Heatmap: Cluster_59 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Young Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Primary Rachis	Secondary Rachis	Petiole	Meristem	Rhizome	Crozier	Young Root	Mature Root
Dcu_g00546	1.0	0.71	0.78	0.38	0.31	0.45	0.46	0.48	0.63	0.5	0.43
Dcu_g00652 (LEJ1)	1.0	0.68	0.82	0.39	0.38	0.56	0.43	0.52	0.44	0.52	0.49
Dcu_g00726 (emb1473)	1.0	0.51	0.67	0.14	0.14	0.19	0.22	0.21	0.26	0.23	0.19
Dcu_g00785	1.0	0.82	0.93	0.3	0.36	0.33	0.27	0.36	0.32	0.42	0.47
Dcu_g00936	1.0	0.67	0.72	0.23	0.3	0.4	0.4	0.33	0.45	0.41	0.35
Dcu_g00949	0.99	0.56	1.0	0.08	0.07	0.06	0.15	0.15	0.15	0.38	0.19
Dcu_g01016	0.97	0.9	1.0	0.28	0.34	0.49	0.35	0.45	0.29	0.42	0.38
Dcu_g01061	1.0	0.65	0.82	0.17	0.2	0.46	0.31	0.4	0.35	0.39	0.27
Dcu_g01251	0.9	0.79	1.0	0.3	0.31	0.43	0.29	0.36	0.36	0.36	0.32
Dcu_g01252	1.0	0.56	0.8	0.15	0.18	0.19	0.19	0.25	0.27	0.23	0.18
Dcu_g01307 (NFU1)	1.0	0.76	0.82	0.25	0.26	0.28	0.26	0.26	0.28	0.26	0.28
Dcu_g01390	1.0	0.57	0.73	0.25	0.22	0.37	0.28	0.25	0.31	0.38	0.33
Dcu_g01391	1.0	0.7	0.89	0.28	0.3	0.42	0.36	0.34	0.32	0.47	0.48
Dcu_g01449 (LUT1)	1.0	0.51	0.78	0.4	0.35	0.44	0.47	0.46	0.6	0.43	0.46
Dcu_g01470 (STN8)	1.0	0.49	0.6	0.09	0.06	0.11	0.15	0.08	0.15	0.11	0.07
Dcu_g01523 (SUFS)	0.98	0.72	1.0	0.42	0.45	0.57	0.52	0.51	0.49	0.49	0.5
Dcu_g01607 (HCF173)	1.0	0.66	0.72	0.08	0.08	0.2	0.18	0.12	0.19	0.15	0.12
Dcu_g01661 (FC2)	1.0	0.49	0.92	0.38	0.38	0.35	0.46	0.38	0.4	0.35	0.36
Dcu_g01688 (EGY1)	1.0	0.76	0.77	0.12	0.13	0.17	0.15	0.13	0.18	0.15	0.13
Dcu_g02296	1.0	0.79	0.84	0.03	0.03	0.06	0.06	0.05	0.08	0.04	0.03
Dcu_g02518	1.0	0.6	0.8	0.3	0.35	0.27	0.32	0.26	0.28	0.28	0.27
Dcu_g02591 (CLPR4)	1.0	0.66	0.89	0.38	0.38	0.48	0.45	0.5	0.53	0.54	0.47
Dcu_g02599 (QPT)	1.0	0.74	0.91	0.44	0.46	0.53	0.42	0.4	0.41	0.43	0.46
Dcu_g02656	1.0	0.91	0.84	0.3	0.3	0.38	0.33	0.39	0.33	0.33	0.37
Dcu_g02684	1.0	0.58	0.75	0.1	0.11	0.16	0.12	0.09	0.12	0.07	0.07
Dcu_g02771 (mtLPD2)	1.0	0.57	0.67	0.26	0.26	0.38	0.27	0.36	0.33	0.4	0.38
Dcu_g02809	1.0	0.69	0.88	0.42	0.4	0.36	0.46	0.4	0.58	0.38	0.39
Dcu_g02819	1.0	0.56	0.85	0.04	0.04	0.14	0.07	0.04	0.1	0.06	0.05
Dcu_g02920	1.0	0.49	0.85	0.16	0.15	0.11	0.18	0.09	0.1	0.1	0.11
Dcu_g02968 (SCY1)	1.0	0.62	0.8	0.15	0.17	0.2	0.25	0.22	0.26	0.21	0.21
Dcu_g03038	1.0	0.68	0.9	0.15	0.15	0.14	0.17	0.08	0.11	0.08	0.07
Dcu_g03119 (ARC6)	1.0	0.56	0.8	0.26	0.25	0.4	0.31	0.34	0.37	0.43	0.39
Dcu_g03176 (MRL1)	1.0	0.4	0.69	0.17	0.2	0.16	0.25	0.2	0.26	0.25	0.25
Dcu_g03428	1.0	0.55	0.87	0.14	0.13	0.09	0.14	0.01	0.07	0.01	0.01
Dcu_g03552	1.0	0.55	0.65	0.15	0.16	0.2	0.22	0.2	0.27	0.27	0.24
Dcu_g03592 (PTAC4)	1.0	0.44	0.84	0.32	0.33	0.37	0.38	0.29	0.38	0.34	0.3
Dcu_g03648	1.0	0.64	0.76	0.27	0.29	0.41	0.37	0.49	0.55	0.42	0.41
Dcu_g03676	1.0	0.55	0.74	0.34	0.31	0.35	0.45	0.42	0.59	0.58	0.49
Dcu_g03694 (PGR7)	1.0	0.63	0.75	0.35	0.33	0.37	0.42	0.38	0.53	0.48	0.45
Dcu_g03892 (ALB3)	1.0	0.73	0.87	0.16	0.16	0.23	0.21	0.16	0.15	0.19	0.2
Dcu_g03940 (GR)	1.0	0.56	0.95	0.44	0.45	0.34	0.4	0.33	0.29	0.35	0.32
Dcu_g04092 (GLDP2)	1.0	0.54	0.86	0.08	0.11	0.21	0.12	0.06	0.07	0.05	0.04
Dcu_g04517 (CYP20-2)	1.0	0.71	0.94	0.35	0.34	0.46	0.42	0.56	0.55	0.57	0.45
Dcu_g05357	1.0	0.6	0.78	0.4	0.4	0.4	0.55	0.5	0.67	0.46	0.43
Dcu_g05693 (SIGB)	1.0	0.53	0.88	0.21	0.21	0.21	0.36	0.16	0.28	0.18	0.17
Dcu_g05732	1.0	0.48	0.83	0.11	0.13	0.12	0.14	0.08	0.13	0.07	0.07
Dcu_g05825 (FUG1)	1.0	0.42	0.76	0.14	0.13	0.17	0.18	0.13	0.23	0.15	0.14
Dcu_g06155	1.0	0.7	0.72	0.13	0.13	0.16	0.15	0.13	0.18	0.14	0.13
Dcu_g06165	1.0	0.44	0.58	0.09	0.08	0.24	0.17	0.22	0.27	0.23	0.17
Dcu_g06429 (OTP86)	1.0	0.54	0.67	0.24	0.22	0.34	0.29	0.37	0.61	0.38	0.31
Dcu_g06433 (CRR22)	1.0	0.39	0.89	0.04	0.03	0.08	0.16	0.12	0.25	0.13	0.08
Dcu_g06462	1.0	0.34	0.77	0.17	0.2	0.18	0.19	0.14	0.21	0.18	0.17
Dcu_g06870 (EMB1241)	1.0	0.63	0.76	0.47	0.43	0.57	0.44	0.48	0.51	0.49	0.46
Dcu_g07041 (HXK1)	1.0	0.58	0.94	0.07	0.06	0.05	0.12	0.12	0.11	0.42	0.2
Dcu_g07096 (PTAC2)	1.0	0.47	0.89	0.24	0.24	0.39	0.34	0.38	0.41	0.41	0.39
Dcu_g07416 (MCD1)	1.0	0.63	0.87	0.44	0.41	0.49	0.51	0.49	0.6	0.51	0.45
Dcu_g07930	1.0	0.66	0.78	0.33	0.21	0.24	0.36	0.34	0.4	0.36	0.32
Dcu_g08135 (RPS1)	1.0	0.72	0.75	0.33	0.32	0.31	0.33	0.28	0.34	0.31	0.3
Dcu_g08163 (GCN5)	1.0	0.38	0.81	0.24	0.2	0.1	0.18	0.09	0.09	0.1	0.07
Dcu_g08218	1.0	0.59	0.78	0.27	0.24	0.32	0.23	0.2	0.18	0.22	0.22
Dcu_g08854	1.0	0.58	0.94	0.39	0.42	0.45	0.51	0.62	0.67	0.54	0.47
Dcu_g09071 (DCT)	1.0	0.54	0.65	0.17	0.17	0.33	0.18	0.29	0.29	0.33	0.31
Dcu_g09097	1.0	0.49	0.68	0.24	0.21	0.22	0.3	0.23	0.32	0.25	0.21
Dcu_g09427	1.0	0.52	0.88	0.32	0.29	0.32	0.41	0.33	0.41	0.32	0.3
Dcu_g09613 (DFB)	1.0	0.58	1.0	0.11	0.14	0.07	0.14	0.12	0.05	0.5	0.36
Dcu_g09837 (CTF2A)	1.0	0.79	0.85	0.3	0.33	0.4	0.32	0.36	0.35	0.46	0.47
Dcu_g10022 (CYP38)	1.0	0.47	0.8	0.09	0.1	0.16	0.14	0.12	0.17	0.13	0.1
Dcu_g10119 (Deg1)	1.0	0.5	0.74	0.22	0.24	0.33	0.28	0.25	0.35	0.29	0.27
Dcu_g10309	1.0	0.58	0.71	0.1	0.12	0.12	0.12	0.08	0.08	0.12	0.05
Dcu_g10380 (TIC55-II)	1.0	0.86	0.81	0.3	0.34	0.29	0.36	0.3	0.38	0.26	0.33
Dcu_g10448	0.81	0.6	1.0	0.32	0.32	0.29	0.31	0.25	0.22	0.38	0.32
Dcu_g11507	1.0	0.78	0.83	0.27	0.29	0.2	0.37	0.18	0.24	0.17	0.22
Dcu_g11508 (SVR2)	1.0	0.68	0.9	0.29	0.29	0.26	0.32	0.24	0.28	0.26	0.28
Dcu_g11871	1.0	0.54	0.78	0.24	0.25	0.37	0.38	0.37	0.48	0.39	0.43
Dcu_g11988	1.0	0.45	0.84	0.19	0.18	0.26	0.22	0.26	0.27	0.23	0.19
Dcu_g12175 (ZEP)	1.0	0.55	0.83	0.08	0.1	0.13	0.14	0.13	0.19	0.13	0.08
Dcu_g12329	1.0	0.64	0.73	0.14	0.13	0.22	0.19	0.17	0.23	0.13	0.1
Dcu_g12562 (PTAC5)	1.0	0.5	0.93	0.05	0.06	0.05	0.07	0.05	0.07	0.07	0.06
Dcu_g12584 (ZKT)	1.0	0.48	0.8	0.08	0.1	0.18	0.12	0.12	0.15	0.11	0.1
Dcu_g13018	1.0	0.58	0.75	0.11	0.1	0.16	0.18	0.16	0.2	0.2	0.12
Dcu_g13470	1.0	0.49	0.87	0.32	0.33	0.33	0.32	0.31	0.31	0.3	0.31
Dcu_g13601 (TROL)	1.0	0.55	0.62	0.19	0.18	0.23	0.28	0.21	0.28	0.2	0.2
Dcu_g14054	1.0	0.64	0.94	0.25	0.26	0.39	0.32	0.37	0.46	0.26	0.34
Dcu_g14140 (HHOA)	1.0	0.69	0.9	0.26	0.28	0.29	0.33	0.27	0.33	0.28	0.25
Dcu_g14380	1.0	0.7	0.81	0.17	0.16	0.18	0.22	0.18	0.19	0.2	0.18
Dcu_g14382	1.0	0.67	0.84	0.06	0.06	0.08	0.08	0.03	0.07	0.03	0.01
Dcu_g14466	1.0	0.79	0.88	0.08	0.12	0.1	0.13	0.03	0.1	0.03	0.01
Dcu_g14491 (LPA3)	1.0	0.48	0.85	0.14	0.14	0.23	0.3	0.24	0.37	0.22	0.19
Dcu_g14509 (SHM2)	1.0	0.4	0.76	0.07	0.04	0.07	0.13	0.01	0.08	0.06	0.05
Dcu_g14554 (STM)	1.0	0.51	0.83	0.12	0.14	0.23	0.13	0.09	0.12	0.08	0.07
Dcu_g14608 (PHR2)	1.0	0.64	0.73	0.27	0.28	0.37	0.36	0.4	0.48	0.4	0.37
Dcu_g14710	1.0	0.48	0.79	0.38	0.33	0.37	0.41	0.44	0.49	0.41	0.39
Dcu_g14711	1.0	0.62	0.87	0.29	0.31	0.22	0.29	0.2	0.18	0.22	0.15
Dcu_g14731 (ATS1)	1.0	0.57	0.85	0.3	0.29	0.3	0.36	0.23	0.33	0.27	0.3
Dcu_g14820 (LIP1)	1.0	0.72	0.85	0.4	0.38	0.43	0.41	0.41	0.43	0.4	0.39
Dcu_g14931	1.0	0.57	0.81	0.25	0.24	0.36	0.26	0.18	0.2	0.16	0.13
Dcu_g15115	1.0	0.56	0.67	0.38	0.41	0.38	0.34	0.35	0.34	0.33	0.39
Dcu_g15253	1.0	0.55	0.67	0.16	0.17	0.26	0.22	0.25	0.29	0.24	0.2
Dcu_g15327	1.0	0.77	0.87	0.17	0.22	0.29	0.22	0.24	0.25	0.25	0.26
Dcu_g15380 (PTAC4)	1.0	0.6	0.98	0.45	0.38	0.38	0.44	0.34	0.36	0.35	0.33
Dcu_g15483 (HEME1)	1.0	0.56	0.58	0.23	0.21	0.24	0.25	0.28	0.37	0.35	0.28
Dcu_g16059 (APX6)	1.0	0.52	0.96	0.34	0.35	0.31	0.33	0.29	0.42	0.23	0.22
Dcu_g16384	1.0	0.5	0.66	0.17	0.21	0.24	0.24	0.17	0.3	0.15	0.13
Dcu_g16627	1.0	0.47	0.68	0.1	0.14	0.18	0.16	0.14	0.17	0.1	0.07
Dcu_g17060	1.0	0.73	0.81	0.49	0.37	0.46	0.49	0.48	0.53	0.46	0.5
Dcu_g17091	1.0	0.57	0.77	0.4	0.41	0.29	0.43	0.34	0.42	0.34	0.34
Dcu_g18361	1.0	0.47	0.55	0.12	0.11	0.16	0.15	0.15	0.18	0.18	0.14
Dcu_g18387 (PLSP1)	1.0	0.69	0.79	0.3	0.26	0.29	0.25	0.35	0.26	0.38	0.29
Dcu_g18588	1.0	0.73	0.82	0.25	0.22	0.31	0.32	0.27	0.34	0.2	0.18
Dcu_g18988 (NDC1)	1.0	0.48	0.79	0.39	0.34	0.38	0.42	0.39	0.37	0.28	0.24
Dcu_g19621	1.0	0.81	0.89	0.3	0.29	0.36	0.39	0.41	0.41	0.38	0.3
Dcu_g20050 (DEF2)	1.0	0.51	0.82	0.19	0.17	0.21	0.26	0.28	0.38	0.26	0.22
Dcu_g20184 (TS)	1.0	0.63	0.7	0.32	0.37	0.33	0.33	0.28	0.31	0.31	0.31
Dcu_g20213	1.0	0.46	0.69	0.28	0.25	0.17	0.26	0.23	0.28	0.28	0.27
Dcu_g20598	1.0	0.52	0.79	0.07	0.06	0.31	0.11	0.13	0.08	0.12	0.08
Dcu_g20883 (LUT5)	1.0	0.39	0.67	0.1	0.1	0.1	0.1	0.0	0.06	0.01	0.01
Dcu_g21154	1.0	0.76	0.77	0.23	0.24	0.27	0.32	0.31	0.42	0.3	0.31
Dcu_g21464 (STM)	1.0	0.43	0.89	0.08	0.07	0.06	0.12	0.02	0.03	0.06	0.05
Dcu_g24022	1.0	0.47	0.89	0.16	0.13	0.14	0.17	0.07	0.12	0.16	0.12
Dcu_g24032	1.0	0.45	0.85	0.18	0.16	0.18	0.2	0.1	0.11	0.1	0.09
Dcu_g24054 (ftsh9)	1.0	0.3	0.61	0.02	0.02	0.08	0.17	0.05	0.2	0.11	0.06
Dcu_g24228	1.0	0.66	0.79	0.4	0.33	0.47	0.46	0.57	0.52	0.58	0.54
Dcu_g24380	1.0	0.52	0.86	0.21	0.17	0.24	0.43	0.21	0.33	0.24	0.25
Dcu_g25531	1.0	0.36	0.7	0.05	0.07	0.16	0.12	0.13	0.16	0.12	0.08
Dcu_g32107	1.0	0.62	0.68	0.27	0.27	0.4	0.3	0.37	0.4	0.49	0.39
Dcu_g32346 (GATB)	1.0	0.54	0.74	0.43	0.35	0.48	0.43	0.57	0.51	0.52	0.47
Dcu_g33038 (CYP38)	1.0	0.43	0.72	0.18	0.16	0.28	0.26	0.2	0.29	0.23	0.22
Dcu_g36105	1.0	0.48	0.89	0.03	0.03	0.16	0.06	0.05	0.09	0.06	0.05
Dcu_g36193	1.0	0.43	0.86	0.11	0.08	0.09	0.11	0.07	0.09	0.07	0.05
Dcu_g36340	1.0	0.46	0.65	0.15	0.14	0.3	0.28	0.33	0.44	0.37	0.3
Dcu_g36364	1.0	0.61	0.61	0.07	0.06	0.14	0.09	0.06	0.16	0.08	0.07
Dcu_g37478 (FER2)	1.0	0.79	0.86	0.34	0.35	0.42	0.32	0.36	0.35	0.36	0.32
Dcu_g37543	1.0	0.5	0.69	0.15	0.15	0.35	0.19	0.25	0.26	0.23	0.15
Dcu_g37720 (ABC1)	1.0	0.66	0.74	0.35	0.36	0.39	0.36	0.36	0.4	0.38	0.42
Dcu_g39518	1.0	0.56	0.76	0.24	0.2	0.19	0.24	0.22	0.19	0.3	0.21
Dcu_g39843 (DUF3)	1.0	0.66	0.79	0.2	0.21	0.37	0.32	0.36	0.37	0.22	0.23
Dcu_g40782	1.0	0.68	0.85	0.23	0.22	0.3	0.23	0.24	0.25	0.21	0.26
Dcu_g41538	1.0	0.47	0.71	0.06	0.09	0.12	0.11	0.05	0.1	0.06	0.05
Dcu_g41978 (APO2)	1.0	0.64	0.78	0.36	0.33	0.25	0.42	0.26	0.4	0.26	0.27
Dcu_g43231	1.0	0.92	0.88	0.24	0.24	0.31	0.28	0.3	0.28	0.36	0.28
Dcu_g43239	1.0	0.59	0.86	0.23	0.21	0.36	0.35	0.32	0.58	0.3	0.29
Dcu_g44210 (FTSH8)	1.0	0.73	0.66	0.11	0.18	0.12	0.18	0.04	0.1	0.05	0.04
Dcu_g44856	1.0	0.25	0.62	0.02	0.09	0.06	0.07	0.01	0.0	0.01	0.04
Dcu_g44904	1.0	0.53	0.86	0.21	0.37	0.26	0.29	0.23	0.24	0.13	0.12
Dcu_g44924	1.0	0.47	0.82	0.2	0.16	0.24	0.33	0.17	0.27	0.17	0.22
Dcu_g46221	1.0	0.53	0.75	0.08	0.1	0.17	0.17	0.21	0.22	0.17	0.16
Dcu_g46680 (PGR5-LIKE A)	1.0	0.48	0.8	0.25	0.27	0.23	0.25	0.16	0.17	0.15	0.14
Dcu_g47605	1.0	0.71	0.84	0.45	0.43	0.45	0.4	0.38	0.32	0.39	0.45
Dcu_g47860	1.0	0.63	0.82	0.52	0.43	0.45	0.5	0.49	0.65	0.45	0.42
Dcu_g48346	1.0	0.85	0.84	0.03	0.04	0.04	0.11	0.07	0.13	0.11	0.09
Dcu_g49354 (SHM2)	1.0	0.44	0.97	0.07	0.06	0.05	0.14	0.01	0.07	0.05	0.06
Dcu_g51580 (NS1)	1.0	0.5	0.84	0.16	0.18	0.27	0.31	0.23	0.33	0.24	0.23

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)