1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_78 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
0.09 -0.86 0.47
0.23 -0.24 -0.03
0.08 -0.17 0.08
0.09 -0.4 0.24
0.49 -0.68 -0.04
0.2 -0.24 0.01
0.08 -0.04 -0.04
0.15 -0.24 0.06
Ehy_g02273 (EXL7)
 0.06 -0.01 -0.06
Ehy_g02408 (SBH1)
 0.28 -0.48 0.09
0.2 -0.22 -0.02
Ehy_g03486 (NUDX19)
 0.12 -0.25 0.1
Ehy_g03606 (SRK2I)
 0.03 -0.19 0.14
Ehy_g04269 (UBC8)
 0.1 -0.24 0.11
0.02 -0.13 0.1
0.08 -0.34 0.21
0.14 -0.22 0.06
0.59 -1.57 0.21
0.12 -0.06 -0.07
0.09 -0.03 -0.07
0.14 -0.07 -0.08
Ehy_g05996 (RIN2)
 0.06 -0.13 0.07
Ehy_g06026 (BZO2H3)
 -0.0 -0.15 0.13
0.41 -0.67 0.06
0.12 -0.04 -0.08
0.09 -0.19 0.08
0.18 -0.15 -0.05
0.1 -0.05 -0.06
0.26 -0.31 -0.01
0.13 -0.21 0.06
0.73 -1.94 0.11
0.24 -0.31 0.02
0.11 -0.24 0.1
Ehy_g07945 (ATG18H)
 0.09 -0.05 -0.05
Ehy_g08142 (ASK1)
 0.15 -0.31 0.12
Ehy_g08257 (MYB54)
 0.51 -1.28 0.22
Ehy_g08271 (CDC2)
 0.1 -0.0 -0.11
Ehy_g08433 (CK1)
 0.08 -0.1 0.02
Ehy_g08504 (SK13)
 0.27 -0.25 -0.07
0.11 -0.31 0.16
0.19 -1.25 0.52
0.25 -1.53 0.55
Ehy_g09595 (ASNAP)
 0.3 -0.25 -0.1
Ehy_g09651 (VTI13)
 0.18 -0.14 -0.06
-0.21 -1.23 0.78
0.01 -0.06 0.05
0.36 -0.74 0.16
0.18 -0.5 0.22
0.61 -1.34 0.11
0.24 -0.67 0.25
0.58 -1.85 0.29
0.19 -0.35 0.1
0.34 -0.85 0.24
0.18 -0.9 0.41
0.05 -0.41 0.28
0.13 -0.46 0.24
0.57 -2.13 0.36
0.14 -0.17 0.02
0.42 -0.78 0.11
0.42 -1.05 0.23
0.17 -0.21 0.01
0.1 -0.44 0.25
0.47 -0.75 0.03
0.17 -0.28 0.07
0.31 -0.48 0.06
0.32 -0.63 0.15
0.07 -0.17 0.09
0.6 -1.76 0.25
0.03 -0.26 0.19
Ehy_g16176 (SRK2B)
 0.17 -0.43 0.18
0.28 -0.47 0.09
0.23 -0.16 -0.1
0.34 -0.77 0.2
0.41 -1.0 0.22
Ehy_g17901 (VAMP712)
 0.18 -0.21 -0.0
0.13 -0.08 -0.06
1.02 - -0.05
0.11 -0.05 -0.07
0.05 -0.09 0.03
0.23 -0.27 -0.0
0.16 -0.25 0.06
0.67 -2.74 0.33
0.14 -0.43 0.21
0.5 -0.8 0.02
Ehy_g20030 (PYM)
 -0.05 -0.18 0.2
0.05 -0.16 0.1
0.01 0.01 -0.02
0.23 -0.78 0.32
0.16 -0.01 -0.18
0.19 -0.34 0.1
Ehy_g21448 (TOPP4)
 0.09 -0.17 0.06
0.17 -0.1 -0.09
0.24 -0.35 0.05
0.09 -0.06 -0.04
0.16 -0.49 0.23
0.27 -0.39 0.05
0.64 -0.74 -0.24
0.18 -0.43 0.17
-0.12 -0.5 0.46
Ehy_g23168 (SYP52)
 0.22 -0.37 0.09
0.54 -0.81 -0.04
0.03 -0.23 0.18
0.36 -1.2 0.36
0.2 -0.2 -0.02
Ehy_g24311 (ATG18H)
 0.07 -0.04 -0.03
0.35 -1.01 0.3
0.43 -0.76 0.1
0.04 -0.07 0.03
0.36 -0.43 -0.05
0.12 -0.12 -0.01
0.36 -0.63 0.1
0.03 -0.05 0.02
0.3 -0.86 0.29
0.37 -0.9 0.22
0.18 -0.08 -0.12
0.24 -0.09 -0.18
0.03 -0.05 0.02
0.27 -0.49 0.11
0.16 -0.59 0.29
0.68 -1.07 -0.12
0.24 -0.41 0.1
0.35 -0.86 0.23
0.44 -0.88 0.14
0.32 -0.46 0.04
0.25 -0.73 0.27
0.08 -0.39 0.24
0.14 -0.22 0.06
0.18 -0.36 0.12
0.17 -0.55 0.25
0.09 -0.14 0.04
0.11 -0.33 0.17
0.26 -0.28 -0.03
0.28 -0.6 0.17
0.4 -0.6 0.03
0.31 -0.5 0.08
0.19 -0.21 -0.01
0.31 -0.15 -0.21
0.27 -0.42 0.07
0.66 -1.9 0.21
0.21 -0.43 0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.