Heatmap: Cluster_107 (HCCA cluster)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g006590.2.1 (Solyc00g006590.2)
- - - - - -1.82 - - -0.2 -0.14 - - - -0.09 - - - - - - - 0.85 -0.74 -1.18 -0.32 - 1.45 2.94 3.21 1.58 1.13 1.3 - -
Solyc00g026905.1.1 (Solyc00g026905.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g026907.1.1 (Solyc00g026907.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g084650.2.1 (Solyc00g084650.2)
-0.49 - - - -0.12 -1.03 -2.68 - -3.6 1.18 1.53 1.05 0.51 0.96 2.11 1.4 1.93 - - -0.05 0.47 -1.32 -1.5 -1.85 -2.67 2.07 -2.76 -1.26 -1.04 -1.96 -1.02 -0.81 - -2.45
Solyc00g125275.1.1 (Solyc00g125275.1)
- - - - -0.07 -1.58 - - - - - -1.82 - - - - - -0.4 0.6 - 2.17 0.35 -1.96 -1.79 -1.23 2.91 -2.67 1.54 3.29 0.56 -1.64 0.09 -2.12 -
Solyc01g011333.1.1 (Solyc01g011333.1)
4.13 - - - - - - - 3.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.27 - - - - - 2.61
Solyc01g012700.3.1 (Solyc01g012700.3)
- - - - - 1.59 - - 1.05 - - - - - - - 0.07 - - - - - - 0.45 -0.7 0.66 0.63 0.19 1.9 - - - 4.16 -
Solyc01g016686.1.1 (Solyc01g016686.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g056950.1.1 (Solyc01g056950.1)
- - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g059760.2.1 (Solyc01g059760.2)
- - - - 1.94 0.41 - - -0.2 - -0.81 - -1.12 -2.68 -0.92 0.31 -0.67 -2.67 -2.38 - 0.82 -0.6 - -3.26 -1.45 2.01 - 1.84 3.42 0.6 -1.65 -0.06 - -
Solyc01g059967.1.1 (Solyc01g059967.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - 1.1 - - - - - - -0.16 0.04 4.73 - 1.1 0.41 - - - - -
Solyc01g097900.1.1 (Solyc01g097900.1)
- 0.68 - - 1.8 1.7 - - - - 0.54 - 0.94 - - - - - - - - - - -1.84 - 4.42 - - -0.88 - - - - -
Solyc01g104710.3.1 (Solyc01g104710.3)
-5.18 -9.93 -4.02 -6.73 0.48 1.32 -2.35 -0.31 -0.29 0.08 -1.39 -0.83 -1.31 -2.06 0.35 1.16 0.94 - -12.67 1.46 1.31 -0.25 -0.42 -0.36 0.08 2.81 -2.53 -1.35 -0.52 -0.67 -0.56 -0.41 -0.53 -1.1
Solyc02g011720.1.1 (Solyc02g011720.1)
- - - - - - - - 4.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.55 - - - - - - -
Solyc02g014033.1.1 (Solyc02g014033.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g030525.1.1 (Solyc02g030525.1)
4.26 - - - - -3.33 - - - - -2.3 - -2.36 0.27 - - - - - - - -1.34 -2.06 -3.88 -2.2 - 0.59 2.08 1.9 0.01 -0.89 -0.95 - -0.65
Solyc02g061825.1.1 (Solyc02g061825.1)
-0.75 - - - 1.31 -0.91 -2.64 - - 3.17 0.17 -1.55 -1.06 -0.62 2.71 0.55 1.95 - - -2.25 -1.84 -2.26 - -1.03 -3.65 2.14 - -2.33 - - -1.31 - -1.09 -
Solyc02g071460.1.1 (Solyc02g071460.1)
- - - - - - - - 2.64 2.44 1.31 - 1.48 - - 3.37 1.44 - 1.03 - - - - - - - - - 0.96 - - - - -
Solyc03g071870.1.1 (Solyc03g071870.1)
-1.18 -0.19 2.61 0.98 - -0.97 -0.75 - 2.04 - -4.92 -4.07 -4.06 -2.77 - - -5.92 - - 2.81 2.73 -1.08 0.38 -0.73 -1.14 - -2.26 -2.52 -2.62 -2.81 -1.81 -2.82 -6.75 0.54
Solyc03g079907.1.1 (Solyc03g079907.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g095750.2.1 (Solyc03g095750.2)
3.93 - - - 2.46 -1.67 - - - 2.65 - - -4.4 - - - -2.38 -2.63 -2.31 -2.84 -1.35 -2.26 - -1.88 -2.03 - -2.63 -0.18 0.01 -2.1 -0.17 0.14 - -1.01
Solyc03g095753.1.1 (Solyc03g095753.1)
3.01 - - - 3.46 -1.44 - - - 2.79 - - - - - - -3.29 - - -3.3 -0.5 -0.07 - -2.11 -2.42 -2.3 -3.67 -0.44 -0.14 -1.66 -0.16 0.59 - -0.37
Solyc03g097085.1.1 (Solyc03g097085.1)
0.31 -2.38 -0.81 -1.68 0.54 0.76 -0.62 -1.15 0.64 1.08 0.17 -0.3 0.65 -0.36 1.47 2.23 1.37 -4.5 -5.38 -0.56 -2.91 -1.29 -2.05 -1.05 -0.82 0.8 -0.71 -0.19 0.07 -1.07 -0.96 -0.84 -2.07 -0.36
Solyc03g097220.1.1 (Solyc03g097220.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g116010.2.1 (Solyc03g116010.2)
- - - - - -1.56 0.75 - 1.09 0.87 -0.12 - 3.86 2.7 - - 0.39 - - - -0.13 - - - - - 0.79 -0.37 - - - - - 0.41
Solyc04g005930.1.1 (Solyc04g005930.1)
- - - - - 2.3 - - - - 4.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g017807.1.1 (Solyc04g017807.1)
- - - - - - - - -0.4 - - - - - - - - - - - - -2.17 2.65 2.08 -1.31 0.15 3.4 2.52 1.98 - - -2.44 - -0.8
Solyc04g039880.2.1 (Solyc04g039880.2)
- - - - - -1.15 - 2.25 2.13 4.32 - 1.15 - - - - - - - - - -0.01 - - - - - - - - - 0.35 - -
Solyc04g047700.1.1 (Solyc04g047700.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - 1.44 - 1.79 - - - - 0.67 4.38 - - 2.45 - - - - -
Solyc04g049270.1.1 (Solyc04g049270.1)
- - - - - 2.48 - - - - - - 4.52 - - - - - - - - 2.46 - - - - - - - - - - - -
Solyc04g050700.2.1 (Solyc04g050700.2)
2.92 - - - 1.4 -0.58 -0.82 - -0.13 3.77 2.13 0.98 - - - - - - - - - - - -0.06 - - - -2.23 - - - -1.09 - -
Solyc04g051050.1.1 (Solyc04g051050.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc04g051378.1.1 (Solyc04g051378.1)
- 2.76 - - - - 0.87 - 4.36 - - - - - - - - - - - - - - -0.36 - - - - - 2.03 - - - -
Solyc04g080145.1.1 (Solyc04g080145.1)
- - - - - 1.4 - - - - - - 2.41 2.65 - - - - - - - - 1.63 0.68 - - 1.49 2.33 2.86 - - - - -
Solyc06g008060.1.1 (Solyc06g008060.1)
3.65 - - - - -3.23 - - - 4.05 - - - - 0.94 - 0.05 - - - - - - -0.95 -0.55 - - - -0.8 - - - - -
Solyc06g024410.2.1 (Solyc06g024410.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g048683.1.1 (Solyc06g048683.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g059870.1.1 (Solyc06g059870.1)
-0.85 -10.12 -3.75 -9.96 -2.03 1.07 -2.91 0.23 1.02 1.34 1.34 1.89 -2.27 -1.54 0.01 -1.69 -0.88 - - -1.66 1.03 0.42 0.44 0.7 0.8 -4.88 -0.27 -0.38 -0.01 -0.17 -0.03 0.62 -1.2 0.67
Solyc06g064920.2.1 (Solyc06g064920.2)
1.35 1.44 - 3.07 0.49 - - 2.46 - - - - - 1.5 - 2.74 - - - - - - - -1.07 - - - - 1.08 - 0.41 - - -
Solyc07g007080.1.1 (Solyc07g007080.1)
1.18 - 3.69 0.86 - -2.36 3.36 - 1.39 - 1.17 - - - - - - - - - - - -0.13 -1.64 -1.18 - - - - - - - - -
Solyc07g017420.1.1 (Solyc07g017420.1)
- 0.44 - - -1.39 -1.45 0.93 0.54 0.85 2.0 -1.14 0.14 0.46 -0.48 - -0.44 -0.6 - - 0.85 -0.08 -0.68 0.34 -0.95 -2.58 1.32 0.1 0.34 -0.04 - 0.62 0.7 -0.08 1.29
Solyc07g025490.2.1 (Solyc07g025490.2)
0.74 0.16 -0.23 0.73 -0.59 -1.78 -0.48 -0.91 -0.78 -0.37 -2.4 -2.83 -2.38 -2.24 -0.77 -1.38 -0.72 0.26 2.22 -1.21 -1.28 0.78 0.79 0.53 0.32 -0.8 0.39 0.07 0.0 0.38 0.68 0.6 -1.49 0.35
Solyc07g032317.1.1 (Solyc07g032317.1)
- - - - - -1.66 - - - - - - 0.83 - - - - - - 1.07 - - - - - 4.84 - - - - - - - 0.15
Solyc07g042135.1.1 (Solyc07g042135.1)
- 3.55 -1.48 2.26 2.02 - -1.84 - - - - - - -2.72 - - - - - - - -1.07 -1.94 -1.31 -0.71 - -2.75 0.59 2.58 -0.54 -0.15 -1.99 - 0.55
Solyc07g043133.1.1 (Solyc07g043133.1)
3.7 - - - - 1.29 - 2.87 - 0.65 - 0.48 - -0.22 - - - - - -0.2 - 0.19 - -0.18 - - - - -1.04 - 0.83 - - 1.18
Solyc08g023340.3.1 (Solyc08g023340.3)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.04 - - - 4.13 - - - - - -
Solyc08g028707.1.1 (Solyc08g028707.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g044334.1.1 (Solyc08g044334.1)
3.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.2 - - - 2.52 3.58 - - - - -
Solyc08g044340.1.1 (Solyc08g044340.1)
- - - - - -0.31 - - - - - - - - - - - - - 2.92 - - - -0.25 - 4.36 - - 0.63 - - - - 1.45
Solyc08g044370.2.1 (Solyc08g044370.2)
- - - - 2.7 1.55 - - - - - - - - - - - -0.54 -0.72 - -0.24 1.2 - -1.87 -2.9 2.84 - 1.7 2.8 -0.16 -0.06 -0.94 - -
Solyc08g044440.1.1 (Solyc08g044440.1)
- - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g045790.1.1 (Solyc08g045790.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g059713.1.1 (Solyc08g059713.1)
- - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g061420.1.1 (Solyc08g061420.1)
- - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g011900.1.1 (Solyc09g011900.1)
- - - - - 3.35 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.74 -
Solyc09g014955.1.1 (Solyc09g014955.1)
2.1 - - - 1.69 2.08 - - - - - - - - - - - - - - 2.57 - - - - 4.03 - - - - - - - -
Solyc09g042720.1.1 (Solyc09g042720.1)
- - - - - - 2.69 - - - 3.3 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.57 2.54 - - - - -
Solyc09g056017.1.1 (Solyc09g056017.1)
- - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g057830.1.1 (Solyc09g057830.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g059813.1.1 (Solyc09g059813.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g059914.1.1 (Solyc09g059914.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g060160.2.1 (Solyc09g060160.2)
- - - - - -1.48 - - - - - - - 1.97 - - - - 2.77 - - - - - - 4.52 - - - - - - - -
Solyc09g062960.2.1 (Solyc09g062960.2)
- - - - - 1.34 3.2 3.33 1.92 -2.35 -3.48 0.92 -1.3 -1.1 -2.51 - - - - - - -3.17 0.57 -1.38 -4.04 - -2.75 -2.02 - - -1.06 - 1.19 -
Solyc09g090170.1.1 (Solyc09g090170.1)
- 1.53 - - - -1.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - -
Solyc10g018180.1.1 (Solyc10g018180.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 -
Solyc10g044495.1.1 (Solyc10g044495.1)
- - - - - 0.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.76 - - - 1.71 4.09 2.61 1.51 - - -
Solyc10g047823.1.1 (Solyc10g047823.1)
3.23 1.81 0.99 0.86 2.54 -4.15 -3.46 - - - -0.26 -2.87 -1.13 0.18 - - - - - -0.43 0.24 - - -2.13 -3.52 - -0.79 0.43 0.63 -0.49 - -2.45 - 1.14
Solyc10g049410.1.1 (Solyc10g049410.1)
- - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g049900.1.1 (Solyc10g049900.1)
- - 1.62 - - 1.59 2.64 - - - - - - - - - 0.16 - - 2.92 - 1.8 - -0.07 -0.57 - 0.29 0.21 1.8 1.03 - - - -
Solyc10g054105.1.1 (Solyc10g054105.1)
- - - - 3.06 -0.84 - - - - - - - - - - - - - - - 3.17 1.71 1.28 0.78 - 2.0 - - - - 2.23 - -
Solyc10g055025.1.1 (Solyc10g055025.1)
- - - - - - - - - - - - 4.68 - - - - - - - - - - - - - - 3.08 - - - - - -
Solyc11g013420.2.1 (Solyc11g013420.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - -
Solyc11g019935.1.1 (Solyc11g019935.1)
1.45 - 3.62 - - -1.32 1.4 - - - - - 0.97 - 1.78 - - - - 1.22 - - - - - - 1.16 - 1.27 - - - 1.83 -
Solyc11g020845.1.1 (Solyc11g020845.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.26 - - 0.59 4.04 - 1.15 3.01 1.97 - -0.01 - -
Solyc11g028025.1.1 (Solyc11g028025.1)
- - - - - -3.76 -0.86 - - - 0.52 - -0.02 - 0.81 1.35 0.63 - - -0.93 - 1.24 -0.09 0.94 -1.06 2.98 -0.61 0.25 -0.13 -0.31 -1.6 2.83 - -
Solyc11g030850.1.1 (Solyc11g030850.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g040220.2.1 (Solyc11g040220.2)
-1.24 1.96 -1.56 1.42 -2.61 -2.01 -1.13 - 2.87 - -1.98 -1.33 - -2.96 - -1.64 - - - 3.33 - -2.31 -1.01 -1.37 -0.45 - 0.49 -1.51 -0.23 -1.17 0.47 -0.56 -2.17 -2.38
Solyc11g044565.1.1 (Solyc11g044565.1)
- - - - - -1.11 - - - - - 0.97 3.94 2.15 - - - - - - - - - - - - 1.37 - 1.82 2.5 - - - -
Solyc11g051010.2.1 (Solyc11g051010.2)
- - - - - - - - 1.33 0.28 - - 4.51 1.88 - - - - - - - - - -0.56 -1.35 - -0.45 -0.22 0.23 - - - - -
Solyc11g051145.1.1 (Solyc11g051145.1)
-0.25 - - - 2.98 3.12 - - 1.9 0.22 -0.6 - - - 0.1 - - - - - - - - - - - -0.24 0.16 -0.26 - - -0.87 - 2.73
Solyc11g061814.1.1 (Solyc11g061814.1)
- - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g065450.1.1 (Solyc11g065450.1)
- - - - 3.26 2.46 - 2.95 - - - - - - - - - - - - - - 2.31 1.67 - - - - - - - - 1.61 -
Solyc12g040270.2.1 (Solyc12g040270.2)
- - - - 2.36 2.32 - - 1.38 1.14 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.06 -1.29 3.21 1.04 - - - 1.68
Solyc12g042140.2.1 (Solyc12g042140.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.31 2.57 3.05 - - - - -
Solyc12g062457.1.1 (Solyc12g062457.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g062700.1.1 (Solyc12g062700.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.76 - - - - - - 4.35 - -
Solyc12g088090.2.1 (Solyc12g088090.2)
0.7 2.51 1.75 2.65 0.6 -4.3 -4.29 -5.66 0.67 -4.79 -0.34 -1.4 1.65 2.42 - - -3.73 - - -4.13 - -2.29 -3.54 -1.84 -3.35 -0.13 -1.01 -0.6 -1.33 -1.9 -4.98 - -7.05 -0.85

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.