Heatmap: Cluster_37 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
-0.38 0.39 -0.12
-0.47 0.26 0.12
-0.13 0.1 0.02
-0.32 0.33 -0.09
-0.19 0.31 -0.18
-1.1 -0.13 0.7
Ehy_g01299 (CAO)
-0.4 0.31 0.0
-1.17 0.24 0.46
Ehy_g01985 (ZFP7)
-1.16 0.15 0.52
-0.5 0.26 0.13
-0.43 0.25 0.09
-0.4 0.24 0.09
-0.48 0.3 0.07
Ehy_g02559 (HPD)
-0.42 0.13 0.21
-0.72 0.3 0.22
Ehy_g02674 (EDA9)
-0.36 0.2 0.1
-0.25 0.19 0.03
Ehy_g02799 (PAT1)
-0.44 0.17 0.19
-0.2 0.1 0.08
-0.22 0.2 -0.01
-0.75 0.46 0.04
-0.2 0.04 0.13
Ehy_g03672 (NFS1)
-0.45 0.18 0.19
-0.45 0.26 0.1
Ehy_g04761 (HDH)
-0.5 0.36 0.01
-0.13 0.09 0.03
-0.18 0.05 0.11
-1.32 0.69 -0.02
Ehy_g06031 (CSK)
-0.46 0.22 0.15
-0.17 0.15 -0.0
Ehy_g06100 (MGP)
-0.31 0.15 0.12
Ehy_g06402 (UBC10)
-0.45 0.33 0.02
-0.46 0.04 0.32
-0.42 0.24 0.1
-0.19 0.03 0.15
-0.33 0.03 0.24
Ehy_g07342 (CYCP3;2)
-0.22 0.09 0.11
Ehy_g07379 (ZHD2)
-0.39 -0.0 0.31
Ehy_g07516 (ZFP3)
-1.02 0.46 0.17
-0.57 0.06 0.36
Ehy_g07700 (ERF1-3)
-0.7 0.3 0.21
Ehy_g08123 (ARF1A1C)
-0.09 0.09 -0.0
-0.51 0.09 0.3
Ehy_g08639 (POLGAMMA2)
-0.37 0.24 0.06
-0.49 0.24 0.14
-0.15 0.13 0.01
-0.78 0.52 -0.02
-0.16 -0.05 0.19
-0.55 0.23 0.19
-0.29 0.11 0.14
Ehy_g09702 (ASE1)
-0.59 0.39 0.04
-1.6 0.53 0.29
Ehy_g10829 (THO3)
-0.39 0.26 0.05
-1.06 -0.15 0.7
-0.56 0.02 0.39
-0.82 0.77 -0.46
-0.15 -0.02 0.16
Ehy_g12684 (CAC3)
-0.22 0.17 0.03
-0.58 0.57 -0.24
-0.33 -0.11 0.35
Ehy_g13356 (UGT85A7)
-0.39 0.31 -0.0
-0.47 0.14 0.23
Ehy_g13493 (PRR2)
-0.44 0.34 0.0
-0.43 0.2 0.14
Ehy_g14240 (AMT2)
-0.67 0.33 0.16
-0.22 0.2 -0.0
Ehy_g14267 (AAP3)
-0.42 0.3 0.03
-0.39 0.32 -0.01
-0.24 0.03 0.18
-0.31 0.1 0.16
-0.5 0.26 0.13
-1.67 0.72 0.05
-0.56 0.17 0.26
-0.51 -0.04 0.4
-0.14 -0.0 0.13
Ehy_g15885 (cpHsc70-1)
-0.3 0.18 0.08
Ehy_g16369 (NCBP)
-0.48 0.1 0.27
-0.8 -0.25 0.66
Ehy_g17119 (BAM1)
-0.64 0.24 0.24
-0.18 0.02 0.14
Ehy_g17470 (DCR)
-0.91 0.32 0.29
-1.05 0.38 0.28
-0.55 0.21 0.21
-0.95 -0.02 0.58
Ehy_g18395 (CYP76C1)
-0.33 -0.12 0.36
Ehy_g18540 (HB-3)
-0.99 0.44 0.19
-0.54 0.13 0.28
-0.25 0.0 0.21
-0.48 0.26 0.12
-0.24 0.18 0.03
-0.78 0.42 0.11
-0.5 0.18 0.21
-3.1 0.52 0.53
-1.3 0.67 0.0
Ehy_g20511 (emb1513)
-0.68 0.41 0.07
-0.49 0.28 0.1
-0.3 0.08 0.18
-0.57 0.53 -0.19
Ehy_g20583 (NFD3)
-0.74 0.26 0.26
-1.24 0.65 0.01
-0.62 0.31 0.15
Ehy_g21080 (AL2)
-0.19 0.16 0.02
-1.24 0.61 0.07
-0.28 0.22 0.02
-0.59 0.28 0.17
-0.88 0.56 -0.02
Ehy_g21465 (CRK25)
-0.46 0.26 0.1
-1.06 -0.15 0.69
Ehy_g21750 (CRR22)
-0.39 0.15 0.17
-0.73 0.08 0.42
-0.76 -0.24 0.64
-0.23 0.06 0.15
-1.58 0.14 0.64
-0.44 -0.05 0.37
-3.14 0.89 0.04
-0.18 0.07 0.09
-1.42 0.17 0.58
Ehy_g23576 (ACR3)
-0.44 0.08 0.27
-0.4 0.23 0.1
Ehy_g23617 (G2484-1)
-0.28 0.06 0.18
-0.93 0.44 0.16
-0.53 0.27 0.14
-0.47 0.21 0.16
-0.24 -0.02 0.22
Ehy_g24805 (NAC2)
-0.25 0.33 -0.15
Ehy_g24952 (ACT7)
-16.7 0.47 0.69
-0.38 0.24 0.08
Ehy_g25325 (CRK2)
-0.17 0.15 0.0
Ehy_g25456 (RBCS1A)
-1.6 0.05 0.71
-0.34 0.18 0.11
-1.13 0.2 0.48
-0.61 0.24 0.21
-1.47 0.04 0.68
-1.12 -0.02 0.64
-0.32 0.16 0.11
Ehy_g26370 (CRR22)
-0.5 0.32 0.06
-1.21 -0.02 0.66
Ehy_g27229 (RLK4)
-0.77 0.11 0.41
- -0.22 1.1
Ehy_g28084 (WTF1)
-0.73 0.25 0.27
-0.54 0.6 -0.33
Ehy_g28618 (SDP1)
-0.33 0.36 -0.12
-0.41 0.11 0.23
-0.58 -0.31 0.61
-0.61 0.18 0.28
Ehy_g30136 (CYP72A8)
-1.54 0.46 0.36
-0.38 0.0 0.29
-0.08 -0.06 0.13
-0.56 0.4 0.01
-0.21 0.06 0.12
Ehy_g30936 (WRKY4)
-1.17 0.63 0.01
-0.77 0.36 0.17
-1.2 -0.44 0.87
Ehy_g31913 (CRK15)
-0.8 -0.19 0.63

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.