Heatmap: Cluster_4 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Primary Rachis	Secondary Rachis	Petiole	Rhizome	Root
Dde_g00144	0.08	0.22	0.58	0.31	0.98	1.0	0.81
Dde_g00299	0.64	0.8	0.59	0.5	0.62	0.94	1.0
Dde_g00637 (AGAL2)	0.16	0.05	0.17	0.08	0.36	1.0	0.38
Dde_g00778 (BAG1)	0.12	0.13	0.4	0.3	0.59	1.0	0.53
Dde_g00791	0.41	0.22	0.52	0.52	0.82	1.0	0.71
Dde_g00845 (VSR3)	0.41	0.43	0.72	0.59	0.89	1.0	0.96
Dde_g00934	0.66	0.66	0.77	0.64	1.0	0.94	0.8
Dde_g00980	0.55	0.7	0.69	0.58	0.77	0.96	1.0
Dde_g01541 (CYP709B1)	0.37	0.34	0.54	0.35	0.58	1.0	0.93
Dde_g01572	0.66	0.72	0.6	0.47	0.53	0.88	1.0
Dde_g01615	0.47	0.51	0.63	0.59	0.61	0.91	1.0
Dde_g01711	0.43	0.79	0.69	0.59	0.78	0.95	1.0
Dde_g01980	0.69	0.79	0.77	0.73	0.81	0.99	1.0
Dde_g02230	0.49	0.58	0.76	0.64	0.95	1.0	0.98
Dde_g02263	0.41	0.42	0.55	0.45	0.87	1.0	0.75
Dde_g02982 (RSW1)	0.16	0.25	0.4	0.27	0.72	0.58	1.0
Dde_g02987 (emb1441)	0.63	0.67	0.76	0.64	0.88	1.0	0.92
Dde_g03379	0.57	0.62	0.52	0.51	0.68	1.0	0.93
Dde_g03511 (AIR9)	0.64	0.68	0.83	0.67	0.97	0.83	1.0
Dde_g03831 (MSS1)	0.79	0.29	0.31	0.22	0.78	1.0	0.97
Dde_g03926 (DL1B)	0.09	0.28	0.36	0.29	0.44	1.0	0.98
Dde_g03988 (CTR1)	0.69	0.68	0.75	0.67	0.83	1.0	0.89
Dde_g04316 (ARG1)	0.31	0.33	0.58	0.48	0.94	1.0	0.99
Dde_g04827 (TUB6)	0.18	0.27	0.25	0.15	0.38	1.0	1.0
Dde_g04836	0.6	0.74	0.9	0.64	1.0	1.0	0.94
Dde_g04905 (PAK)	0.3	0.5	0.55	0.4	0.68	1.0	0.97
Dde_g05253 (TUB6)	0.49	0.55	0.67	0.52	0.97	0.96	1.0
Dde_g05334 (APC7)	0.44	0.44	0.67	0.48	0.89	1.0	0.76
Dde_g05537	0.11	0.25	0.41	0.31	0.49	0.95	1.0
Dde_g05774 (VTC1)	0.46	0.17	0.2	0.1	0.5	1.0	0.58
Dde_g05921	0.43	0.38	0.54	0.48	0.64	1.0	0.67
Dde_g05945	0.35	0.13	0.29	0.16	0.49	1.0	0.61
Dde_g06153	0.04	0.48	0.25	0.1	0.53	0.89	1.0
Dde_g06437	0.15	0.17	0.23	0.15	0.48	1.0	0.67
Dde_g06721	0.04	0.07	0.16	0.05	0.52	0.95	1.0
Dde_g06737	0.06	0.05	0.44	0.18	1.0	0.45	0.65
Dde_g07018	0.21	0.5	0.51	0.33	0.41	1.0	0.79
Dde_g07182	0.13	0.32	0.16	0.04	0.31	1.0	0.64
Dde_g07256	0.84	0.73	0.79	0.84	0.82	1.0	0.87
Dde_g07292	0.18	0.18	0.49	0.34	0.53	1.0	0.62
Dde_g07629 (RAT4)	0.04	0.07	0.2	0.11	0.45	0.49	1.0
Dde_g07685	0.29	0.46	0.38	0.34	0.4	1.0	0.83
Dde_g07788 (cycp3;1)	0.33	0.53	0.23	0.36	0.67	1.0	0.69
Dde_g07855 (FLA17)	0.08	0.25	0.69	0.48	0.61	0.87	1.0
Dde_g08469 (TBL27)	0.14	0.11	0.32	0.11	0.78	0.73	1.0
Dde_g08779 (BAG1)	0.21	0.11	0.34	0.19	0.47	0.66	1.0
Dde_g09236 (AP1)	0.35	0.33	0.6	0.44	0.66	0.95	1.0
Dde_g09451	0.34	0.44	0.56	0.56	0.56	1.0	0.57
Dde_g09707 (WRKY71)	0.31	0.21	0.29	0.21	0.63	0.61	1.0
Dde_g10290	0.16	0.1	0.31	0.09	1.0	0.79	0.99
Dde_g10301 (CID12)	0.42	0.77	0.62	0.47	0.71	1.0	0.93
Dde_g10549 (KOR)	0.05	0.21	0.24	0.12	0.52	0.49	1.0
Dde_g10597 (MEE32)	0.44	0.55	0.67	0.53	0.76	1.0	0.93
Dde_g10764	0.25	0.39	0.61	0.38	0.85	1.0	0.8
Dde_g11120 (HIK)	0.48	0.74	0.38	0.24	0.31	1.0	0.59
Dde_g11658 (AK)	0.39	0.49	0.71	0.55	0.86	1.0	0.81
Dde_g11773	0.43	0.4	0.5	0.38	0.63	1.0	0.98
Dde_g12267 (RAC3)	0.61	0.69	0.72	0.7	0.85	1.0	0.74
Dde_g12348	0.2	0.49	0.41	0.33	0.56	0.8	1.0
Dde_g12860	0.49	0.64	0.55	0.53	0.62	0.9	1.0
Dde_g13010	0.07	0.12	0.3	0.19	0.51	1.0	0.57
Dde_g13154	0.31	0.44	0.28	0.24	0.46	0.95	1.0
Dde_g13165	0.29	0.45	0.35	0.26	0.48	1.0	0.94
Dde_g13212	0.13	0.25	0.48	0.38	0.67	1.0	0.75
Dde_g14279	0.01	0.28	0.13	0.09	0.22	1.0	0.92
Dde_g14896	0.01	0.03	0.23	0.08	0.43	1.0	0.38
Dde_g15321	0.17	0.36	0.35	0.52	0.38	1.0	0.75
Dde_g15361	0.0	0.0	0.22	0.08	0.64	0.99	1.0
Dde_g15634	0.23	0.39	0.33	0.37	0.41	0.93	1.0
Dde_g15680	0.2	0.21	0.18	0.14	0.51	1.0	0.37
Dde_g16103	0.02	0.32	0.3	0.19	0.64	0.81	1.0
Dde_g17305 (IQD6)	0.14	0.29	0.37	0.17	0.37	1.0	0.35
Dde_g17307	0.29	0.12	0.5	0.26	0.68	1.0	0.83
Dde_g18032	0.33	0.16	0.45	0.3	0.59	0.81	1.0
Dde_g18145 (ROPGEF1)	0.3	0.52	0.08	0.06	0.2	0.82	1.0
Dde_g18180	0.06	0.15	0.27	0.17	0.63	1.0	0.93
Dde_g18270 (DIN9)	0.26	0.23	0.31	0.29	0.52	1.0	0.61
Dde_g18643 (PG2)	0.03	0.07	0.19	0.05	0.42	0.68	1.0
Dde_g19197 (ELP)	0.21	0.34	0.26	0.17	0.43	0.75	1.0
Dde_g19980	0.37	0.43	0.82	0.63	1.0	0.89	0.57
Dde_g20072	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03	1.0	0.85
Dde_g20639 (SUB1)	0.0	0.4	0.22	0.08	0.13	0.84	1.0
Dde_g20955 (NCRK)	0.12	0.13	0.21	0.1	0.45	1.0	0.53
Dde_g21146 (SRF7)	0.05	0.11	0.31	0.19	0.45	1.0	0.57
Dde_g21317 (GT18)	0.36	0.33	0.65	0.53	0.95	1.0	0.55
Dde_g21332	0.1	0.13	0.39	0.33	0.41	1.0	0.5
Dde_g21409	0.27	0.17	0.81	0.2	0.35	1.0	0.7
Dde_g21991 (GAUT9)	0.24	0.66	0.52	0.51	0.65	1.0	0.99
Dde_g22101	0.48	0.76	0.53	0.31	0.39	1.0	0.7
Dde_g22503	0.39	0.35	0.57	0.42	0.82	1.0	0.84
Dde_g22524	0.28	0.75	0.67	0.44	0.52	0.82	1.0
Dde_g22827	0.33	0.57	0.55	0.49	0.67	1.0	0.63
Dde_g22845	0.02	0.02	0.2	0.12	0.42	0.64	1.0
Dde_g23477	0.25	0.39	0.54	0.42	0.59	1.0	0.66
Dde_g23747	0.0	0.18	0.13	0.06	0.48	0.63	1.0
Dde_g23976	0.03	0.09	0.21	0.1	0.52	1.0	0.59
Dde_g24024 (TOR2)	0.06	0.43	0.24	0.12	0.43	1.0	0.81
Dde_g24704	0.26	0.46	0.36	0.43	0.36	0.8	1.0
Dde_g24836 (HCT)	0.0	0.01	0.47	0.07	1.0	0.88	0.44
Dde_g25023	0.08	0.15	0.31	0.28	0.52	1.0	0.71
Dde_g25301	0.41	0.55	0.67	0.57	0.74	1.0	0.83
Dde_g25423	0.43	0.41	0.59	0.49	0.75	1.0	0.88
Dde_g25928	0.02	0.27	0.11	0.09	0.15	1.0	0.86
Dde_g26003 (TOR2)	0.55	0.67	0.51	0.37	0.5	0.83	1.0
Dde_g26018 (TBL5)	0.06	0.02	0.28	0.1	0.69	1.0	0.7
Dde_g26247	0.0	0.08	0.39	0.31	0.9	1.0	0.27
Dde_g26326 (IQD6)	0.16	0.54	0.35	0.27	0.42	0.86	1.0
Dde_g26433	0.78	0.76	0.8	0.81	0.7	1.0	0.84
Dde_g26546	0.45	0.57	0.64	0.36	1.0	0.83	0.91
Dde_g26548 (ARF6)	0.3	0.48	0.4	0.33	0.4	0.68	1.0
Dde_g26595	0.02	0.26	0.2	0.08	0.19	0.75	1.0
Dde_g26831	0.02	0.02	0.26	0.07	0.47	1.0	0.35
Dde_g26915 (COBL1)	0.14	0.1	0.54	0.29	1.0	0.5	0.74
Dde_g27090	0.07	0.22	0.27	0.6	0.3	1.0	0.28
Dde_g27447 (ENODL14)	0.02	0.26	0.28	0.11	0.4	1.0	0.89
Dde_g27672	0.24	0.41	0.3	0.21	0.42	0.88	1.0
Dde_g27785	0.0	0.13	0.11	0.09	0.42	1.0	0.4
Dde_g28216	0.36	0.55	0.55	0.53	0.76	0.73	1.0
Dde_g29082	0.26	0.72	0.65	0.47	0.69	0.85	1.0
Dde_g29806 (TOR2)	0.06	0.32	0.18	0.12	0.33	1.0	0.81
Dde_g29968	0.05	0.19	0.28	0.23	0.45	1.0	0.36
Dde_g30009	0.14	0.18	0.22	0.15	0.57	1.0	0.48
Dde_g30876	0.06	0.3	0.18	0.13	0.22	1.0	0.57
Dde_g31048	0.22	0.2	0.17	0.15	0.33	1.0	0.33
Dde_g35167	0.14	0.18	0.57	0.38	0.48	1.0	0.69
Dde_g36065 (FAS4)	0.71	0.56	0.64	0.53	0.67	1.0	0.71
Dde_g36428	0.31	0.06	0.17	0.1	0.33	1.0	0.44
Dde_g37087	0.03	0.23	0.19	0.27	0.47	1.0	0.32
Dde_g39386 (HTA3)	0.51	0.72	0.48	0.42	0.63	0.89	1.0
Dde_g41791	0.53	0.57	0.52	0.5	0.67	1.0	0.7
Dde_g42663	0.05	0.53	0.29	0.04	0.19	1.0	0.8
Dde_g43722 (ZIFL1)	0.11	0.23	0.27	0.18	0.37	1.0	0.61
Dde_g45943	0.11	0.67	0.44	0.32	0.46	1.0	0.72
Dde_g46515	0.02	0.15	0.22	0.15	0.27	1.0	0.39
Dde_g46538	0.5	0.52	0.66	0.57	0.73	1.0	0.82
Dde_g46931	0.11	0.21	0.37	0.43	0.38	1.0	0.56
Dde_g47289 (IXR1)	0.4	0.42	0.66	0.55	1.0	0.98	0.62
Dde_g48017	0.24	0.35	0.59	0.35	0.78	1.0	0.94
Dde_g48638	0.29	0.33	0.33	0.25	0.73	1.0	0.38
Dde_g49858	0.28	0.51	0.63	0.43	1.0	0.7	0.8
Dde_g49955	0.2	0.33	0.4	0.13	0.91	1.0	0.98
Dde_g50036	0.09	0.57	0.58	0.33	0.51	1.0	0.89
Dde_g50099 (ATH-A)	0.1	0.24	0.61	0.32	1.0	0.87	0.89
Dde_g50236	0.35	0.57	0.49	0.51	0.74	0.9	1.0
Dde_g52237	0.0	0.0	0.42	0.17	0.64	0.96	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)