Heatmap: Cluster_76 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Meristem
Rhizome
Crozier
Young Root
Mature Root
Dcu_g17379 (AAT2)
-6.9 -6.14 0.63 -3.88 -3.43 -0.57 -1.75 -0.03 -6.0 2.3 1.24
-6.03 -4.4 0.6 -3.17 -4.27 -0.98 -1.83 -0.16 -5.77 2.42 1.14
Dcu_g17546 (PDI5)
- -4.44 0.54 -4.37 -3.02 -0.9 -2.24 -0.05 -6.29 2.36 1.31
-5.13 -5.68 0.88 -3.66 -6.13 -1.13 -2.37 -0.08 -5.94 2.32 1.28
Dcu_g17848 (SQE3)
-8.18 -4.27 0.85 -3.57 -4.55 -0.88 -1.84 -0.14 -5.36 2.35 1.11
Dcu_g17989 (SBH1)
-5.98 -5.74 0.87 -2.44 -4.77 -1.09 -1.74 0.01 -5.83 2.29 1.15
Dcu_g18118 (UGP2)
- -4.73 0.74 -3.41 -4.25 -1.0 -1.72 -0.29 -5.12 2.35 1.27
-6.13 -4.54 0.75 -3.55 -4.61 -1.08 -2.04 -0.05 -7.85 2.35 1.23
-5.39 -3.99 0.66 -3.14 -4.12 -0.99 -2.15 -0.48 -5.7 2.35 1.38
- -7.05 0.8 -2.81 -4.08 -1.52 -2.33 -0.08 - 2.22 1.53
Dcu_g18574 (HXK2)
-6.11 -5.18 0.88 -3.65 -4.06 -1.02 -2.22 0.07 -5.32 2.23 1.33
-9.57 -4.74 0.73 -3.41 -3.97 -0.93 -1.97 -0.05 -5.59 2.4 1.08
Dcu_g18857 (VTC1)
-5.47 -3.22 0.74 -3.89 -4.19 -1.26 -2.1 -0.34 -4.7 2.34 1.35
-6.15 -4.99 0.52 -3.71 -4.11 -0.69 -1.89 -0.02 -5.65 2.21 1.51
Dcu_g19190 (HSP70)
-6.48 -5.04 0.73 -3.37 -3.61 -0.91 -2.0 -0.03 -5.33 2.33 1.2
Dcu_g19675 (HXK2)
-5.47 -4.67 0.8 -3.76 -4.25 -1.03 -2.24 -0.17 -5.11 2.32 1.29
Dcu_g19952 (PHS2)
-6.72 -5.16 0.78 -3.23 -3.72 -0.95 -1.82 -0.11 -5.55 2.32 1.22
Dcu_g20350 (mtLPD1)
-6.94 -4.94 0.84 -4.25 -4.98 -0.99 -2.28 -0.08 -6.96 2.25 1.4
Dcu_g20370 (MEE51)
-6.52 -5.77 0.6 -3.37 -4.48 -0.93 -1.98 0.03 -5.5 2.29 1.37
-5.46 -5.72 0.6 -3.32 -4.06 -0.96 -2.06 -0.07 -5.87 2.32 1.36
-5.07 -7.21 0.15 -3.09 -3.91 -0.98 -2.1 -0.07 -8.06 2.36 1.51
-4.99 -3.68 0.87 -3.17 -5.82 -0.68 -2.43 -0.16 -5.4 2.33 1.12
- - 0.63 -2.94 -4.15 -0.65 -1.79 -0.04 -5.12 2.31 1.26
Dcu_g25485 (PGSIP5)
-4.57 -5.51 0.4 -2.83 -3.88 -0.8 -1.76 -0.15 -5.36 2.41 1.19
Dcu_g25492 (TPS7)
-6.88 -5.22 0.65 -3.19 -4.04 -0.89 -2.18 0.08 -4.69 2.27 1.34
-5.74 -2.23 0.53 -3.94 -4.54 -1.09 -2.06 -0.08 - 2.38 1.24
Dcu_g25681 (SDH1-1)
- -6.32 0.64 -4.05 -5.37 -0.75 -1.89 -0.13 -4.84 2.3 1.39
Dcu_g25862 (NAP1;1)
-6.77 -5.94 0.72 -5.66 -4.25 -0.88 -2.39 0.11 -6.8 2.26 1.4
-6.86 - 0.39 -2.76 -4.23 -1.02 -2.01 0.02 - 2.26 1.55
Dcu_g26212 (SBE2.2)
- - 0.4 -3.78 -3.79 -0.74 -2.0 -0.05 -6.19 2.36 1.36
Dcu_g26223 (HSP81-3)
-5.74 -5.0 0.63 -3.15 -3.95 -1.14 -2.22 -0.36 -5.86 2.34 1.44
-5.35 -4.32 0.52 -2.61 -4.33 -0.85 -2.18 -0.46 -5.17 2.37 1.36
Dcu_g27328 (RPT1A)
-6.15 - 0.82 -3.04 -4.32 -0.79 -2.3 -0.13 -4.37 2.23 1.39
Dcu_g27386 (HMG)
- -5.1 0.65 -3.42 -5.18 -0.49 -2.03 -0.1 - 2.36 1.18
-6.1 -7.67 0.7 -4.09 -4.03 -0.72 -2.24 -0.46 -4.06 2.29 1.46
-6.72 -4.22 0.61 -4.1 -4.98 -1.09 -2.33 -0.07 -5.59 2.37 1.33
Dcu_g27508 (CID4)
-5.09 -6.26 -0.03 -3.65 - -1.06 -1.5 0.04 - 2.4 1.47
Dcu_g27582 (PBB1)
-5.71 -6.59 0.51 -3.35 -4.31 -0.73 -1.94 -0.24 -6.44 2.26 1.54
- -5.98 0.37 -2.78 -5.03 -1.1 -2.73 -0.13 -6.41 2.41 1.41
-3.61 -3.74 0.29 -3.45 -3.55 -1.74 -2.85 -0.62 - 2.44 1.55
-6.13 -5.3 0.74 -3.42 -4.29 -1.21 -2.7 0.15 -6.15 2.33 1.27
- -3.52 0.47 -4.23 -5.16 -1.02 -1.91 0.19 -5.96 2.36 1.25
Dcu_g28000 (ATKRS-1)
-6.18 - 0.56 -3.19 -5.03 -0.94 -2.13 -0.26 -5.2 2.35 1.41
Dcu_g28064 (RPT5A)
-5.1 -5.07 0.86 -4.23 -3.15 -0.89 -2.4 -0.27 - 2.28 1.34
-7.98 -6.15 0.72 -3.55 -4.38 -0.66 -1.76 0.02 -7.0 2.31 1.2
- -5.93 0.72 -3.38 -4.18 -1.07 -1.82 0.05 -6.78 2.36 1.17
- - 0.74 -3.01 -4.36 -1.1 -2.32 0.07 -3.56 2.3 1.28
- -5.6 0.08 -3.23 -4.4 -0.79 -1.89 -0.0 -4.91 2.33 1.51
Dcu_g28475 (MLS)
-6.49 -5.7 0.85 -3.75 -3.62 -0.67 -1.7 -0.36 -4.75 2.31 1.21
- -4.81 0.68 -3.01 -4.04 -1.04 -1.86 0.02 - 2.37 1.15
Dcu_g28581 (EIF2 GAMMA)
- - 0.78 -2.86 -4.09 -0.92 -2.49 -0.43 -5.32 2.31 1.41
- -6.31 0.83 -3.43 -4.09 -0.63 -1.47 -0.13 -6.17 2.2 1.33
- -6.18 0.56 -4.89 -3.84 -0.71 -2.2 -0.12 -5.44 2.34 1.35
- -3.65 0.69 -3.79 -4.46 -0.69 -1.95 -0.21 -3.93 2.33 1.23
-5.58 -4.21 0.52 -3.34 -4.31 -0.79 -1.81 0.09 -6.32 2.39 1.11
Dcu_g29292 (DCP5)
-5.65 -3.82 0.65 -4.29 -4.31 -1.09 -2.53 -0.16 -5.67 2.37 1.33
-6.21 -5.62 0.5 -3.91 -4.01 -0.84 -1.95 -0.18 -5.08 2.38 1.31
-6.52 -5.76 0.56 -3.66 -4.01 -0.61 -2.19 0.12 -6.62 2.26 1.37
- -4.62 0.71 -4.11 -3.53 -1.14 -1.98 -0.34 - 2.32 1.43
- -6.11 0.71 -3.82 -3.86 -0.71 -1.98 0.01 -5.96 2.25 1.36
Dcu_g30216 (LACS8)
- -5.04 0.65 -3.2 -3.48 -0.76 -1.85 -0.06 -6.89 2.39 1.08
-4.11 -6.33 0.38 -5.04 -4.69 -0.69 -2.13 -0.03 -5.18 2.41 1.25
-5.14 -5.17 0.9 -4.99 -4.28 -1.08 -1.88 -0.18 - 2.25 1.39
- -4.14 0.64 -3.13 -5.17 -0.61 -2.68 0.18 -4.41 2.26 1.31
Dcu_g30617 (CAK4)
-6.72 -5.3 0.35 -4.05 -4.88 -1.13 -1.66 -0.09 -5.74 2.42 1.33
Dcu_g31246 (AGD9)
-6.91 -3.45 0.69 -2.82 -4.16 -0.82 -2.89 -0.21 -5.63 2.28 1.4
- -3.27 0.77 -3.07 -4.66 -0.68 -1.93 -0.39 -5.21 2.24 1.39
Dcu_g31295 (TOPP4)
-5.55 - -0.22 -5.44 -2.5 -0.67 -1.85 0.03 -3.58 2.36 1.47
-5.23 -5.51 0.23 -2.48 -5.15 -0.64 -2.61 -0.15 -5.95 2.37 1.43
-4.82 - 0.45 -3.25 -3.82 -0.71 -1.97 -0.54 -5.91 2.37 1.43
- -4.14 0.76 -3.26 -3.6 -0.72 -1.64 -0.22 -4.58 2.38 1.04
Dcu_g31558 (VHA-A)
-6.88 -6.05 0.61 -3.3 -4.31 -0.95 -2.35 -0.03 -5.9 2.34 1.34
-5.72 -4.96 0.89 -2.9 -4.07 -1.26 -1.99 -0.24 -6.81 2.32 1.25
-5.5 -6.25 0.8 -4.24 -4.47 -1.04 -2.03 -0.15 -3.87 2.33 1.27
Dcu_g31875 (OPT4)
-7.03 -4.89 0.77 -3.3 -3.79 -1.05 -2.14 0.12 -4.63 2.34 1.12
- - 0.5 -3.23 -5.85 -0.91 -1.73 -0.0 - 2.32 1.4
-6.01 -6.77 0.41 -4.02 -4.83 -0.67 -2.12 -0.1 -4.11 2.3 1.47
-5.67 -5.89 0.4 -4.26 -4.49 -0.81 -2.35 -0.14 -6.47 2.34 1.49
Dcu_g32436 (TPR8)
- -3.82 0.58 -3.45 -3.49 -0.65 -1.67 -0.04 - 2.35 1.16
Dcu_g32516 (ATMS1)
-6.15 -5.15 0.73 -3.55 -4.18 -0.8 -1.95 -0.04 -5.61 2.28 1.31
- -4.42 0.69 -3.28 -3.77 -1.01 -1.56 -0.19 - 2.28 1.37
Dcu_g32676 (PK6)
- -6.8 0.25 -2.6 -6.69 -0.73 -2.02 -0.31 -5.06 2.4 1.42
Dcu_g32720 (OPT5)
-6.59 -4.76 0.79 -3.95 -3.98 -1.24 -1.94 -0.45 - 2.45 1.14
- - 0.46 -3.62 -4.0 -1.14 -2.58 0.18 -3.96 2.39 1.28
-6.77 -5.01 0.45 -3.4 -3.32 -1.34 -2.7 -0.18 -6.87 2.4 1.42
-7.02 -4.61 0.72 -3.8 -4.31 -0.95 -2.02 0.09 -5.04 2.28 1.31
Dcu_g32947 (ERO2)
-5.02 -5.77 0.76 -2.48 -6.92 -0.87 -2.67 0.23 - 2.27 1.25
-6.29 -5.26 0.34 -3.27 -4.58 -0.79 -2.02 0.14 -5.34 2.35 1.32
Dcu_g33068 (ERMO2)
-5.39 -4.29 0.5 -3.49 -5.37 -1.31 -2.29 0.05 -5.84 2.33 1.44
- - 0.25 -4.77 -4.35 -0.64 -2.26 0.3 -4.92 2.38 1.26
-6.24 -3.96 0.22 -6.12 -2.37 -1.24 -1.87 -0.66 - 2.43 1.5
-7.63 -6.37 0.61 -4.23 -4.32 -0.72 -1.76 -0.13 -7.55 2.43 1.1
-6.47 -7.64 0.73 -2.48 -4.07 -0.85 -2.04 -0.47 -7.49 2.26 1.48
-6.82 -7.99 0.62 -4.53 -4.72 -1.25 -2.01 0.04 -5.26 2.39 1.26
- -6.68 0.55 -3.94 -4.07 -0.85 -2.02 -0.18 -5.05 2.32 1.42
Dcu_g33750 (RAN1)
-5.76 -8.0 0.77 -3.34 -3.21 -1.0 -2.08 -0.26 -5.18 2.38 1.18
Dcu_g33867 (FIM5)
-7.63 -7.8 0.5 -3.54 -4.29 -0.89 -1.96 0.01 -7.65 2.29 1.45
-6.45 -6.32 0.13 -3.22 -6.22 -1.37 -1.78 0.27 -6.17 2.39 1.4
-5.32 -4.59 0.6 -3.7 -4.24 -1.22 -1.81 -0.22 -5.29 2.39 1.29
Dcu_g34257 (ADK2)
-5.07 -3.76 0.98 -4.02 -5.21 -0.81 -3.46 -0.15 - 2.33 1.17
-6.89 -5.47 0.32 -3.49 -4.11 -0.5 -2.27 -0.09 -5.33 2.34 1.4
-6.67 -6.32 0.2 -3.19 -4.4 -0.64 -1.83 -0.02 -6.73 2.38 1.35
- -4.84 0.84 -5.14 -3.87 -1.13 -2.33 -0.08 -5.22 2.34 1.26
-4.82 -4.69 0.6 -3.66 -2.81 -1.4 -1.89 0.11 -6.87 2.32 1.28
Dcu_g34988 (CHMP1B)
- - 0.45 -2.58 - -1.28 -1.54 -0.1 -4.73 2.26 1.57
-7.81 -4.69 0.69 -2.91 -4.32 -0.98 -1.78 -0.18 -5.35 2.25 1.44
Dcu_g36503 (ECA4)
-5.05 -5.81 0.69 -4.21 -3.9 -0.88 -1.93 -0.2 -5.07 2.46 0.99
Dcu_g37266 (VPS60.1)
- -4.74 0.35 - - -0.83 -1.76 0.24 - 2.35 1.35
- -5.17 0.56 -6.88 -4.62 -0.94 -1.95 -0.28 -4.69 2.37 1.39
- -6.13 0.44 -2.86 -4.33 -0.72 -2.67 -0.09 -5.85 2.4 1.29
Dcu_g40998 (PGM)
-8.58 -7.16 0.75 -3.31 -4.59 -1.01 -1.78 -0.05 -6.01 2.38 1.13
- -6.84 0.51 -3.38 -4.06 -0.67 -2.64 0.24 - 2.29 1.36
-5.65 -7.43 0.73 -2.78 -5.74 -1.06 -1.77 0.22 -4.97 2.26 1.25
- - 0.22 -3.32 -5.4 -1.12 -2.13 0.12 -3.58 2.35 1.47
Dcu_g43439 (IAR4)
-5.15 -3.56 0.65 -3.29 -5.29 -0.64 -1.7 -0.11 -6.47 2.23 1.38
-5.81 -4.91 0.85 -3.98 -3.93 -0.72 -2.01 -0.1 -6.46 2.34 1.09
Dcu_g44023 (UBA 2)
- - 0.6 -4.19 -4.29 -1.36 -1.77 -0.19 -5.03 2.25 1.6
Dcu_g44459 (APM1)
-6.42 -4.42 0.71 -3.32 -4.01 -0.81 -2.11 -0.23 -5.96 2.3 1.34
-5.41 -5.28 0.74 -3.57 -3.2 -0.82 -1.82 -0.26 -4.64 2.27 1.36
Dcu_g44849 (GATA20)
- -4.48 0.4 -2.75 -4.81 -0.79 -1.7 -0.22 -7.14 2.39 1.29
Dcu_g49673 (UPL1)
- -5.64 0.19 -3.55 -4.1 -0.76 -2.55 0.12 -4.78 2.3 1.53
-4.67 -3.19 0.41 -4.23 -4.15 -1.23 -1.31 0.06 - 2.31 1.37
Dcu_g49884 (FIB1)
- - 0.82 -5.48 -4.09 -1.37 -1.65 -0.28 -5.62 2.46 1.07
Dcu_g49900 (HSC70-5)
-6.23 -6.26 0.15 -3.86 -4.03 -0.67 -1.39 0.16 -5.11 2.26 1.47
-4.86 -5.06 0.26 -3.07 -4.18 -0.76 -1.62 -0.04 -4.59 2.27 1.49
-7.09 -5.37 0.21 -2.99 -4.37 -0.65 -2.15 -0.4 -5.68 2.32 1.58
- -5.55 0.26 -2.69 -3.59 -0.94 -1.72 0.31 -5.03 2.37 1.18
-6.36 -7.29 0.1 -3.09 -4.13 -0.68 -2.01 0.03 -5.12 2.3 1.53
- -5.34 0.83 -6.05 -3.59 -0.73 -1.88 -0.25 -6.19 2.39 1.1
Dcu_g51010 (ORF240B)
- -5.39 0.51 -2.94 -4.71 -1.28 -1.97 -0.05 -5.46 2.4 1.29
Dcu_g51302 (THFS)
-6.1 -4.59 0.67 -3.55 -3.89 -0.83 -2.04 -0.1 -5.58 2.35 1.23
-6.72 -4.63 0.43 -3.64 -4.38 -1.05 -1.98 -0.15 -5.22 2.41 1.33
- -4.25 0.59 -3.08 -5.02 -0.65 -1.93 0.14 -7.27 2.29 1.25

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.