Heatmap: Cluster_213 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Meristem
Rhizome
Crozier
Young Root
Mature Root
Dcu_g01100 (ARPC1)
-0.71 -1.28 -0.66 -0.04 -0.02 0.43 0.12 0.43 0.08 0.36 0.35
Dcu_g01427 (WRM)
-1.03 -1.67 -0.54 -0.04 -0.1 0.29 -0.13 0.4 0.03 0.68 0.61
Dcu_g01567 (BRCC36A)
-0.98 -2.32 -0.85 0.03 0.19 0.44 0.13 0.27 0.21 0.56 0.37
Dcu_g01708 (NSF)
-1.05 -2.72 -1.05 -0.02 0.05 0.54 -0.13 0.39 0.1 0.6 0.67
-0.61 -2.34 -0.58 0.03 0.14 0.59 0.07 0.33 0.14 0.27 0.3
-1.32 -3.1 -1.64 0.06 0.01 0.53 -0.16 0.67 0.29 0.73 0.37
-1.3 -2.14 -0.94 -0.39 -0.34 0.51 0.34 0.5 0.14 0.7 0.54
-0.99 -3.71 -1.27 0.13 -0.12 0.65 0.12 0.59 0.2 0.5 0.32
-0.72 -1.68 -0.81 -0.21 0.2 0.42 -0.08 0.48 0.24 0.42 0.38
-0.73 -3.17 -0.87 -0.17 -0.15 0.44 -0.02 0.54 0.29 0.6 0.5
-1.1 -2.0 -0.97 -0.07 0.3 0.4 -0.05 0.44 -0.25 0.65 0.62
Dcu_g03953 (GAPCP-2)
-1.96 -2.6 -1.53 0.22 0.17 0.29 0.09 0.52 0.29 0.57 0.6
-0.7 -1.97 -0.79 -0.18 -0.08 0.62 -0.09 0.28 -0.17 0.56 0.73
-0.76 -3.56 -1.3 -0.16 0.03 0.5 0.05 0.31 0.23 0.6 0.7
Dcu_g04598 (ENO2)
-1.25 -1.68 -0.74 0.09 -0.02 0.29 -0.14 0.55 -0.0 0.64 0.54
-0.75 -1.82 -0.77 0.17 0.2 0.41 0.14 0.35 0.13 0.31 0.29
Dcu_g04896 (QWRF8)
-1.67 -3.83 -1.96 -0.16 0.25 0.28 0.32 0.38 0.2 0.78 0.72
Dcu_g04998 (PA200)
-1.94 -4.44 -1.92 0.1 0.21 0.58 0.01 0.58 0.05 0.67 0.66
Dcu_g05819 (GRL)
-1.43 -3.92 -1.91 0.02 0.18 0.54 0.14 0.49 0.2 0.59 0.62
-0.84 -2.12 -0.62 -0.14 -0.11 0.55 -0.06 0.52 0.1 0.62 0.34
-0.81 -2.98 -0.9 0.04 -0.01 0.47 0.25 0.43 -0.21 0.64 0.49
Dcu_g06855 (ABIL1)
-0.98 -2.07 -0.8 0.18 0.12 0.48 0.25 0.26 0.04 0.41 0.41
Dcu_g06924 (RAD23)
-0.65 -1.02 -0.64 -0.07 -0.07 0.29 -0.08 0.38 0.08 0.51 0.45
-0.43 -1.32 -0.53 -0.07 -0.08 0.18 0.02 0.24 0.16 0.59 0.41
Dcu_g07029 (CPK13)
-0.73 -1.66 -0.7 0.06 -0.12 0.4 -0.1 0.35 -0.01 0.56 0.58
-0.75 -3.27 -0.77 -0.24 0.18 0.68 0.16 0.23 -0.04 0.33 0.69
-0.43 -1.76 -0.44 -0.19 -0.09 0.46 0.1 0.33 0.02 0.33 0.52
Dcu_g07630 (DEI1)
-0.84 -2.64 -0.6 0.1 0.07 0.37 0.05 0.36 -0.0 0.66 0.39
Dcu_g07765 (ITB1)
-1.17 -4.22 -1.63 0.38 0.11 0.43 0.17 0.39 0.11 0.49 0.61
-0.49 -1.65 -0.54 0.08 0.12 0.48 0.02 0.4 -0.04 0.3 0.26
-0.51 -1.1 -0.46 -0.06 -0.09 0.26 -0.02 0.2 0.11 0.47 0.5
Dcu_g08157 (EDR3)
-0.72 -1.88 -0.74 -0.01 0.08 0.52 0.01 0.33 -0.06 0.56 0.42
Dcu_g08406 (UBP12)
-1.45 -3.33 -1.59 0.13 0.49 0.64 -0.18 0.33 -0.0 0.53 0.64
Dcu_g08831 (CGL)
-0.83 -2.14 -0.76 -0.02 0.08 0.5 0.15 0.37 0.13 0.32 0.5
Dcu_g08850 (RH8)
-0.65 -1.81 -0.54 -0.05 0.0 0.15 -0.05 0.42 0.14 0.57 0.5
Dcu_g09724 (RGLG1)
-1.11 -2.39 -0.89 -0.12 0.25 0.53 -0.03 0.57 -0.02 0.61 0.35
-0.8 -2.94 -0.85 0.14 0.04 0.55 0.06 0.38 0.15 0.43 0.43
-1.15 -3.18 -1.45 0.11 0.28 0.63 0.16 0.19 0.16 0.48 0.54
-1.14 -3.02 -1.48 0.38 0.43 0.33 0.17 0.24 -0.07 0.33 0.71
Dcu_g11460 (TEJ)
-1.04 -1.74 -0.91 0.08 0.1 0.29 -0.03 0.22 0.26 0.48 0.67
-0.43 -1.21 -0.47 0.13 0.02 0.41 0.04 0.26 0.08 0.32 0.16
Dcu_g12179 (HA11)
-1.47 -3.88 -2.19 -0.09 0.06 0.42 -0.0 0.87 0.09 0.74 0.56
Dcu_g12305 (MHK)
-1.32 -2.7 -0.82 -0.04 -0.01 0.7 -0.13 0.55 -0.03 0.63 0.48
-1.16 -2.88 -1.56 -0.23 0.07 0.45 -0.09 0.36 0.28 0.66 0.84
-1.14 -2.01 -1.17 0.01 0.1 0.62 0.07 0.47 0.09 0.55 0.35
Dcu_g12546 (CERK1)
-1.3 -2.31 -1.41 0.21 0.03 0.6 0.25 0.33 0.22 0.38 0.48
-1.07 -2.5 -0.76 -0.12 0.16 0.53 -0.07 0.49 0.21 0.59 0.33
Dcu_g12620 (UBP12)
-1.58 -4.08 -1.93 0.08 0.41 0.68 -0.1 0.56 0.21 0.58 0.37
-0.76 -1.84 -0.62 0.13 0.21 0.27 0.08 0.32 0.0 0.57 0.3
-1.65 -3.63 -1.49 0.12 0.19 0.41 -0.06 0.35 0.15 0.74 0.75
-0.62 -2.58 -0.88 -0.04 0.13 0.6 0.07 0.43 0.05 0.47 0.31
-1.41 -3.35 -1.15 -0.1 0.03 0.13 0.31 0.4 -0.08 0.78 0.86
Dcu_g14355 (RPN5B)
-0.74 -2.07 -0.76 0.0 -0.01 0.57 0.07 0.33 0.23 0.51 0.27
Dcu_g14391 (VPS4)
-0.47 -0.9 -0.46 0.06 -0.0 0.37 0.05 0.2 0.1 0.27 0.3
-1.04 -1.76 -0.74 0.01 -0.02 0.61 -0.06 0.42 -0.04 0.62 0.36
-0.74 -2.19 -0.84 -0.14 0.06 0.27 -0.05 0.34 0.28 0.6 0.6
-0.82 -1.88 -0.66 -0.0 -0.02 0.35 0.08 0.23 0.18 0.68 0.39
Dcu_g14902 (MPK20)
-0.25 -3.09 -0.99 0.11 0.08 0.45 0.04 0.38 -0.14 0.37 0.58
Dcu_g14907 (CERK1)
-0.62 -1.97 -0.56 -0.02 -0.21 0.26 -0.17 0.44 0.14 0.68 0.5
-1.71 -3.62 -1.84 0.02 -0.14 0.88 0.11 0.61 0.3 0.58 0.31
Dcu_g15398 (VIK)
-1.13 -2.06 -1.22 0.01 0.03 0.69 -0.06 0.45 0.17 0.5 0.45
-1.14 -2.86 -1.94 -0.7 -0.49 0.35 -0.11 0.51 0.77 0.69 0.9
-1.11 -1.79 -0.82 0.12 -0.11 0.22 -0.22 0.27 0.13 0.76 0.72
-1.03 -1.96 -1.02 0.01 0.11 0.29 -0.41 0.6 0.17 0.76 0.46
-1.03 -3.99 -1.71 -0.18 0.12 0.57 0.15 0.4 0.28 0.64 0.57
-1.1 -1.71 -0.79 0.02 -0.02 0.66 0.11 0.38 -0.01 0.45 0.41
-1.63 -3.21 -1.08 0.13 0.22 0.58 0.2 0.49 0.04 0.56 0.36
Dcu_g19343 (UVR8)
-0.65 -2.38 -0.9 -0.14 0.02 0.25 0.09 0.39 0.0 0.63 0.67
-0.7 -2.8 -0.69 0.01 0.19 0.69 0.18 0.1 -0.35 0.4 0.64
-0.79 -1.31 -0.71 0.15 0.14 0.19 0.1 0.23 -0.02 0.46 0.53
-1.55 -2.82 -1.37 0.01 0.19 0.57 0.19 0.59 0.08 0.52 0.44
-1.68 -2.76 -1.59 0.14 0.22 0.41 0.16 0.43 0.19 0.65 0.52
-0.42 -2.44 -1.04 0.21 0.17 0.15 0.0 0.15 0.13 0.45 0.7
-1.28 -2.65 -1.08 -0.37 -0.3 0.69 0.2 0.55 0.16 0.72 0.46
Dcu_g22927 (KEU)
-1.13 -2.58 -0.88 -0.13 0.12 0.47 0.04 0.66 0.07 0.52 0.44
Dcu_g26240 (AIR9)
-1.69 -4.58 -2.6 0.35 0.47 0.72 -0.07 0.37 -0.34 0.7 0.59
-1.52 -2.98 -1.92 -0.68 -0.13 0.32 -0.11 0.56 0.4 0.96 0.86
-1.79 -3.6 -1.48 0.3 0.41 0.53 -0.03 0.39 -0.27 0.7 0.61
Dcu_g31675 (SK13)
-0.93 -1.82 -0.72 0.13 0.09 0.21 -0.07 0.28 -0.07 0.63 0.69
-0.84 -1.96 -0.92 0.17 0.04 0.47 -0.0 0.4 -0.28 0.55 0.6
-1.82 -2.55 -1.26 0.16 0.11 0.47 -0.2 0.59 0.13 0.62 0.62
-0.95 -2.21 -0.79 -0.02 0.11 0.3 0.22 0.41 0.11 0.58 0.41
-0.88 -1.82 -0.46 0.06 0.05 0.47 0.11 0.28 0.01 0.53 0.31
-1.26 -2.37 -0.92 0.07 0.09 0.68 0.09 0.52 0.14 0.48 0.2
-2.47 -5.46 -1.61 -0.15 -0.03 0.22 0.22 0.33 0.13 1.04 0.9
-0.95 -2.45 -0.92 0.03 0.19 0.25 0.29 0.23 -0.04 0.67 0.54
Dcu_g39262 (XT2)
-2.3 -4.15 -3.55 -0.59 0.38 0.27 -1.0 0.72 0.63 1.09 0.74
-0.8 -2.32 -1.02 0.4 0.28 0.07 0.23 0.08 -0.1 0.48 0.66
-0.71 -2.7 -0.88 0.24 0.08 0.49 0.13 0.45 0.25 0.36 0.15
Dcu_g49251 (DCL4)
-1.63 -4.31 -1.63 0.07 0.17 0.53 0.15 0.3 -0.29 0.9 0.74
-1.23 -3.1 -0.76 -0.55 0.05 0.62 -0.15 0.74 0.14 0.48 0.63
-1.24 -2.48 -1.08 -0.05 0.01 0.7 -0.1 0.52 0.21 0.58 0.39
Dcu_g50920 (NAD-ME1)
-1.15 -2.86 -1.37 0.16 0.22 0.56 -0.11 0.56 -0.07 0.64 0.43

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.