Heatmap: Cluster_54 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Meristem
Rhizome
Crozier
Young Root
Mature Root
Dcu_g04647 (HPD)
61.7 109.75 54.08 11.13 10.59 19.91 15.2 23.29 18.5 37.03 41.17
14.84 28.19 14.84 4.38 1.4 1.46 4.1 2.58 2.3 7.67 7.57
23.77 36.89 15.14 3.09 2.1 0.63 2.63 4.11 3.48 5.77 7.71
21.68 46.26 19.96 2.84 2.39 1.0 3.66 5.3 5.8 4.1 7.96
1.73 9.92 5.26 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.97 4.12 0.55 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.39 8.43 1.15 0.0 0.14 2.3 0.33 1.02 0.16 1.49 2.15
3.71 24.68 3.05 1.05 1.18 0.0 0.63 0.02 0.05 0.24 1.45
1.64 4.39 1.02 0.05 0.04 0.04 0.07 0.11 0.12 0.21 0.42
1.25 2.74 0.95 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.4 2.02 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.59 4.71 0.5 0.03 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05
2.06 2.58 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.49 4.34 1.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dcu_g21265 (ALDH2)
0.47 3.66 0.38 0.15 0.16 0.0 0.15 0.04 0.0 0.04 0.15
1.74 4.24 0.65 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.05 2.92 0.79 0.0 0.05 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.27
0.89 4.4 1.96 0.31 0.23 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.32 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.45 2.81 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.02 2.61 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.44 1.85 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.78 5.69 1.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 2.19 0.09 0.0 0.09 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
1.71 1.07 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 3.46 1.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.38 6.71 2.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dcu_g22235 (STP1)
0.58 3.22 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.63 1.95 0.75 0.0 0.05 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
Dcu_g22760 (ACS)
0.23 2.35 0.15 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.74 5.59 0.74 0.16 0.12 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.88
0.43 3.42 0.95 0.27 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.21 9.69 1.41 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 1.92 0.06 0.0 0.07 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0
1.49 1.9 0.19 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.79 6.6 1.68 0.18 0.66 0.0 0.33 0.0 0.0 0.51 0.0
0.67 3.96 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.74 3.41 1.41 0.14 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.32 3.52 0.94 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26
8.58 15.86 6.16 0.15 0.0 0.08 0.23 0.09 0.0 0.81 1.46
0.72 8.24 0.42 0.13 0.11 0.0 0.22 0.0 0.0 0.37 0.12
Dcu_g23556 (FKBP15-1)
1.33 1.87 0.24 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.68 4.87 1.46 0.12 0.0 0.13 0.36 0.0 0.0 0.0 0.36
0.78 12.42 0.63 1.14 0.06 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 9.54 0.33 0.24 0.19 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0
Dcu_g23875 (AAE1)
4.04 8.19 1.83 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.63 0.55
2.6 4.59 1.07 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.87 3.59 0.79 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.19
0.46 1.95 0.0 0.1 0.07 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.43 2.03 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.66 5.61 2.31 0.32 0.11 0.28 1.16 0.04 0.05 0.23 1.89
1.79 2.89 1.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.71 2.94 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.42 4.01 0.2 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 2.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.82 4.05 0.8 0.0 0.04 0.0 0.5 0.28 0.0 0.0 0.26
0.94 3.73 0.48 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02
0.0 1.9 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dcu_g24514 (BG1)
20.88 53.56 17.37 0.13 0.18 0.06 1.69 0.22 0.95 0.52 3.0
0.69 2.41 0.26 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0
0.52 4.28 0.79 0.54 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 8.87 0.64 0.64 0.0 0.0 1.13 0.38 0.0 0.5 1.44
1.46 4.21 1.23 0.48 0.06 0.24 0.3 0.37 0.35 0.52 0.42
4.54 5.19 2.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.31 3.92 1.64 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.93 2.87 0.29 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.12 3.24 1.02 0.45 0.03 0.0 0.06 0.1 0.04 0.53 0.31
0.13 2.11 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.21 2.65 1.07 0.0 0.0 0.0 0.11 0.14 0.0 0.0 0.38
5.65 4.63 2.4 0.07 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 2.23 0.54 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dcu_g44594 (CTF2A)
2.02 5.03 2.48 0.99 0.72 0.17 1.12 0.71 0.79 0.67 1.07
1.74 3.05 1.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.91 3.72 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.73 4.69 0.68 0.14 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.13
0.84 5.43 0.83 0.17 0.05 0.06 0.34 0.05 0.0 0.0 0.49
3.77 4.58 1.71 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
3.73 7.15 2.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 1.77 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.34 2.25 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.72 2.55 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.63 2.24 0.53 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
1.83 1.87 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.24 1.84 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.13 2.44 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.51 2.47 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.53 2.44 0.4 0.12 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.81 7.98 2.3 0.12 0.0 0.0 0.35 0.42 0.0 0.0 0.0
1.85 1.94 0.89 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.56 4.72 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.59 2.13 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
11.34 20.61 13.42 1.99 0.52 0.86 2.79 0.94 1.77 1.73 2.09
2.04 5.29 1.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
10.75 47.84 15.4 1.48 2.24 0.41 1.84 0.84 0.2 0.38 0.81
Dcu_g49170 (REF1)
2.99 3.97 1.49 0.25 0.07 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.13
6.26 9.11 3.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
1.96 5.85 1.1 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)