Heatmap: Cluster_31 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
Ceric.01G042500.1 (Ceric.01G042500)
0.36 3.79 2.54 0.31 2.43 15.66 4.57 2.6 6.23 6.6 53.95 3.2 2.79 0.05 2.9 1.55 1.96 0.08 2.83 1.18 0.35 2.29 0.69 4.84 5.54 2.14
Ceric.02G006000.1 (Ceric.02G006000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.02G023200.1 (Ceric.02G023200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.03G059400.1 (Ceric.03G059400)
0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.09 0.08 0.04 0.07 0.19 2.57 0.91 1.62 0.0 0.02 0.0 0.01 0.07 0.0 0.01 0.05 0.0 0.01 0.21 0.04 0.0
Ceric.03G075900.1 (Ceric.03G075900)
0.0 0.24 0.25 0.0 0.0 0.18 0.06 0.06 0.5 0.21 29.77 2.78 3.29 0.04 0.37 0.08 0.0 0.12 0.0 0.39 0.06 0.57 0.14 0.22 1.55 0.2
Ceric.04G001700.1 (Ceric.04G001700)
0.0 0.0 0.01 0.0 2.43 0.39 0.56 0.15 1.37 1.28 4.73 1.99 1.76 0.66 0.32 0.03 2.43 0.08 0.0 0.12 0.0 1.29 0.12 1.66 1.88 0.11
Ceric.04G063300.1 (Ceric.04G063300)
0.0 0.02 0.04 0.0 1.96 0.0 0.11 0.02 0.19 0.12 26.07 5.93 11.97 0.04 0.87 1.27 2.13 0.39 0.57 0.23 0.03 1.3 0.0 6.88 2.55 0.02
Ceric.04G063400.1 (Ceric.04G063400)
0.0 0.02 0.04 0.0 1.96 0.0 0.11 0.02 0.19 0.12 26.07 5.93 11.97 0.04 0.87 1.27 2.13 0.39 0.57 0.23 0.03 1.3 0.0 6.88 2.55 0.02
Ceric.04G063600.1 (Ceric.04G063600)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.32 0.0 0.17 0.27 0.25 0.06 8.85 1.15 4.61 0.0 0.23 0.25 1.49 0.07 0.04 0.24 0.0 0.42 0.0 1.39 3.09 0.0
Ceric.04G105800.1 (Ceric.04G105800)
0.32 6.12 16.55 2.3 3.38 12.0 7.92 18.55 52.88 56.8 340.18 58.21 134.79 0.69 4.99 2.14 3.26 1.16 17.51 8.44 47.27 1.44 4.51 2.73 9.74 9.66
Ceric.05G011400.1 (Ceric.05G011400)
2.74 2.74 4.15 5.73 0.91 1.71 2.22 6.06 2.99 2.99 62.41 27.19 32.57 0.24 1.19 0.77 0.89 0.25 1.49 1.62 2.51 0.65 0.42 1.39 0.9 1.15
Ceric.06G038800.1 (Ceric.06G038800)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.06G043800.1 (Ceric.06G043800)
0.17 0.47 0.51 0.56 5.99 0.38 1.09 0.66 1.66 0.65 18.95 2.17 5.09 0.07 0.62 0.06 6.93 0.0 0.19 1.01 0.26 0.18 0.31 2.43 0.19 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.07G008000.1 (Ceric.07G008000)
30.99 26.26 78.05 79.08 135.16 41.07 41.7 37.02 90.18 74.56 503.02 95.06 146.36 24.38 62.89 37.92 135.47 23.8 120.38 64.03 29.31 147.3 16.25 235.47 152.26 8.11
0.04 0.19 0.13 0.06 0.07 0.04 0.01 0.01 0.05 0.09 1.62 0.4 0.47 0.0 0.03 0.02 0.07 0.01 0.0 0.06 0.15 0.04 0.02 0.03 0.0 0.0
Ceric.07G085700.1 (Ceric.07G085700)
0.0 0.0 0.0 0.0 5.78 0.08 0.17 0.25 0.2 0.07 10.46 3.13 5.35 0.06 0.38 0.62 3.98 0.16 0.0 0.09 0.0 0.31 0.07 3.33 0.32 0.0
Ceric.08G011000.1 (Ceric.08G011000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.08G064900.1 (Ceric.08G064900)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.09G025100.1 (Ceric.09G025100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 18.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.10G014400.1 (Ceric.10G014400)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.33 0.05 0.14 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.11G035000.1 (Ceric.11G035000)
0.17 4.71 8.47 0.81 2.46 4.68 3.89 8.82 12.02 13.82 179.41 31.47 64.76 0.94 3.83 1.0 2.33 0.71 13.85 6.45 24.71 0.34 3.54 1.87 9.08 5.74
Ceric.11G038400.1 (Ceric.11G038400)
2.39 3.07 0.23 3.76 0.28 0.37 1.53 7.33 0.4 0.49 38.74 13.25 22.87 0.08 0.37 0.04 0.28 0.06 0.16 3.07 0.23 0.23 0.3 1.3 0.24 0.03
Ceric.11G079400.1 (Ceric.11G079400)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.12G021500.1 (Ceric.12G021500)
0.42 1.09 2.35 4.72 1.96 4.37 1.81 2.05 5.28 5.4 105.11 9.61 7.52 0.6 5.23 1.49 2.29 0.0 9.23 7.73 4.92 0.81 2.81 3.18 6.99 3.07
Ceric.12G023300.1 (Ceric.12G023300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.04 0.06 0.0 0.01 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
Ceric.13G019000.1 (Ceric.13G019000)
0.0 0.69 0.49 0.24 0.18 0.4 0.41 0.79 0.82 0.7 16.7 2.86 2.23 0.0 0.78 0.05 0.18 0.46 0.98 1.4 1.38 0.15 0.39 0.58 1.08 0.48
Ceric.13G033800.1 (Ceric.13G033800)
1.61 0.31 0.69 1.24 1.9 0.24 0.21 0.04 1.01 0.57 8.83 3.51 2.54 0.01 0.15 0.0 1.54 0.0 0.0 0.39 0.07 0.0 0.0 1.46 0.0 0.0
Ceric.13G087100.1 (Ceric.13G087100)
0.76 0.84 1.24 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 16.69 3.41 3.07 0.0 0.15 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0
Ceric.14G001200.1 (Ceric.14G001200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.14G037900.1 (Ceric.14G037900)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 74.79 30.65 40.84 0.0 0.07 0.0 0.0 0.04 0.2 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.15G047400.1 (Ceric.15G047400)
6.51 6.15 22.3 40.51 58.61 8.97 11.41 10.85 24.62 24.29 159.71 32.25 54.11 9.13 20.25 17.28 55.48 5.91 47.19 32.62 13.67 39.52 7.2 82.98 55.83 4.24
Ceric.19G005100.1 (Ceric.19G005100)
30.99 26.26 78.05 79.08 135.16 41.07 41.7 37.02 90.18 74.56 503.02 95.06 146.36 24.38 62.89 37.92 135.47 23.8 120.38 64.03 29.31 147.3 16.25 235.47 152.26 8.11
Ceric.19G019700.1 (Ceric.19G019700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.19G032300.1 (Ceric.19G032300)
30.99 26.26 78.05 79.08 135.16 41.07 41.7 37.02 90.18 74.56 503.02 95.06 146.36 24.38 62.89 37.92 135.47 23.8 120.38 64.03 29.31 147.3 16.25 235.47 152.26 8.11
5.23 28.93 58.65 65.9 233.29 37.24 40.39 57.2 13.79 6.82 526.04 112.51 175.67 46.87 58.22 72.19 242.95 39.68 184.5 120.81 47.49 228.17 17.23 293.8 169.86 0.0
11.83 14.67 36.29 13.06 98.35 31.15 30.28 33.94 100.28 108.13 275.83 128.0 107.57 8.67 41.52 30.92 98.37 9.5 12.77 47.69 19.51 84.46 53.25 85.33 76.77 54.65
0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.02 0.0 0.01 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z045200.1 (Ceric.1Z045200)
0.2 0.44 0.58 0.34 0.16 0.46 0.47 0.07 0.62 0.44 6.54 1.6 0.98 0.0 0.51 0.31 0.6 0.0 0.71 0.57 0.4 0.33 0.35 0.51 1.43 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z180200.1 (Ceric.1Z180200)
0.72 0.56 0.0 1.98 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.06 25.04 6.66 14.77 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.17 0.53 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0
Ceric.1Z221200.1 (Ceric.1Z221200)
0.63 1.72 2.81 1.35 2.13 1.21 1.09 1.4 1.96 1.91 53.53 4.62 6.37 0.09 2.27 0.74 2.25 0.22 2.98 3.34 1.41 0.43 1.42 1.62 2.99 0.96
Ceric.1Z233300.1 (Ceric.1Z233300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 22.54 5.66 10.51 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.36 0.05 0.0 0.26 0.0 0.1 0.0 0.1
Ceric.1Z271500.1 (Ceric.1Z271500)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.21G011500.1 (Ceric.21G011500)
0.24 0.31 0.61 1.24 1.42 0.69 1.09 0.63 1.16 1.12 18.03 4.73 7.62 0.0 1.25 0.18 1.34 0.0 1.48 1.13 0.87 0.2 0.9 0.81 3.68 0.6
Ceric.21G025300.1 (Ceric.21G025300)
0.06 0.06 0.46 0.06 0.27 0.3 0.44 0.6 0.54 0.35 20.18 5.0 4.82 0.0 0.42 0.08 0.36 0.06 0.83 0.69 0.27 0.56 0.19 0.57 0.47 0.28
Ceric.22G038900.1 (Ceric.22G038900)
0.1 0.51 1.08 0.11 1.54 0.27 0.71 0.36 1.25 1.47 14.54 4.11 4.5 0.0 1.33 1.08 1.31 0.26 0.86 0.76 1.06 0.59 0.69 0.85 2.06 0.8
Ceric.23G036100.1 (Ceric.23G036100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 35.53 0.02 2.47 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.09 0.0
Ceric.24G037600.1 (Ceric.24G037600)
0.0 0.0 0.19 0.18 0.82 0.0 0.19 0.0 0.27 0.32 20.47 2.52 2.92 0.0 0.35 0.0 0.54 0.0 0.0 0.08 0.49 0.0 0.0 0.27 0.0 0.12
5.23 28.93 58.65 65.9 233.29 37.24 40.39 57.2 13.79 6.82 526.04 112.51 175.67 46.87 58.22 72.19 242.95 39.68 184.5 120.81 47.49 228.17 17.23 293.8 169.86 0.0
Ceric.25G034300.1 (Ceric.25G034300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.26G022000.1 (Ceric.26G022000)
2.44 11.42 9.28 3.88 19.27 6.53 6.2 5.4 11.44 11.03 86.25 22.98 48.62 2.66 7.67 4.97 19.29 1.01 20.46 4.52 3.09 7.75 2.35 52.01 14.69 2.07
Ceric.26G059800.1 (PLA2-ALPHA)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.09 0.27 0.13 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0
0.1 0.15 0.06 0.12 0.11 0.03 0.02 0.03 0.18 0.15 1.3 0.34 0.43 0.01 0.05 0.03 0.08 0.0 0.0 0.03 0.01 0.06 0.01 0.08 0.0 0.04
Ceric.29G034400.1 (Ceric.29G034400)
0.0 92.18 17.72 8.86 16.27 20.0 28.13 14.39 13.35 22.0 417.55 118.32 108.12 0.0 36.59 6.16 29.89 3.52 10.71 18.4 6.63 0.0 5.98 21.13 42.35 4.69
Ceric.29G048300.1 (Ceric.29G048300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 10.4 1.45 0.87 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.11 0.05 0.04 0.48 0.02
Ceric.32G017000.1 (Ceric.32G017000)
28.15 15.47 69.5 45.74 21.31 9.9 2.51 14.03 0.48 0.95 1256.05 380.19 755.28 19.42 2.48 0.1 18.26 0.14 0.19 265.82 5.18 1.63 2.96 12.28 5.13 0.17
0.0 0.36 0.03 0.02 0.0 2.53 2.71 0.4 0.0 0.0 33.66 0.16 0.2 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.35G011100.1 (Ceric.35G011100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.36G028100.1 (Ceric.36G028100)
0.22 0.4 0.1 0.28 0.0 0.0 0.37 0.06 0.49 0.12 12.8 2.11 4.51 0.05 0.13 0.96 0.05 0.0 0.53 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)