1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_24 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
Ehy_g00560 (PSAO)
 899.84 2090.24 1.4
Ehy_g00597 (PSAH-1)
 1366.02 3014.1 9.11
Ehy_g00811 (PSBY)
 372.95 923.52 1.83
16.56 32.06 1.84
Ehy_g01051 (GC1)
 18.06 34.01 5.4
12.29 31.67 0.78
Ehy_g01084 (PGLP1)
 94.05 199.71 13.77
Ehy_g01091 (HEME2)
 30.75 69.13 4.32
Ehy_g01124 (PSBD)
 65.07 141.46 2.2
72.21 188.67 3.87
373.71 754.92 65.63
16.11 25.35 7.86
7.96 15.88 3.43
Ehy_g01652 (PTAC2)
 5.53 10.64 2.33
73.5 157.56 3.5
Ehy_g02100 (YLMG2)
 23.27 51.32 7.08
Ehy_g02142 (PSAF)
 727.84 1775.75 18.16
Ehy_g02315 (HEMC)
 37.31 86.22 7.51
13.71 35.62 2.66
27.84 54.46 6.85
Ehy_g02496 (HEME1)
 15.35 33.86 2.54
Ehy_g02865 (PSBC)
 56.85 124.26 2.24
31.12 66.29 7.6
23.5 48.98 7.8
54.55 121.19 0.62
Ehy_g03348 (LHCB4.1)
 509.64 1210.97 68.61
34.68 70.39 9.76
13.68 36.01 2.43
16.65 35.05 2.0
36.0 95.54 0.63
20.31 38.21 2.51
Ehy_g04752 (NARA5)
 11.94 24.7 1.73
52.54 140.29 0.86
Ehy_g04933 (FTSH1)
 33.87 76.97 8.46
Ehy_g05072 (CHX20)
 3.39 9.12 0.0
101.45 282.6 0.0
Ehy_g05348 (CSD2)
 225.8 515.71 25.9
16.79 39.39 2.08
108.3 215.45 35.52
Ehy_g06408 (HCF164)
 30.65 53.39 15.22
38.03 80.96 1.54
Ehy_g06483 (GPX7)
 23.42 54.83 0.25
Ehy_g06719 (E37)
 85.21 165.97 22.51
5.54 14.07 0.0
Ehy_g06997 (EMB2750)
 9.72 25.4 0.0
Ehy_g07374 (APE1)
 66.17 130.2 9.68
16.96 36.9 3.38
Ehy_g08308 (HDR)
 133.06 328.62 34.79
Ehy_g08364 (DXR)
 46.02 82.06 16.27
Ehy_g08379 (PSY)
 56.36 109.65 14.83
Ehy_g08533 (PGI)
 44.72 115.22 4.51
Ehy_g08589 (SIGB)
 7.81 17.55 0.0
Ehy_g08592 (CR88)
 48.79 98.62 10.3
Ehy_g09089 (PFK7)
 5.83 12.54 0.77
Ehy_g09628 (RPL15)
 93.84 196.9 13.89
Ehy_g10030 (CCH)
 26.38 75.04 0.18
16.74 26.35 12.27
8.66 18.22 1.41
27.58 73.03 0.99
Ehy_g10478 (YCF37)
 65.18 135.73 16.68
12.34 24.12 4.1
29.75 63.35 5.41
8.88 19.85 2.34
Ehy_g10925 (PIMT2)
 17.52 31.03 7.86
74.43 151.87 35.66
25.29 60.45 1.71
Ehy_g11249 (TAPX)
 34.69 71.49 8.33
Ehy_g11259 (PSBY)
 42.46 98.24 6.93
85.74 162.72 46.85
6.2 11.86 2.23
11.17 22.92 1.78
Ehy_g13273 (MINE1)
 20.82 33.02 8.59
Ehy_g13670 (PMSR3)
 125.55 233.76 47.32
11.08 24.86 1.41
2.7 6.25 0.0
Ehy_g14008 (OVA2)
 7.33 16.12 2.1
48.97 84.5 25.48
Ehy_g15147 (PSBQ)
 920.26 2166.83 45.31
Ehy_g15282 (LPA3)
 11.25 23.42 3.15
4.53 9.88 0.58
6.72 16.66 0.83
Ehy_g17235 (ZIFL1)
 5.35 9.31 1.13
60.37 117.87 13.03
9.29 24.33 1.41
Ehy_g19209 (RRF)
 52.37 102.73 10.48
9.34 19.75 2.89
7.2 14.41 2.21
Ehy_g20514 (NDF1)
 15.81 32.01 3.55
Ehy_g20807 (AK-HSDH)
 5.55 11.77 0.57
Ehy_g20973 (CAB4)
 144.01 334.66 0.84
Ehy_g21274 (CCD1)
 5.18 12.33 0.02
Ehy_g21883 (LHCA1)
 510.23 1143.08 12.61
Ehy_g21933 (OE23)
 744.83 1661.5 19.14
16.45 38.55 3.77
Ehy_g22404 (PSBR)
 521.68 1115.99 9.22
Ehy_g22516 (PSAN)
 419.37 1036.2 2.24
192.78 300.33 109.44
33.04 51.83 21.81
Ehy_g23195 (CP24)
 144.43 310.23 18.06
Ehy_g23323 (HCF164)
 18.97 46.51 1.6
Ehy_g23441 (PSBX)
 262.39 652.19 0.3
Ehy_g23566 (LHCA3)
 1091.45 2613.36 1.42
Ehy_g24419 (PSAK)
 408.87 909.69 1.24
1415.12 3236.3 10.99
Ehy_g25803 (PSAD-2)
 403.95 1015.46 8.73
Ehy_g28732 (NSI)
 6.5 13.87 2.59
15.87 31.77 4.97
24.79 45.8 12.69
8.8 14.17 4.89
Ehy_g31950 (NOL)
 8.61 14.78 3.18

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)