1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_19 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Ceric.02G008000.1 (Ceric.02G008000)
 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.02G022800.1 (Ceric.02G022800)
 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.02G046400.1 (Ceric.02G046400)
 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.03G024000.1 (Ceric.03G024000)
 1.62 0.54 0.85 1.46 0.0 0.0 0.0 0.19 0.16 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.01
Ceric.04G031600.1 (Ceric.04G031600)
 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.01
0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.05G005300.1 (Ceric.05G005300)
 0.18 0.08 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.05G035000.1 (Ceric.05G035000)
 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.12 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.08G020700.1 (Ceric.08G020700)
 0.0 0.09 0.03 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.08G054500.1 (Ceric.08G054500)
 3.14 1.15 1.57 1.16 0.0 0.0 2.51 1.18 0.89 0.92 0.0 0.0 1.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.09 0.0 0.94 0.0 0.0 0.33
Ceric.09G004200.1 (Ceric.09G004200)
 0.0 0.4 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.09G083600.1 (Ceric.09G083600)
 3.14 17.32 65.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 2.73 0.7 0.0 0.0 0.19 0.0 0.31 0.29 0.0 2.66 0.0 0.0 0.03
Ceric.09G100600.1 (Ceric.09G100600)
 0.0 0.1 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.10G045600.1 (Ceric.10G045600)
 0.29 0.7 1.5 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.42 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.11G023800.1 (Ceric.11G023800)
 0.0 0.0 1.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0
Ceric.11G035900.1 (Ceric.11G035900)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.13G022500.1 (Ceric.13G022500)
 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
Ceric.13G051200.1 (Ceric.13G051200)
 0.0 0.17 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.13G059600.1 (Ceric.13G059600)
 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.45 0.03
Ceric.13G087500.1 (Ceric.13G087500)
 0.04 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.27 0.04 0.03 0.0 0.13 0.12 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.14G008900.1 (Ceric.14G008900)
 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.14G044300.1 (Ceric.14G044300)
 0.13 0.26 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 1.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.15G038800.1 (Ceric.15G038800)
 0.27 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.17 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.16G013400.1 (Ceric.16G013400)
 0.0 0.12 0.77 0.07 0.0 0.0 0.14 0.0 0.24 0.28 0.0 0.0 0.79 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.5 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
Ceric.16G036100.1 (Ceric.16G036100)
 0.84 3.52 2.24 2.0 0.51 0.23 0.24 1.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.17 0.0 0.0 0.37 0.42 0.0 0.53 0.5 0.0 1.06
Ceric.17G022400.1 (Ceric.17G022400)
 0.0 0.24 0.04 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.18 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.11 0.0 0.11 0.0 0.0 0.09
Ceric.18G064400.1 (Ceric.18G064400)
 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z165200.1 (Ceric.1Z165200)
 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z185300.1 (Ceric.1Z185300)
 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.11 0.0 0.66 0.28 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.1 0.24 0.57 0.12
Ceric.1Z252000.1 (Ceric.1Z252000)
 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 1.39 0.07
Ceric.1Z296800.1 (Ceric.1Z296800)
 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0
Ceric.23G081000.1 (Ceric.23G081000)
 0.0 0.08 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.24G023500.1 (Ceric.24G023500)
 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
Ceric.25G038600.1 (Ceric.25G038600)
 0.0 0.0 0.33 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.26G051800.1 (Ceric.26G051800)
 0.0 0.06 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.1 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.26G063100.1 (Ceric.26G063100)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.27G014000.1 (Ceric.27G014000)
 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.27G017400.1 (Ceric.27G017400)
 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.28G049100.1 (Ceric.28G049100)
 1.42 2.84 6.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.25 0.0 0.0 0.0 3.88 1.06 1.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3
0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.30G034700.1 (Ceric.30G034700)
 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.01
Ceric.30G062500.1 (Ceric.30G062500)
 0.0 0.0 0.26 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.01
Ceric.32G001600.1 (Ceric.32G001600)
 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.32G064900.1 (Ceric.32G064900)
 0.0 0.0 0.08 0.35 0.0 0.24 0.12 0.0 0.16 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.16 0.09 0.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.16
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.72 0.0
Ceric.35G005500.1 (Ceric.35G005500)
 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.12 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.39G018000.1 (Ceric.39G018000)
 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)