Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
Ceric.01G108900.1 (Ceric.01G108900)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G124500.1 (Ceric.01G124500)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.02G008700.1 (Ceric.02G008700)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.02G105200.1 (Ceric.02G105200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Ceric.04G032100.1 (Ceric.04G032100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 13.76 0.0 2.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.07 0.05 0.02 0.0 0.0 0.12 0.05 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.08 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
Ceric.05G034400.1 (Ceric.05G034400)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.06G004600.1 (Ceric.06G004600)
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.26 0.4 0.32 0.15 0.13 0.46 0.44 0.06 0.22 0.0 6.92 2.66 0.07 0.04 0.3 0.22 0.0 0.27 0.3 0.25 0.06 0.11 0.21 0.06 4.0
Ceric.09G010300.1 (Ceric.09G010300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.7 1.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.11G025000.1 (Ceric.11G025000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.11G062000.1 (Ceric.11G062000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.11G089000.1 (Ceric.11G089000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.16 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.12G093000.1 (Ceric.12G093000)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.13G035300.1 (Ceric.13G035300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.13G095900.1 (Ceric.13G095900)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.06 0.13 0.14 0.89 0.26 0.45 0.42 0.26 0.11 0.66 1.48 0.09 0.06 0.0 0.09 0.0 0.0 0.16 0.06 0.0 0.11 0.19 0.0 0.12
Ceric.16G033700.1 (Ceric.16G033700)
0.06 0.0 0.22 0.73 0.0 0.0 1.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 4.18 1.14 0.02 0.0 0.38 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24
Ceric.17G044000.1 (Ceric.17G044000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.62 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Ceric.1Z015600.1 (Ceric.1Z015600)
1.23 1.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.36 8.81 1.01 0.25 0.0 1.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z171600.1 (Ceric.1Z171600)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.3 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.22G038500.1 (Ceric.22G038500)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.17 0.36 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.23G042400.1 (Ceric.23G042400)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 5.27 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.13 0.0
Ceric.23G067900.1 (Ceric.23G067900)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.23G071000.1 (Ceric.23G071000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.14 0.76 0.0 0.02 0.0 0.0 0.19 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59
Ceric.26G004900.1 (Ceric.26G004900)
0.05 0.02 0.03 0.04 0.0 0.03 0.01 0.03 0.11 0.13 0.0 0.42 0.18 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.02 0.01 0.09 0.0 0.06 0.03 0.0 0.36
Ceric.27G026600.1 (Ceric.27G026600)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.29G049800.1 (Ceric.29G049800)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.33G038700.1 (Ceric.33G038700)
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 1.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.07 0.15 0.07 0.16 0.66 0.0 1.18 0.33 0.0 0.09 0.0 0.0 0.41 0.09 0.11 0.32 0.13 0.06 0.0 0.14 0.7
Ceric.35G035600.1 (Ceric.35G035600)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.35G045600.1 (Ceric.35G045600)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.7 1.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.13 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.36G059300.1 (Ceric.36G059300)
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.39G051300.1 (Ceric.39G051300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)