Heatmap: Cluster_67 (HCCA cluster)

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(Showing raw values)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g009480.3.1 (Solyc01g009480.3)
1.0 0.1 7.69 8.51 0.04 0.24 0.0 0.14 1.77 18.38 0.03 0.14 0.01 0.0 0.18 0.17 5.43 149.81 237.31 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.04 0.01 0.0 0.01 0.05 0.02 0.03 0.03 0.04 1.66
Solyc01g009600.3.1 (Solyc01g009600.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 6.2 35.17 0.0 0.0 0.01 0.0 0.21 0.21 3.21 106.53 144.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Solyc01g010880.3.1 (Solyc01g010880.3)
10.67 5.08 25.35 13.08 15.45 11.72 20.25 7.36 23.59 145.65 19.67 23.2 9.93 15.54 10.76 10.05 30.75 301.1 734.9 11.4 9.04 6.02 7.61 5.93 5.67 6.21 5.74 5.51 5.48 4.66 6.89 4.9 3.41 10.75
Solyc01g011390.2.1 (Solyc01g011390.2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.76 98.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.9 14.68 428.94 493.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
Solyc01g096170.3.1 (Solyc01g096170.3)
0.29 0.03 0.09 0.04 0.58 0.45 0.38 0.19 3.91 35.81 0.03 0.04 0.09 0.1 1.27 1.3 11.51 156.7 227.76 0.06 0.22 1.28 0.18 0.45 0.58 0.48 0.55 1.17 1.04 1.88 1.56 1.94 0.01 0.26
Solyc01g096690.2.1 (Solyc01g096690.2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.17 0.88 0.01 0.01 0.08 0.01 0.03 0.04 0.05 3.13 6.58 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01
Solyc01g097180.2.1 (Solyc01g097180.2)
0.0 0.0 0.09 0.36 0.0 0.02 0.0 0.0 18.57 111.92 0.04 0.06 0.06 0.05 0.45 1.26 18.93 232.99 836.43 0.01 0.07 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04
Solyc01g100460.3.1 (Solyc01g100460.3)
8.03 1.32 3.46 0.26 5.0 11.58 7.05 1.7 25.28 169.59 8.42 8.49 12.31 14.1 8.6 4.67 40.77 210.8 1485.34 20.2 2.8 0.63 1.12 0.92 0.86 47.82 0.8 1.26 3.0 0.68 0.59 0.78 1.84 14.28
Solyc01g103240.3.1 (Solyc01g103240.3)
0.27 0.68 0.82 0.79 0.46 0.53 0.48 0.28 13.02 104.08 0.31 0.37 0.65 0.74 1.74 1.43 13.57 128.16 816.2 0.15 1.85 2.51 3.4 2.85 2.86 0.11 2.45 2.36 2.27 1.93 2.3 1.98 0.06 0.9
Solyc01g105510.3.1 (Solyc01g105510.3)
3.73 3.6 3.97 2.71 10.23 2.93 10.13 2.12 12.65 29.55 4.61 3.0 13.68 7.2 10.86 11.04 13.07 40.1 136.34 2.23 10.65 7.18 5.3 5.93 5.96 6.98 6.43 7.37 7.91 6.29 6.69 7.52 0.08 3.51
Solyc01g107120.3.1 (Solyc01g107120.3)
1.07 0.0 0.05 0.05 0.03 0.18 0.05 0.0 0.98 12.5 0.05 0.03 0.04 0.04 0.31 0.4 1.68 12.17 68.06 0.04 0.0 0.04 0.02 0.04 0.03 0.01 0.03 0.07 0.08 0.09 0.03 0.07 0.01 1.37
Solyc01g110030.3.1 (Solyc01g110030.3)
12.41 14.87 14.96 37.41 7.54 9.08 12.81 8.6 17.95 36.89 12.17 7.21 13.56 9.93 21.83 18.72 25.53 39.43 180.15 9.94 12.35 13.24 13.13 14.9 14.56 20.77 12.63 12.63 11.78 11.49 12.0 13.23 3.18 15.88
Solyc02g021450.2.1 (Solyc02g021450.2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.23 19.4 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.33 4.18 32.23 134.82 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Solyc02g032820.3.1 (Solyc02g032820.3)
0.06 1.64 0.23 0.29 0.58 0.3 0.13 0.14 5.58 42.05 0.97 0.82 0.2 0.32 0.25 0.27 5.71 143.99 190.3 0.12 0.63 0.27 0.33 0.38 0.41 0.45 0.53 0.65 1.42 0.35 0.37 0.86 0.01 0.43
Solyc02g088320.3.1 (Solyc02g088320.3)
0.59 7.23 3.05 1.87 7.31 0.21 0.0 0.35 7.05 42.37 0.1 0.0 0.19 0.41 7.19 24.66 12.42 148.75 301.24 0.0 1.2 1.38 0.0 0.36 0.74 0.0 0.17 0.5 0.45 2.47 1.95 2.91 0.09 4.07
Solyc02g088325.1.1 (Solyc02g088325.1)
3.02 10.34 9.24 4.22 18.93 0.53 0.04 1.71 17.47 67.39 0.0 0.03 0.2 0.51 14.43 48.32 32.09 303.77 497.87 0.03 2.1 5.84 0.17 1.17 1.44 0.03 0.51 1.27 0.95 7.84 5.75 12.17 0.28 15.73
Solyc02g090150.1.1 (Solyc02g090150.1)
0.09 0.0 0.57 0.05 0.59 1.03 0.0 0.38 1.84 23.34 0.05 0.05 0.04 0.01 0.15 0.4 6.53 109.39 159.73 0.01 0.0 0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.03 0.01 0.05 0.02 0.01 0.06 0.1 0.05
Solyc03g005720.3.1 (Solyc03g005720.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.51 36.94 0.02 0.01 0.02 0.01 0.35 0.64 9.47 103.76 351.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Solyc03g006110.3.1 (Solyc03g006110.3)
0.18 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 2.26 30.74 0.0 0.0 0.13 0.01 0.28 0.53 7.71 198.4 243.07 0.25 0.11 0.01 0.0 0.01 0.0 0.09 0.08 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28
Solyc03g013310.3.1 (Solyc03g013310.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.04 57.21 0.0 0.0 0.01 0.0 0.38 0.62 10.73 137.1 505.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Solyc03g019680.3.1 (Solyc03g019680.3)
21.02 2.96 34.17 7.68 22.35 32.79 4.94 11.21 32.79 130.21 5.08 4.02 9.15 5.49 12.3 16.77 37.82 145.76 826.6 15.65 10.39 5.28 6.07 5.95 6.21 31.19 5.01 5.45 5.52 4.83 4.75 5.97 2.92 18.44
Solyc03g031770.3.1 (Solyc03g031770.3)
0.76 0.0 11.64 0.39 0.04 0.07 0.0 0.0 4.77 27.4 0.02 0.0 0.0 0.0 0.11 0.15 6.45 135.88 290.86 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
Solyc03g032240.3.1 (Solyc03g032240.3)
0.51 1.46 1.31 0.79 0.27 0.32 1.09 0.46 7.79 41.41 1.64 0.93 0.95 0.79 0.64 0.39 7.54 101.26 303.21 0.57 8.87 1.53 1.28 1.31 0.93 2.38 3.15 2.53 1.63 2.09 2.14 1.43 0.03 0.29
Solyc03g052990.3.1 (Solyc03g052990.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.22 13.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.43 7.97 30.61 170.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Solyc03g058400.3.1 (Solyc03g058400.3)
0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.02 0.07 0.03 27.42 120.66 0.03 0.07 0.82 0.68 1.45 1.87 25.18 614.35 866.12 0.02 0.04 0.05 0.06 0.01 0.01 0.0 0.53 0.31 0.23 0.16 0.07 0.06 0.0 0.0
Solyc03g058430.2.1 (Solyc03g058430.2)
21.46 14.99 11.98 68.55 6.04 25.1 9.55 24.84 41.48 145.67 2.61 1.44 4.79 3.96 1.56 2.91 41.22 355.78 1164.94 0.08 0.41 1.0 10.02 7.67 6.02 0.13 6.54 6.92 6.65 1.36 1.28 0.56 37.63 31.61
Solyc03g058890.3.1 (Solyc03g058890.3)
0.03 0.0 0.1 0.02 0.13 0.48 0.0 0.12 79.29 454.96 0.11 0.07 0.2 0.0 3.72 5.18 98.24 1668.87 2724.82 0.04 0.03 0.1 0.21 0.07 0.03 0.0 0.01 0.04 0.02 0.06 0.1 0.04 0.0 1.15
Solyc03g065205.1.1 (Solyc03g065205.1)
0.06 0.0 0.04 0.0 0.04 3.62 0.0 1.25 5.6 46.63 0.01 0.0 0.03 0.0 0.47 1.31 20.98 317.99 569.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.02
Solyc03g096390.3.1 (Solyc03g096390.3)
60.95 9.54 38.29 16.79 6.16 17.92 33.17 5.58 21.69 146.56 14.66 13.26 13.95 13.75 14.07 13.44 46.3 462.67 1057.04 19.62 10.4 2.83 3.98 3.88 2.8 34.66 8.26 6.21 4.5 3.71 3.86 4.41 13.27 46.51
Solyc03g098500.3.1 (Solyc03g098500.3)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 31.84 136.4 0.0 0.01 0.01 0.01 1.19 1.2 24.67 293.3 1013.25 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.35 0.04 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0
Solyc03g112080.1.1 (Solyc03g112080.1)
10.4 3.34 7.41 4.39 12.89 10.03 5.04 4.46 9.63 45.04 5.81 6.23 10.57 9.39 10.94 10.84 20.37 54.9 200.89 11.66 7.41 6.95 6.64 7.03 7.88 10.92 8.87 8.75 10.26 7.45 6.59 7.06 3.15 12.59
Solyc03g113440.3.1 (Solyc03g113440.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.32 0.09 6.79 35.92 0.06 0.0 0.03 0.0 0.29 0.48 10.46 198.79 291.71 0.07 4.52 0.0 0.01 0.01 0.0 1.39 0.36 0.1 0.05 0.03 0.03 0.0 0.01 0.0
Solyc03g121220.2.1 (Solyc03g121220.2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 1.74 29.23 0.0 0.0 0.07 0.0 0.1 0.24 5.55 100.86 221.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Solyc04g008270.3.1 (Solyc04g008270.3)
0.0 0.0 0.0 0.06 1.94 0.04 0.0 0.03 7.59 60.86 0.0 0.0 0.02 0.0 0.41 0.9 16.5 155.87 609.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
Solyc04g009190.3.1 (Solyc04g009190.3)
29.29 16.46 22.97 16.66 3.91 5.14 19.8 6.1 18.12 30.82 13.65 12.65 18.38 16.72 15.98 21.57 23.57 145.06 218.02 17.65 16.37 6.48 5.19 8.92 11.38 13.51 6.09 10.4 10.93 9.04 9.23 13.6 4.67 12.98
Solyc04g011570.3.1 (Solyc04g011570.3)
17.98 4.87 14.87 17.32 5.12 6.43 9.19 4.18 20.5 47.01 7.12 4.99 11.82 9.69 22.06 22.01 27.66 67.55 163.04 9.74 8.49 9.55 8.73 9.96 9.65 19.18 9.0 9.85 9.61 9.46 10.0 11.85 2.36 16.85
Solyc04g025400.3.1 (Solyc04g025400.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 16.11 121.24 0.01 0.0 0.3 0.08 3.17 2.34 26.43 528.11 1044.27 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.02 0.0 0.1 0.09 0.19 0.05 0.04 0.02 0.0 0.0
Solyc04g076150.3.1 (Solyc04g076150.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 14.9 100.49 0.13 0.05 0.08 0.0 1.17 1.46 20.13 266.62 1234.73 0.02 0.18 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.07 0.1 0.0 0.0
Solyc04g082440.3.1 (Solyc04g082440.3)
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Solyc05g007675.1.1 (Solyc05g007675.1)
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Solyc05g012330.3.1 (Solyc05g012330.3)
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Solyc05g024173.1.1 (Solyc05g024173.1)
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Solyc05g026360.3.1 (Solyc05g026360.3)
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Solyc05g047570.2.1 (Solyc05g047570.2)
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Solyc05g051050.3.1 (Solyc05g051050.3)
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Solyc05g051570.3.1 (Solyc05g051570.3)
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Solyc05g051970.3.1 (Solyc05g051970.3)
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Solyc06g054470.1.1 (Solyc06g054470.1)
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Solyc06g063060.3.1 (Solyc06g063060.3)
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Solyc06g066120.3.1 (Solyc06g066120.3)
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Solyc06g076090.3.1 (Solyc06g076090.3)
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Solyc06g082820.3.1 (Solyc06g082820.3)
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Solyc07g006020.3.1 (Solyc07g006020.3)
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Solyc07g007610.2.1 (Solyc07g007610.2)
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Solyc07g008070.1.1 (Solyc07g008070.1)
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Solyc07g008400.2.1 (Solyc07g008400.2)
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Solyc11g008900.2.1 (Solyc11g008900.2)
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Solyc11g012785.1.1 (Solyc11g012785.1)
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Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)