1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_154 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
Ceric.01G065300.1 (Ceric.01G065300)
 0.02 0.0 4.28 0.15 0.07 0.0 0.0 0.03 0.04 0.02 0.0 0.0 0.14 0.0 0.28 0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.27 0.0 0.02 0.0 0.0
Ceric.01G065600.1 (Ceric.01G065600)
 0.0 0.22 1.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.1 0.0 0.0 0.05 0.0
Ceric.01G075600.1 (Ceric.01G075600)
 0.0 0.15 0.58 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.17 0.58 0.0 0.03 0.0 0.0 0.15 0.02 0.09 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
1.06 3.3 6.25 2.95 1.53 3.59 3.61 2.84 2.07 1.93 3.39 12.9 6.28 0.85 1.18 0.75 1.36 0.07 1.17 0.48 0.69 1.76 1.64 4.8 0.81 1.06
0.03 0.04 1.37 0.0 0.0 0.24 0.29 0.16 0.26 0.27 0.0 0.09 0.0 0.0 0.19 0.13 0.0 0.08 0.13 0.06 0.43 0.0 0.0 0.06 0.08 0.16
0.0 0.76 1.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.07 0.04 0.0 0.09 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.06G014100.1 (Ceric.06G014100)
 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.06G052800.1 (Ceric.06G052800)
 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0
Ceric.07G039800.1 (Ceric.07G039800)
 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.09G005100.1 (Ceric.09G005100)
 0.19 6.1 71.0 0.2 0.0 1.82 3.14 1.81 13.79 10.8 13.72 106.16 44.33 0.14 2.71 0.14 0.3 0.0 0.0 0.26 0.19 1.13 1.6 15.03 0.39 1.4
Ceric.10G078300.1 (Ceric.10G078300)
 0.0 0.08 13.41 0.0 0.13 1.31 3.58 4.76 2.26 1.17 0.09 12.23 3.77 0.0 1.15 0.11 0.06 0.22 0.58 1.72 0.58 0.0 0.0 0.06 0.43 0.0
Ceric.11G040500.1 (Ceric.11G040500)
 0.0 0.39 8.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.07 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
Ceric.12G065800.1 (Ceric.12G065800)
 0.0 0.03 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.12G065900.1 (Ceric.12G065900)
 0.0 0.18 7.61 0.0 0.07 0.03 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.74 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
Ceric.12G066000.1 (Ceric.12G066000)
 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.12G066100.1 (Ceric.12G066100)
 0.0 0.05 1.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.12G068200.1 (Ceric.12G068200)
 0.0 0.05 0.38 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.12G092100.1 (Ceric.12G092100)
 0.0 0.0 1.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.13G003800.1 (Ceric.13G003800)
 0.0 0.13 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.13G011800.1 (Ceric.13G011800)
 0.06 0.02 6.05 0.45 0.0 0.09 0.11 0.24 0.08 0.08 0.0 0.1 0.18 0.04 1.26 0.0 0.0 0.02 0.0 0.34 0.04 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0
Ceric.13G011900.1 (Ceric.13G011900)
 0.07 0.1 3.8 0.7 0.33 0.09 0.35 0.4 0.08 0.08 0.04 0.34 0.25 0.07 0.91 0.03 0.36 0.06 0.01 0.23 0.02 0.24 0.09 0.4 0.0 0.0
Ceric.13G065800.1 (Ceric.13G065800)
 3.22 2.36 17.13 3.41 0.0 0.76 0.21 0.19 0.14 0.35 15.67 49.72 23.42 0.91 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.54 0.35 0.0 2.3 0.76 0.03
Ceric.13G082200.1 (Ceric.13G082200)
 0.04 0.04 0.99 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
Ceric.13G087300.1 (Ceric.13G087300)
 0.0 0.0 0.56 0.14 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.15 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.25 1.18 0.08 0.0 0.09 0.18 0.0 0.07 0.0 0.0 0.77 0.2 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0 0.17 0.01
0.0 0.0 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.0 2.77 0.72 0.0 0.03 0.03 0.09 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Ceric.17G011600.1 (Ceric.17G011600)
 0.03 0.19 0.31 0.15 0.0 0.0 0.03 0.01 0.05 0.04 0.0 0.49 0.21 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.32 0.01 0.03 0.02 0.01 0.0 0.05 0.01
Ceric.18G012500.1 (Ceric.18G012500)
 0.0 0.21 1.14 0.44 0.13 0.17 0.12 0.06 0.41 0.18 0.28 3.58 1.76 0.08 0.26 0.0 0.13 0.16 0.76 0.28 1.38 0.21 0.19 1.75 0.43 0.07
Ceric.19G012100.1 (Ceric.19G012100)
 0.0 0.0 1.58 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.19G028700.1 (Ceric.19G028700)
 0.0 0.05 4.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 3.52 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z031100.1 (Ceric.1Z031100)
 8.51 28.89 49.01 5.56 0.0 2.38 5.92 7.84 8.37 14.4 3.93 91.05 32.51 0.66 5.3 0.06 0.33 4.61 6.3 2.56 22.96 9.49 1.46 6.22 1.54 2.92
0.07 7.28 18.16 0.0 0.0 2.0 1.31 1.2 1.46 1.24 0.0 0.07 0.0 0.01 2.42 0.0 0.01 0.37 0.22 6.09 2.22 0.11 0.2 0.13 0.04 0.01
Ceric.1Z156400.1 (Ceric.1Z156400)
 0.0 0.15 0.58 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.17 0.58 0.0 0.03 0.0 0.0 0.15 0.02 0.09 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
Ceric.1Z273200.1 (Ceric.1Z273200)
 0.0 0.0 3.63 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.01 0.0 0.47 0.1 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 1.27 0.63 0.0 0.33 0.0 0.29 0.16 0.0
Ceric.20G049500.1 (Ceric.20G049500)
 0.0 0.06 8.81 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.20G091900.1 (Ceric.20G091900)
 0.0 0.1 2.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.21G024700.1 (Ceric.21G024700)
 0.0 0.0 2.09 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.21G051600.1 (Ceric.21G051600)
 0.0 0.0 0.55 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0 0.09 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
Ceric.21G082300.1 (Ceric.21G082300)
 0.0 0.16 14.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.24G081000.1 (Ceric.24G081000)
 0.22 37.27 131.5 0.49 0.0 0.25 5.36 5.36 20.6 31.53 54.23 172.83 54.58 0.0 6.31 4.53 0.0 0.24 0.0 0.09 0.0 5.04 6.78 6.11 0.48 0.2
Ceric.28G008800.1 (Ceric.28G008800)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.30G039000.1 (Ceric.30G039000)
 0.07 0.08 3.48 0.08 0.0 0.0 0.12 0.31 0.47 1.21 0.1 0.22 0.49 0.24 0.5 0.0 0.0 1.06 0.86 0.42 0.75 0.49 0.09 0.0 0.0 0.11
Ceric.30G039200.1 (Ceric.30G039200)
 0.0 0.08 0.6 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.08 0.11 0.22 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.2 0.02 3.06 0.12 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0
Ceric.30G063700.1 (Ceric.30G063700)
 0.0 0.06 0.85 0.19 0.0 0.06 0.07 0.13 0.04 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.09 0.04 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01
34.5 104.51 318.63 36.55 49.11 25.45 57.35 79.08 54.94 55.52 42.28 43.67 55.34 5.83 49.62 22.43 46.51 12.33 10.45 45.45 94.45 29.66 23.74 40.43 26.72 89.68
Ceric.34G032500.1 (Ceric.34G032500)
 0.0 0.0 7.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.34G054500.1 (Ceric.34G054500)
 0.0 1.49 5.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.23 0.01
Ceric.37G012800.1 (Ceric.37G012800)
 0.05 0.23 1.72 0.24 0.15 0.03 0.04 0.09 0.2 0.22 0.44 0.82 0.83 0.1 0.11 0.03 0.2 0.07 0.02 0.19 0.1 0.21 0.14 0.19 0.08 0.11
0.0 0.05 4.99 0.01 0.0 0.11 0.13 0.09 0.44 0.47 0.0 0.17 0.1 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
Ceric.38G051600.1 (Ceric.38G051600)
 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.39G060700.1 (Ceric.39G060700)
 0.0 0.1 3.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.08 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)