Heatmap: Cluster_227 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots (apex), 7 DAG
Roots (differentation zone), 4 DAP
Roots (elongation zone), 4 DAP
Roots (meristematic zone), 4 DAP
Roots (stele cells), 7 DAS
Roots (tip)
Leaves (rosette), 21 DAG
Leaves (rosette), 29 DAG
Leaves (rosette), 35 DAG
Leaves (rosette), 42 DAG
Leaves (rosette), 57 DAG
Epidermis cells
Mature guard cells
Stems (internode)
Stems (internode), senescent
Meristem (M1-3), 7-9 DAG
Meristem (M4-6), 1-12 DAG
Meristem (M7-1), 13-16 DAG
Axis of the inflorescence
Pedicel
Flowers (receptacles)
Flowers (floral buds)
Flowers (sepals)
Flowers (petals)
Flowers (stamen filaments)
Flowers (anthers)
Flowers (carpels)
Flowers (ovules)
Stigmatic tissues
Pollen
Siliques
Siliques, senescent
Pods of Siliques
Pods of Siliques, senescent
Embryo
Endosperm
Seeds, dry
Seeds, from senescent siliques
Seeds, young
Seeds, germinating
Seedlings, 5 DAG
Seedlings, 11 DAG
Seedlings, 14 DAG
Seedlings, etiolated
0.02 -0.45 -1.8 0.02 - -0.12 -0.96 -1.19 -0.56 -0.86 -1.2 -3.85 -3.12 -1.72 -1.05 0.82 0.91 0.95 0.54 -0.04 0.22 0.4 0.31 0.24 -0.48 0.48 0.95 1.4 0.74 -1.5 0.11 -0.52 -0.31 -1.47 1.53 0.61 -0.86 -0.54 1.33 0.08 -0.88 -0.46 -0.52 -0.61
0.55 -1.09 0.44 -0.5 -0.6 -0.38 -0.29 0.29 -0.79 -1.87 -1.33 -2.27 -2.75 0.81 -0.42 -0.81 -0.51 0.08 0.57 0.15 0.56 1.04 0.33 1.27 0.47 -1.73 0.55 0.39 0.74 - 0.46 -3.0 0.57 -3.55 0.23 1.1 -3.36 -3.03 0.87 -0.43 -1.21 0.62 0.99 0.1
-0.35 -1.27 -0.79 -0.53 1.58 -0.92 -1.2 1.45 0.89 0.81 0.82 -2.02 -2.62 -0.6 0.95 -1.14 -0.59 -0.04 -0.27 -0.03 -0.12 0.4 -0.0 0.5 -0.53 -2.2 0.45 0.11 -0.53 - -0.13 -1.77 -0.09 -2.12 -0.25 1.85 -2.55 -1.73 0.39 0.06 -1.06 0.28 0.78 -0.31
AT1G32070 (NSI)
-1.33 -0.04 -0.53 -1.01 -6.17 -1.56 0.89 0.46 -0.1 -0.49 -0.64 -1.44 -8.55 0.66 0.28 -0.63 -0.72 -0.42 0.64 1.21 0.23 0.84 1.53 0.46 0.27 -1.89 0.08 -0.57 0.08 - 0.74 -2.1 1.27 0.43 -0.53 -1.38 -2.79 -2.61 -0.64 0.66 -0.13 1.51 0.31 -0.36
0.38 0.38 0.21 0.35 0.52 0.17 -0.93 0.21 0.55 0.38 0.42 -2.44 -4.51 0.04 0.26 -0.4 -0.18 0.24 0.16 -0.2 0.23 0.24 -0.02 0.08 -0.05 0.12 0.41 0.76 0.47 -9.27 0.02 -0.57 -0.22 -0.08 0.06 -0.62 -0.24 -0.7 0.59 0.04 -1.05 -0.02 -0.25 -0.01
-0.36 -2.09 -0.59 0.63 0.69 -0.3 -0.75 0.86 -0.6 -0.61 -1.2 -2.07 -6.84 -0.49 -0.83 0.46 0.62 1.09 0.78 0.63 -0.29 0.14 -0.16 -0.25 -0.93 -0.81 1.12 0.87 0.1 - 0.24 -1.58 0.07 -2.87 0.91 1.78 -0.81 -1.75 0.58 0.08 -0.1 -0.07 -0.43 -1.01
AT1G47550 (SEC3A)
0.82 0.28 0.67 -0.08 0.02 -0.05 -0.51 0.05 0.17 0.19 0.42 -2.39 -1.99 0.19 0.16 -0.61 -0.19 0.21 0.02 -0.32 0.29 0.71 -0.16 0.24 -0.07 -0.65 0.37 0.67 0.21 -2.93 0.04 -0.37 0.07 0.37 -0.08 -0.27 -0.54 -0.64 0.52 -0.02 -0.9 0.12 -0.05 0.0
0.31 -0.27 0.3 1.15 -0.17 0.41 -0.27 -0.15 -0.04 0.07 0.13 -1.54 -0.44 -0.32 0.33 -0.89 -0.39 0.1 0.77 0.48 0.51 0.77 0.02 0.09 -0.81 -0.85 0.47 0.28 0.37 -2.33 -0.41 -0.99 -0.29 0.25 0.21 -0.25 -1.16 -0.97 0.12 0.2 -0.83 0.58 0.05 -0.23
0.38 -2.03 0.05 0.69 - 0.69 -1.75 -1.32 -1.57 -1.26 -1.18 -6.14 -5.83 -0.73 -0.25 -0.08 0.16 0.61 0.79 -0.47 0.48 -0.19 -0.24 -3.53 -1.52 -0.96 1.63 1.75 1.82 - -0.6 -1.99 -1.12 -1.43 1.6 1.69 -1.14 -1.48 1.38 -0.3 -1.34 -0.77 -0.37 -0.39
-0.3 0.48 -0.45 -0.67 -0.87 -0.97 -0.75 0.16 1.06 1.01 0.73 -3.45 -5.34 0.03 -0.14 -0.16 0.28 0.36 -0.32 -0.41 0.41 0.43 0.13 -0.18 -0.29 -0.75 0.62 0.79 0.96 -6.95 0.44 -2.64 0.18 -0.55 0.97 0.07 -3.15 -3.14 0.91 -0.06 -0.52 0.03 0.48 0.15
AT1G55970 (HAC4)
-1.35 -1.93 -1.51 -0.55 - -1.57 -0.3 -0.6 0.27 0.36 0.32 -0.16 2.52 -0.03 0.92 -1.17 -0.58 -0.01 0.34 0.23 0.27 0.21 -0.13 -0.71 -0.81 -1.56 0.64 0.55 1.09 -7.23 -0.16 -0.69 0.25 -0.35 0.0 1.41 -2.47 -1.21 -0.21 -0.54 -0.99 -0.01 0.54 -0.91
AT1G59560 (DAL2)
-0.31 0.31 -0.21 0.9 -5.57 0.05 -0.34 -1.9 -2.1 -3.1 -2.44 -3.97 -7.37 0.67 -0.15 0.36 0.68 0.94 0.83 0.4 0.52 1.54 0.03 0.17 -0.49 -0.81 1.29 1.23 0.02 -4.3 0.42 -3.21 0.25 -1.38 0.79 0.08 -5.06 -3.25 0.87 -0.64 -0.57 0.84 -0.11 -0.59
AT1G60220 (OTS1)
-0.28 0.52 0.39 0.41 -0.79 -0.25 -0.89 -0.27 0.04 0.05 0.1 -3.97 -0.98 0.23 0.09 -0.68 -0.02 0.51 0.42 0.2 0.71 0.31 0.21 0.12 -0.73 -1.21 0.65 0.61 0.32 -8.39 0.23 -1.74 0.21 0.32 0.63 1.36 -2.7 -2.05 0.53 0.02 -0.8 -0.32 0.12 0.04
0.23 -0.77 -0.2 0.89 - 0.31 -1.01 -3.45 -2.41 -2.2 -2.37 -4.52 -4.67 -0.2 -1.48 0.98 1.31 1.54 1.23 0.12 0.16 1.1 -0.78 -0.75 -0.73 -1.33 1.01 1.55 -0.16 -6.64 0.03 -2.68 -0.84 -1.27 1.1 1.04 -2.64 -2.84 1.3 -0.34 -1.59 0.9 0.26 -1.31
0.03 0.04 0.32 0.3 1.68 0.14 -1.87 -0.24 -0.03 -0.15 -0.13 -2.15 -0.37 -0.07 0.3 0.06 0.6 0.63 0.12 -0.51 0.1 -0.12 -0.31 0.07 -0.07 -0.68 0.86 0.84 0.6 -5.82 0.13 -0.82 -0.39 -0.19 -0.29 0.39 -1.36 -0.99 0.71 0.08 -1.41 -1.1 -0.07 -0.36
-4.87 -2.18 -3.15 -2.56 - -4.17 -1.62 -0.14 -0.42 -0.98 -1.1 -2.7 -3.39 0.14 0.77 -0.29 0.19 0.58 1.15 1.15 0.25 1.27 0.02 -0.19 -0.23 -1.86 1.05 0.91 -0.01 - 0.13 0.52 0.04 -2.87 1.54 1.39 0.78 0.33 0.7 -0.94 -1.68 0.63 0.52 -1.73
-1.0 -1.74 -0.49 -0.12 -7.05 -0.88 0.32 -1.33 -3.98 -2.79 -2.24 -3.99 -5.73 0.98 -1.83 0.4 0.38 0.57 0.56 0.78 1.0 -0.55 1.03 1.46 1.45 -0.35 0.52 0.61 1.45 -1.77 0.65 -3.44 0.53 -3.26 0.81 0.75 -5.3 -3.7 0.57 -0.42 -0.3 -0.76 0.45 -0.75
-0.51 0.0 -1.4 -2.62 -0.43 -2.49 -1.35 0.33 0.97 0.71 0.85 -0.58 -2.66 0.64 1.54 -0.8 -0.35 0.18 0.0 0.1 0.71 0.21 0.12 -0.17 -0.25 -0.44 1.06 0.59 0.42 -3.14 0.46 -0.85 0.29 -0.25 -0.42 0.8 -1.2 -0.88 0.73 -0.34 -1.67 -0.88 -0.15 -0.21
-1.64 -2.22 -0.94 -0.25 2.2 -1.24 -0.39 0.09 -0.12 -0.43 -0.81 -0.66 2.7 -1.99 0.81 -1.99 -2.2 -1.05 -1.98 -0.68 0.45 -0.13 1.19 -1.05 -1.6 0.08 0.22 0.15 0.75 - 0.57 -2.83 0.53 0.94 -0.06 0.87 -7.37 -4.36 0.54 -1.88 -1.18 -0.98 -0.25 -1.63
AT2G16090 (ARI2)
0.2 -0.56 -0.13 0.68 -7.2 0.16 -0.93 -0.5 -0.18 -0.54 -0.39 -3.76 -2.91 -0.17 0.27 0.04 0.26 0.71 0.45 0.07 0.34 0.1 0.04 -0.21 -0.28 -0.26 0.95 1.05 0.51 -3.8 0.17 -1.01 0.02 -0.68 1.04 1.74 -1.47 -0.92 0.89 -0.14 -0.89 -0.92 -0.01 -0.7
-0.51 -0.28 -1.16 -0.45 -0.8 -1.05 -0.22 1.17 0.67 0.53 0.75 -2.03 -2.04 -0.37 0.5 -0.68 -0.3 0.13 0.02 0.11 -0.12 0.26 1.51 1.71 -0.49 -1.72 0.02 -0.06 0.49 - -0.01 -2.56 0.42 0.2 0.42 0.73 -4.04 -4.23 -0.51 -0.0 -0.33 -0.17 0.3 0.18
AT2G28830 (PUB12)
-0.11 -0.93 -0.3 0.33 - -0.16 -1.09 -0.06 2.23 1.99 1.82 0.33 1.1 -0.35 0.41 -1.1 -0.51 -0.36 0.05 -0.62 0.42 -0.39 -1.02 -0.98 -0.78 -1.16 -0.47 -0.35 -1.06 - -0.67 -1.81 -0.69 -1.47 0.19 1.28 -2.56 -1.33 -0.66 -0.78 -0.66 -0.37 0.1 -0.07
AT2G36490 (DML1)
-1.66 -3.17 -1.67 -0.99 -1.93 -2.74 -0.88 -0.25 -0.76 -2.31 -2.19 -0.7 -3.06 0.26 -2.65 -0.39 0.24 0.74 0.64 0.59 0.42 0.4 0.44 1.16 0.79 -0.33 0.95 0.88 0.97 -9.77 0.44 -0.12 0.53 -3.27 1.65 2.06 -0.01 -0.35 0.55 -2.54 -3.37 -1.05 0.53 -3.23
AT2G43980 (ITPK4)
0.47 0.66 0.31 0.7 -2.83 0.23 -0.83 -1.25 -0.32 -0.21 -0.21 -2.03 0.41 0.07 0.21 0.04 0.46 0.68 0.13 -0.29 0.47 0.19 0.21 0.56 -0.09 -0.9 0.62 0.77 0.53 -7.19 0.44 -1.39 0.05 0.09 0.82 -0.05 -1.78 -1.31 0.62 0.02 -1.23 -0.45 -0.6 -0.54
AT3G01200 (RP2)
-0.82 0.26 -0.18 -1.52 -4.79 -1.87 -0.87 0.39 0.86 0.93 0.89 -1.67 -1.39 -0.54 0.35 -1.16 -1.01 -0.43 -0.8 -0.42 -0.06 0.37 0.3 0.01 -0.32 0.32 0.35 -0.03 0.17 -0.06 0.01 0.72 -0.02 1.3 -1.01 0.08 0.9 0.89 -0.0 -0.59 -0.12 -0.51 0.04 0.05
AT3G05870 (APC11)
0.23 0.55 0.72 1.5 - 1.04 -0.68 -1.5 -1.06 -0.2 0.0 -5.61 - 0.14 -0.15 0.65 0.15 0.51 0.61 0.23 0.59 -0.29 -0.12 -0.59 -0.84 0.52 0.67 0.81 0.2 -1.74 0.06 -1.06 -0.33 1.13 0.73 -1.76 -0.93 -1.64 0.67 0.29 -1.49 -0.93 -1.08 -0.98
-0.04 0.82 0.64 -0.72 1.6 -0.75 -0.57 0.06 0.47 0.6 0.76 -4.49 -4.27 0.1 0.78 -0.41 -0.4 -0.16 -0.58 -0.32 0.26 -1.3 0.03 0.1 0.13 0.44 0.26 0.23 -0.11 0.23 -0.16 -1.17 -0.03 0.71 -0.37 -0.04 -1.52 -2.32 -0.22 -0.14 0.5 -1.85 -0.68 0.54
-0.5 -0.07 0.31 -0.47 1.26 -0.92 -0.9 0.56 1.03 1.02 1.12 -3.28 -1.09 -0.72 0.93 -0.4 -0.69 -0.25 -0.44 -0.7 -0.27 -0.65 -0.03 0.04 0.06 -0.74 0.3 0.35 0.08 -5.67 0.06 -0.0 0.13 0.18 -0.33 0.28 0.2 0.19 0.07 -0.62 0.07 -1.3 -0.25 0.36
-0.63 1.16 -0.52 -1.07 0.76 -1.7 -1.05 -1.1 -0.93 -1.09 -0.72 -0.03 3.02 -0.06 -0.96 -1.47 -0.97 -0.37 -0.43 -0.52 -0.04 0.77 -0.34 -0.22 -0.88 -1.68 -0.05 -0.45 -0.1 -8.77 -0.08 -2.08 -0.04 0.28 -0.31 2.2 -2.84 -3.08 -1.04 -0.63 -0.8 0.22 0.33 -0.41
-0.23 0.45 0.06 -1.01 -0.46 -1.1 -0.26 -0.1 0.1 -0.46 -0.4 -0.28 0.11 -0.44 0.14 -0.38 -1.15 -0.77 -0.01 -0.06 0.93 0.61 0.37 0.66 0.12 0.22 -0.12 -0.28 0.2 0.26 0.11 -1.34 0.25 1.55 -0.4 1.49 -2.78 -2.87 -0.36 -0.42 -1.15 0.24 0.2 -0.25
-1.69 -1.05 -2.45 -2.63 2.04 -2.69 -0.45 -2.23 -2.43 -2.88 -2.95 -4.19 - 0.66 0.92 0.61 0.84 0.61 0.52 -0.05 0.46 0.07 -0.66 -0.45 -0.41 -0.51 1.2 1.83 -0.19 - -0.26 -2.8 -0.19 -1.62 0.64 1.75 -2.15 -2.14 1.22 -0.72 -0.43 -0.34 0.53 -0.02
AT3G28970 (AAR3)
-0.34 -0.07 0.34 0.58 -1.07 0.11 -0.35 -0.09 0.04 0.06 -0.12 -1.48 -0.92 0.22 0.23 -1.2 -0.83 -0.48 0.08 -0.01 0.31 0.46 0.4 0.56 0.14 0.13 0.36 0.05 0.92 -0.37 0.18 -0.92 0.26 -0.08 -0.76 1.48 -1.47 -0.9 0.05 0.1 -1.47 -0.02 0.42 -0.41
0.23 -0.32 0.67 0.44 - 0.57 -1.13 -0.61 -1.39 -1.49 -1.59 - - 0.44 -0.31 0.32 0.8 0.73 0.33 -0.18 0.55 0.38 -1.26 -0.04 1.0 -0.23 1.09 1.47 1.17 - 0.17 -1.64 -0.06 -1.5 0.59 -0.38 -3.54 -4.26 1.06 0.41 -1.17 -0.49 0.79 -0.3
AT3G50240 (KICP-02)
-1.5 -2.55 -1.1 -0.14 -0.42 -1.39 -0.03 0.76 -0.75 -1.45 -1.79 0.64 -5.36 0.85 -2.79 -1.4 -1.27 0.26 1.27 1.03 0.6 0.88 1.03 -0.89 -0.85 -1.31 1.68 1.14 -0.12 -7.4 0.05 -5.53 0.28 -4.02 0.84 0.28 - -9.22 0.89 -0.74 -0.41 1.13 1.31 -0.65
AT3G51310 (VPS35C)
0.47 0.14 0.58 0.48 -0.11 0.14 -0.69 0.07 0.1 0.18 0.27 -2.62 -1.04 0.05 0.32 -0.31 -0.01 0.37 0.44 0.12 0.64 0.54 0.14 0.26 -0.13 -1.36 0.72 0.44 0.38 -7.03 0.09 -1.44 0.07 0.0 0.12 -0.01 -2.13 -1.58 0.22 -0.22 -0.62 -0.04 0.45 -0.06
-1.53 -1.07 -0.55 0.94 - -0.43 1.73 -3.6 -4.95 -6.64 -6.0 -0.29 -5.46 0.41 -1.49 -0.27 -0.01 0.36 1.05 1.64 0.68 0.08 1.06 -0.42 -0.66 -1.85 1.26 0.52 0.14 - 0.65 -7.32 1.04 -5.19 0.86 -1.95 - -5.84 0.39 0.14 0.79 0.65 0.97 -0.26
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AT3G58970 (MGT6)
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-0.05 0.51 -0.1 -0.35 0.35 -0.59 -0.36 -0.45 0.02 -0.11 -0.18 -1.94 -3.07 -0.19 0.52 -0.13 0.0 0.28 0.05 -0.07 0.19 0.06 0.18 0.05 0.22 0.51 0.65 0.41 0.08 0.24 0.06 -0.78 0.26 0.56 0.19 0.29 -1.49 -1.19 0.41 -0.05 -0.33 -0.41 0.09 0.46
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AT4G02020 (SWN)
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AT5G04110 (GYRB3)
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AT5G13690 (CYL1)
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0.11 -0.21 -0.26 0.19 -0.2 -0.16 -0.34 0.02 0.13 0.2 0.31 -0.43 -1.08 -0.21 0.12 -0.26 -0.07 0.41 0.23 0.04 0.22 0.18 -0.16 0.62 -0.07 -0.68 0.5 0.66 0.21 -4.61 -0.16 -1.54 -0.05 -0.07 0.98 1.13 -2.05 -1.92 0.34 0.02 -0.56 -0.07 0.52 -0.17
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.