Heatmap: Cluster_120 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Gametophyte	Male Gametophyte	Hermaphrodite Gametophyte	Gametophyte; Antheridiogen added at D-3	Sporophyte	Seedling, sporophyte	Seedling, 24h of 2\,4-D treatment	Seedling, 48h of 2\,4-D treatment	Whole plant	Whole plant, 2\,4-D Auxin	Callus	Differentiating Callus	Proliferating Callus	Bulbil	Leaf	Leaf (without leaf tip)	Leaf Tip	Root	Root (without root tip)	Root Tip	Differentiated root	Shoot Apex	Shoot	Shoot Tip	Vegetative Frond	Frond
Ceric.01G012100.1 (Ceric.01G012100)	0.15	0.17	0.18	0.46	0.03	0.07	0.12	0.11	0.13	0.2	0.93	0.43	1.0	0.0	0.13	0.0	0.01	0.11	0.68	0.27	0.71	0.05	0.0	0.05	0.02	0.02
Ceric.03G021100.1 (Ceric.03G021100)	0.01	0.05	0.03	0.03	0.06	0.07	0.05	0.05	0.05	0.05	0.08	0.77	1.0	0.08	0.11	0.11	0.05	0.18	0.22	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.07	0.01
Ceric.04G071400.1 (Ceric.04G071400)	0.19	0.02	0.03	0.22	0.18	0.07	0.11	0.11	0.13	0.08	0.34	0.44	1.0	0.12	0.23	0.03	0.22	0.13	0.09	0.16	0.12	0.51	0.05	0.41	0.25	0.02
Ceric.04G076800.1 (Ceric.04G076800)	0.06	0.09	0.08	0.16	0.14	0.28	0.28	0.28	0.22	0.2	0.12	1.0	0.68	0.01	0.06	0.18	0.15	0.05	0.55	0.16	0.15	0.09	0.02	0.24	0.43	0.03
Ceric.05G007700.1 (SAT5)	0.0	0.42	0.2	0.01	0.0	0.03	0.11	0.18	0.23	0.23	0.95	0.59	0.93	0.01	0.06	0.04	0.0	0.54	1.0	0.16	0.06	0.06	0.0	0.01	0.0	0.02
Ceric.05G013900.1 (Ceric.05G013900)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.06	0.06	0.03	0.11	0.09	0.18	0.59	1.0	0.02	0.04	0.08	0.03	0.59	0.35	0.06	0.37	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03
Ceric.05G080900.1 (Ceric.05G080900)	0.05	0.02	0.03	0.09	0.03	0.08	0.05	0.06	0.05	0.04	0.42	0.56	1.0	0.03	0.09	0.04	0.03	0.05	0.11	0.04	0.12	0.07	0.04	0.1	0.14	0.07
Ceric.06G069400.1 (Ceric.06G069400)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.12	0.21	0.3	0.29	0.41	0.36	0.82	1.0	0.06	0.11	0.07	0.04	0.31	0.44	0.1	0.33	0.18	0.09	0.12	0.01	0.1
Ceric.07G017100.1 (bZIP3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.0	0.03	0.14	0.13	0.02	0.86	1.0	0.02	0.04	0.0	0.01	0.56	0.21	0.03	0.32	0.0	0.0	0.05	0.06	0.0
Ceric.07G051600.1 (Ceric.07G051600)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.18	0.2	0.57	0.7	1.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.07	0.22	0.1	0.18	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0
Ceric.07G051800.1 (Ceric.07G051800)	0.07	0.02	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.03	0.39	0.25	0.25	0.96	1.0	0.01	0.05	0.0	0.0	0.21	0.2	0.08	0.38	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0
Ceric.07G052100.1 (Ceric.07G052100)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.05	0.29	0.19	0.39	0.84	1.0	0.03	0.09	0.0	0.0	0.19	0.24	0.1	0.29	0.02	0.0	0.17	0.0	0.0
Ceric.08G007100.1 (Ceric.08G007100)	0.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.12	0.15	0.18	0.09	0.08	0.01	0.78	0.9	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.72	0.0	0.03	0.01	0.0	0.01
Ceric.08G059800.1 (Ceric.08G059800)	0.03	0.09	0.04	0.0	0.0	0.01	0.03	0.01	0.07	0.08	0.0	0.44	1.0	0.0	0.07	0.01	0.0	0.16	0.14	0.03	0.4	0.08	0.01	0.01	0.03	0.07
Ceric.10G075200.1 (Ceric.10G075200)	0.0	0.05	0.11	0.01	0.01	0.11	0.17	0.23	0.29	0.39	0.09	0.48	0.54	0.02	0.09	0.14	0.01	0.07	1.0	0.02	0.27	0.09	0.04	0.04	0.08	0.05
Ceric.11G070700.1 (Ceric.11G070700)	0.0	0.02	0.01	0.0	0.02	0.03	0.05	0.01	0.08	0.09	0.68	0.66	1.0	0.0	0.03	0.04	0.01	0.13	0.02	0.23	0.05	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0
Ceric.12G090600.1 (Ceric.12G090600)	0.28	0.16	0.1	0.15	0.03	0.05	0.03	0.07	0.19	0.18	0.12	0.51	1.0	0.03	0.15	0.08	0.03	0.21	0.17	0.15	0.49	0.09	0.07	0.05	0.16	0.11
Ceric.13G060000.1 (SUS3)	0.01	0.01	0.02	0.01	0.1	0.09	0.12	0.09	0.19	0.18	0.4	0.72	1.0	0.02	0.08	0.05	0.1	0.04	0.99	0.07	0.24	0.11	0.04	0.24	0.05	0.03
Ceric.16G051800.1 (Ceric.16G051800)	0.11	0.09	0.01	0.22	0.01	0.16	0.12	0.23	0.15	0.12	0.04	0.8	1.0	0.03	0.12	0.02	0.01	0.2	0.25	0.32	0.48	0.04	0.03	0.05	0.01	0.0
Ceric.16G051900.1 (Ceric.16G051900)	0.1	0.16	0.03	0.3	0.02	0.24	0.1	0.34	0.15	0.14	0.07	1.0	0.99	0.02	0.08	0.01	0.02	0.16	0.21	0.25	0.47	0.02	0.01	0.07	0.03	0.0
Ceric.18G023900.1 (Ceric.18G023900)	0.0	0.0	0.01	0.0	0.04	0.01	0.03	0.04	0.21	0.21	0.56	0.85	1.0	0.01	0.06	0.0	0.03	0.04	0.08	0.23	0.11	0.04	0.03	0.09	0.0	0.05
Ceric.18G069600.1 (Ceric.18G069600)	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.09	0.09	0.11	0.12	0.13	0.36	0.63	1.0	0.04	0.12	0.1	0.03	0.11	0.23	0.15	0.19	0.03	0.04	0.03	0.18	0.05
Ceric.18G084200.1 (YUC9)	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.23	0.11	0.13	0.24	0.21	0.16	1.0	0.71	0.06	0.05	0.0	0.0	0.1	0.24	0.08	0.11	0.05	0.01	0.06	0.0	0.0
Ceric.1Z064100.1 (WOX12)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.24	0.25	0.22	0.29	0.44	0.65	1.0	0.19	0.14	0.0	0.0	0.28	0.3	0.25	0.46	0.07	0.02	0.09	0.32	0.0
Ceric.1Z064300.1 (STPL)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.06	0.05	0.14	0.25	0.1	0.24	1.0	0.74	0.0	0.12	0.0	0.0	0.21	0.09	0.18	0.33	0.06	0.01	0.06	0.09	0.0
Ceric.1Z064800.1 (WOX12)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.24	0.25	0.22	0.29	0.44	0.65	1.0	0.19	0.14	0.0	0.0	0.28	0.3	0.25	0.46	0.07	0.02	0.09	0.32	0.0
Ceric.20G039100.1 (Ceric.20G039100)	0.0	0.21	0.1	0.0	0.01	0.1	0.24	0.49	0.18	0.39	0.39	0.76	1.0	0.03	0.15	0.2	0.01	0.14	0.7	0.14	0.23	0.04	0.08	0.04	0.05	0.13
Ceric.20G053300.1 (Ceric.20G053300)	0.08	0.2	0.08	0.08	0.0	0.13	0.09	0.11	0.42	0.48	1.0	0.24	0.76	0.01	0.12	0.01	0.0	0.24	0.54	0.14	0.72	0.02	0.0	0.02	0.0	0.03
Ceric.22G033900.1 (Ceric.22G033900)	0.03	0.52	0.13	0.02	0.05	0.02	0.04	0.04	0.11	0.11	0.74	0.5	1.0	0.03	0.15	0.02	0.05	0.17	0.22	0.08	0.2	0.1	0.02	0.04	0.05	0.05
Ceric.23G047800.1 (ATE2)	0.11	0.34	0.21	0.16	0.08	0.12	0.17	0.13	0.21	0.2	0.39	0.82	1.0	0.04	0.19	0.33	0.09	0.19	0.3	0.17	0.23	0.12	0.14	0.25	0.14	0.07
Ceric.24G027800.1 (ARFA1F)	0.06	0.14	0.21	0.23	0.01	0.16	0.32	0.6	0.34	0.34	0.65	0.24	0.54	0.05	0.22	0.02	0.01	0.1	1.0	0.22	0.73	0.09	0.01	0.01	0.13	0.02
Ceric.25G000100.1 (LBD23)	0.01	0.06	0.05	0.01	0.0	0.09	0.11	0.26	0.1	0.18	0.38	0.4	1.0	0.03	0.13	0.04	0.0	0.13	0.09	0.09	0.25	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03
Ceric.25G039800.1 (Ceric.25G039800)	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.35	0.65	1.0	0.02	0.08	0.01	0.0	0.06	0.03	0.01	0.05	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0
Ceric.26G053300.1 (NRT2.4)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.08	0.07	0.29	0.38	0.42	0.31	1.0	0.0	0.11	0.0	0.01	0.82	0.02	0.22	0.03	0.22	0.01	0.03	0.0	0.0
Ceric.31G027400.1 (AHL22)	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.06	0.1	0.15	0.08	0.08	0.06	1.0	0.76	0.03	0.05	0.0	0.0	0.2	0.24	0.25	0.11	0.03	0.01	0.18	0.0	0.01
Ceric.32G004700.1 (TMK1)	0.03	0.25	0.34	0.17	0.2	0.17	0.17	0.22	0.36	0.36	0.9	1.0	0.99	0.1	0.24	0.15	0.19	0.43	0.48	0.46	0.58	0.3	0.06	0.25	0.14	0.16
Ceric.34G051600.1 (CRK2)	0.07	0.07	0.09	0.15	0.08	0.12	0.11	0.09	0.13	0.11	0.35	0.83	1.0	0.06	0.19	0.1	0.08	0.21	0.14	0.08	0.13	0.06	0.05	0.1	0.07	0.1
Ceric.34G064500.1 (YLS7)	0.01	0.0	0.0	0.02	0.1	0.09	0.11	0.14	0.12	0.1	0.15	0.67	1.0	0.06	0.12	0.18	0.08	0.2	0.18	0.05	0.06	0.07	0.01	0.22	0.02	0.03
Ceric.36G027400.1 (Ceric.36G027400)	0.12	0.11	0.09	0.17	0.02	0.22	0.22	0.26	0.16	0.18	0.81	0.31	0.48	0.04	0.13	0.02	0.01	0.11	1.0	0.2	0.32	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01
Ceric.36G027500.1 (Ceric.36G027500)	0.11	0.06	0.11	0.2	0.01	0.11	0.24	0.27	0.13	0.08	0.57	0.5	0.77	0.04	0.1	0.07	0.01	0.14	1.0	0.15	0.19	0.04	0.01	0.04	0.14	0.01
Ceric.36G036900.1 (Ceric.36G036900)	0.0	0.0	0.07	0.03	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.51	0.74	1.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.16	0.01	0.03	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02
Ceric.36G061800.1 (Ceric.36G061800)	0.07	0.05	0.06	0.13	0.08	0.11	0.09	0.07	0.18	0.14	0.32	0.6	1.0	0.05	0.23	0.06	0.1	0.06	0.39	0.17	0.42	0.27	0.08	0.21	0.24	0.08
Ceric.38G019000.1 (Ceric.38G019000)	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.05	0.06	0.15	0.11	0.11	0.09	1.0	0.99	0.07	0.08	0.0	0.0	0.31	0.53	0.37	0.2	0.04	0.01	0.1	0.01	0.0
Ceric.38G047300.1 (Ceric.38G047300)	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.04	0.02	0.15	0.17	0.13	0.78	1.0	0.02	0.09	0.0	0.0	0.78	0.31	0.03	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Ceric.39G004500.1 (Ceric.39G004500)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.06	0.05	0.09	0.53	1.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.11	0.32	0.01	0.44	0.02	0.0	0.0	0.0	0.03
Ceric.39G027300.1 (Ceric.39G027300)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.07	0.08	0.16	0.1	0.14	0.04	1.0	0.8	0.03	0.05	0.0	0.01	0.23	0.47	0.38	0.23	0.07	0.01	0.2	0.02	0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)