Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
56.3 34.95 84.48
Ehy_g01517 (RSH2)
5.41 2.32 7.67
16.82 5.86 18.09
8.57 3.13 13.81
11.34 5.94 13.46
Ehy_g02214 (CXE20)
7.37 4.8 10.57
Ehy_g02354 (RABA1f)
49.81 40.48 59.89
9.79 6.02 16.77
Ehy_g02687 (WRKY74)
7.84 0.82 11.3
17.3 13.67 22.48
24.27 15.65 34.79
Ehy_g03396 (PUX4)
44.44 38.26 56.63
22.62 8.58 40.16
5.51 4.34 7.46
Ehy_g03799 (PDC2)
23.82 14.71 36.41
16.51 11.83 19.17
4.28 2.95 5.45
38.55 32.3 48.25
23.75 16.22 35.58
2.88 0.76 5.42
60.51 44.58 81.25
Ehy_g04352 (RTE1)
33.16 23.51 41.66
9.77 8.04 11.91
Ehy_g04842 (ACK2)
14.57 10.42 18.3
4.39 2.61 5.04
Ehy_g05115 (GLT1)
12.19 2.68 19.43
46.45 28.03 69.0
Ehy_g05798 (HAP15)
36.59 27.36 42.6
Ehy_g05820 (CIPK3)
7.75 2.44 10.15
3.62 2.09 5.38
Ehy_g05862 (PPD2)
12.0 7.17 22.55
6.61 4.29 9.4
Ehy_g06058 (XEG113)
2.17 1.15 3.22
Ehy_g06065 (AR1)
38.48 31.36 45.16
Ehy_g06174 (SFC)
15.85 10.11 20.34
10.18 6.08 11.82
32.51 24.43 38.91
21.02 16.4 29.03
5.48 1.6 7.56
60.25 38.88 89.37
16.51 13.82 20.98
3.0 0.07 6.66
Ehy_g07603 (SRK2B)
56.39 30.23 94.7
4.26 3.23 4.83
11.2 7.19 12.92
21.48 14.3 30.75
Ehy_g07900 (BLH1)
11.5 4.87 16.63
Ehy_g07901 (EXO70A1)
2.46 0.76 3.97
2.63 1.23 3.62
10.69 9.48 12.92
Ehy_g08518 (WOL)
5.18 2.4 7.94
Ehy_g08549 (SERK1)
11.77 5.33 18.45
13.55 10.59 17.49
Ehy_g08671 (TPL)
12.48 8.46 17.2
2.24 0.77 2.88
Ehy_g08691 (ARF6)
15.43 9.67 22.05
38.74 21.02 58.18
Ehy_g08863 (CUM1)
23.58 19.03 24.66
Ehy_g09014 (NPSN12)
7.58 4.83 8.53
Ehy_g09260 (YDA)
4.95 3.3 6.37
3.54 0.42 7.59
4.82 1.22 9.46
10.67 7.71 12.47
10.33 7.62 13.57
Ehy_g09860 (SK13)
21.98 13.16 25.77
6.68 1.6 10.67
4.54 3.43 6.39
30.48 22.63 37.77
Ehy_g11706 (BAT1)
17.36 9.8 24.11
Ehy_g12365 (ORP4B)
6.98 2.04 11.64
Ehy_g12650 (ILP1)
3.31 2.57 4.16
Ehy_g12752 (SYR1)
3.39 0.78 5.74
Ehy_g13017 (NBS1)
3.56 2.65 4.64
5.39 1.21 8.57
Ehy_g14712 (SNP33)
10.44 5.63 11.53
4.79 4.03 6.15
Ehy_g15699 (PBRP)
3.11 2.34 4.16
Ehy_g16244 (XLG3)
2.02 1.13 2.56
Ehy_g16372 (ML5)
11.15 8.72 12.87
Ehy_g16652 (MRH1)
2.1 1.15 3.19
Ehy_g17146 (CSI1)
29.31 16.95 41.73
117.3 64.57 171.48
Ehy_g17505 (delta-ADR)
4.62 2.74 6.71
7.66 4.63 10.44
7.95 5.15 10.54
2.81 1.2 4.07
Ehy_g18440 (LKS1)
6.72 1.68 7.93
Ehy_g18445 (ROPGEF7)
2.3 0.38 4.9
4.4 2.58 6.91
30.74 13.01 43.52
Ehy_g19685 (RXF12)
2.95 0.08 5.63
Ehy_g19828 (PHO1;H1)
1.92 0.7 2.72
23.88 15.82 30.38
35.91 27.5 42.16
9.42 7.83 11.21
Ehy_g21359 (WOL)
7.38 3.69 9.98
63.51 41.25 81.02
Ehy_g22273 (ATG2)
6.88 5.0 8.46
8.53 6.7 13.26
110.79 85.86 135.4
8.69 3.23 10.57
13.05 9.0 15.84
3.04 1.39 3.43
Ehy_g24795 (HMA2)
9.57 2.14 16.44
1.4 0.74 2.39
Ehy_g25094 (PUM1)
15.03 12.83 19.62
26.53 11.59 44.02
23.8 9.06 39.29
Ehy_g26253 (VFB4)
30.6 23.68 37.59
41.74 32.75 56.55
5.61 2.25 6.47
3.64 1.86 5.45
Ehy_g27446 (SFC)
2.44 1.74 3.2
6.05 2.56 9.18
2.45 1.36 3.67
34.55 27.75 43.17
11.27 7.68 16.16
80.53 12.63 106.27
6.91 3.51 8.65
27.51 13.07 35.42
6.75 0.79 8.38
62.7 44.33 84.07
1.53 0.64 2.68
39.48 25.6 46.72
9.97 7.11 10.7
12.82 8.52 17.8

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)