Heatmap: Cluster_146 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
Ceric.01G035400.1 (Ceric.01G035400)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.03G073100.1 (Ceric.03G073100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.04G005800.1 (Ceric.04G005800)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.05 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.06G032200.1 (Ceric.06G032200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.01
Ceric.09G040100.1 (Ceric.09G040100)
0.77 0.84 1.43 4.12 3.78 0.0 0.0 0.82 1.21 3.0 2.79 7.74 13.86 2.3 1.36 0.0 2.51 4.91 0.0 25.92 6.12 1.57 2.71 9.23 1.64 0.06
Ceric.09G100000.1 (Ceric.09G100000)
0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.18 0.16 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.11G083700.1 (Ceric.11G083700)
0.0 0.0 0.0 0.0 9.33 0.0 0.0 4.19 0.0 0.0 6.89 9.7 0.0 0.0 4.31 0.0 3.11 0.0 0.0 9.95 7.51 0.0 3.25 0.0 0.0 0.0
Ceric.12G035100.1 (Ceric.12G035100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
Ceric.12G063800.1 (Ceric.12G063800)
0.04 0.08 0.04 0.08 0.0 0.08 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.12 0.04 0.0 0.0 0.12 0.0 0.01
Ceric.13G033400.1 (Ceric.13G033400)
0.0 0.0 0.01 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.09 0.16 0.0
0.05 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
Ceric.14G009200.1 (Ceric.14G009200)
0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.4 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.15G062700.1 (Ceric.15G062700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.16G048800.1 (Ceric.16G048800)
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.17G019400.1 (Ceric.17G019400)
0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.17G051500.1 (Ceric.17G051500)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.12 0.0 0.03
Ceric.18G027400.1 (Ceric.18G027400)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z121800.1 (Ceric.1Z121800)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
Ceric.1Z172100.1 (Ceric.1Z172100)
0.0 2.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 2.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z245700.1 (Ceric.1Z245700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z299700.1 (Ceric.1Z299700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.14 0.0 0.0
Ceric.1Z315600.1 (Ceric.1Z315600)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.14 0.0 0.0
Ceric.20G042200.1 (Ceric.20G042200)
0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.14 2.07 3.46 1.56 0.0 0.0 0.0 4.2 0.06 0.0 3.05 1.99 1.31 3.92 1.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.20G050800.1 (Ceric.20G050800)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.21G006100.1 (Ceric.21G006100)
0.01 0.08 0.09 0.16 0.14 0.16 0.26 0.14 0.19 0.19 0.1 0.03 0.02 0.16 0.09 0.04 0.25 0.01 0.16 0.06 0.05 0.07 0.11 0.18 0.06 0.11
Ceric.24G072500.1 (Ceric.24G072500)
0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.22 0.0 0.21 0.0 0.19 0.0 0.0 0.51 0.0 0.12 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.2 0.4 0.34 0.16 0.0 0.28
Ceric.25G055300.1 (Ceric.25G055300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.28G005800.1 (Ceric.28G005800)
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.16 0.0 0.0 0.27 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Ceric.29G003300.1 (Ceric.29G003300)
0.03 0.0 0.29 10.65 1.01 0.0 1.05 0.0 6.98 13.29 0.0 11.23 14.0 0.0 9.78 0.0 0.34 14.82 0.0 59.38 0.0 0.0 8.9 0.0 0.0 4.21
Ceric.30G001400.1 (Ceric.30G001400)
0.0 1.3 0.23 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.74 0.5 0.0 0.0 0.11 0.0 1.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0
Ceric.32G039000.1 (Ceric.32G039000)
0.0 1.24 1.08 0.33 0.0 0.61 0.42 0.4 0.2 0.19 0.11 0.93 0.4 0.05 0.29 0.18 0.15 0.2 0.35 0.74 1.1 0.25 0.28 0.1 0.26 0.45
Ceric.33G008900.1 (Ceric.33G008900)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0 0.0 0.12 0.0
Ceric.34G013100.1 (Ceric.34G013100)
0.02 0.21 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.02 0.05 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.2 0.1 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01
Ceric.36G003300.1 (Ceric.36G003300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.28 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01
Ceric.37G018300.1 (Ceric.37G018300)
0.0 0.37 0.06 0.0 0.0 0.19 0.13 0.0 0.05 0.06 0.0 0.07 0.23 0.13 0.09 0.0 0.0 0.5 0.0 0.63 0.88 0.0 0.2 0.0 0.92 0.17
Ceric.38G031000.1 (Ceric.38G031000)
0.11 0.06 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.05 0.0 0.13 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.31 0.0 0.0 0.14 0.0 0.06
Ceric.39G034600.1 (Ceric.39G034600)
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)