82
23.08 12.17 23.07
27.68 20.57 26.92
Ehy_g05929 (PFK3)
16.33 3.97 12.74
Ehy_g06073 (SHI)
8.41 0.7 6.13
Ehy_g06095 (RHM1)
36.74 9.59 34.3
13.95 1.78 8.14
52.64 28.71 50.85
58.49 14.71 51.63
69.59 22.57 65.89
62.55 27.12 45.95
52.18 5.01 55.24
Ehy_g06596 (UCU2)
5.65 3.07 5.94
57.91 27.48 57.54
2.46 0.04 1.27
2.86 0.46 2.36
Ehy_g06698 (SYP32)
28.2 12.08 19.95
Ehy_g06758 (GAE2)
27.6 9.75 23.15
45.79 5.06 38.51
Ehy_g07413 (JAZ1)
37.23 11.01 39.01
10.91 1.58 5.4
14.63 8.28 13.6
Ehy_g07593 (CPY)
59.07 34.35 55.53
22.69 3.65 20.75
Ehy_g08157 (UBC10)
449.0 235.88 375.2
Ehy_g08225 (CCR1)
10.62 3.19 10.26
4.35 0.52 4.0
5.83 1.5 5.14
Ehy_g09172 (KUP10)
11.45 5.04 9.55
Ehy_g09235 (RBOHF)
17.08 3.64 13.5
14.76 5.31 10.54
19.42 11.83 14.02
43.81 19.64 40.12
Ehy_g09577 (MSL10)
7.27 0.43 4.83
33.67 14.34 30.17
Ehy_g09666 (MSL5)
3.9 0.54 2.59
Ehy_g09710 (ALIS1)
51.98 33.27 49.57
Ehy_g09758 (EHD1)
5.06 0.9 4.27
10.51 2.24 6.62
27.01 11.89 29.19
44.92 6.82 31.68
123.41 43.99 134.92
137.08 71.99 110.43
15.35 10.95 15.84
10.14 0.47 5.29
Ehy_g11623 (DDE1)
123.45 40.03 95.46
2.1 0.0 1.05
Ehy_g12150 (UNE10)
22.83 8.86 14.69
Ehy_g12467 (CYP77A4)
9.9 0.52 5.61
Ehy_g12660 (RABA1e)
3.12 0.24 1.6
2.12 0.29 1.36
5.39 1.1 2.97
13.64 3.7 8.49
Ehy_g13907 (UNE5)
53.31 25.34 47.42
10.33 1.12 8.41
Ehy_g14157 (TGA2)
4.15 0.21 2.79
7.38 0.83 4.54
4.55 1.3 3.28
Ehy_g14581 (MYB61)
2.86 0.19 2.59
9.47 2.49 8.23
2.71 0.91 2.56
Ehy_g15458 (GK-2)
3.91 0.55 2.46
5.45 2.7 5.34
133.73 64.1 113.53
6.36 0.0 2.26
72.97 34.45 60.1
Ehy_g16625 (PAP16)
22.13 4.56 14.53
4.21 0.69 3.89
3.69 0.54 2.67
2.75 1.5 2.22
3.19 1.82 2.55
Ehy_g17962 (GAPCP-1)
4.91 0.53 5.26
3.38 0.28 1.8
5.09 2.49 5.28
Ehy_g18887 (NFD3)
213.49 91.15 203.92
Ehy_g19071 (ACT7)
211.15 91.58 191.92
6.56 2.61 5.39
Ehy_g19110 (HAT14)
29.77 20.13 25.66
10.94 0.79 5.92
18.06 7.78 12.36
16.77 10.6 14.88
23.36 10.44 20.08
4.96 0.0 3.4
6.3 1.82 4.63
14.79 8.11 13.58
88.28 44.18 77.78
79.7 12.25 55.27
142.35 72.63 118.73
18.29 3.87 17.14
7.17 1.77 5.83
5.85 3.9 5.49
56.78 33.47 56.47
Ehy_g21905 (GRF12)
43.18 19.67 38.69
2.45 0.84 1.61
303.59 106.05 245.23
7.34 2.31 7.68
21.28 5.3 12.82
13.25 6.73 12.46
7.78 4.79 6.96
8.76 0.39 6.54
10.17 2.98 7.86
2.56 1.48 2.2
Ehy_g26687 (ORP1C)
3.82 1.4 3.89
2.54 1.08 2.23
Ehy_g27114 (WRKY48)
7.34 2.91 6.44
25.09 6.19 21.27
3.55 0.24 1.63
2.4 0.25 1.68
Ehy_g29095 (GSTL3)
6.89 0.0 4.82
Ehy_g29517 (DET3)
52.66 23.74 46.82
Ehy_g29706 (MSL10)
3.39 0.48 2.36
Ehy_g29779 (CCoAOMT1)
19.39 7.86 18.54
Ehy_g29886 (NQR)
15.75 5.97 11.36
9.13 2.1 7.34
3.83 1.29 2.89
5.51 1.49 4.01
Ehy_g31420 (SHI)
3.47 0.09 2.11
7.09 2.43 4.95
Ehy_g31753 (ATERDJ2A)
2.11 0.49 1.73
43.65 25.1 41.11

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)