Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Young Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Primary Rachis	Secondary Rachis	Petiole	Meristem	Rhizome	Crozier	Young Root	Mature Root
Dcu_g00073	0.09	0.0	0.13	1.0	0.73	0.68	0.59	0.48	0.85	0.8	0.79
Dcu_g00300	0.12	0.01	0.16	0.29	0.29	0.45	0.3	0.6	0.48	1.0	0.4
Dcu_g00428	0.82	0.31	0.88	0.52	0.48	0.38	1.0	0.44	0.48	0.88	0.55
Dcu_g00808 (NADK3)	0.42	0.22	0.54	0.87	0.72	1.0	0.82	0.89	0.83	0.87	0.53
Dcu_g01047	0.73	0.49	0.68	0.64	0.63	0.7	0.74	0.83	0.84	1.0	0.71
Dcu_g01097	0.59	0.2	0.53	0.63	0.58	0.84	0.55	0.8	0.74	1.0	0.85
Dcu_g01130 (SEH1H)	0.81	0.64	0.98	0.96	0.85	0.87	0.99	0.88	1.0	1.0	0.79
Dcu_g01732	0.08	0.02	0.06	0.16	0.22	1.0	0.13	0.21	0.24	0.48	0.39
Dcu_g01744	0.29	0.02	0.3	0.85	0.47	0.31	1.0	0.31	0.7	0.62	0.34
Dcu_g01849 (CAT2)	0.68	0.6	0.7	0.79	0.72	0.8	0.89	0.8	0.73	1.0	0.75
Dcu_g02129	0.61	0.14	0.55	0.84	0.73	0.42	1.0	0.58	0.77	0.93	0.6
Dcu_g02195	0.82	0.68	0.97	0.9	0.8	0.99	0.82	1.0	0.84	1.0	0.95
Dcu_g02867	0.32	0.23	0.26	0.29	0.48	0.58	0.93	0.45	1.0	0.85	0.68
Dcu_g02913	0.43	0.13	0.52	0.84	0.67	1.0	0.88	0.99	0.79	0.92	0.68
Dcu_g03104 (WEB1)	0.73	0.18	0.68	1.0	0.73	0.74	0.97	0.77	0.71	0.9	0.78
Dcu_g03269	0.12	0.01	0.25	0.56	0.96	0.68	0.7	0.8	0.52	0.93	1.0
Dcu_g03288	0.19	0.11	0.65	0.66	0.79	0.7	0.45	0.52	0.94	1.0	0.53
Dcu_g03289	0.42	0.3	0.45	0.55	0.37	0.35	0.53	0.38	0.31	1.0	0.48
Dcu_g03686	0.72	0.82	0.81	0.81	0.72	0.96	0.87	0.95	0.87	1.0	0.99
Dcu_g04540 (TOM20-3)	0.81	0.74	1.0	0.87	0.78	0.9	0.82	0.85	0.79	0.96	0.88
Dcu_g04568 (GGB)	0.65	0.39	0.56	0.76	0.7	0.92	0.86	0.87	0.67	1.0	0.74
Dcu_g04709 (PUX2)	0.81	0.6	0.86	0.85	0.77	1.0	0.71	0.9	0.67	0.88	0.95
Dcu_g04749	0.62	0.1	0.21	0.11	0.16	0.5	0.42	0.73	0.25	1.0	0.66
Dcu_g05193	0.39	0.19	0.36	0.38	0.5	0.5	0.61	0.67	0.7	1.0	0.93
Dcu_g05537	0.44	0.33	0.36	0.23	0.5	0.66	0.83	0.67	1.0	0.97	0.72
Dcu_g06538	0.29	0.13	0.14	1.0	0.3	0.29	0.89	0.22	0.92	0.79	0.44
Dcu_g06967	0.62	0.53	0.74	0.85	0.67	0.7	0.92	0.83	0.94	1.0	0.81
Dcu_g07085	0.48	0.18	0.54	0.97	0.79	0.61	1.0	0.7	0.78	0.76	0.71
Dcu_g08438	0.29	0.06	0.36	0.73	0.77	0.43	0.6	0.34	0.53	1.0	0.78
Dcu_g08720 (ACT7)	0.91	0.71	0.95	0.98	0.92	0.83	0.85	0.86	0.84	0.94	1.0
Dcu_g09167	0.33	0.0	0.3	0.5	0.58	0.8	0.73	0.39	0.32	0.94	1.0
Dcu_g09219	0.71	0.7	0.7	0.74	0.72	0.66	0.81	0.86	1.0	0.97	0.79
Dcu_g09246 (SRT2)	0.61	0.42	0.6	0.58	0.49	0.59	0.66	0.59	0.55	1.0	0.59
Dcu_g09725	0.29	0.04	0.47	0.52	0.36	0.56	0.66	0.53	0.54	1.0	0.53
Dcu_g09841 (UPL5)	0.7	0.21	0.64	0.84	0.78	0.83	0.9	0.91	1.0	0.98	0.98
Dcu_g09870	0.18	0.35	0.27	0.39	0.56	0.5	0.38	0.62	0.43	1.0	0.57
Dcu_g10132 (GLY2)	0.7	0.68	0.82	0.83	0.79	0.88	0.79	0.92	0.84	1.0	0.96
Dcu_g10217	0.28	0.36	0.16	0.1	0.11	0.63	1.0	0.78	0.94	0.87	0.54
Dcu_g10276	0.33	0.25	0.46	0.86	0.61	0.58	0.87	0.66	0.71	1.0	0.7
Dcu_g10642	0.73	0.5	0.85	0.9	0.67	0.67	0.96	0.85	0.97	1.0	0.74
Dcu_g11015	0.52	0.0	0.48	0.17	0.2	0.1	0.93	0.57	0.41	1.0	0.26
Dcu_g11029	0.18	0.03	0.11	1.0	0.75	0.68	0.33	0.5	0.56	0.48	0.77
Dcu_g11098 (BIN5)	0.77	0.62	0.61	0.55	0.6	0.58	0.8	0.75	0.93	1.0	0.78
Dcu_g11567	0.36	0.35	0.37	0.24	0.51	0.7	0.93	0.6	1.0	0.92	0.62
Dcu_g12173	0.42	0.27	0.46	0.26	0.49	0.66	0.64	0.59	1.0	0.92	0.49
Dcu_g12189 (ECHIA)	0.81	0.75	1.0	0.9	0.83	0.92	0.86	0.83	0.65	0.97	0.88
Dcu_g12330	0.48	0.08	0.44	0.73	0.63	0.63	1.0	0.96	0.85	0.89	0.9
Dcu_g13124	0.09	0.06	0.14	0.27	0.39	1.0	0.22	0.34	0.42	0.87	0.72
Dcu_g13697	0.09	0.0	0.34	0.26	0.19	0.13	0.19	0.34	1.0	0.64	0.46
Dcu_g13722	0.59	0.47	0.81	1.0	0.9	0.67	0.9	0.81	0.73	0.93	0.76
Dcu_g13778	0.49	0.16	0.28	1.0	0.54	0.66	0.8	0.68	0.76	0.81	0.57
Dcu_g13922	0.87	0.53	1.0	0.98	0.51	0.57	0.87	0.59	0.68	0.85	0.49
Dcu_g14183	0.12	0.03	0.18	0.24	0.37	0.45	0.48	0.47	0.53	1.0	0.41
Dcu_g14343	0.6	0.29	0.6	0.93	0.66	0.81	0.87	0.85	1.0	1.0	0.65
Dcu_g15383	0.21	0.25	0.16	0.05	0.05	0.48	0.7	0.37	1.0	0.58	0.32
Dcu_g15558	0.43	0.1	0.48	0.66	0.51	0.31	1.0	0.18	0.42	0.55	0.5
Dcu_g16037	0.43	0.3	0.66	0.82	0.59	0.33	1.0	0.53	0.47	0.97	0.43
Dcu_g16195	0.74	0.15	0.29	0.74	0.47	0.36	1.0	0.46	0.56	0.69	0.56
Dcu_g16340	0.55	0.12	0.4	0.56	0.35	0.54	0.46	0.57	1.0	0.62	0.4
Dcu_g16593	0.32	0.05	0.24	0.72	0.53	0.98	1.0	0.8	0.94	0.92	0.67
Dcu_g17763	0.42	0.36	0.37	0.39	0.39	0.51	0.54	0.59	0.83	1.0	0.79
Dcu_g18951	0.78	0.24	0.81	0.37	0.32	0.41	1.0	0.36	0.43	0.9	0.38
Dcu_g19206	0.77	0.23	0.45	0.22	0.06	0.54	0.31	1.0	0.92	0.13	0.16
Dcu_g19280	0.49	0.15	0.5	0.69	0.41	0.61	0.77	0.69	0.42	1.0	0.59
Dcu_g19323	0.13	0.0	0.09	1.0	0.27	0.45	0.93	0.59	0.42	0.56	0.32
Dcu_g19482	0.13	0.06	0.08	0.22	0.38	1.0	0.21	0.45	0.4	0.65	0.45
Dcu_g19553	0.61	0.4	0.76	0.74	0.67	0.84	0.76	0.79	0.8	1.0	0.55
Dcu_g19988 (SUF4)	0.71	0.76	0.84	0.83	0.72	0.84	0.95	0.81	0.96	1.0	0.88
Dcu_g20017	0.06	0.02	0.07	0.22	0.04	0.4	0.85	0.32	0.42	1.0	0.79
Dcu_g20064	0.42	0.19	0.5	1.0	0.48	0.6	0.81	0.59	0.46	0.84	0.44
Dcu_g20178	0.69	0.42	0.67	0.84	0.66	0.67	0.87	0.76	0.9	1.0	0.86
Dcu_g20593	0.47	0.36	0.58	0.63	0.47	0.48	1.0	0.52	0.72	0.82	0.39
Dcu_g22116	0.42	0.1	0.45	0.54	0.5	1.0	0.69	0.69	0.66	0.64	0.46
Dcu_g22257	0.89	0.42	0.99	0.95	0.87	0.85	1.0	0.83	0.61	0.95	0.65
Dcu_g22338	0.41	0.2	0.48	0.8	0.72	0.78	0.92	0.77	0.81	1.0	0.75
Dcu_g22454 (APTX)	0.92	0.67	0.99	0.52	0.33	0.45	0.79	0.57	0.71	1.0	0.47
Dcu_g22710	0.58	0.56	0.76	0.45	0.34	0.55	0.85	0.6	0.81	1.0	0.77
Dcu_g22837	0.49	0.18	0.56	0.4	0.12	0.53	0.97	0.38	0.62	1.0	0.81
Dcu_g23806	0.21	0.14	0.73	0.85	0.82	0.75	1.0	0.85	0.89	0.96	0.52
Dcu_g23987	0.62	0.23	0.53	0.6	0.6	0.82	0.76	0.89	0.7	1.0	0.65
Dcu_g26064	0.71	0.25	0.64	0.19	0.06	0.51	0.47	1.0	0.74	0.04	0.16
Dcu_g26540	0.44	0.01	0.28	0.8	0.46	0.33	1.0	0.24	0.88	0.64	0.51
Dcu_g27884	0.24	0.19	0.46	0.82	0.44	0.26	1.0	0.18	0.38	0.62	0.28
Dcu_g29222	0.62	0.38	0.79	0.74	0.63	0.74	0.83	0.83	0.96	1.0	0.78
Dcu_g31583	0.53	0.08	0.48	1.0	0.46	0.25	0.75	0.42	0.46	0.89	0.47
Dcu_g31892	0.38	0.1	0.2	0.69	0.46	0.99	0.84	0.74	1.0	0.82	0.64
Dcu_g31926 (CYP704B1)	0.46	0.11	0.52	0.19	0.29	0.6	0.34	0.96	1.0	0.36	0.17
Dcu_g32759	0.52	0.32	0.51	0.66	0.58	1.0	0.75	0.91	0.7	0.81	0.6
Dcu_g32985	0.64	0.33	0.66	0.67	0.37	0.35	0.83	0.37	0.68	1.0	0.43
Dcu_g33449	0.26	0.18	0.19	0.78	0.48	0.78	0.55	0.56	1.0	0.55	0.64
Dcu_g34098	0.58	0.41	0.68	0.71	0.52	0.67	0.68	0.75	1.0	0.83	0.62
Dcu_g35379	0.09	0.01	0.39	0.41	0.31	0.24	0.86	0.35	0.32	1.0	0.52
Dcu_g35447	0.22	0.0	0.1	0.66	0.44	0.75	0.91	0.4	1.0	0.32	0.8
Dcu_g35596	0.09	0.05	0.12	0.21	0.34	0.99	0.2	0.34	0.48	1.0	0.84
Dcu_g35755 (RS41)	0.8	0.65	0.91	0.79	0.79	0.8	0.81	0.92	0.8	1.0	0.9
Dcu_g35848	0.49	0.2	0.46	0.25	0.11	0.31	0.29	0.34	0.21	1.0	0.49
Dcu_g35955	0.46	0.01	0.42	1.0	0.56	0.63	0.83	0.69	0.7	0.72	0.45
Dcu_g35975	0.47	0.33	0.34	0.17	0.51	0.66	0.83	0.65	1.0	0.94	0.65
Dcu_g36028	0.33	0.24	0.19	0.23	0.09	0.31	0.47	0.54	0.11	1.0	0.61
Dcu_g36092	0.63	0.35	0.71	0.63	0.45	0.87	0.7	0.81	1.0	0.79	0.57
Dcu_g36214	0.23	0.08	0.07	0.51	0.59	0.25	1.0	0.36	0.74	0.27	0.29
Dcu_g36278 (SCE1)	0.44	0.32	0.78	0.9	0.47	0.21	1.0	0.62	0.6	0.81	0.36
Dcu_g36354	0.21	0.68	0.43	0.97	0.5	0.64	0.93	0.94	0.67	1.0	0.41
Dcu_g37625	0.51	0.25	0.55	0.66	0.51	0.72	0.86	0.56	1.0	0.6	0.67
Dcu_g37673	0.15	0.02	0.2	1.0	0.84	0.77	0.65	0.52	0.59	0.47	0.51
Dcu_g38211	0.38	0.4	0.52	0.5	0.33	0.35	0.44	0.52	0.41	1.0	0.66
Dcu_g38364	0.34	0.09	0.49	0.65	1.0	0.58	0.62	0.8	0.88	0.85	0.54
Dcu_g39232	0.45	0.31	0.84	1.0	0.46	0.41	0.79	0.33	0.33	0.92	0.35
Dcu_g39569	0.74	0.25	0.76	1.0	0.76	0.75	0.78	0.73	0.71	0.83	0.66
Dcu_g39674	0.64	0.28	0.54	0.85	0.69	0.74	1.0	0.85	0.67	0.93	0.84
Dcu_g39739	0.02	0.0	0.19	0.34	0.56	1.0	0.41	0.45	0.4	0.86	0.64
Dcu_g40461	0.73	0.52	0.71	0.65	0.52	0.53	0.84	0.83	0.88	1.0	0.66
Dcu_g40734	0.39	0.0	0.28	0.09	0.14	0.39	0.83	0.99	1.0	0.29	0.26
Dcu_g42021	0.7	0.27	0.67	0.78	0.66	0.85	0.97	0.89	0.9	1.0	0.64
Dcu_g42333	0.33	0.15	0.4	0.42	0.37	0.52	0.51	0.46	0.63	1.0	0.87
Dcu_g42421	0.43	0.07	0.16	1.0	0.39	0.19	0.59	0.33	0.36	0.66	0.23
Dcu_g42610	0.56	0.24	0.62	1.0	0.77	0.6	0.58	0.63	0.55	0.85	0.56
Dcu_g43282	0.39	0.24	0.49	0.84	0.55	0.93	1.0	0.59	0.86	0.85	0.82
Dcu_g43981	0.09	0.04	0.17	0.36	0.5	1.0	0.26	0.37	0.56	0.65	0.76
Dcu_g44755	0.52	0.47	0.87	0.61	0.69	0.79	0.68	0.99	0.8	1.0	0.8
Dcu_g44869 (NCED5)	0.46	0.04	0.51	0.57	0.42	0.96	0.64	0.91	0.68	1.0	0.91
Dcu_g44895	0.45	0.23	0.39	0.42	0.22	0.38	0.5	0.45	0.39	1.0	0.42
Dcu_g45531	0.36	0.08	0.39	0.83	0.67	0.4	0.93	0.4	0.79	1.0	0.6
Dcu_g45617	0.68	0.15	0.63	0.89	0.63	0.69	1.0	0.69	0.87	0.88	0.7
Dcu_g45627	0.65	0.72	0.45	0.77	0.53	0.92	0.69	0.6	0.51	1.0	0.56
Dcu_g45801	0.34	0.32	0.51	0.59	0.51	0.51	0.65	0.69	0.48	1.0	0.6
Dcu_g46300	0.34	0.26	0.71	0.54	0.35	0.55	1.0	0.36	0.65	0.55	0.67
Dcu_g46405	0.3	0.17	0.69	0.71	0.95	0.37	1.0	0.52	0.59	0.65	0.4
Dcu_g46439	0.68	0.55	0.85	0.75	0.63	0.77	0.69	1.0	0.74	0.99	0.91
Dcu_g47043	0.28	0.29	0.43	0.74	0.58	0.58	0.64	0.7	0.75	1.0	0.7
Dcu_g47597	0.45	0.05	0.35	0.78	0.57	0.67	0.79	0.78	0.69	1.0	0.98
Dcu_g47787	0.12	0.01	0.11	0.32	0.46	1.0	0.24	0.26	0.51	0.61	0.47
Dcu_g47923	0.6	0.21	0.62	0.5	0.26	0.37	0.62	0.56	0.4	1.0	0.75
Dcu_g48387	0.58	0.44	0.51	0.51	0.35	0.42	0.64	0.27	0.34	1.0	0.59
Dcu_g48597	0.59	0.54	0.48	0.91	0.68	0.47	1.0	0.55	0.61	0.81	0.67
Dcu_g48618 (UBQ11)	0.5	0.41	0.47	1.0	0.58	0.62	0.79	0.6	0.99	0.95	0.56
Dcu_g49421	0.38	0.31	0.62	0.69	0.41	0.26	0.91	0.55	0.76	0.59	1.0
Dcu_g49703	0.07	0.0	0.08	0.77	0.39	0.35	1.0	0.35	0.32	0.94	0.25
Dcu_g50199	0.13	0.04	0.47	1.0	0.54	0.59	0.72	0.5	0.52	0.71	0.58
Dcu_g50951	0.04	0.0	0.15	0.41	0.42	0.57	1.0	0.44	0.7	0.98	0.44
Dcu_g51009	0.22	0.0	0.28	0.77	0.19	0.54	0.63	0.36	0.36	1.0	0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)