Heatmap: Cluster_37 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g006490.3.1 (Solyc00g006490.3)
0.22 0.11 -0.24 0.13 0.36 -0.03 1.28 -0.26 0.35 0.43 -0.1 -0.61 0.58 0.06 0.48 0.4 0.32 -4.56 -4.83 -0.32 -0.09 -0.27 -0.21 -0.25 -0.61 0.6 0.08 -0.05 -0.31 -0.26 -0.14 -0.32 -2.49 0.61
Solyc01g006360.3.1 (Solyc01g006360.3)
-0.05 0.17 -0.87 0.04 -0.87 -0.93 0.82 -0.3 0.39 0.42 -0.08 -0.46 0.36 -0.13 0.31 -0.07 0.12 -2.82 -2.52 -0.89 -0.51 0.38 0.56 0.52 -0.02 0.16 0.74 0.65 0.25 0.37 0.45 0.26 -4.14 -0.59
Solyc01g006880.3.1 (Solyc01g006880.3)
-0.55 -0.7 -0.41 -0.8 -0.42 -0.33 0.53 -0.5 0.06 0.79 -0.13 -0.35 0.81 0.43 0.59 0.73 0.82 -4.07 -4.65 0.4 0.08 0.18 -0.36 -0.03 -0.1 0.98 -0.19 0.02 -0.12 -0.03 0.01 0.34 -3.1 -0.47
Solyc01g008120.3.1 (Solyc01g008120.3)
0.53 -0.15 0.28 0.3 -0.35 -0.44 0.94 -0.2 0.2 0.01 0.17 -0.0 0.58 0.3 0.59 0.54 0.44 -2.98 -4.01 -0.49 -0.19 -0.2 0.13 -0.03 -0.53 0.31 -0.01 -0.08 -0.42 -0.22 -0.08 -0.29 -2.45 0.51
Solyc01g009280.3.1 (Solyc01g009280.3)
0.22 -0.19 -0.12 0.45 0.23 -0.1 0.86 -0.55 0.41 0.19 -0.43 -0.91 0.04 -0.4 0.57 0.5 0.5 -2.15 -3.7 -0.53 -0.23 0.09 0.01 0.13 -0.11 0.28 0.3 0.29 0.13 0.13 0.18 0.13 -2.87 0.09
Solyc01g056570.3.1 (Solyc01g056570.3)
-0.01 -0.28 -0.43 -0.5 0.1 -0.29 0.86 -0.45 -0.33 -0.08 0.02 -0.29 0.85 0.36 0.37 0.24 0.21 -5.12 -4.83 -0.09 0.17 0.19 0.13 0.14 -0.03 0.65 0.16 0.21 0.04 0.16 0.15 0.11 -1.89 0.14
Solyc01g060080.3.1 (Solyc01g060080.3)
-0.17 -0.08 0.02 -0.37 -0.36 -0.23 0.55 -0.15 0.45 0.51 -0.12 -0.57 0.5 0.34 1.02 0.9 0.85 -8.86 -9.04 -0.22 -0.35 -0.24 -0.04 -0.15 -0.56 0.89 -0.01 -0.12 -0.45 -0.29 -0.17 -0.24 -1.92 0.31
Solyc01g067600.3.1 (Solyc01g067600.3)
-0.15 -0.6 -0.46 -0.93 -0.4 -0.65 1.1 -0.91 0.06 1.02 0.03 -0.64 0.79 0.27 0.32 0.53 0.42 -1.35 -1.41 -0.43 0.25 -0.11 -0.26 -0.08 -0.4 0.77 0.08 0.22 0.01 -0.08 -0.07 0.18 -3.82 0.3
Solyc01g068210.3.1 (Solyc01g068210.3)
-0.19 -0.61 0.04 -0.6 -0.2 -0.28 0.96 -0.3 0.15 0.53 0.26 -0.18 0.57 0.2 0.9 0.99 0.8 -9.56 -8.74 -0.75 -0.28 -0.16 0.11 -0.04 -0.35 0.53 -0.02 -0.09 -0.13 -0.22 -0.09 -0.19 -3.24 0.34
Solyc01g081420.2.1 (Solyc01g081420.2)
0.42 -0.14 -0.92 -1.04 -2.55 -0.97 0.88 -0.39 0.79 0.46 -0.69 -1.4 0.28 -0.77 0.25 0.22 0.25 -6.82 -10.03 0.58 -0.75 0.43 -0.09 0.11 -0.25 1.92 -0.13 0.22 -0.0 0.37 0.34 0.61 -4.47 -0.47
Solyc01g088700.3.1 (Solyc01g088700.3)
0.23 -0.1 -0.57 -0.36 0.14 -0.48 1.07 -0.64 0.01 -0.2 0.21 -0.15 0.82 0.6 0.26 0.08 0.11 -5.22 -5.33 -0.24 0.49 -0.1 0.04 0.04 -0.26 0.57 0.16 0.21 0.01 -0.05 0.03 -0.14 -2.9 0.48
Solyc01g090250.3.1 (Solyc01g090250.3)
0.1 0.29 -0.63 -1.08 -1.57 -0.59 1.09 -0.47 0.51 0.57 0.48 -0.26 1.28 0.82 0.27 -0.03 -0.13 - -9.1 -1.15 -0.59 0.03 0.3 0.2 -0.35 -0.03 0.53 0.35 -0.01 -0.18 0.22 0.05 -3.45 0.2
Solyc01g090780.3.1 (Solyc01g090780.3)
0.49 -0.36 -0.57 -0.38 -1.47 -0.91 0.89 -0.45 0.31 0.48 -0.42 -1.12 0.35 -0.28 0.72 0.74 0.58 -6.52 -7.35 -0.13 -0.12 0.23 0.18 0.2 -0.07 0.76 0.26 0.34 0.13 0.2 0.28 0.26 -3.72 -0.02
Solyc01g090860.3.1 (Solyc01g090860.3)
-0.55 -1.1 -1.0 -0.93 -0.92 -0.92 1.05 -0.72 0.76 1.0 0.22 -0.63 1.04 0.26 0.62 0.64 0.51 -3.51 -3.91 -0.43 0.23 0.11 -0.06 0.06 -0.25 0.65 0.15 0.21 -0.04 0.03 0.11 0.25 -4.27 -0.56
Solyc01g094000.3.1 (Solyc01g094000.3)
0.23 -0.94 -0.59 -0.97 0.17 -0.1 1.31 -0.8 -0.19 0.5 0.51 -0.15 0.94 0.26 0.17 0.03 0.36 -4.05 -3.97 0.12 0.47 -0.08 -0.33 -0.13 -0.19 0.2 -0.13 -0.03 -0.13 -0.03 0.05 -0.03 -0.85 0.29
Solyc01g094620.3.1 (Solyc01g094620.3)
0.49 -0.79 -0.85 -0.78 -0.32 -0.53 2.02 -0.65 0.17 0.22 0.39 -0.19 0.94 0.71 -0.03 0.12 0.01 -4.94 -6.25 -0.11 -0.03 -0.33 0.05 -0.21 -0.65 0.79 -0.16 -0.21 -0.46 -0.4 -0.24 -0.46 -2.65 0.64
Solyc01g095710.3.1 (Solyc01g095710.3)
0.16 1.09 -0.34 -0.6 -0.02 -0.25 0.86 -0.12 0.39 0.42 0.44 -0.4 1.35 0.83 0.25 0.25 0.13 -9.46 -10.04 0.13 0.22 -0.93 -0.78 -1.02 -1.39 1.01 -0.33 -0.42 -0.54 -0.65 -0.58 -0.56 -2.48 0.61
Solyc01g095730.3.1 (Solyc01g095730.3)
-0.24 -0.71 -0.77 -0.85 -0.05 -0.57 0.95 -0.97 0.24 0.86 0.33 -0.19 0.87 0.27 0.41 0.29 0.18 -1.54 -0.41 -0.2 0.13 -0.1 0.13 -0.02 -0.33 0.56 0.1 0.03 -0.08 -0.12 -0.02 -0.03 -3.23 0.14
Solyc01g096110.3.1 (Solyc01g096110.3)
0.24 -0.42 -0.38 0.76 -1.19 -0.91 1.01 -0.51 0.73 0.28 -0.34 -0.58 0.42 -0.12 0.7 0.66 0.5 -5.94 -7.1 -0.21 -0.08 -0.06 0.0 0.02 -0.36 0.85 0.01 0.14 -0.15 -0.01 0.14 -0.06 -3.52 0.19
Solyc01g096490.3.1 (Solyc01g096490.3)
0.03 -0.53 0.41 0.19 0.15 -0.26 1.18 -0.67 -0.23 0.37 0.36 -0.04 0.87 0.79 0.3 0.22 0.3 -3.67 -3.44 -0.37 0.45 -0.42 -0.22 -0.28 -0.63 0.43 -0.18 -0.12 -0.33 -0.45 -0.29 -0.34 -2.4 0.61
Solyc01g097320.3.1 (Solyc01g097320.3)
0.12 -0.29 -0.65 -0.39 -0.51 -0.32 1.53 -0.79 0.4 0.54 0.44 -0.05 0.81 0.54 0.27 0.22 0.12 -2.44 -1.06 -0.24 0.08 -0.4 -0.16 -0.31 -0.73 0.7 0.07 0.0 -0.18 -0.38 -0.21 -0.37 -2.65 0.27
Solyc01g099220.3.1 (Solyc01g099220.3)
0.65 0.04 -0.11 -1.09 -0.47 -0.49 0.58 -0.99 -0.14 0.5 0.48 -0.31 1.13 0.42 -0.15 -0.11 -0.08 -3.8 -4.44 -0.13 0.26 -0.19 -0.13 -0.12 -0.39 1.39 -0.03 0.18 0.07 -0.09 -0.08 0.07 -3.65 0.31
Solyc01g099300.3.1 (Solyc01g099300.3)
-0.28 0.23 0.06 -0.47 -0.6 -0.57 0.95 -0.16 0.77 0.35 -0.14 -0.73 0.21 -0.08 0.7 0.74 0.64 -3.5 -2.9 -0.97 -0.31 0.12 0.06 0.02 -0.35 0.59 0.3 0.2 0.11 0.11 0.27 -0.02 -3.36 -0.25
Solyc01g103420.3.1 (Solyc01g103420.3)
-0.08 -0.69 -0.42 -0.56 -0.24 -0.48 0.55 -0.97 0.32 0.31 0.02 -0.44 0.74 0.57 0.85 0.82 0.82 -3.67 -4.09 0.18 0.32 -0.25 -0.48 -0.35 -0.52 1.05 -0.1 -0.05 -0.08 -0.14 -0.19 0.14 -2.95 0.33
Solyc01g103690.3.1 (Solyc01g103690.3)
-0.05 -0.38 -0.35 -0.82 0.44 -0.07 0.79 -0.43 0.36 0.75 0.08 -0.35 0.95 0.83 0.6 0.64 0.64 -4.18 -4.09 -0.81 -0.43 -0.13 -0.33 -0.31 -0.58 0.83 0.04 -0.09 -0.35 -0.14 0.05 -0.04 -3.92 -0.23
Solyc01g103695.1.1 (Solyc01g103695.1)
-0.21 -0.43 -1.01 -1.25 -0.55 -0.63 0.53 -0.69 0.43 1.06 0.52 0.03 1.64 1.31 0.34 0.39 0.58 -4.47 -4.02 -0.27 0.04 -0.26 -0.28 -0.32 -0.66 0.62 -0.05 -0.02 -0.39 -0.3 -0.12 -0.13 -4.01 -0.92
Solyc01g106770.3.1 (Solyc01g106770.3)
-0.03 -0.24 -1.01 -0.86 -0.63 -0.61 1.52 -0.4 0.46 0.85 -0.07 -0.68 0.28 -0.22 0.43 0.41 0.31 -6.81 -6.16 -0.46 -0.4 0.2 0.03 0.15 -0.16 0.63 0.31 0.41 0.3 0.18 0.21 0.32 -3.61 -0.38
Solyc01g108410.2.1 (Solyc01g108410.2)
-0.36 -0.01 -0.66 -1.23 -0.39 -0.47 0.52 -0.55 0.43 0.48 0.13 -0.62 0.88 0.05 -0.08 -0.07 -0.27 -6.54 -8.71 0.08 -0.29 0.0 0.44 0.35 -0.22 1.69 0.48 0.39 0.07 -0.05 0.17 0.04 -2.8 -0.21
Solyc01g109080.3.1 (Solyc01g109080.3)
0.36 0.29 -0.19 -0.44 -1.39 -0.93 1.18 -0.64 0.47 0.72 0.09 -0.62 0.68 0.11 0.36 0.58 0.41 -4.7 -5.91 -0.68 -0.47 -0.09 0.27 0.18 -0.51 0.77 0.36 0.44 0.1 -0.1 0.03 -0.13 -4.18 -0.3
Solyc01g111680.3.1 (Solyc01g111680.3)
0.22 0.28 0.11 0.36 -0.03 -0.57 1.3 -0.62 -0.08 0.2 -0.09 -0.35 -0.07 -0.17 0.1 -0.14 0.01 -0.78 -1.12 -0.33 0.3 0.02 -0.07 -0.07 -0.26 0.64 0.08 -0.01 -0.22 0.13 0.14 0.06 -2.51 0.17
Solyc02g014130.2.1 (Solyc02g014130.2)
0.2 -0.01 -0.66 -0.59 -0.62 -0.37 1.33 -0.68 0.42 0.27 0.33 0.04 1.18 0.75 0.42 0.41 0.42 -5.63 -5.03 -0.17 0.09 -0.37 -0.18 -0.23 -0.63 0.46 -0.18 -0.13 -0.3 -0.33 -0.21 -0.2 -3.32 0.52
Solyc02g014180.2.1 (Solyc02g014180.2)
0.52 -0.89 0.15 0.25 -0.47 -0.81 1.27 -0.61 -0.27 0.51 -0.19 -0.89 0.18 -0.54 -0.36 -0.08 -0.18 -3.74 -3.98 -0.41 -0.31 0.38 0.31 0.35 0.09 1.23 0.13 0.26 0.04 0.22 0.3 0.34 -3.35 0.34
Solyc02g014187.1.1 (Solyc02g014187.1)
0.14 -0.58 -0.11 0.23 -2.78 -0.71 1.51 -0.29 -1.31 0.69 0.1 -0.63 0.68 -0.23 0.15 0.51 0.23 -2.7 -3.69 -0.25 -0.07 0.22 0.07 0.25 -0.3 1.34 0.06 0.17 -0.09 -0.0 -0.06 0.25 -3.51 -0.54
Solyc02g014190.3.1 (Solyc02g014190.3)
0.44 -0.73 -0.98 -0.16 -2.43 -1.21 1.05 -0.56 0.11 0.88 -0.63 -1.5 0.07 -0.84 -0.09 0.21 0.08 -3.47 -3.84 -0.2 -0.92 0.6 0.49 0.78 0.19 1.16 0.3 0.73 0.32 0.53 0.39 0.66 -3.74 -1.06
Solyc02g031860.3.1 (Solyc02g031860.3)
0.11 0.2 -0.25 0.23 -0.84 -0.74 0.32 -0.55 -0.55 0.61 0.22 -0.64 0.41 -0.19 1.02 1.38 1.42 -9.67 -10.95 -0.57 -0.56 -0.09 -0.25 -0.02 -0.26 0.65 -0.22 -0.01 -0.23 -0.21 -0.2 -0.09 -2.53 0.11
Solyc02g032480.2.1 (Solyc02g032480.2)
0.56 0.16 -1.68 -1.39 -1.08 -0.88 0.51 -0.14 0.63 0.89 -0.02 -0.99 0.38 -0.54 0.51 0.27 0.41 -7.27 -8.21 -0.21 -0.28 0.14 0.22 0.33 -0.11 1.27 0.32 0.43 0.13 0.23 0.18 0.27 -3.33 -0.63
Solyc02g063050.3.1 (Solyc02g063050.3)
-0.04 -0.08 0.12 0.04 -0.23 -0.43 0.91 -0.55 0.27 0.24 -0.02 -0.51 0.32 -0.04 0.48 0.55 0.47 -2.61 -2.11 -0.39 -0.31 -0.02 0.22 0.06 -0.14 0.72 0.36 0.23 0.08 -0.02 0.03 -0.06 -2.95 -0.11
Solyc02g067570.3.1 (Solyc02g067570.3)
0.15 -0.62 -0.88 -0.27 0.45 -0.11 0.86 -0.57 0.23 0.52 0.21 -0.26 0.81 0.58 0.5 0.4 0.33 -7.64 -10.21 -0.36 0.29 -0.17 -0.28 -0.16 -0.51 0.71 0.01 0.05 -0.09 -0.19 -0.11 0.0 -2.7 0.44
Solyc02g078550.3.1 (Solyc02g078550.3)
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Solyc02g078560.3.1 (Solyc02g078560.3)
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Solyc02g078790.3.1 (Solyc02g078790.3)
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Solyc02g083900.3.1 (Solyc02g083900.3)
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Solyc02g084480.2.1 (Solyc02g084480.2)
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Solyc02g087360.3.1 (Solyc02g087360.3)
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Solyc02g088550.3.1 (Solyc02g088550.3)
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Solyc02g089260.3.1 (Solyc02g089260.3)
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Solyc02g089263.1.1 (Solyc02g089263.1)
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Solyc02g089390.2.1 (Solyc02g089390.2)
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Solyc02g090135.1.1 (Solyc02g090135.1)
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Solyc02g090760.3.1 (Solyc02g090760.3)
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Solyc02g094510.3.1 (Solyc02g094510.3)
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Solyc03g046570.3.1 (Solyc03g046570.3)
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Solyc03g097355.1.1 (Solyc03g097355.1)
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Solyc03g111570.3.1 (Solyc03g111570.3)
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Solyc04g011385.1.1 (Solyc04g011385.1)
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Solyc04g016410.3.1 (Solyc04g016410.3)
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Solyc04g039950.3.1 (Solyc04g039950.3)
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Solyc04g054140.3.1 (Solyc04g054140.3)
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Solyc04g055120.3.1 (Solyc04g055120.3)
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Solyc04g057880.3.1 (Solyc04g057880.3)
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Solyc04g057990.3.1 (Solyc04g057990.3)
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Solyc04g072265.1.1 (Solyc04g072265.1)
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Solyc04g072830.3.1 (Solyc04g072830.3)
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Solyc04g074720.3.1 (Solyc04g074720.3)
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Solyc04g076550.3.1 (Solyc04g076550.3)
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Solyc04g076620.3.1 (Solyc04g076620.3)
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Solyc05g005640.3.1 (Solyc05g005640.3)
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Solyc05g005650.2.1 (Solyc05g005650.2)
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Solyc05g008633.1.1 (Solyc05g008633.1)
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Solyc05g015210.3.1 (Solyc05g015210.3)
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Solyc05g015650.3.1 (Solyc05g015650.3)
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Solyc05g044615.1.1 (Solyc05g044615.1)
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Solyc05g053130.3.1 (Solyc05g053130.3)
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Solyc05g054910.3.1 (Solyc05g054910.3)
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Solyc06g005670.3.1 (Solyc06g005670.3)
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Solyc06g076340.3.1 (Solyc06g076340.3)
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Solyc07g005030.3.1 (Solyc07g005030.3)
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Solyc07g007140.3.1 (Solyc07g007140.3)
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Solyc07g026810.3.1 (Solyc07g026810.3)
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Solyc07g040980.3.1 (Solyc07g040980.3)
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Solyc07g041150.3.1 (Solyc07g041150.3)
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Solyc07g041155.1.1 (Solyc07g041155.1)
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Solyc07g047760.2.1 (Solyc07g047760.2)
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Solyc07g047820.2.1 (Solyc07g047820.2)
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Solyc09g014780.3.1 (Solyc09g014780.3)
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Solyc09g055260.3.1 (Solyc09g055260.3)
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Solyc09g055350.3.1 (Solyc09g055350.3)
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Solyc09g065650.3.1 (Solyc09g065650.3)
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Solyc09g074110.3.1 (Solyc09g074110.3)
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Solyc09g074113.1.1 (Solyc09g074113.1)
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Solyc12g055910.2.1 (Solyc12g055910.2)
-0.19 -0.5 -0.78 -0.39 0.19 -0.19 0.95 -0.7 0.58 0.48 0.18 0.02 1.37 0.89 0.74 0.77 0.53 -6.4 -6.06 -0.88 -0.09 -0.32 -0.13 -0.3 -0.58 0.19 -0.26 -0.32 -0.39 -0.42 -0.26 -0.25 -3.34 0.55
Solyc12g099010.2.1 (Solyc12g099010.2)
0.05 0.62 -0.35 -0.36 -0.98 -0.61 1.1 -0.28 0.39 0.34 -0.39 -0.77 -0.1 -0.56 0.55 0.24 0.51 -7.13 -9.72 -0.35 -0.61 0.17 0.08 0.14 -0.07 1.4 0.09 0.13 -0.17 0.15 0.27 0.23 -3.02 0.23
Solyc12g099320.2.1 (Solyc12g099320.2)
0.54 0.25 0.04 0.13 -0.17 -0.21 0.42 -0.41 0.18 0.18 0.01 -0.15 0.68 0.36 0.61 0.55 0.53 -4.56 -2.83 -0.56 -0.45 -0.18 -0.06 -0.14 -0.46 0.59 0.03 -0.01 -0.14 -0.07 -0.01 -0.21 -2.16 0.46
Solyc12g100353.1.1 (Solyc12g100353.1)
-0.33 0.21 -0.69 -0.7 -0.33 -0.43 1.85 -0.39 0.34 0.79 0.11 -0.48 0.51 0.33 0.38 0.17 0.09 -5.93 -5.02 -0.18 -0.06 -0.06 0.07 -0.02 -0.5 0.69 0.1 0.07 -0.14 -0.19 0.01 -0.11 -3.7 -0.28

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.