Heatmap: Cluster_52 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Gametophyte	Male Gametophyte	Hermaphrodite Gametophyte	Gametophyte; Antheridiogen added at D-3	Sporophyte	Seedling, sporophyte	Seedling, 24h of 2\,4-D treatment	Seedling, 48h of 2\,4-D treatment	Whole plant	Whole plant, 2\,4-D Auxin	Callus	Differentiating Callus	Proliferating Callus	Bulbil	Leaf	Leaf (without leaf tip)	Leaf Tip	Root	Root (without root tip)	Root Tip	Differentiated root	Shoot Apex	Shoot	Shoot Tip	Vegetative Frond	Frond
Ceric.01G029900.1 (Ceric.01G029900)	0.56	0.5	0.27	1.0	0.33	0.18	0.19	0.2	0.25	0.25	0.26	0.73	0.78	0.12	0.35	0.13	0.32	0.24	0.24	0.66	0.71	0.32	0.3	0.3	0.34	0.42
Ceric.01G058100.1 (Ceric.01G058100)	0.65	0.51	0.43	1.0	0.68	0.46	0.48	0.42	0.21	0.2	0.47	0.28	0.3	0.11	0.4	0.42	0.66	0.14	0.24	0.57	0.23	0.99	0.24	0.56	0.69	0.21
Ceric.01G093400.1 (Ceric.01G093400)	0.87	0.87	0.25	0.8	0.12	0.07	0.13	0.19	0.58	0.75	0.29	0.14	0.13	0.08	0.45	0.12	0.19	0.39	0.14	0.47	1.0	0.53	0.43	0.14	0.36	0.22
Ceric.02G061700.1 (RNL)	0.31	0.48	0.34	1.0	0.23	0.26	0.36	0.38	0.53	0.45	0.21	0.38	0.47	0.04	0.25	0.12	0.25	0.23	0.54	0.36	0.93	0.19	0.15	0.22	0.43	0.31
Ceric.02G074400.1 (TPS5)	0.12	0.18	0.08	0.25	0.01	0.09	0.15	0.18	0.48	0.51	0.12	0.07	0.14	0.01	0.12	0.03	0.02	0.13	0.43	0.25	1.0	0.16	0.03	0.03	0.05	0.03
Ceric.02G085600.1 (RHF2A)	0.14	0.44	0.37	0.18	0.46	0.48	0.55	0.46	0.37	0.4	0.3	0.56	0.59	0.1	0.42	0.31	0.45	0.22	1.0	0.52	0.89	0.49	0.26	0.52	0.62	0.53
Ceric.03G017000.1 (Ceric.03G017000)	0.33	0.37	0.33	0.58	0.01	0.13	0.22	0.25	0.47	0.53	0.11	0.1	0.21	0.03	0.27	0.06	0.01	0.18	0.62	0.41	1.0	0.12	0.03	0.04	0.22	0.03
Ceric.03G041800.1 (ATDAD1)	0.53	0.4	0.36	0.74	0.59	0.5	0.48	0.53	0.46	0.47	0.97	0.98	0.93	0.2	0.44	0.34	0.61	0.44	0.41	1.0	0.8	0.66	0.35	0.69	0.6	0.34
Ceric.03G078400.1 (TIM23-2)	0.6	0.56	0.46	0.63	0.42	0.41	0.5	0.47	1.0	0.91	0.63	0.65	0.78	0.16	0.55	0.3	0.39	0.45	0.8	0.74	0.88	0.39	0.24	0.53	0.52	0.4
Ceric.04G008600.1 (Ceric.04G008600)	0.56	0.17	0.1	1.0	0.13	0.06	0.07	0.07	0.39	0.35	0.31	0.36	0.3	0.11	0.28	0.05	0.17	0.22	0.07	0.4	0.32	0.33	0.22	0.2	0.26	0.0
Ceric.04G094400.1 (Ceric.04G094400)	0.09	0.34	0.52	1.0	0.52	0.37	0.44	0.4	0.65	0.63	0.38	0.64	0.61	0.06	0.29	0.26	0.47	0.14	0.35	0.55	0.54	0.35	0.34	0.49	0.36	0.35
Ceric.05G022500.1 (Ceric.05G022500)	0.45	0.43	0.22	1.0	0.14	0.14	0.14	0.14	0.13	0.13	0.16	0.38	0.32	0.11	0.26	0.13	0.15	0.36	0.15	0.62	0.88	0.38	0.26	0.18	0.32	0.12
Ceric.05G059000.1 (Ceric.05G059000)	0.6	0.75	0.65	0.9	0.46	0.56	0.49	0.44	0.78	0.84	0.22	0.22	0.19	0.13	0.47	0.58	0.46	0.53	0.67	0.68	1.0	0.67	0.38	0.55	0.73	0.31
Ceric.05G059600.1 (SYT5)	0.43	0.49	0.49	1.0	0.33	0.24	0.35	0.29	0.71	0.66	0.73	0.51	0.51	0.09	0.34	0.06	0.29	0.17	0.64	0.43	0.92	0.45	0.08	0.56	0.78	0.12
Ceric.06G036900.1 (Ceric.06G036900)	0.11	0.28	0.3	0.48	0.52	0.65	0.73	0.56	0.65	0.7	0.27	0.71	0.89	0.12	0.41	0.5	0.5	0.27	1.0	0.44	0.6	0.18	0.28	0.43	0.41	0.41
Ceric.06G045800.1 (Ceric.06G045800)	0.38	0.34	0.17	1.0	0.27	0.15	0.15	0.17	0.16	0.14	0.16	0.17	0.16	0.01	0.15	0.13	0.27	0.06	0.16	0.42	0.33	0.31	0.15	0.26	0.24	0.17
Ceric.06G066200.1 (PFN1)	0.34	0.46	0.34	0.39	0.21	0.41	0.46	0.42	0.21	0.22	0.23	0.28	0.34	0.12	0.32	0.36	0.2	0.63	0.68	0.71	1.0	0.37	0.28	0.31	0.42	0.34
Ceric.07G076400.1 (Ceric.07G076400)	0.25	0.08	0.04	1.0	0.1	0.6	0.01	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.1	0.01	0.09	0.0	0.66	0.18	0.23	0.0	0.01	0.01	0.06	0.05
Ceric.07G076500.1 (Ceric.07G076500)	0.17	0.02	0.03	1.0	0.09	0.66	0.04	0.14	0.01	0.0	0.03	0.04	0.11	0.46	0.07	0.0	0.1	0.01	0.47	0.44	0.23	0.02	0.01	0.03	0.24	0.03
Ceric.07G082700.1 (TPLATE)	0.18	0.38	0.44	1.0	0.31	0.36	0.42	0.42	0.67	0.64	0.33	0.55	0.67	0.06	0.29	0.27	0.31	0.19	0.46	0.59	0.44	0.42	0.17	0.61	0.51	0.21
Ceric.08G039700.1 (MTACP1)	0.69	0.5	0.29	1.0	0.31	0.2	0.26	0.26	0.59	0.6	0.44	0.61	0.58	0.1	0.37	0.17	0.33	0.3	0.24	0.89	0.87	0.4	0.33	0.34	0.42	0.24
Ceric.09G062800.1 (Ceric.09G062800)	0.67	0.59	0.35	1.0	0.41	0.19	0.14	0.13	0.54	0.51	0.49	0.38	0.44	0.15	0.37	0.11	0.38	0.29	0.1	0.66	0.47	0.88	0.29	0.42	0.38	0.23
Ceric.09G066600.1 (Ceric.09G066600)	0.07	0.32	0.32	1.0	0.21	0.26	0.19	0.13	0.59	0.67	0.06	0.41	0.41	0.11	0.36	0.2	0.15	0.55	0.51	0.57	0.57	0.11	0.48	0.29	0.42	0.47
Ceric.11G017700.1 (Ceric.11G017700)	0.47	0.19	0.19	1.0	0.08	0.05	0.01	0.06	0.38	0.44	0.29	0.15	0.17	0.11	0.21	0.01	0.06	0.35	0.04	0.45	0.5	0.37	0.21	0.11	0.27	0.0
Ceric.11G029100.1 (Ceric.11G029100)	0.39	0.59	0.32	0.47	0.58	0.53	0.57	0.66	0.29	0.3	0.39	0.85	1.0	0.11	0.34	0.45	0.61	0.34	0.58	0.97	0.73	0.47	0.29	0.7	0.35	0.29
Ceric.11G034000.1 (Ceric.11G034000)	0.1	0.17	0.23	0.56	0.23	0.35	0.42	0.46	0.46	0.43	0.2	0.18	0.22	0.06	0.29	0.15	0.19	0.11	1.0	0.34	0.62	0.19	0.08	0.31	0.27	0.21
Ceric.11G093700.1 (CCR1)	0.24	0.42	0.34	0.33	0.64	0.79	0.54	0.58	0.72	0.65	0.3	0.46	0.49	0.15	0.43	0.42	0.59	0.23	1.0	0.54	0.71	0.63	0.32	0.54	0.55	0.46
Ceric.12G026100.1 (Ceric.12G026100)	0.51	0.34	0.21	1.0	0.27	0.16	0.24	0.3	0.51	0.5	0.38	0.74	0.72	0.13	0.3	0.17	0.27	0.4	0.26	0.73	0.66	0.34	0.22	0.28	0.37	0.16
Ceric.13G019800.1 (PPOX)	0.3	0.37	0.28	1.0	0.29	0.34	0.3	0.36	0.54	0.5	0.24	0.35	0.46	0.09	0.27	0.22	0.31	0.25	0.66	0.61	0.56	0.29	0.13	0.45	0.36	0.24
Ceric.16G051400.1 (Ceric.16G051400)	0.45	0.52	0.25	1.0	0.15	0.13	0.15	0.16	0.13	0.13	0.16	0.13	0.11	0.06	0.21	0.13	0.16	0.19	0.16	0.35	0.45	0.26	0.15	0.17	0.24	0.14
Ceric.18G006400.1 (Ceric.18G006400)	0.57	0.53	0.2	0.89	0.08	0.04	0.04	0.11	0.29	0.39	0.32	0.35	0.48	0.08	0.28	0.02	0.08	0.21	0.21	0.32	1.0	0.14	0.08	0.16	0.27	0.18
Ceric.1Z037100.1 (Ceric.1Z037100)	0.19	0.2	0.26	0.58	0.15	0.33	0.44	0.47	0.71	0.7	0.21	0.16	0.2	0.03	0.35	0.17	0.2	0.1	1.0	0.4	0.66	0.3	0.06	0.34	0.35	0.2
Ceric.20G025600.1 (EIF4B1)	0.35	0.28	0.33	1.0	0.33	0.33	0.32	0.38	0.55	0.54	0.37	0.47	0.6	0.06	0.24	0.18	0.33	0.21	0.59	0.37	0.72	0.24	0.12	0.36	0.3	0.3
Ceric.20G037000.1 (Ceric.20G037000)	0.37	0.58	0.46	1.0	0.27	0.44	0.5	0.56	0.51	0.57	0.18	0.44	0.49	0.12	0.38	0.23	0.26	0.42	1.0	0.46	0.67	0.37	0.18	0.38	0.76	0.32
Ceric.20G045900.1 (Ceric.20G045900)	0.53	0.78	0.84	1.0	0.83	0.39	0.52	0.42	0.91	0.85	0.83	0.77	0.96	0.13	0.53	0.32	0.82	0.18	0.69	0.72	0.81	0.66	0.38	0.82	0.55	0.59
Ceric.21G030000.1 (Ceric.21G030000)	0.36	0.4	0.22	1.0	0.48	0.4	0.42	0.46	0.2	0.2	0.31	0.49	0.44	0.1	0.3	0.31	0.49	0.24	0.43	0.67	0.54	0.34	0.16	0.57	0.34	0.23
Ceric.22G034100.1 (PEX7)	0.67	0.45	0.6	1.0	0.49	0.35	0.34	0.25	0.69	0.67	0.57	0.55	0.65	0.15	0.34	0.27	0.5	0.21	0.37	0.54	0.72	0.36	0.39	0.41	0.4	0.58
Ceric.22G055300.1 (Ceric.22G055300)	0.33	0.35	0.15	0.95	0.34	0.55	0.32	0.25	0.31	0.31	0.04	0.09	0.05	0.14	0.24	0.38	0.34	0.09	0.84	0.43	1.0	0.2	0.23	0.39	0.33	0.15
Ceric.22G064400.1 (Ceric.22G064400)	0.6	0.33	0.39	1.0	0.53	0.33	0.34	0.3	0.33	0.31	0.3	0.21	0.23	0.12	0.33	0.35	0.54	0.19	0.21	0.51	0.26	0.3	0.25	0.49	0.2	0.25
Ceric.22G077800.1 (Ceric.22G077800)	0.32	0.32	0.3	1.0	0.44	0.37	0.4	0.4	0.51	0.47	0.29	0.58	0.67	0.09	0.29	0.2	0.45	0.2	0.47	0.62	0.65	0.32	0.14	0.47	0.48	0.22
Ceric.23G015200.1 (ACT4)	0.22	0.38	0.11	0.24	0.07	0.14	0.15	0.25	0.49	0.47	0.03	0.11	0.12	0.04	0.23	0.06	0.06	0.4	0.65	0.17	1.0	0.44	0.05	0.15	0.41	0.02
Ceric.23G076400.1 (Ceric.23G076400)	0.17	0.29	0.24	0.2	0.17	0.25	0.25	0.27	0.34	0.33	0.18	0.36	0.34	0.14	0.29	0.19	0.18	0.3	0.75	0.32	1.0	0.28	0.16	0.25	0.44	0.32
Ceric.24G023300.1 (GLT1)	0.09	0.28	0.38	0.73	0.26	0.45	1.0	0.26	0.54	0.58	0.69	0.44	0.44	0.02	0.2	0.19	0.26	0.09	0.97	0.24	0.74	0.17	0.25	0.2	0.18	0.19
Ceric.24G032000.1 (RHF2A)	0.22	0.5	0.14	0.84	0.38	0.42	0.53	0.08	0.33	0.39	0.0	0.38	0.3	0.12	0.24	0.29	0.63	0.08	0.17	0.71	1.0	0.63	0.07	0.55	0.16	0.01
Ceric.24G032100.1 (Ceric.24G032100)	0.32	0.61	0.38	1.0	0.28	0.22	0.22	0.3	0.34	0.33	0.33	0.5	0.54	0.08	0.26	0.06	0.28	0.19	0.95	0.67	0.72	0.22	0.05	0.47	0.47	0.19
Ceric.24G053700.1 (GMII)	0.22	0.58	0.6	1.0	0.6	0.49	0.56	0.49	0.76	0.7	0.49	0.79	0.91	0.14	0.42	0.38	0.59	0.25	0.64	0.76	0.48	0.42	0.21	0.6	0.65	0.34
Ceric.24G073800.1 (GAE1)	0.37	0.5	0.68	0.7	0.32	0.59	0.57	0.79	0.77	0.77	0.31	0.37	0.44	0.15	0.44	0.68	0.38	0.35	0.88	0.61	1.0	0.53	0.35	0.38	0.85	0.3
Ceric.25G006700.1 (NLP7)	0.16	0.51	0.5	0.48	0.28	0.47	0.56	0.52	0.94	1.0	0.22	0.6	0.72	0.08	0.44	0.34	0.28	0.3	0.58	0.46	0.54	0.28	0.25	0.22	0.26	0.35
Ceric.26G001400.1 (Ceric.26G001400)	0.6	0.46	0.48	0.69	0.66	0.4	0.43	0.41	0.93	1.0	0.64	0.38	0.45	0.12	0.41	0.27	0.63	0.16	0.28	0.77	0.47	0.63	0.32	0.53	0.48	0.31
Ceric.26G003400.1 (Ceric.26G003400)	0.55	0.28	0.19	1.0	0.34	0.36	0.34	0.42	0.17	0.18	0.24	0.54	0.48	0.09	0.25	0.25	0.32	0.27	0.27	0.49	0.38	0.27	0.14	0.35	0.24	0.12
Ceric.26G048400.1 (Ceric.26G048400)	0.88	0.66	0.38	0.74	0.35	0.33	0.34	0.35	0.59	0.5	1.0	0.42	0.48	0.16	0.45	0.21	0.39	0.3	0.23	0.85	0.62	0.64	0.37	0.52	0.58	0.16
Ceric.27G015400.1 (Ceric.27G015400)	0.77	0.67	0.55	1.0	0.53	0.46	0.49	0.5	0.68	0.62	0.49	0.64	0.66	0.13	0.41	0.29	0.5	0.31	0.5	0.96	0.88	0.56	0.33	0.56	0.56	0.5
Ceric.28G004900.1 (Ceric.28G004900)	0.7	0.63	0.42	1.0	0.52	0.32	0.33	0.3	0.37	0.32	0.45	0.49	0.49	0.14	0.54	0.28	0.51	0.21	0.25	0.71	0.74	0.74	0.51	0.49	0.67	0.35
Ceric.28G050900.1 (Ceric.28G050900)	0.82	0.29	0.53	1.0	0.37	0.08	0.09	0.09	0.28	0.28	0.5	0.59	0.47	0.13	0.38	0.06	0.34	0.21	0.09	0.95	0.41	0.4	0.29	0.33	0.18	0.12
Ceric.28G051900.1 (Ceric.28G051900)	0.72	0.47	0.46	0.94	0.62	0.8	0.87	0.92	0.91	0.89	0.38	0.95	0.87	0.11	0.36	0.45	0.58	0.33	0.95	0.65	1.0	0.41	0.17	0.76	0.36	0.32
Ceric.28G061700.1 (Ceric.28G061700)	0.4	0.62	0.46	0.9	0.35	0.5	0.58	0.72	0.74	0.76	0.4	0.53	0.64	0.09	0.39	0.44	0.39	0.33	0.92	0.69	1.0	0.49	0.28	0.48	0.74	0.35
Ceric.29G055700.1 (Ceric.29G055700)	0.58	0.55	0.35	1.0	0.21	0.14	0.16	0.19	0.42	0.42	0.33	0.3	0.39	0.09	0.33	0.12	0.22	0.24	0.21	0.61	0.69	0.37	0.3	0.26	0.32	0.26
Ceric.30G008000.1 (Ceric.30G008000)	0.32	0.55	0.36	0.62	0.29	0.38	0.38	0.39	0.3	0.28	0.29	0.3	0.31	0.09	0.32	0.26	0.25	0.34	0.35	0.75	1.0	0.37	0.28	0.34	0.32	0.3
Ceric.30G074100.1 (CYB-1)	0.85	0.59	0.49	0.87	0.42	0.23	0.27	0.22	1.0	0.87	0.61	0.5	0.64	0.11	0.44	0.23	0.43	0.28	0.38	0.91	0.7	0.56	0.26	0.49	0.53	0.29
Ceric.31G005000.1 (Ceric.31G005000)	0.73	0.5	0.36	1.0	0.29	0.24	0.29	0.27	0.19	0.15	0.35	0.17	0.15	0.09	0.28	0.23	0.28	0.28	0.28	0.61	0.67	0.58	0.22	0.31	0.49	0.15
Ceric.32G016300.1 (APX2)	0.36	0.48	0.26	0.73	0.74	0.37	0.41	0.4	0.26	0.23	0.58	0.41	0.43	0.14	0.32	0.09	0.75	0.24	0.3	0.96	0.47	0.63	0.09	1.0	0.49	0.3
Ceric.33G020500.1 (Ceric.33G020500)	0.77	0.84	0.71	0.86	0.38	0.67	0.49	0.59	0.86	0.9	0.36	1.0	0.94	0.18	0.57	0.47	0.37	0.47	0.72	0.94	0.91	0.44	0.51	0.48	0.54	0.73
Ceric.33G026300.1 (Ceric.33G026300)	0.56	0.63	0.5	0.65	0.39	0.24	0.2	0.19	0.57	0.55	0.5	0.3	0.32	0.22	0.38	0.3	0.33	0.54	0.32	0.73	1.0	0.44	0.45	0.4	0.3	0.28
Ceric.34G001000.1 (Ceric.34G001000)	0.38	0.73	0.27	1.0	0.2	0.1	0.11	0.1	0.52	0.65	0.47	0.6	0.63	0.15	0.36	0.06	0.23	0.32	0.1	0.57	0.45	0.46	0.27	0.3	0.22	0.09
Ceric.35G004500.1 (Ceric.35G004500)	0.28	0.56	0.37	0.81	0.22	0.34	0.39	0.41	0.7	0.61	0.18	0.33	0.39	0.06	0.34	0.13	0.23	0.32	0.72	0.67	1.0	0.19	0.09	0.26	0.4	0.26
Ceric.35G022100.1 (Ceric.35G022100)	0.82	0.29	0.53	1.0	0.37	0.08	0.09	0.09	0.28	0.28	0.5	0.59	0.47	0.13	0.38	0.06	0.34	0.21	0.09	0.95	0.41	0.4	0.29	0.33	0.18	0.12
Ceric.35G022200.1 (Ceric.35G022200)	0.82	0.29	0.53	1.0	0.37	0.08	0.09	0.09	0.28	0.28	0.5	0.59	0.47	0.13	0.38	0.06	0.34	0.21	0.09	0.95	0.41	0.4	0.29	0.33	0.18	0.12
Ceric.35G022300.1 (Ceric.35G022300)	0.82	0.29	0.53	1.0	0.37	0.08	0.09	0.09	0.28	0.28	0.5	0.59	0.47	0.13	0.38	0.06	0.34	0.21	0.09	0.95	0.41	0.4	0.29	0.33	0.18	0.12
Ceric.38G023900.1 (Ceric.38G023900)	0.06	0.41	0.25	0.49	0.2	0.1	0.15	0.17	0.26	0.23	0.01	0.07	0.06	0.11	0.28	0.01	0.22	0.24	0.68	0.63	1.0	0.11	0.04	0.33	0.32	0.02
Ceric.38G050200.1 (Ceric.38G050200)	0.37	0.33	0.38	0.48	0.44	0.24	0.31	0.33	1.0	0.86	0.48	0.5	0.59	0.1	0.33	0.17	0.41	0.22	0.25	0.73	0.56	0.4	0.29	0.41	0.4	0.23
Ceric.39G028100.1 (Ceric.39G028100)	0.14	0.19	0.21	1.0	0.05	0.16	0.22	0.21	0.33	0.29	0.45	0.3	0.37	0.03	0.18	0.08	0.05	0.16	0.85	0.33	0.67	0.17	0.02	0.06	0.29	0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)