Heatmap: Cluster_6 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Rhizome
Root
4.2 1.61 0.64 1.83 0.49 0.0 0.0
Dde_g00679 (KAS1)
5.65 5.18 3.04 3.87 3.13 2.44 2.95
64.06 52.14 42.41 47.15 39.6 25.2 33.56
155.0 83.11 33.27 52.87 32.28 10.13 8.35
40.16 24.81 9.7 12.75 12.59 6.95 5.2
6.91 4.22 2.54 3.13 2.49 0.5 0.5
27.63 26.35 12.69 15.77 11.98 14.08 11.42
180.91 161.91 98.1 152.3 76.24 70.81 54.43
24.64 26.88 18.47 21.14 15.67 12.64 8.89
Dde_g03085 (CSD1)
277.69 327.35 129.59 205.19 111.03 83.45 23.34
17.17 17.51 10.31 14.06 7.36 5.29 2.97
Dde_g03414 (PLSP1)
47.07 55.09 22.71 30.7 20.58 16.76 16.25
Dde_g03445 (AAE15)
12.23 11.87 5.33 7.48 3.14 2.8 5.01
6.14 5.82 2.77 3.42 1.46 0.99 0.33
35.34 38.13 16.48 23.73 12.94 14.92 12.07
26.26 15.68 6.82 8.78 7.27 4.06 3.86
4.45 3.52 0.21 2.56 0.0 0.28 0.0
9.14 5.25 1.48 2.94 1.68 1.13 0.47
5.44 5.24 3.0 2.97 3.25 1.66 1.68
18.18 16.59 9.93 13.18 7.83 8.9 8.08
46.61 45.46 30.22 38.19 27.47 23.89 25.42
76.23 74.87 52.37 60.52 43.97 38.32 28.24
Dde_g07439 (PDR11)
106.85 48.21 30.7 31.23 22.83 0.65 0.36
3.41 1.98 1.4 1.61 0.71 0.67 0.1
16.62 12.59 4.75 5.98 2.3 0.13 0.65
Dde_g07992 (CYP77A4)
18.2 19.63 10.69 12.1 6.24 2.21 2.53
20.68 19.52 2.24 6.72 0.13 0.22 0.54
146.0 105.26 73.81 72.05 68.27 53.07 29.99
2.58 2.71 1.17 1.46 0.59 0.3 0.2
64.98 58.22 25.26 37.3 26.24 17.86 15.47
4.77 2.41 1.08 1.1 1.34 0.77 0.3
149.81 174.49 68.46 125.82 34.73 19.49 14.08
30.88 23.17 4.22 7.8 1.92 4.4 2.25
20.46 19.87 15.38 15.54 14.42 11.77 11.44
95.25 91.31 31.58 45.68 15.19 9.09 12.87
59.32 54.64 30.44 33.89 23.66 12.89 6.99
32.35 22.62 3.83 7.33 2.39 3.3 0.94
14.83 15.41 10.22 11.1 7.46 6.2 3.2
Dde_g12279 (EHD1)
5.86 4.28 3.35 2.19 3.35 1.97 0.97
3.14 2.6 1.72 1.74 0.75 0.16 0.03
5.53 6.08 2.17 4.94 0.39 0.71 0.0
Dde_g13637 (SHS1)
82.33 67.68 41.04 40.16 44.46 33.32 15.33
32.47 35.93 20.59 26.44 17.22 13.85 9.35
90.97 92.38 47.82 50.13 44.76 28.46 15.59
173.43 176.74 45.89 77.18 31.74 34.1 40.31
24.4 17.02 5.02 9.41 1.15 1.27 0.05
Dde_g15086 (PAO)
45.74 44.21 26.25 31.88 22.59 14.66 6.5
72.27 59.65 30.85 41.08 20.56 18.61 16.8
121.06 119.54 29.62 52.87 19.83 9.37 4.17
7.63 6.9 4.81 5.07 4.15 3.46 2.17
4.06 4.25 1.99 2.66 1.64 0.96 0.62
141.97 133.2 53.57 70.84 49.63 53.42 23.45
Dde_g17770 (MSRB1)
85.44 81.25 49.4 61.57 42.03 37.75 45.31
Dde_g17794 (HB5)
256.55 112.64 77.68 81.15 83.82 12.42 2.19
17.52 15.05 8.15 9.2 6.66 2.98 6.3
Dde_g18491 (PGR5)
100.64 61.1 36.39 41.48 31.34 12.55 11.11
Dde_g18857 (AGD2)
21.13 21.86 9.73 15.78 7.15 7.67 8.05
19.48 8.49 4.23 4.49 2.35 0.26 0.29
8.25 8.03 5.59 5.53 5.52 3.84 2.91
Dde_g20814 (SEP1)
65.01 86.84 30.85 54.34 20.67 21.55 6.13
6.56 5.3 3.37 3.31 3.24 2.28 2.01
Dde_g20916 (EGY1)
113.97 82.94 28.61 52.43 21.48 9.17 4.62
Dde_g20918 (CRY3)
14.96 12.97 4.69 5.95 2.43 0.43 0.17
Dde_g21681 (PANK2)
17.84 18.86 11.68 13.46 10.43 5.79 5.74
6.14 5.5 2.18 2.64 1.89 1.5 0.92
Dde_g23063 (CPSAR1)
13.24 11.9 4.72 6.66 3.23 3.39 2.86
5.27 6.06 0.44 1.87 0.02 0.05 0.07
Dde_g23398 (PHT3;3)
58.34 50.46 44.46 45.41 42.06 24.06 33.06
143.91 137.49 57.82 76.19 40.69 35.72 34.42
3.09 1.62 0.74 0.82 0.25 0.13 0.05
23.87 25.62 10.48 13.9 8.92 5.58 1.22
33.46 34.35 20.82 24.03 17.66 16.28 10.23
74.25 49.69 31.01 36.53 34.04 21.57 14.63
Dde_g24097 (EMB2758)
26.75 23.51 16.06 18.29 13.07 10.1 7.47
Dde_g24102 (MAP70-1)
17.07 15.42 10.17 11.64 9.92 8.12 3.05
27.85 30.39 10.77 16.49 8.93 4.11 9.2
Dde_g24273 (MAR1)
35.42 34.59 24.03 25.62 23.16 13.42 13.03
12.09 11.01 8.76 9.68 8.43 6.67 5.54
155.34 172.27 91.13 109.61 78.04 54.58 51.61
15.44 17.23 9.11 12.74 6.32 4.0 0.75
63.74 65.12 30.88 38.24 22.37 5.46 0.84
8.02 6.59 4.22 4.39 4.19 3.74 2.74
Dde_g25134 (CYP86B1)
37.41 21.53 20.2 18.44 11.33 1.17 0.16
32.3 33.05 20.92 25.91 16.58 13.79 7.25
Dde_g25445 (CRR22)
12.27 13.26 7.09 8.01 5.95 5.21 4.02
2.83 3.58 1.73 2.38 1.84 1.65 0.99
5.35 4.22 2.82 3.3 3.19 2.2 2.33
13.6 14.72 7.46 11.26 6.07 4.38 5.73
5.63 5.73 3.69 3.95 3.19 2.25 1.69
15.41 18.55 7.58 10.75 5.8 3.71 0.93
Dde_g26203 (UGT85A1)
85.69 59.91 23.19 27.31 23.65 16.52 2.53
Dde_g26244 (emb1273)
27.36 28.49 17.17 21.12 15.04 13.05 7.71
Dde_g26388 (KEA2)
59.8 44.89 26.79 36.58 32.14 28.33 7.56
Dde_g26438 (RABE1b)
68.47 69.92 48.9 51.71 49.13 31.85 30.64
67.61 67.45 25.55 39.73 11.71 10.62 6.89
75.84 50.48 26.56 42.73 28.24 16.88 8.25
38.34 40.9 21.03 32.37 14.97 10.66 2.55
16.95 17.77 8.76 10.87 6.73 5.16 5.85
99.32 130.19 20.53 55.79 5.5 9.54 4.77
27.8 26.33 11.68 15.52 6.99 2.73 1.77
8.16 6.56 3.72 3.75 3.76 2.32 1.07
Dde_g31899 (SOUL-1)
93.29 75.32 41.98 49.79 37.14 7.01 14.38
21.32 16.87 10.01 14.12 7.41 7.98 3.6
Dde_g38510 (OTP84)
16.28 19.32 10.27 11.7 9.79 8.98 4.28
39.47 17.77 14.97 14.25 14.83 5.53 5.34
5.19 4.92 2.61 2.93 2.71 1.34 1.13
10.08 11.03 5.34 6.36 4.1 3.39 3.83
148.46 121.92 67.72 78.59 82.0 47.25 22.45
24.56 24.45 5.99 10.1 2.41 1.54 0.4
4.98 4.64 2.74 3.23 3.04 2.48 0.58
Dde_g46719 (NRT1.8)
15.48 9.33 5.12 5.24 3.27 0.94 0.28
6.97 5.31 3.47 3.55 3.51 2.28 2.02
58.18 48.3 40.29 39.85 41.13 30.47 29.13
83.04 81.71 47.4 44.03 37.28 22.65 16.04
Dde_g48528 (UGT85A1)
24.21 32.15 10.53 15.57 9.19 7.48 0.89
39.12 25.82 15.15 15.85 16.51 10.6 9.91
Dde_g49752 (OTP86)
23.79 22.94 10.76 11.62 9.24 5.21 3.08
31.81 35.17 5.48 15.03 0.32 0.51 0.19
36.73 38.76 15.77 23.11 11.82 14.55 10.05
5.36 3.88 2.26 2.69 1.61 0.99 0.7
3.79 4.0 1.64 2.8 0.41 0.2 0.11
Dde_g51243 (TIFY8)
9.28 6.88 6.07 5.27 5.69 3.78 3.69
Dde_g51592 (NADK2)
27.99 19.56 12.1 15.45 10.85 7.89 5.62
3.07 3.18 0.82 1.29 0.23 0.0 0.0
3.45 3.52 0.96 1.89 0.26 0.08 0.02
56.42 49.36 38.09 39.53 34.85 26.06 18.07

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)