1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_108 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
0.0 4.97 12.46 1.4 0.0 0.0 0.71 0.0 3.57 1.74 0.0 0.4 1.21 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.77
Ceric.02G017900.1 (Ceric.02G017900)
 0.0 0.0 0.05 0.0 2.76 0.15 0.8 0.46 0.11 0.26 0.31 0.0 0.0 0.0 0.58 0.21 1.61 0.0 2.42 1.59 0.14 0.0 0.0 2.69 0.3 0.01
Ceric.02G054000.1 (Ceric.02G054000)
 0.02 0.31 0.38 0.05 0.25 0.0 0.0 0.28 0.15 0.04 0.27 0.4 0.22 0.0 0.25 0.05 0.16 0.0 0.18 0.1 0.06 0.04 0.06 0.15 0.5 0.07
Ceric.03G013500.1 (Ceric.03G013500)
 0.35 0.88 0.77 1.85 2.53 3.26 2.5 1.47 6.86 3.78 1.03 3.48 3.48 1.09 2.48 2.91 3.49 1.35 3.14 1.04 0.7 1.16 0.49 3.2 2.45 0.59
Ceric.04G100400.1 (Ceric.04G100400)
 0.0 0.1 0.16 0.22 0.34 0.0 0.13 0.1 0.25 0.22 0.38 0.26 0.27 0.0 0.21 0.23 0.25 0.07 0.03 0.1 0.0 0.0 0.15 0.07 0.4 0.16
Ceric.05G078600.1 (Ceric.05G078600)
 1.04 1.68 2.07 0.71 3.55 1.59 2.24 1.57 3.82 4.06 1.43 6.26 3.19 0.2 2.74 2.06 3.66 0.28 2.54 3.02 3.16 2.95 2.32 2.21 3.92 1.34
Ceric.06G018300.1 (Ceric.06G018300)
 0.41 2.77 0.9 1.33 7.42 5.97 7.65 10.13 7.13 4.05 0.38 0.43 0.77 1.85 2.03 2.44 9.19 3.14 6.94 3.06 1.02 2.13 0.4 4.71 1.18 0.29
Ceric.06G032900.1 (Ceric.06G032900)
 0.3 0.45 0.88 0.97 0.0 0.66 0.77 0.24 0.68 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.84 0.46 0.0 0.0 1.08 0.1 0.0 1.01 0.57 0.48 0.0 0.19
Ceric.08G016700.1 (Ceric.08G016700)
 0.14 0.44 0.33 0.46 0.17 0.15 0.12 0.11 0.67 0.3 0.21 0.04 0.1 0.07 0.25 0.14 0.31 0.0 0.18 0.09 0.0 0.0 0.03 0.19 0.52 0.09
Ceric.08G061000.1 (Ceric.08G061000)
 0.0 0.0 0.3 0.35 3.81 2.96 4.2 2.0 3.52 1.37 1.52 1.13 1.57 0.27 1.1 1.15 4.59 0.27 2.85 1.15 0.11 0.0 0.0 3.41 2.2 0.14
Ceric.10G004700.1 (Ceric.10G004700)
 0.56 1.64 1.68 1.08 2.88 2.3 2.01 2.01 3.72 3.59 1.8 1.71 1.35 0.23 1.15 1.29 2.73 0.44 2.62 0.84 0.14 0.61 0.22 1.89 2.22 0.49
Ceric.10G022900.1 (Ceric.10G022900)
 0.49 2.72 2.74 2.32 8.0 9.8 10.62 8.83 6.37 6.39 1.13 3.01 3.2 1.29 4.1 9.94 9.77 2.22 16.63 2.86 0.13 1.55 0.65 6.89 4.04 0.47
Ceric.10G064400.1 (Ceric.10G064400)
 0.05 0.34 0.48 0.0 0.33 0.16 0.1 0.15 0.66 0.04 0.0 0.12 0.06 0.0 0.12 0.08 0.15 0.0 0.36 0.1 0.05 0.0 0.11 0.11 0.56 0.09
4.23 7.7 15.45 5.05 5.8 13.44 11.94 9.68 14.59 12.47 2.41 8.1 6.82 3.27 9.41 7.81 6.12 6.17 13.56 11.82 6.88 5.61 6.82 9.69 10.79 7.41
Ceric.12G029800.1 (Ceric.12G029800)
 1.36 2.52 2.76 6.72 2.26 1.5 2.44 1.53 8.78 10.34 5.74 7.28 8.49 0.81 7.18 1.31 3.9 0.37 1.69 1.81 0.81 1.12 1.16 2.85 7.82 3.93
Ceric.13G015400.1 (Ceric.13G015400)
 0.0 0.19 0.15 0.19 0.14 0.06 0.07 0.0 0.1 0.17 0.43 0.37 0.0 0.0 0.19 0.0 0.14 0.0 0.17 0.13 0.23 0.0 0.0 0.28 0.62 0.06
Ceric.13G064000.1 (Ceric.13G064000)
 0.0 0.12 0.34 0.96 2.18 2.08 1.2 1.57 2.85 2.54 1.26 1.3 0.85 0.8 0.89 0.76 2.39 0.49 1.41 0.83 0.11 0.45 0.09 2.07 0.48 0.16
Ceric.13G071600.1 (Ceric.13G071600)
 0.24 0.08 0.09 0.17 1.17 0.62 1.26 1.0 0.58 0.73 0.29 1.38 0.9 0.52 0.72 0.33 1.34 0.33 1.96 0.36 0.15 0.0 0.0 1.01 0.33 0.16
Ceric.14G029400.1 (Ceric.14G029400)
 1.1 0.98 1.87 1.57 1.3 0.47 0.35 0.4 2.7 3.25 2.09 0.87 0.43 0.11 0.84 0.54 0.98 0.14 1.42 1.33 1.35 0.15 0.52 0.49 2.16 0.81
Ceric.14G063900.1 (Ceric.14G063900)
 0.22 1.25 1.84 1.23 53.14 26.41 31.64 19.4 21.34 23.9 3.65 9.54 7.41 5.88 13.83 19.59 57.76 9.1 16.75 14.37 0.59 0.62 1.06 32.01 2.11 1.26
Ceric.15G010900.1 (Ceric.15G010900)
 0.0 0.08 0.23 0.06 0.22 0.14 0.16 0.14 0.21 0.2 0.39 0.18 0.25 0.0 0.2 0.17 0.13 0.02 0.05 0.03 0.09 0.04 0.13 0.03 0.27 0.23
Ceric.15G052000.1 (Ceric.15G052000)
 0.26 0.0 0.88 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 1.33 1.49 0.57 0.0 0.23 0.38 0.29 0.34 0.13 0.22 0.2 0.0 0.14 0.0 0.12 0.45 0.32 0.2
Ceric.16G051600.1 (Ceric.16G051600)
 0.07 0.65 0.93 0.55 0.33 0.45 0.87 1.46 0.21 0.09 1.6 2.04 2.2 0.13 0.94 0.15 0.5 0.14 0.72 0.19 0.17 0.14 0.15 0.24 1.44 0.65
0.0 4.97 12.46 1.4 0.0 0.0 0.71 0.0 3.57 1.74 0.0 0.4 1.21 0.0 1.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.77
Ceric.1Z248500.1 (Ceric.1Z248500)
 0.0 0.08 0.08 0.08 0.18 0.48 0.33 0.0 0.11 0.13 0.0 0.56 0.66 0.0 0.29 0.16 0.42 0.0 0.0 0.14 0.07 0.15 0.19 0.47 0.47 0.08
Ceric.1Z299400.1 (Ceric.1Z299400)
 0.38 1.02 1.02 1.35 2.88 2.29 2.7 2.11 2.46 2.61 1.36 2.69 1.68 0.72 1.56 1.4 3.2 0.4 3.43 0.95 0.23 0.96 0.05 2.17 1.5 0.35
Ceric.20G048600.1 (Ceric.20G048600)
 1.1 1.3 3.08 1.23 0.67 0.33 0.4 0.21 3.9 2.42 2.39 0.12 0.0 0.0 0.53 0.11 0.22 0.16 0.25 0.76 0.78 0.27 1.06 0.16 0.95 0.57
Ceric.21G018300.1 (Ceric.21G018300)
 0.0 0.58 0.83 0.51 0.16 0.24 0.07 0.45 0.77 1.04 0.82 0.55 0.15 0.08 0.44 0.13 0.54 0.0 0.14 0.1 0.05 0.11 0.18 0.72 0.52 0.17
Ceric.21G042800.1 (Ceric.21G042800)
 0.0 0.0 1.08 2.6 0.0 0.0 0.43 0.0 3.0 0.22 2.03 0.22 0.43 0.19 0.92 0.26 0.98 0.55 0.0 0.21 0.0 0.0 0.07 0.66 0.0 0.11
Ceric.23G062100.1 (Ceric.23G062100)
 0.1 0.14 0.21 0.29 0.08 0.18 0.08 0.04 0.22 0.32 0.49 0.34 0.3 0.0 0.18 0.03 0.22 0.04 0.24 0.04 0.03 0.0 0.12 0.43 0.43 0.04
Ceric.23G082300.1 (Ceric.23G082300)
 0.06 0.4 1.0 0.23 1.05 0.5 0.6 0.4 2.33 1.98 0.24 0.2 0.12 0.0 0.84 0.35 0.7 0.52 0.44 0.24 0.17 0.0 0.15 0.43 0.35 0.37
Ceric.24G058700.1 (Ceric.24G058700)
 0.05 0.41 0.25 0.41 0.0 0.09 0.09 0.16 0.46 0.4 0.17 0.0 0.0 0.23 0.08 0.06 0.04 0.23 0.11 0.1 0.24 0.0 0.1 0.18 0.44 0.09
Ceric.24G068300.1 (Ceric.24G068300)
 0.16 0.83 0.24 0.08 0.14 0.05 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.11 0.05 0.05 0.0 0.21 0.2 0.08 0.06 0.03 0.12 0.0 0.06
Ceric.24G071600.1 (Ceric.24G071600)
 0.0 0.82 0.5 0.6 2.45 1.89 2.96 1.45 3.51 3.45 0.0 0.62 0.39 0.0 0.71 0.57 1.65 0.5 1.48 0.45 0.0 0.28 0.0 1.53 0.36 0.07
Ceric.25G056000.1 (Ceric.25G056000)
 0.08 0.34 5.15 0.68 0.99 0.96 0.45 0.69 0.93 0.53 2.68 0.0 1.63 0.0 2.14 0.53 1.51 0.0 0.74 1.36 0.0 0.32 0.73 2.03 0.0 0.36
Ceric.26G060400.1 (Ceric.26G060400)
 0.05 0.06 0.37 0.1 0.74 0.63 0.96 0.62 0.43 0.66 0.09 1.0 0.65 0.0 0.77 1.24 0.57 0.0 0.67 0.43 0.2 0.1 0.26 1.21 0.88 0.07
Ceric.26G062600.1 (Ceric.26G062600)
 1.32 4.83 10.21 4.34 1.06 4.13 6.18 0.56 7.47 6.21 0.54 2.24 1.07 1.06 4.27 5.28 1.12 0.39 3.05 2.51 0.52 2.67 1.84 2.53 3.74 2.28
Ceric.26G062700.1 (Ceric.26G062700)
 2.01 5.33 9.58 4.01 1.4 5.21 6.84 0.77 11.9 10.56 0.36 1.9 1.77 0.96 4.63 7.28 1.03 0.96 3.27 2.87 1.15 3.11 2.51 2.88 6.05 3.78
Ceric.27G021800.1 (Ceric.27G021800)
 0.3 1.52 1.31 1.21 5.59 3.9 5.78 3.94 5.19 4.48 2.23 2.55 2.35 0.17 2.33 3.74 5.24 0.47 4.11 2.16 0.51 1.97 0.31 4.38 1.56 0.81
6.4 20.47 14.03 7.18 35.96 41.96 40.08 42.63 35.25 33.12 14.53 20.08 28.46 9.23 28.97 43.03 35.49 29.51 54.38 36.4 32.93 22.18 12.94 35.89 34.88 15.68
Ceric.29G012500.1 (Ceric.29G012500)
 0.0 0.76 0.13 1.06 0.0 0.37 0.0 0.0 1.12 0.38 2.95 0.0 1.71 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.24 0.57 0.33 0.0 0.0 0.0 1.22 0.23
1.24 9.41 24.15 3.27 50.31 41.23 63.14 37.22 45.46 54.22 25.88 19.5 11.88 0.0 22.03 24.7 60.69 2.18 11.28 11.63 2.36 24.9 9.83 24.85 51.02 4.1
Ceric.30G021100.1 (Ceric.30G021100)
 0.47 0.1 0.44 0.7 6.22 12.47 8.32 11.82 22.71 22.29 0.76 4.05 3.31 4.02 7.45 0.53 5.92 20.17 27.81 22.09 2.23 1.52 0.38 17.87 0.3 0.28
Ceric.30G033100.1 (Ceric.30G033100)
 0.49 1.36 3.57 1.36 2.33 0.81 1.2 0.69 2.56 2.01 1.13 0.62 0.41 0.05 1.18 0.82 2.21 0.09 1.65 0.4 0.1 0.76 0.63 1.2 2.69 0.54
Ceric.31G012300.1 (Ceric.31G012300)
 0.33 1.6 0.86 0.37 0.71 0.0 0.0 0.16 0.55 0.45 0.53 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.95 0.0 0.0 0.13 0.44 0.89 0.5 0.7 0.72 0.22
0.0 4.97 12.46 1.4 0.0 0.0 0.71 0.0 3.57 1.74 0.0 0.4 1.21 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.77
Ceric.32G059100.1 (Ceric.32G059100)
 1.26 0.76 1.09 0.9 6.01 1.24 4.17 3.24 4.74 4.07 0.42 2.11 2.41 0.81 2.8 3.04 6.81 1.13 4.56 2.18 0.97 0.43 0.33 4.55 1.03 1.12
Ceric.32G063800.1 (Ceric.32G063800)
 0.5 0.48 0.93 0.11 0.0 0.79 1.12 0.48 0.94 1.16 0.0 0.49 0.0 0.0 0.42 0.57 0.09 0.0 0.18 0.14 0.1 0.75 0.0 0.67 0.0 0.38
Ceric.33G013100.1 (Ceric.33G013100)
 0.03 0.01 0.09 0.02 0.05 0.02 0.01 0.02 0.06 0.08 0.12 0.01 0.15 0.0 0.08 0.04 0.04 0.02 0.12 0.03 0.02 0.0 0.02 0.03 0.25 0.05
Ceric.33G055500.1 (Ceric.33G055500)
 0.0 0.43 0.97 0.43 1.99 0.0 0.69 0.22 0.33 0.2 6.99 3.56 1.3 0.0 1.33 0.46 1.66 0.22 0.29 0.5 0.6 0.41 1.25 1.78 0.0 0.3
Ceric.34G066400.1 (Ceric.34G066400)
 0.12 0.23 0.82 0.0 1.33 0.0 1.02 0.85 2.62 2.85 0.0 2.72 1.22 0.11 0.55 1.09 0.89 0.0 0.77 0.2 0.0 0.3 0.11 0.54 0.87 0.18
Ceric.35G025700.1 (Ceric.35G025700)
 0.43 1.27 1.57 1.73 8.91 5.85 3.24 5.72 6.01 8.47 1.06 5.76 2.42 0.24 3.84 10.69 9.47 1.28 19.49 1.8 0.24 5.87 0.26 8.49 8.48 0.32
Ceric.35G069900.1 (Ceric.35G069900)
 0.0 0.57 0.23 0.12 0.0 0.0 0.27 0.0 0.67 0.29 0.15 0.09 0.0 0.0 0.39 0.05 0.11 0.0 0.41 0.14 0.1 0.0 0.07 0.14 0.0 0.32
Ceric.36G022600.1 (Ceric.36G022600)
 0.76 2.31 4.46 3.6 4.47 2.46 2.28 2.7 4.91 4.14 4.84 2.3 1.77 0.0 1.99 0.86 3.19 0.46 4.74 1.39 2.08 0.94 2.5 4.13 4.03 0.73
Ceric.36G056800.1 (Ceric.36G056800)
 0.11 0.54 0.92 0.15 0.6 0.27 0.43 0.56 0.62 0.45 0.68 0.59 0.48 0.0 0.42 0.52 0.71 0.03 0.37 0.28 0.16 0.38 0.02 0.52 0.34 0.2
Ceric.37G056800.1 (Ceric.37G056800)
 0.0 0.77 0.41 1.27 4.48 2.28 2.7 1.64 3.18 2.07 1.15 4.95 2.22 0.39 1.55 2.42 4.61 0.73 3.45 1.42 0.13 0.9 0.1 3.3 2.36 0.44
Ceric.38G043300.1 (Ceric.38G043300)
 0.12 0.2 0.32 0.36 0.12 0.03 0.19 0.16 0.35 0.49 0.87 0.33 0.27 0.0 0.42 0.07 0.14 0.03 0.31 0.1 0.12 0.05 0.08 0.3 0.56 0.13
Ceric.38G043500.1 (Ceric.38G043500)
 0.95 1.03 8.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.12 4.31 5.32 0.0 0.0 0.0 1.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.77 0.0 0.0 0.0 2.52 0.78
4.3 16.76 7.56 12.33 10.03 13.39 11.88 12.66 12.62 12.94 6.71 9.02 9.59 2.27 9.93 12.04 10.45 5.25 17.5 11.06 14.49 9.26 3.34 10.72 20.18 5.39
Ceric.39G049800.1 (Ceric.39G049800)
 0.0 0.0 0.43 0.18 4.32 0.71 0.55 1.41 0.7 1.38 0.0 1.19 0.85 0.0 0.64 0.61 2.45 0.0 0.82 0.82 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.07

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)