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Heatmap: Cluster_123 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Meristem
Rhizome
Crozier
Young Root
Mature Root
-4.67 -3.07 -2.66 -5.7 -4.72 -4.93 -3.3 -1.58 -2.39 -0.47 3.21
- - - - - - - - - -0.07 3.33
Dcu_g25348 (HTA9)
 - - - - - - - - - - 3.46
Dcu_g25386 (UBC5)
 - - - - - - - -3.4 - - 3.45
- - - -2.84 - - -3.2 -0.6 - -0.0 3.18
- - -0.64 - - - - - - -1.01 3.3
-1.94 -3.05 - - - - - - - -0.83 3.33
- - - - - - - - -4.28 -1.18 3.39
-4.87 - -4.42 - -3.84 - -2.56 -1.51 - -0.75 3.28
- - - - - - - -3.49 - 0.22 3.28
Dcu_g26940 (ARP2)
 - - - - - - - - - 0.0 3.32
Dcu_g27445 (UBQ11)
 - -1.47 - -2.71 -2.77 - -2.14 -3.52 - -1.41 3.27
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - -1.13 - -0.33 3.29
- - - - - - - - - -2.19 3.43
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - - 3.46
Dcu_g27924 (ACT11)
 - -1.96 - - -3.77 - -3.57 - - -0.44 3.3
- - - - - - - -1.68 - -0.75 3.34
- - -2.59 - - - - -4.08 - -0.53 3.33
- - - - - - - - - -0.91 3.39
- -2.35 - - - - - - - -1.74 3.39
- - - - - - - - - -0.51 3.36
Dcu_g28269 (HTA2)
 - - - - - - - - - -0.86 3.39
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - -2.19 - -0.41 3.33
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - - 3.46
Dcu_g28998 (SK11)
 - - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - - 3.46
- -2.41 - - - - - - - -0.14 3.31
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - 0.05 3.32
- -2.92 -2.61 -5.36 - - -5.71 -2.78 - 0.8 3.13
- - - - - -2.05 - -2.42 - 0.36 3.21
- - - - - - - - - -0.34 3.35
- - - - - - - - - -0.11 3.33
- - - - - - - - - -2.77 3.44
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - -2.02 3.43
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - -2.7 3.44
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - -1.68 - -0.6 3.33
- - - -1.7 - - - - - - 3.42
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - -0.18 3.34
- - - - - - - - - -0.47 3.36
Dcu_g30461 (UBQ11)
 - -4.75 -5.4 -4.39 - - -4.16 -4.41 -5.51 -0.75 3.35
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - -0.25 3.34
- - - - - - - - - 0.47 3.27
- - - - - - - - - -2.51 3.44
- - - - - - - - - -2.62 3.44
- - - - - - - - - -0.72 3.38
- -3.11 - -6.14 -6.38 - - -5.17 - -1.45 3.39
- - -1.89 - - - -2.32 - - -0.78 3.31
- - - - - - - -2.54 - -0.6 3.35
- - - - - - - -3.01 - -3.05 3.43
- - - - - - - - - - 3.46
Dcu_g31361 (ATJ)
 - - - - - - - - -2.77 -2.92 3.42
- - - - - - - -4.05 - - 3.45
- -5.2 -3.0 - - - - -4.71 -4.81 0.38 3.24
- - - - - - - - - - 3.46
Dcu_g31685 (AAc1)
 - - - - - - -3.82 -2.63 - -1.72 3.39
- - - - - - - -1.72 - -1.66 3.38
Dcu_g31787 (RPL16A)
 - - -2.97 - - - - - - -1.88 3.41
Dcu_g32018 (ACT11)
 -3.85 - - - - - - - -3.26 -1.09 3.37
-2.68 -1.4 -2.09 -4.12 -4.66 - -3.88 - -4.26 -0.33 3.2
- - - - - - - -2.57 - -0.99 3.37
- - - - - - - -3.45 - -2.08 3.42
- - - - - - - -1.56 - -2.1 3.38
- - - - - - - - - -0.54 3.37
Dcu_g32302 (ACT11)
 - -3.29 - - - - -4.03 - -4.92 -1.13 3.37
-3.02 -1.8 -2.72 -3.19 -3.58 - -2.16 -5.36 - 0.62 3.08
- - - - - -3.65 -2.21 -3.45 - -1.07 3.34
- - - - - - - - - -0.23 3.34
Dcu_g32507 (ACT11)
 -2.12 -1.55 -2.72 - - - - -4.24 - 0.2 3.18
Dcu_g32729 (UBQ6)
 - -3.66 - - -1.69 - -1.72 - - -0.19 3.24
- - - - - - - - - -0.98 3.39
-2.6 - - - - - - -2.57 - -0.19 3.29
- -5.39 - - - - - -5.06 - 0.26 3.29
- - - - - - - -4.61 - -0.41 3.35
- - - - - - - - - - 3.46
- - -4.71 - - - - - - -1.1 3.39
- - - - - - - - - -3.0 3.44
Dcu_g33501 (ADF4)
 - - - - - - - - - - 3.46
Dcu_g33533 (CB5-A)
 - - - - - - - - - - 3.46
- - - -4.62 - -6.2 - -2.86 -4.09 -0.04 3.29
- - - - - - - - - -0.68 3.37
- - - - - - - -3.46 - 0.04 3.3
Dcu_g33796 (CAM6)
 - - - - - - - - - -0.48 3.36
- - -5.84 - - - -4.41 -4.26 - -0.64 3.36
- - -2.89 - - - - - - -0.4 3.34
Dcu_g33944 (ROP1)
 - - -2.74 - - - - - - -2.04 3.41
-5.58 -1.96 -4.63 - -6.19 - - -2.8 -3.11 -0.28 3.26
-4.68 -2.19 -4.53 -4.88 -7.37 -5.53 - -3.68 -3.37 0.06 3.24
-5.67 - - - - - - -3.31 -5.74 0.27 3.27
-1.99 -2.52 -2.74 -4.35 - - -3.69 -3.36 - 0.01 3.2
Dcu_g34072 (PRF5)
 - - - - - - - - - -1.69 3.42
-5.17 - - - - - - -2.81 -4.23 0.4 3.24
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - -2.66 - - -0.54 - -0.05 3.2
Dcu_g34383 (PFL)
 - - - - - - - - - -1.02 3.39
- - - - - - - - - -0.12 3.33
- - - - - - - - - -0.52 3.37
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - - - - 3.46
- -2.64 -3.11 - - - -4.49 -4.14 - -0.75 3.33
- - - - - - - - - -0.46 3.36
- - - - - - - - - -0.73 3.38
- - -1.89 - - - - - - -1.0 3.35
- - -3.98 -3.02 -2.65 -2.89 -2.99 -3.61 -2.44 -0.04 3.19
- - - - - - - - - - 3.46
- - - - - - - -1.42 - -0.29 3.29
- - - - - - -3.01 - - -2.48 3.42
- - -4.43 - - - - -5.63 -6.14 -1.05 3.38
- - - - - - - - - -0.92 3.39
- - - - - - - -1.83 - -1.88 3.38
- - - - - - - - - -0.82 3.38
- - - - - - - - - -0.5 3.36
- - - - - - - - - -0.04 3.33
Dcu_g51184 (UBQ11)
 - -2.78 -5.16 -6.25 -5.24 - -6.38 -5.06 - -0.46 3.32
-3.14 -1.95 - - - - - - - -0.69 3.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.