Heatmap: Cluster_44 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Rhizome
Root
1.53 9.73 12.27 24.18 5.68 24.91 22.78
18.72 41.26 63.86 75.31 51.41 103.05 58.69
Dde_g01248 (CAM3)
219.22 460.7 442.44 597.76 304.73 683.53 510.21
26.35 105.63 108.63 155.25 71.51 150.46 160.05
Dde_g01598 (CPK13)
8.32 27.48 41.7 47.27 21.03 55.4 39.47
Dde_g01658 (ECT6)
30.79 52.0 61.4 75.42 56.15 62.01 50.36
Dde_g02225 (ERO1)
8.04 30.18 32.67 38.64 23.93 43.48 46.33
Dde_g02332 (MRH1)
6.66 10.61 11.49 12.76 12.12 12.5 11.23
8.31 12.09 13.38 16.37 12.24 15.08 16.53
4.99 14.5 16.2 23.61 13.56 30.93 25.91
7.43 8.02 9.19 11.37 6.56 10.83 10.28
7.64 10.44 9.23 10.69 8.47 11.35 12.13
48.2 80.44 98.03 126.49 68.5 126.86 128.75
23.53 34.96 167.18 145.79 79.03 209.42 155.04
3.85 10.09 24.15 31.11 15.88 30.59 28.49
9.51 19.88 22.63 27.27 22.81 22.71 17.76
10.93 14.31 15.71 20.09 12.76 23.25 13.82
4.16 10.13 14.06 15.77 12.9 13.82 9.66
4.78 10.82 15.97 17.4 11.72 22.18 13.46
Dde_g08347 (RLI2)
55.34 78.17 89.85 112.84 75.96 93.98 97.09
4.29 5.8 5.9 7.65 6.14 8.65 9.03
5.36 9.75 11.15 14.02 10.37 19.44 16.47
Dde_g09389 (AL7)
47.36 70.93 69.45 75.49 67.96 88.27 85.11
3.74 14.07 21.53 32.67 14.1 40.9 26.93
Dde_g10959 (RIN4)
5.97 9.78 19.37 21.64 11.34 21.41 33.1
Dde_g11066 (PAT1)
6.93 9.3 46.44 42.95 22.93 68.51 46.85
Dde_g11281 (CSLD2)
2.48 13.76 16.03 28.26 4.65 16.79 13.19
0.53 8.88 16.03 22.68 10.76 37.76 25.65
113.87 176.78 235.81 345.18 117.95 275.55 194.65
21.52 40.82 44.86 60.24 32.56 45.05 43.12
Dde_g11890 (SRO2)
9.03 22.25 19.94 26.05 12.93 33.33 30.06
16.94 24.95 29.22 38.38 20.89 26.15 32.72
7.4 29.69 29.61 47.71 26.58 50.9 54.03
2.71 14.62 13.42 20.89 12.09 24.19 24.35
5.13 37.31 42.63 74.37 16.1 54.34 61.54
Dde_g12116 (CAN)
11.13 38.73 38.73 45.21 32.27 58.02 69.66
3.43 7.44 7.1 8.29 5.65 9.96 9.59
Dde_g12885 (ECT8)
25.85 49.9 42.77 61.86 32.05 53.41 103.88
5.08 13.91 15.3 20.65 14.95 22.21 21.15
4.84 25.16 27.44 33.2 18.73 26.53 24.97
3.98 4.96 5.91 6.39 5.36 7.13 6.44
8.48 16.62 21.56 22.27 15.92 31.09 29.75
2.47 10.03 9.59 18.8 8.72 13.52 29.58
2.65 6.83 14.13 14.25 6.96 18.97 11.11
0.0 16.2 15.66 30.22 6.87 21.19 20.97
2.74 19.16 13.34 28.45 6.89 28.3 16.7
9.25 40.93 32.92 51.04 21.86 45.59 44.91
Dde_g16608 (SNP33)
12.36 38.87 37.16 46.71 25.42 55.42 54.94
Dde_g16942 (CSTF64)
8.61 10.97 11.98 13.54 8.03 16.73 10.84
24.25 41.6 30.5 47.71 27.74 56.84 50.72
2.3 5.36 3.86 8.7 5.01 9.09 12.96
1.77 4.86 9.45 13.33 6.34 10.59 24.16
8.32 20.28 30.17 32.25 25.73 24.53 19.25
1.08 1.78 2.53 4.86 1.04 4.24 3.87
0.35 1.53 1.97 2.18 0.96 2.95 1.85
7.45 18.76 29.4 35.9 21.08 52.14 30.42
3.17 10.96 13.91 14.41 13.21 12.56 10.28
1.86 10.24 13.69 20.05 10.01 24.17 19.97
17.36 24.16 25.46 27.85 22.23 32.63 35.04
4.45 24.85 20.45 33.85 12.96 49.57 28.94
0.36 4.73 9.04 6.67 3.42 9.7 5.62
4.93 7.82 7.86 9.55 5.85 9.17 8.21
1.59 2.08 1.51 5.15 0.97 3.65 2.32
Dde_g22698 (ROW1)
4.52 10.14 9.6 12.28 6.62 14.96 10.66
0.0 1.05 5.86 5.39 1.66 7.85 2.79
Dde_g22849 (sks5)
0.02 1.65 7.28 6.38 1.69 11.24 6.79
Dde_g23046 (URED)
0.91 5.67 9.05 10.86 7.28 11.32 12.57
26.58 73.92 60.32 76.85 29.26 110.48 77.81
Dde_g24363 (NAC071)
0.3 4.87 5.44 9.4 4.08 9.6 13.44
Dde_g25086 (NHX2)
10.04 12.42 8.4 15.26 7.03 16.26 13.88
Dde_g25321 (CPK17)
21.11 32.38 30.16 37.63 22.79 32.88 37.67
0.29 4.16 14.99 14.16 6.84 17.88 8.43
0.27 14.14 12.99 23.55 3.82 25.91 16.94
1.35 3.72 5.45 8.17 4.21 8.21 12.81
0.0 1.08 0.92 3.1 0.12 4.62 3.14
2.76 7.47 10.6 11.93 10.28 11.49 13.81
0.34 1.26 1.9 2.27 1.73 2.88 1.78
4.22 8.59 11.66 20.9 11.69 14.82 16.92
0.0 1.7 2.2 2.81 1.09 3.29 3.46
6.07 29.0 29.8 28.0 15.79 27.83 28.07
8.2 22.91 26.72 41.56 20.03 41.26 33.0
12.18 14.55 14.12 16.77 13.18 21.85 17.96
3.17 7.93 10.2 10.35 7.07 9.41 19.03
6.86 11.09 10.21 13.46 8.42 12.53 8.81
3.07 5.6 5.11 8.15 4.08 8.55 15.41
10.04 17.38 22.8 24.33 15.66 22.18 36.31
0.91 1.9 4.2 5.17 1.3 7.17 4.9
0.36 1.62 2.59 3.28 1.33 3.94 2.16
2.24 9.32 12.15 11.7 6.77 11.5 30.35
1.07 4.98 7.2 7.86 5.79 8.47 6.74
13.16 16.31 23.57 23.37 19.58 22.67 41.78
0.52 2.78 2.12 3.46 1.61 2.49 3.63
8.33 38.83 44.4 53.19 24.97 45.53 41.54
3.29 5.27 14.08 15.54 8.16 16.35 14.66
12.86 30.57 31.73 38.33 28.11 33.35 45.72
16.51 43.98 43.24 54.59 30.44 52.58 106.91
16.16 28.53 19.14 30.75 19.66 30.55 34.44
0.13 1.46 1.95 2.64 0.79 3.21 2.13
98.78 157.93 182.41 241.69 162.14 227.08 235.46
24.45 35.47 27.28 36.2 26.31 40.86 36.03
1.16 2.89 3.75 5.52 2.68 6.43 7.26
0.62 5.15 6.71 12.48 3.88 11.61 15.14
2.56 5.38 4.61 5.52 4.5 9.51 8.1

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)