Heatmap: Cluster_94 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
Ceric.02G025000.1 (Ceric.02G025000)
0.05 0.11 1.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.16 0.33 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.09 0.01
0.33 0.26 0.78 0.42 0.62 0.47 0.47 0.27 0.68 0.82 1.0 0.33 0.25 0.11 0.57 0.31 0.56 0.13 0.25 0.35 0.22 0.63 0.16 0.5 0.34 0.15
Ceric.06G015700.1 (Ceric.06G015700)
0.16 0.28 0.97 0.52 0.29 0.17 0.37 0.2 0.68 1.0 0.78 0.31 0.35 0.0 0.56 0.23 0.26 0.0 0.14 0.14 0.13 0.11 0.11 0.52 0.92 0.19
0.27 0.56 0.45 1.0 0.03 0.02 0.02 0.01 0.09 0.1 0.33 0.12 0.09 0.1 0.28 0.01 0.03 0.1 0.0 0.03 0.02 0.61 0.02 0.02 0.24 0.03
Ceric.06G080600.1 (Ceric.06G080600)
0.0 0.31 0.76 0.03 0.0 0.05 0.26 0.23 0.04 0.04 1.0 0.15 0.19 0.0 0.21 0.09 0.04 0.05 0.18 0.02 0.02 0.1 0.02 0.02 0.36 0.23
0.12 0.62 0.8 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.05 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 1.0 0.0
0.17 0.69 1.0 0.15 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.69 0.02 0.0 0.19 0.48 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.82 0.0
Ceric.08G014300.1 (AtATG18a)
0.08 0.63 0.85 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.01 0.19 0.45 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 1.0 0.0
Ceric.08G014400.1 (Ceric.08G014400)
0.15 0.55 0.82 0.46 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.09 0.55 0.0 0.0 0.09 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.02 0.64 0.0
Ceric.08G014500.1 (Ceric.08G014500)
0.02 0.34 0.69 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.06 0.06 0.01 0.32 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.23 0.02 0.0 0.08 0.0
Ceric.08G014600.1 (Ceric.08G014600)
0.06 0.34 0.87 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.41 0.05 0.0 0.0 0.26 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.29 0.0 0.0 0.38 0.0
Ceric.08G021200.1 (Ceric.08G021200)
0.01 0.54 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.19 0.0 0.01 0.02 0.34 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.01 0.02
Ceric.08G021600.1 (Ceric.08G021600)
0.09 0.42 1.0 0.18 0.02 0.05 0.12 0.07 0.2 0.21 0.18 0.07 0.09 0.1 0.54 0.05 0.03 0.07 0.11 0.03 0.08 0.56 0.07 0.01 0.47 0.23
Ceric.08G022800.1 (Ceric.08G022800)
0.07 0.14 1.0 0.12 0.09 0.04 0.04 0.04 0.1 0.13 0.77 0.12 0.12 0.15 0.42 0.09 0.1 0.09 0.08 0.12 0.13 0.37 0.12 0.09 0.17 0.12
Ceric.08G022900.1 (Ceric.08G022900)
0.02 0.13 1.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.09 0.35 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.16 0.0
Ceric.08G023900.1 (Ceric.08G023900)
0.0 0.74 1.0 0.99 0.0 0.0 0.28 0.0 0.2 0.13 0.94 0.11 0.11 0.0 0.24 0.11 0.42 0.0 0.0 0.18 0.0 0.15 0.09 0.04 0.13 0.0
Ceric.09G041300.1 (Ceric.09G041300)
0.17 0.45 1.0 0.2 0.51 0.19 0.19 0.16 0.27 0.29 0.57 0.38 0.34 0.17 0.56 0.3 0.52 0.18 0.29 0.55 0.36 0.6 0.37 0.55 0.31 0.35
Ceric.09G079400.1 (Ceric.09G079400)
0.1 0.24 0.89 0.38 0.74 0.14 0.61 0.16 0.42 0.41 0.95 0.25 0.29 0.0 0.51 0.28 0.8 0.0 0.37 0.54 0.18 0.26 0.25 1.0 0.48 0.29
Ceric.11G039100.1 (Ceric.11G039100)
0.05 0.27 1.0 0.4 0.33 0.1 0.2 0.09 0.51 0.43 0.68 0.43 0.13 0.0 0.24 0.14 0.25 0.0 0.11 0.07 0.22 0.07 0.12 0.3 0.92 0.13
Ceric.12G005900.1 (Ceric.12G005900)
0.02 0.05 0.02 0.02 0.13 0.19 0.18 0.13 0.17 0.1 0.09 0.11 0.15 0.04 0.62 0.08 0.1 0.3 0.63 0.29 0.32 0.3 0.03 0.05 1.0 0.0
Ceric.14G029300.1 (Ceric.14G029300)
0.1 0.34 1.0 0.16 0.09 0.04 0.47 0.6 0.22 0.4 0.38 0.48 0.62 0.0 0.28 0.03 0.03 0.0 0.47 0.11 0.11 0.39 0.07 0.0 0.48 0.39
Ceric.1Z007800.1 (Ceric.1Z007800)
0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.08
Ceric.1Z054200.1 (Ceric.1Z054200)
0.17 0.39 1.0 0.3 0.53 0.12 0.31 0.21 0.23 0.16 0.52 0.14 0.18 0.11 0.63 0.13 0.42 0.03 0.11 0.14 0.05 0.65 0.01 0.51 0.44 0.01
Ceric.1Z084600.1 (Ceric.1Z084600)
0.04 0.2 0.75 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.3 0.0
Ceric.1Z084700.1 (Ceric.1Z084700)
0.12 0.1 0.95 1.0 0.13 0.05 0.16 0.12 0.1 0.15 0.45 0.19 0.2 0.0 0.26 0.1 0.11 0.01 0.12 0.02 0.01 0.15 0.01 0.18 0.23 0.08
Ceric.1Z086200.1 (Ceric.1Z086200)
0.0 0.43 0.33 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.05 0.05 0.46 0.01 0.01 0.1 1.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.84 0.01 0.0 0.51 0.04
Ceric.1Z098600.1 (Ceric.1Z098600)
0.2 0.38 1.0 0.89 0.82 0.09 0.36 0.21 0.59 0.63 0.77 0.56 0.29 0.0 0.5 0.14 0.69 0.0 0.37 0.47 0.33 0.17 0.27 0.61 0.68 0.32
Ceric.1Z146800.1 (Ceric.1Z146800)
0.06 0.34 0.87 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.41 0.05 0.0 0.0 0.26 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.29 0.0 0.0 0.38 0.0
0.07 0.49 1.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.02 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.32 0.0
Ceric.1Z166100.1 (Ceric.1Z166100)
0.25 0.64 1.0 0.71 0.4 0.14 0.0 0.04 0.09 0.24 0.5 0.04 0.08 0.0 0.22 0.0 0.13 0.0 0.12 0.09 0.0 0.41 0.06 0.17 0.21 0.03
Ceric.1Z232500.1 (Ceric.1Z232500)
0.17 0.39 1.0 0.3 0.53 0.12 0.31 0.21 0.23 0.16 0.52 0.14 0.18 0.11 0.63 0.13 0.42 0.03 0.11 0.14 0.05 0.65 0.01 0.51 0.44 0.01
Ceric.1Z261600.1 (Ceric.1Z261600)
0.2 0.54 0.82 1.0 0.43 0.26 0.09 0.05 0.2 0.64 0.34 0.45 0.27 0.0 0.22 0.04 0.14 0.0 0.14 0.05 0.0 0.26 0.0 0.06 0.61 0.18
Ceric.20G038900.1 (Ceric.20G038900)
0.08 0.13 0.17 0.06 0.0 0.12 0.1 0.08 0.12 0.11 0.36 0.67 1.0 0.18 0.38 0.12 0.08 0.13 0.07 0.26 0.08 0.17 0.22 0.12 0.21 0.09
Ceric.22G017400.1 (Ceric.22G017400)
0.03 0.22 0.37 0.08 0.05 0.04 0.03 0.04 0.05 0.04 0.3 0.45 0.4 0.24 0.51 0.05 0.02 0.21 0.04 0.22 0.03 1.0 0.03 0.06 0.68 0.01
0.0 0.16 0.23 0.0 0.03 0.03 0.01 0.01 0.02 0.03 0.11 1.0 0.62 0.4 0.46 0.02 0.03 0.3 0.0 0.22 0.01 0.54 0.04 0.05 0.43 0.01
Ceric.25G037100.1 (Ceric.25G037100)
0.22 0.41 1.0 0.11 0.14 0.1 0.06 0.05 0.48 0.46 0.85 0.45 0.48 0.14 0.59 0.09 0.2 0.1 0.28 0.27 0.43 0.49 0.14 0.25 0.46 0.33
Ceric.25G059400.1 (Ceric.25G059400)
0.01 0.25 1.0 0.05 0.0 0.19 0.27 0.22 0.27 0.67 0.19 0.08 0.41 0.01 0.47 0.25 0.01 0.31 0.31 0.14 0.06 0.18 0.28 0.04 0.09 0.11
Ceric.28G013000.1 (Ceric.28G013000)
0.11 0.31 0.91 0.35 0.51 0.19 0.39 0.17 0.65 0.4 1.0 0.53 0.44 0.09 0.33 0.18 0.57 0.0 0.53 0.31 0.19 0.14 0.08 0.44 0.81 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.11 0.07 0.07 0.01 0.02 0.07 0.07 0.09 0.13 0.42 0.06 0.18 0.04 0.04 0.02 0.02 0.57 0.1 0.1 1.0 0.05
Ceric.32G023100.1 (Ceric.32G023100)
0.18 0.26 0.85 1.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.14 0.0 0.0 0.16 0.79 0.0 0.01 0.24 0.0 0.11 0.0 0.22 0.0 0.12 0.23 0.0
Ceric.33G066800.1 (Ceric.33G066800)
0.16 0.84 1.0 0.13 0.1 0.02 0.06 0.04 0.09 0.08 0.27 0.09 0.12 0.11 0.53 0.0 0.18 0.06 0.01 0.03 0.01 0.21 0.01 0.09 0.27 0.0
Ceric.33G066900.1 (Ceric.33G066900)
0.16 0.84 1.0 0.13 0.1 0.02 0.06 0.04 0.09 0.08 0.27 0.09 0.12 0.11 0.53 0.0 0.18 0.06 0.01 0.03 0.01 0.21 0.01 0.09 0.27 0.0
Ceric.36G058000.1 (Ceric.36G058000)
0.67 0.55 1.0 0.99 0.13 0.82 0.37 0.3 0.36 0.42 0.26 0.37 0.59 0.07 0.4 0.44 0.15 0.01 0.08 0.19 0.07 0.09 0.11 0.25 0.87 0.25
Ceric.37G004300.1 (Ceric.37G004300)
0.0 0.71 1.0 0.13 0.28 0.12 0.38 0.0 0.3 0.41 0.41 0.42 0.58 0.17 0.53 0.17 0.74 0.0 0.24 0.23 0.34 0.69 0.42 0.45 0.48 0.19
Ceric.37G050000.1 (Ceric.37G050000)
0.14 0.26 0.86 0.11 0.08 0.04 0.04 0.0 0.06 0.05 1.0 0.1 0.04 0.02 0.33 0.02 0.05 0.01 0.07 0.03 0.01 0.56 0.02 0.06 0.26 0.04
0.2 0.85 1.0 0.57 0.24 0.02 0.02 0.02 0.1 0.1 0.12 0.19 0.1 0.08 0.51 0.0 0.31 0.2 0.0 0.04 0.01 0.1 0.03 0.16 0.26 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)