Heatmap: Cluster_91 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Meristem
Rhizome
Crozier
Young Root
Mature Root
2.61 2.84 1.91 3.3 0.51 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0
3.16 5.68 3.05 5.09 1.69 0.0 1.24 0.0 0.0 0.0 0.0
1.8 2.91 1.69 1.0 0.42 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0
Dcu_g18575 (CAT1)
2.8 2.75 1.83 1.57 0.62 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.03
4.22 6.43 2.66 1.56 0.79 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0
10.61 14.52 7.18 7.95 1.99 0.02 1.58 0.0 0.0 0.02 0.0
6.01 6.81 3.64 5.03 1.42 0.0 1.04 0.0 0.0 0.0 0.0
3.12 4.4 3.2 3.53 0.85 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.05
8.32 1.05 2.49 4.44 1.02 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0
2.43 1.43 1.24 1.56 0.58 0.02 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
1.49 1.96 0.41 0.27 0.31 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
1.52 1.68 0.09 0.21 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.6 4.09 2.75 2.17 0.76 0.0 0.46 0.03 0.0 0.0 0.0
2.82 2.98 2.22 1.22 0.36 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0
1.35 2.98 1.03 0.89 0.22 0.0 0.28 0.02 0.0 0.0 0.0
5.58 6.45 3.32 3.2 0.65 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0
2.46 3.02 1.48 1.46 0.44 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0
1.74 2.66 1.3 0.88 0.26 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
2.98 2.86 2.54 2.14 0.66 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0
Dcu_g23082 (ALDH2)
4.47 7.94 2.97 1.9 1.17 0.01 0.58 0.09 0.01 0.0 0.01
Dcu_g23149 (COX6B)
3.1 3.51 2.85 1.47 0.27 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0
3.4 3.2 2.51 0.21 0.23 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
4.09 2.63 1.95 1.79 0.35 0.0 0.54 0.05 0.0 0.0 0.1
Dcu_g23322 (TIP2;3)
2.5 2.82 1.85 0.16 0.39 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
2.83 4.67 3.47 1.08 0.37 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.11
2.82 3.41 1.54 1.13 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0
3.31 1.0 0.67 1.35 0.37 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
1.15 1.62 0.68 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
14.41 22.47 12.79 5.25 1.15 0.18 2.16 0.0 0.0 0.0 0.98
Dcu_g24368 (CAD1)
0.97 1.64 0.92 0.24 0.39 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.01
2.75 3.88 1.0 1.19 0.61 0.03 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0
1.75 2.45 1.06 0.45 0.17 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
4.13 5.66 4.42 2.6 0.51 0.04 0.43 0.0 0.0 0.15 0.12
2.3 3.02 1.69 0.85 0.48 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0
1.75 3.04 0.96 0.94 0.4 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
2.14 2.63 1.3 1.03 0.25 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
1.32 2.25 1.16 1.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0
6.92 3.88 2.23 3.22 0.74 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0
4.14 7.16 3.16 1.2 0.43 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
1.41 3.61 1.28 1.05 0.19 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
1.68 3.32 1.89 1.16 0.65 0.0 0.41 0.01 0.0 0.0 0.02
2.03 0.76 1.2 1.17 0.06 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
Dcu_g39563 (ATB2)
2.34 4.74 1.27 0.95 0.35 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
3.73 5.22 3.0 1.61 0.35 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0
0.76 2.49 1.07 0.55 0.18 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
2.48 0.85 1.01 1.04 0.34 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
2.92 0.73 1.3 1.01 0.27 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0
1.72 2.08 0.65 1.08 0.2 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0
1.2 2.18 0.49 0.79 0.08 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
3.89 4.46 1.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.98 2.09 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
16.12 15.66 14.41 8.01 3.67 0.0 2.12 0.0 0.0 0.09 0.0
9.46 8.52 7.77 3.86 1.03 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0
1.8 1.87 0.98 0.55 0.16 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
3.76 3.83 2.6 2.43 0.99 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0
8.78 14.08 5.78 1.65 0.44 0.46 0.43 0.0 0.0 0.36 2.04
Dcu_g44666 (ELI3)
4.01 4.0 3.0 2.54 0.6 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0
2.93 3.04 2.27 1.89 0.31 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
1.31 2.78 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.17 1.79 0.86 0.11 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.2 2.1 1.32 1.03 0.46 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
5.91 7.33 3.8 0.07 0.06 0.19 0.46 0.0 0.0 0.07 0.0
8.18 11.21 5.73 8.74 2.73 0.0 3.13 0.0 0.0 0.0 0.0
10.21 18.09 11.2 9.73 3.52 0.0 2.42 0.0 0.0 0.0 0.27
0.59 2.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.43 2.81 1.66 0.83 0.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.09 0.68
4.69 5.54 2.93 1.95 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.94 2.44 0.76 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.6 2.73 0.55 1.01 0.13 0.0 0.41 0.0 0.0 0.23 0.0
3.52 6.38 1.86 0.0 0.18 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
22.87 24.21 21.54 13.39 5.14 0.0 2.72 0.09 0.0 0.05 0.0
3.79 1.35 0.97 1.7 0.42 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0
1.91 2.48 0.79 0.63 0.52 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
2.04 2.28 1.39 1.41 0.54 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.11
4.19 4.76 2.77 1.5 0.42 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0
4.03 8.4 2.51 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.11 3.27 0.55 0.67 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 2.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.89 1.98 0.43 0.9 0.2 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
3.87 3.26 3.1 2.11 0.21 0.04 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)