1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_34 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
0.3 0.79 0.47 0.35 0.75 0.59 0.58 0.41 1.0 0.94 0.21 0.35 0.39 0.05 0.38 0.4 0.71 0.07 0.32 0.4 0.39 0.46 0.39 0.44 0.45 0.33
0.21 0.64 0.59 0.42 1.0 0.34 0.36 0.33 0.88 0.98 0.66 0.4 0.4 0.11 0.42 0.37 0.93 0.11 0.36 0.55 0.23 0.5 0.19 0.92 0.37 0.3
Ceric.03G017500.1 (Ceric.03G017500)
 0.16 0.55 0.95 0.42 0.7 0.43 0.52 0.4 0.91 1.0 0.61 0.24 0.3 0.11 0.53 0.6 0.73 0.22 0.6 0.6 0.5 0.58 0.46 0.82 0.42 0.53
Ceric.03G059500.1 (Ceric.03G059500)
 0.41 0.64 0.64 1.0 0.67 0.4 0.52 0.4 0.75 0.82 0.37 0.28 0.34 0.06 0.29 0.26 0.64 0.11 0.45 0.42 0.49 0.36 0.24 0.59 0.18 0.32
0.29 0.51 0.78 1.0 0.72 0.25 0.24 0.22 0.53 0.52 0.39 0.67 0.48 0.03 0.38 0.27 0.74 0.04 0.1 0.36 0.13 0.43 0.17 0.65 0.41 0.2
Ceric.03G098000.1 (Ceric.03G098000)
 0.23 0.21 0.25 0.5 0.37 0.09 0.13 0.07 0.77 1.0 0.31 0.18 0.15 0.02 0.19 0.07 0.41 0.0 0.14 0.17 0.1 0.06 0.1 0.36 0.13 0.13
0.21 0.39 0.66 0.32 0.77 0.36 0.47 0.23 1.0 0.99 0.53 0.26 0.28 0.05 0.36 0.33 0.81 0.02 0.19 0.39 0.18 0.4 0.3 0.66 0.39 0.34
Ceric.04G074900.1 (Ceric.04G074900)
 0.23 0.4 0.55 0.63 1.0 0.3 0.35 0.17 0.78 0.92 0.26 0.49 0.39 0.08 0.34 0.25 0.89 0.03 0.11 0.27 0.18 0.56 0.25 0.8 0.34 0.27
Ceric.06G039000.1 (Ceric.06G039000)
 0.16 0.23 0.54 0.22 0.51 0.41 0.41 0.53 0.94 1.0 0.32 0.32 0.27 0.06 0.31 0.46 0.5 0.12 0.14 0.36 0.24 0.52 0.5 0.49 0.39 0.36
Ceric.06G066800.1 (Ceric.06G066800)
 0.2 0.49 0.55 0.5 0.64 0.52 0.48 0.4 0.99 1.0 0.36 0.61 0.63 0.11 0.42 0.36 0.57 0.13 0.27 0.39 0.3 0.37 0.48 0.55 0.5 0.44
Ceric.07G062100.1 (Ceric.07G062100)
 0.17 0.4 0.78 0.51 0.63 0.36 0.39 0.21 1.0 0.96 0.48 0.45 0.45 0.05 0.4 0.2 0.67 0.06 0.24 0.47 0.29 0.42 0.31 0.63 0.33 0.28
Ceric.09G012300.1 (Ceric.09G012300)
 0.37 0.47 0.89 0.6 0.97 0.78 0.82 0.56 0.99 1.0 0.52 0.63 0.61 0.16 0.44 0.73 0.99 0.05 0.42 0.36 0.29 0.56 0.28 0.74 0.27 0.52
0.13 0.17 0.43 0.66 0.64 0.32 0.3 0.12 1.0 0.95 0.09 0.42 0.46 0.02 0.26 0.19 0.73 0.03 0.09 0.37 0.12 0.15 0.12 0.58 0.22 0.14
Ceric.10G043500.1 (Ceric.10G043500)
 0.27 0.48 0.8 0.44 0.61 0.37 0.36 0.33 1.0 0.96 0.33 0.23 0.2 0.05 0.4 0.3 0.67 0.05 0.31 0.39 0.22 0.46 0.29 0.71 0.29 0.38
Ceric.10G066800.1 (Ceric.10G066800)
 0.2 0.36 0.67 0.5 0.83 0.53 0.56 0.33 1.0 0.98 0.68 0.23 0.25 0.12 0.48 0.41 0.84 0.14 0.53 0.59 0.4 0.55 0.3 0.73 0.53 0.39
Ceric.11G000300.1 (Ceric.11G000300)
 0.38 0.63 0.88 0.72 1.0 0.42 0.44 0.32 0.93 0.86 0.3 0.63 0.44 0.13 0.48 0.36 0.9 0.06 0.18 0.45 0.33 0.77 0.33 0.88 0.53 0.36
Ceric.11G018800.1 (Ceric.11G018800)
 0.24 0.45 0.63 0.61 0.56 0.31 0.33 0.2 1.0 0.92 0.39 0.49 0.47 0.03 0.42 0.2 0.65 0.07 0.18 0.44 0.35 0.4 0.19 0.7 0.24 0.21
Ceric.11G076600.1 (Ceric.11G076600)
 0.24 0.41 0.54 0.47 0.63 0.24 0.35 0.26 0.91 1.0 0.21 0.27 0.28 0.04 0.39 0.3 0.54 0.09 0.29 0.38 0.28 0.41 0.2 0.57 0.47 0.3
0.24 0.35 0.53 0.63 0.49 0.49 0.39 0.37 0.93 1.0 0.33 0.56 0.51 0.1 0.29 0.49 0.49 0.15 0.16 0.33 0.42 0.3 0.34 0.53 0.72 0.39
Ceric.12G029300.1 (Ceric.12G029300)
 0.24 0.4 0.64 0.56 0.6 0.37 0.35 0.27 0.96 1.0 0.62 0.39 0.43 0.07 0.28 0.29 0.63 0.07 0.15 0.38 0.21 0.27 0.22 0.66 0.15 0.35
Ceric.13G002000.1 (Ceric.13G002000)
 0.35 0.39 0.59 0.53 0.62 0.32 0.33 0.28 0.95 1.0 0.42 0.2 0.19 0.06 0.44 0.31 0.62 0.06 0.19 0.39 0.34 0.43 0.32 0.55 0.5 0.37
0.19 0.22 0.37 0.29 0.37 0.16 0.19 0.11 0.9 1.0 0.21 0.23 0.24 0.01 0.35 0.11 0.33 0.02 0.15 0.24 0.2 0.21 0.11 0.28 0.3 0.19
Ceric.13G052100.1 (Ceric.13G052100)
 0.28 0.8 0.66 0.57 1.0 0.42 0.39 0.34 0.76 0.8 0.35 0.32 0.37 0.05 0.37 0.26 0.96 0.12 0.41 0.44 0.36 0.5 0.21 0.72 0.37 0.41
Ceric.14G050300.1 (Ceric.14G050300)
 0.36 0.7 0.59 0.26 0.68 0.3 0.24 0.16 0.95 1.0 0.28 0.31 0.33 0.09 0.29 0.24 0.71 0.05 0.09 0.38 0.18 0.27 0.21 0.67 0.23 0.42
Ceric.14G066900.1 (Ceric.14G066900)
 0.12 0.3 0.59 0.4 0.82 0.32 0.36 0.23 1.0 0.92 0.21 0.36 0.36 0.02 0.44 0.32 0.83 0.02 0.23 0.4 0.27 0.34 0.24 0.69 0.39 0.17
0.24 0.92 0.69 0.48 0.95 0.39 0.51 0.42 0.98 0.89 0.44 0.44 0.47 0.06 0.45 0.29 1.0 0.07 0.36 0.65 0.49 0.61 0.4 0.92 0.46 0.43
0.13 0.43 0.73 0.41 0.73 0.42 0.45 0.28 1.0 0.92 0.47 0.32 0.38 0.05 0.42 0.43 0.68 0.1 0.37 0.55 0.39 0.6 0.55 0.68 0.54 0.26
Ceric.17G026700.1 (Ceric.17G026700)
 0.41 0.4 0.6 0.79 0.56 0.34 0.39 0.29 0.99 1.0 0.46 0.31 0.44 0.11 0.3 0.24 0.55 0.07 0.26 0.46 0.4 0.5 0.27 0.49 0.33 0.33
0.37 0.59 1.0 0.55 0.99 0.51 0.5 0.51 0.83 0.86 0.69 0.48 0.57 0.16 0.51 0.52 1.0 0.19 0.36 0.7 0.43 0.92 0.45 0.84 0.56 0.43
0.3 0.51 0.83 0.41 0.5 0.58 0.53 0.4 1.0 0.99 0.45 0.24 0.19 0.11 0.41 0.35 0.52 0.32 0.41 0.53 0.46 0.81 0.42 0.58 0.55 0.53
Ceric.18G072300.1 (Ceric.18G072300)
 0.3 0.44 0.6 0.67 0.84 0.45 0.46 0.37 1.0 1.0 0.54 0.55 0.59 0.07 0.47 0.46 0.83 0.13 0.35 0.45 0.44 0.53 0.52 0.6 0.46 0.37
Ceric.19G061300.1 (Ceric.19G061300)
 0.18 0.25 0.65 0.44 0.83 0.26 0.29 0.18 0.98 1.0 0.57 0.68 0.57 0.05 0.4 0.16 0.78 0.06 0.22 0.51 0.2 0.37 0.19 0.7 0.34 0.21
Ceric.19G076800.1 (Ceric.19G076800)
 0.34 0.48 0.62 0.83 0.65 0.36 0.33 0.28 1.0 0.93 0.27 0.22 0.21 0.05 0.4 0.35 0.7 0.1 0.3 0.51 0.46 0.45 0.36 0.52 0.44 0.37
Ceric.1Z017100.1 (Ceric.1Z017100)
 0.23 0.31 0.46 0.59 0.81 0.44 0.42 0.38 0.99 1.0 0.2 0.23 0.23 0.05 0.3 0.45 0.78 0.05 0.15 0.41 0.27 0.71 0.43 0.5 0.47 0.31
Ceric.1Z041200.1 (Ceric.1Z041200)
 0.27 0.23 0.41 0.39 0.55 0.49 0.5 0.24 1.0 0.96 0.22 0.26 0.34 0.04 0.27 0.47 0.57 0.08 0.09 0.28 0.2 0.27 0.43 0.41 0.22 0.26
0.37 0.18 0.41 0.0 0.02 0.0 0.04 0.1 1.0 0.96 0.17 0.0 0.09 0.0 0.3 0.1 0.04 0.01 0.08 0.07 0.15 0.15 0.19 0.12 0.15 0.18
Ceric.20G013300.1 (Ceric.20G013300)
 0.09 0.48 0.61 0.43 1.0 0.26 0.33 0.27 0.76 0.82 0.16 0.19 0.14 0.07 0.33 0.27 1.0 0.06 0.16 0.31 0.14 0.48 0.34 0.63 0.21 0.19
0.15 0.82 0.9 0.52 0.91 0.4 0.39 0.37 1.0 0.95 0.5 0.26 0.26 0.05 0.42 0.45 0.9 0.07 0.31 0.48 0.21 0.38 0.3 0.84 0.33 0.31
Ceric.22G028900.1 (Ceric.22G028900)
 0.13 0.47 0.64 0.26 0.63 0.19 0.36 0.23 1.0 0.98 0.27 0.02 0.01 0.01 0.31 0.17 0.59 0.0 0.09 0.13 0.16 0.34 0.18 0.54 0.58 0.16
Ceric.22G049500.1 (Ceric.22G049500)
 0.46 0.42 0.56 0.51 0.55 0.36 0.33 0.3 1.0 0.94 0.41 0.37 0.46 0.06 0.32 0.32 0.47 0.07 0.26 0.4 0.35 0.45 0.33 0.46 0.27 0.38
Ceric.23G029600.1 (Ceric.23G029600)
 0.5 0.58 0.69 0.98 0.78 0.41 0.46 0.39 1.0 0.94 0.49 0.23 0.25 0.1 0.43 0.31 0.8 0.16 0.41 0.58 0.4 0.63 0.29 0.69 0.54 0.41
Ceric.23G057900.1 (Ceric.23G057900)
 0.27 0.25 0.39 0.44 0.61 0.53 0.41 0.17 1.0 0.93 0.29 0.23 0.27 0.03 0.26 0.2 0.59 0.03 0.15 0.39 0.27 0.21 0.32 0.47 0.38 0.26
0.3 0.5 0.65 0.59 0.72 0.32 0.42 0.24 0.95 1.0 0.52 0.5 0.65 0.1 0.4 0.4 0.7 0.11 0.28 0.4 0.27 0.71 0.26 0.63 0.49 0.37
Ceric.25G013600.1 (Ceric.25G013600)
 0.24 0.43 0.71 0.49 1.0 0.4 0.44 0.41 0.77 0.76 0.74 0.32 0.41 0.1 0.5 0.51 0.99 0.08 0.31 0.51 0.32 0.59 0.33 0.93 0.61 0.3
Ceric.26G011200.1 (Ceric.26G011200)
 0.08 0.42 0.94 0.59 0.66 0.43 0.49 0.28 0.8 1.0 0.36 0.25 0.16 0.07 0.31 0.51 0.49 0.11 0.21 0.49 0.28 0.64 0.71 0.56 0.72 0.5
0.23 0.53 0.47 0.42 0.76 0.61 0.61 0.51 0.99 1.0 0.32 0.36 0.46 0.08 0.33 0.42 0.74 0.1 0.26 0.34 0.22 0.43 0.29 0.52 0.37 0.28
Ceric.26G023300.1 (Ceric.26G023300)
 0.27 0.38 0.82 0.86 0.98 0.37 0.49 0.35 1.0 0.94 0.34 0.81 0.79 0.04 0.5 0.42 1.0 0.04 0.21 0.56 0.24 0.44 0.23 0.84 0.51 0.36
0.2 0.26 0.71 0.36 0.51 0.24 0.3 0.17 0.9 1.0 0.41 0.23 0.33 0.07 0.41 0.2 0.58 0.03 0.11 0.32 0.22 0.37 0.3 0.4 0.29 0.32
Ceric.28G026700.1 (Ceric.28G026700)
 0.11 0.31 0.82 0.75 0.93 0.42 0.48 0.19 1.0 0.99 0.31 0.39 0.37 0.03 0.46 0.46 0.97 0.03 0.16 0.52 0.13 0.44 0.27 0.7 0.45 0.18
Ceric.29G064700.1 (Ceric.29G064700)
 0.11 0.06 0.34 0.18 0.13 0.06 0.18 0.06 0.65 1.0 0.1 0.2 0.2 0.04 0.28 0.08 0.26 0.0 0.04 0.12 0.11 0.11 0.0 0.34 0.11 0.05
0.37 0.35 0.63 0.54 0.69 0.58 0.56 0.42 1.0 0.85 0.44 0.6 0.48 0.13 0.39 0.52 0.67 0.05 0.36 0.27 0.37 0.61 0.49 0.6 0.54 0.41
Ceric.31G000400.1 (Ceric.31G000400)
 0.52 0.45 0.7 0.78 0.61 0.33 0.46 0.37 1.0 0.97 0.48 0.26 0.3 0.08 0.38 0.35 0.63 0.13 0.25 0.6 0.41 0.63 0.33 0.62 0.41 0.36
0.33 0.58 1.0 0.38 0.74 0.66 0.5 0.46 0.83 0.88 0.3 0.61 0.61 0.14 0.53 0.42 0.79 0.12 0.24 0.45 0.27 0.42 0.45 0.51 0.4 0.35
Ceric.34G013400.1 (Ceric.34G013400)
 0.08 0.33 0.02 0.0 0.26 0.05 0.1 0.0 1.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.25 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.33 0.04 0.02 0.0
Ceric.34G048600.1 (Ceric.34G048600)
 0.21 0.34 0.65 0.43 0.79 0.4 0.44 0.16 0.94 1.0 0.42 0.31 0.31 0.07 0.33 0.31 0.71 0.04 0.13 0.41 0.19 0.29 0.31 0.56 0.2 0.25
Ceric.34G071000.1 (Ceric.34G071000)
 0.52 0.45 0.77 0.69 0.52 0.2 0.26 0.15 0.95 1.0 0.22 0.24 0.24 0.05 0.31 0.15 0.58 0.11 0.08 0.48 0.22 0.4 0.35 0.49 0.33 0.21
Ceric.36G022000.1 (Ceric.36G022000)
 0.19 0.24 0.5 0.45 0.42 0.21 0.21 0.17 1.0 0.96 0.29 0.27 0.2 0.02 0.26 0.13 0.42 0.01 0.09 0.26 0.2 0.18 0.14 0.37 0.19 0.11
Ceric.38G019100.1 (Ceric.38G019100)
 0.11 0.7 0.57 0.25 0.81 0.36 0.36 0.25 0.99 1.0 0.4 0.35 0.34 0.07 0.52 0.29 0.86 0.05 0.29 0.44 0.23 0.61 0.37 0.83 0.6 0.35
Ceric.38G033300.1 (Ceric.38G033300)
 0.36 0.54 0.48 0.7 0.68 0.47 0.41 0.32 0.95 1.0 0.51 0.38 0.33 0.06 0.39 0.31 0.71 0.15 0.26 0.51 0.59 0.44 0.24 0.61 0.53 0.36
Ceric.39G010400.1 (Ceric.39G010400)
 0.47 0.25 0.6 0.42 0.72 0.33 0.4 0.2 1.0 1.0 0.29 0.17 0.18 0.02 0.26 0.26 0.68 0.01 0.07 0.2 0.15 0.36 0.31 0.41 0.25 0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)