Heatmap: Cluster_28 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Young Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Primary Rachis	Secondary Rachis	Petiole	Meristem	Rhizome	Crozier	Young Root	Mature Root
Dcu_g00530	0.3	0.32	1.0	0.58	0.65	0.63	0.22	0.55	0.68	0.45	0.41
Dcu_g02533	0.3	0.17	1.0	0.04	0.12	0.22	0.34	0.47	0.52	0.44	0.79
Dcu_g02675	0.06	0.0	1.0	0.03	0.05	0.17	0.18	0.3	0.15	0.7	0.34
Dcu_g02739	0.51	0.4	1.0	1.0	0.76	0.66	0.66	0.71	0.56	0.82	0.72
Dcu_g03018 (KCS4)	0.14	0.04	1.0	0.11	0.15	0.38	0.17	0.57	0.65	0.82	0.6
Dcu_g03164 (KUP3)	0.44	0.23	0.82	0.52	0.31	0.22	0.58	0.39	0.56	0.88	1.0
Dcu_g04349	0.17	0.05	0.48	0.15	0.11	1.0	0.19	0.56	0.47	0.66	0.47
Dcu_g04406	0.3	0.04	1.0	0.21	0.28	0.8	0.34	0.39	0.28	0.95	0.87
Dcu_g04453	0.47	0.22	1.0	0.45	0.44	0.85	0.54	0.58	0.5	0.53	0.46
Dcu_g04469	0.06	0.03	1.0	0.94	0.69	0.96	0.36	0.5	0.33	0.56	0.61
Dcu_g04486 (UPP)	0.4	0.22	1.0	0.41	0.44	0.54	0.57	0.73	0.67	0.78	0.64
Dcu_g04534	0.19	0.13	0.47	0.86	1.0	0.51	0.56	0.61	0.52	0.44	0.34
Dcu_g04830	0.35	0.13	0.49	0.58	0.57	0.71	0.41	0.52	0.38	1.0	0.98
Dcu_g05118 (PFN3)	0.09	0.06	0.78	0.51	0.54	1.0	0.39	0.68	0.23	0.58	0.4
Dcu_g05213 (NAC057)	0.18	0.01	0.72	0.22	0.11	0.65	0.18	0.7	0.28	1.0	0.9
Dcu_g05494	0.2	0.02	1.0	0.83	0.07	0.03	0.72	0.61	0.92	0.72	0.61
Dcu_g05518 (DPBF3)	0.82	0.28	0.95	0.64	0.58	0.73	0.68	0.73	0.84	0.98	1.0
Dcu_g06417	0.38	0.31	0.51	0.52	0.58	0.53	0.99	0.71	0.69	1.0	0.86
Dcu_g08062	0.43	0.22	1.0	0.43	0.41	0.49	0.68	0.58	0.74	0.62	0.67
Dcu_g08142	0.26	0.06	0.65	0.51	0.43	0.4	0.68	0.83	0.48	1.0	0.7
Dcu_g09819	0.03	0.0	0.52	0.0	0.06	0.11	0.09	0.26	0.19	1.0	0.6
Dcu_g11426 (TET3)	0.12	0.0	0.5	0.08	0.05	1.0	0.1	0.41	0.2	0.21	0.16
Dcu_g12993 (HSP21)	0.07	0.01	0.44	0.1	0.08	1.0	0.09	0.42	0.27	0.57	0.29
Dcu_g13237 (LBD15)	0.07	0.01	0.55	0.04	0.02	0.01	0.15	0.33	0.13	1.0	0.84
Dcu_g13405	0.04	0.04	1.0	0.15	0.12	0.2	0.15	0.62	0.16	0.61	0.49
Dcu_g14090 (GDU5)	0.03	0.02	0.47	0.59	0.33	1.0	0.17	0.44	0.27	0.99	1.0
Dcu_g14091	0.06	0.0	1.0	0.1	0.08	0.12	0.09	0.2	0.7	0.28	0.21
Dcu_g15340	0.18	0.06	1.0	0.23	0.43	0.36	0.36	0.59	0.38	0.79	0.34
Dcu_g15733	0.21	0.11	0.79	0.76	1.0	0.56	0.58	0.63	0.61	0.56	0.36
Dcu_g17521 (CLI1)	0.21	0.14	0.55	0.15	0.06	0.03	0.19	0.3	0.3	1.0	0.97
Dcu_g18173	0.1	0.03	0.55	0.08	0.08	0.86	0.1	0.44	0.05	0.38	1.0
Dcu_g18299	0.46	0.14	1.0	0.82	0.91	0.27	0.67	0.57	0.37	0.57	0.54
Dcu_g18636	0.11	0.01	1.0	0.19	0.15	0.18	0.35	0.53	0.58	0.6	0.36
Dcu_g18691	0.09	0.0	0.77	0.04	0.03	0.14	0.17	0.33	0.41	1.0	0.63
Dcu_g19993	0.25	0.05	0.8	0.66	0.69	0.59	0.6	0.47	0.45	0.53	1.0
Dcu_g21226 (NPC1)	0.39	0.13	1.0	0.66	0.76	0.28	0.62	0.52	0.5	0.43	0.41
Dcu_g21442	0.54	0.42	0.67	0.53	0.62	0.63	0.92	0.92	0.69	1.0	0.92
Dcu_g22947	0.18	0.07	1.0	0.33	0.35	0.78	0.51	0.78	0.83	0.46	0.34
Dcu_g27801	0.09	0.03	0.98	1.0	0.12	0.49	0.63	0.41	0.44	0.27	0.45
Dcu_g30520	0.07	0.03	0.78	0.05	0.05	0.41	0.03	0.42	0.11	1.0	0.8
Dcu_g33658 (5PTASE11)	0.21	0.0	1.0	0.02	0.06	0.1	0.32	0.21	0.49	0.74	0.92
Dcu_g34230	0.0	0.0	0.75	0.31	0.25	0.67	0.41	0.27	0.45	0.88	1.0
Dcu_g35414 (ISA1)	0.37	0.11	1.0	0.29	0.22	0.34	0.47	0.46	0.54	0.53	0.47
Dcu_g35621	0.47	0.33	1.0	0.33	0.26	0.2	0.5	0.24	0.62	0.71	0.77
Dcu_g36178	0.22	0.01	1.0	0.62	0.71	0.06	0.95	0.01	0.0	0.01	0.01
Dcu_g36704	0.3	0.0	1.0	0.04	0.03	0.83	0.15	0.22	0.12	0.21	0.34
Dcu_g37020 (BGAL3)	0.22	0.08	0.78	0.13	0.18	1.0	0.28	0.43	0.38	0.56	0.53
Dcu_g39539	0.08	0.03	1.0	0.15	0.16	0.47	0.27	0.68	0.36	0.52	0.9
Dcu_g39742	0.01	0.0	1.0	0.29	0.02	0.33	0.06	0.41	0.03	0.28	0.31
Dcu_g40471	0.08	0.04	1.0	0.12	0.09	0.1	0.33	0.42	0.49	0.6	0.34
Dcu_g40994	0.15	0.02	0.79	0.34	1.0	0.23	0.34	0.38	0.21	0.21	0.39
Dcu_g41124	0.02	0.0	0.38	0.24	0.04	0.01	0.07	0.06	0.0	1.0	0.61
Dcu_g42631	0.13	0.08	0.55	0.74	1.0	0.28	0.59	0.42	0.28	0.53	0.46
Dcu_g44567 (HVA22K)	0.33	0.15	0.9	0.76	0.76	1.0	0.56	0.79	0.4	0.62	0.48
Dcu_g45484	0.22	0.08	0.77	0.5	0.5	0.4	0.61	0.86	0.39	1.0	0.69
Dcu_g46604	0.4	0.29	1.0	0.59	0.86	0.97	0.79	0.97	0.94	0.7	0.39
Dcu_g48404	0.21	0.11	0.63	0.67	0.55	0.81	0.46	0.54	0.22	1.0	0.73
Dcu_g50673 (LACS4)	0.22	0.06	1.0	0.2	0.19	0.91	0.33	0.46	0.35	0.29	0.23
Dcu_g51497 (IBO1)	0.19	0.14	0.59	0.29	0.32	0.29	0.38	0.4	0.41	1.0	0.85
Dcu_g51914	0.23	0.04	1.0	0.17	0.23	0.37	0.29	0.45	0.55	0.68	0.56

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)