Heatmap: Cluster_8 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G008900.1 (Ceric.01G008900)
0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.23 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.07 0.0 0.05 1.0 0.02 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G009000.1 (Ceric.01G009000)
0.0 0.21 0.07 0.0 0.0 0.05 0.05 0.03 0.39 0.41 0.0 0.02 0.02 0.0 0.81 0.0 0.0 0.08 1.0 0.02 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G009100.1 (Ceric.01G009100)
0.0 0.11 0.04 0.0 0.0 0.04 0.13 0.13 0.4 0.46 0.07 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.22 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
Ceric.01G068000.1 (Ceric.01G068000)
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G073300.1 (Ceric.01G073300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.06 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G073800.1 (Ceric.01G073800)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.22 0.0 0.0 1.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G073900.1 (Ceric.01G073900)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.29 0.0 0.0 1.0 0.0 0.11 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G074000.1 (Ceric.01G074000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.46 0.75 0.0 0.66 0.0 0.0 1.0 0.0 0.47 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G074100.1 (Ceric.01G074100)
0.0 0.24 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 1.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G074200.1 (Ceric.01G074200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.03 0.07 0.0 0.21 0.19 0.0 0.07 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G074400.1 (Ceric.01G074400)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.03 0.07 0.0 0.21 0.19 0.0 0.07 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G074500.1 (Ceric.01G074500)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 1.0 0.0 0.1 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G074600.1 (Ceric.01G074600)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.71 0.08 0.03 0.0 0.1 0.0 0.02 0.15 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G074700.1 (Ceric.01G074700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.46 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.42 0.0 0.28 0.0 0.0 1.0 0.12 0.07 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G074900.1 (Ceric.01G074900)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.09 0.0 0.05 0.24 0.06 0.06 0.0 0.0 0.78 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G075000.1 (Ceric.01G075000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.05 0.73 0.0 0.47 0.19 0.0 0.19 0.0 0.0 1.0 0.32 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G075200.1 (Ceric.01G075200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.13 0.0 0.06 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G075300.1 (Ceric.01G075300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.11 1.0 0.0 0.1 0.0 0.08 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.76 0.1 0.01 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G075400.1 (Ceric.01G075400)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.03G007500.1 (Ceric.03G007500)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.08G008800.1 (Ceric.08G008800)
0.07 0.1 0.01 0.49 0.0 0.19 0.12 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.08 0.07 0.0 0.0 0.31 0.0 0.02 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.08G012800.1 (Ceric.08G012800)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.04 0.04 0.31 0.37 0.07 0.06 0.06 0.0 0.84 0.02 0.01 0.13 1.0 0.01 0.81 0.02 0.08 0.01 0.05 0.21
Ceric.11G017900.1 (Ceric.11G017900)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.25 0.0 1.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.41 0.02
Ceric.11G057500.1 (Ceric.11G057500)
0.03 0.1 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.14 0.0 0.04 0.05 0.04 0.0 0.03 0.18 0.0 0.01
Ceric.15G025200.1 (Ceric.15G025200)
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24
Ceric.15G060100.1 (Ceric.15G060100)
0.1 0.04 0.06 0.21 0.16 0.0 0.04 0.0 0.33 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.28 0.3 1.0 0.24 0.43 0.51 0.21 0.03 0.08 0.07 0.09
Ceric.19G062500.1 (Ceric.19G062500)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.05 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.08 0.69 0.01 0.0 0.03 0.2 0.0 0.23 0.07 0.11 0.01 1.0 0.43
Ceric.1Z031200.1 (Ceric.1Z031200)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.99 0.0 0.02 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.19 0.01 0.0 0.0 0.04 0.11 0.0 0.04 0.21
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.91 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.27 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.39
Ceric.1Z045800.1 (Ceric.1Z045800)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.1 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.1Z152700.1 (Ceric.1Z152700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.84 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
Ceric.1Z153300.1 (Ceric.1Z153300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.84 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
Ceric.1Z156300.1 (Ceric.1Z156300)
0.01 0.39 0.52 0.01 0.0 0.21 0.14 1.0 0.06 0.11 0.04 0.13 0.06 0.01 0.11 0.0 0.0 0.18 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z165400.1 (Ceric.1Z165400)
0.0 0.05 0.08 0.0 0.0 0.17 0.07 1.0 0.09 0.1 0.0 0.09 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.12 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z165500.1 (Ceric.1Z165500)
0.01 0.39 0.52 0.01 0.0 0.21 0.14 1.0 0.06 0.11 0.04 0.13 0.06 0.01 0.11 0.0 0.0 0.18 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z182400.1 (Ceric.1Z182400)
0.01 0.39 0.52 0.01 0.0 0.21 0.14 1.0 0.06 0.11 0.04 0.13 0.06 0.01 0.11 0.0 0.0 0.18 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z188600.1 (Ceric.1Z188600)
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.21 0.27 0.0 0.23 1.0 0.0 0.3 0.0 0.1 0.27 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0
Ceric.1Z193700.1 (Ceric.1Z193700)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.12 0.0 0.02 0.01 0.09 0.06 0.0 0.01 0.01 0.0 0.89 0.0 0.07 0.14 1.0 0.02 0.26 0.08 0.0 0.02 0.03 0.01
Ceric.1Z214100.1 (Ceric.1Z214100)
0.0 0.0 0.03 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.03 0.0 0.17 0.0 0.27 1.0 0.0 0.03 0.19 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01
Ceric.1Z244200.1 (Ceric.1Z244200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.57 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.74 0.54 0.26 0.53 0.0 0.0 0.0 0.21
Ceric.1Z249600.1 (Ceric.1Z249600)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.95 0.11 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z264400.1 (Ceric.1Z264400)
0.01 0.39 0.52 0.01 0.0 0.21 0.14 1.0 0.06 0.11 0.04 0.13 0.06 0.01 0.11 0.0 0.0 0.18 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.23G024200.1 (Ceric.23G024200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.24G036000.1 (Ceric.24G036000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.11 0.0 0.14 0.09 0.0 0.0 0.12 0.0 0.18 0.0 0.08 1.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.17 0.0 0.2 0.05
Ceric.27G050300.1 (Ceric.27G050300)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.72 0.0 0.38 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.53 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
Ceric.27G050400.1 (Ceric.27G050400)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.11 0.52 0.63 0.77 0.0 0.59 0.15 0.03 0.79 0.0 0.0 1.0 0.33 0.0 0.83 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.27G066400.1 (Ceric.27G066400)
0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 1.0 0.82 0.04 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Ceric.28G049300.1 (Ceric.28G049300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 1.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.31G061100.1 (Ceric.31G061100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.12 0.0 0.1 0.07 0.13 0.0 0.0 0.0 1.0 0.05 0.0 0.12 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.01
Ceric.31G070700.1 (Ceric.31G070700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.32G052400.1 (Ceric.32G052400)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Ceric.36G036600.1 (Ceric.36G036600)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.01 0.26 0.0 0.04 0.17 0.0
Ceric.36G036700.1 (Ceric.36G036700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0
Ceric.36G036800.1 (Ceric.36G036800)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0
Ceric.38G012200.1 (Ceric.38G012200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.39 0.0 0.0 0.08 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Ceric.38G034300.1 (Ceric.38G034300)
0.06 0.19 0.69 0.32 0.43 0.0 0.46 0.06 0.25 0.34 0.0 0.5 0.81 0.09 0.76 0.13 0.19 0.0 1.0 0.22 0.18 0.12 0.11 0.23 0.37 0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)