1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_63 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
Ceric.02G020900.1 (Ceric.02G020900)
 2.64 0.76 0.94 4.43 0.76 0.11 0.47 0.33 0.09 0.14 0.0 0.26 0.33 0.42 3.21 0.0 0.38 0.16 0.07 0.14 0.0 0.31 0.0 0.33 0.11 0.08
Ceric.02G021000.1 (Ceric.02G021000)
 5.48 4.37 2.18 1.47 0.29 0.13 0.07 0.0 0.23 0.26 0.0 0.0 0.08 0.04 6.39 0.4 0.19 0.44 0.04 0.36 1.31 1.09 0.05 0.28 1.14 0.02
Ceric.02G097600.1 (Ceric.02G097600)
 1.16 0.0 0.55 0.0 0.37 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 1.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.14 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Ceric.04G031700.1 (Ceric.04G031700)
 1.95 9.68 1.1 0.27 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.3 0.11 0.0 4.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.2 0.08 0.0 0.0 0.09 0.0
3.68 0.15 1.58 11.89 0.19 0.0 0.02 0.06 0.0 0.04 0.04 0.32 0.15 0.0 4.61 0.01 0.16 0.0 0.0 0.2 0.04 0.08 0.03 0.03 0.29 0.0
25.88 1.85 2.78 81.33 0.59 0.13 0.03 0.03 0.0 0.0 0.05 0.11 0.04 0.09 35.34 0.02 0.56 0.0 0.15 0.41 0.27 0.91 0.0 1.29 0.25 0.0
Ceric.06G034100.1 (Ceric.06G034100)
 9.3 3.55 1.27 72.6 6.16 3.8 1.89 1.67 2.29 2.52 8.19 14.66 22.63 0.96 20.06 2.91 5.93 0.23 6.72 5.43 1.33 1.55 0.51 3.92 4.32 0.78
0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
588.85 115.66 10.99 1277.61 0.0 2.68 0.79 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.26 434.78 0.0 0.0 0.0 2.22 11.06 1.62 0.0 0.0 0.0 20.03 0.1
308.07 19.4 9.06 720.97 0.0 4.97 9.9 8.33 2.86 3.31 139.58 80.15 149.17 7.02 217.23 0.0 0.0 6.3 1.25 21.66 0.81 2.13 0.0 8.06 28.94 0.1
Ceric.10G046900.1 (Ceric.10G046900)
 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.11G064500.1 (Ceric.11G064500)
 32.31 0.96 0.48 71.52 0.0 0.0 0.09 0.0 0.47 0.39 0.3 0.21 0.53 0.12 33.9 0.0 0.0 0.0 0.17 0.07 0.24 0.5 0.08 0.13 1.57 0.28
Ceric.12G096200.1 (Ceric.12G096200)
 30.68 1.07 2.62 81.74 0.0 4.94 3.86 7.61 0.14 0.1 0.0 0.13 0.06 1.29 22.62 0.12 0.0 0.06 0.56 7.22 3.17 0.21 0.32 0.04 2.56 0.76
Ceric.12G096400.1 (Ceric.12G096400)
 4.23 0.54 0.72 19.91 0.84 2.0 0.9 0.68 0.44 0.66 0.0 0.19 0.16 0.62 11.92 0.05 0.7 0.01 0.2 1.29 0.41 0.0 0.22 0.24 1.13 0.47
Ceric.13G075400.1 (Ceric.13G075400)
 23.02 0.6 1.88 77.82 1.17 8.7 0.48 0.52 0.08 0.09 0.0 1.49 1.21 2.8 28.71 0.07 0.97 0.05 4.79 7.82 3.21 0.0 0.51 1.78 8.39 0.05
Ceric.15G039200.1 (Ceric.15G039200)
 0.47 0.42 2.44 5.87 0.0 0.13 0.27 0.13 0.1 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 3.46 0.0 0.16 0.04 2.48 0.03 0.36 0.0 0.0 0.92 0.25 0.01
Ceric.16G082600.1 (Ceric.16G082600)
 0.73 5.03 0.65 4.3 0.68 0.16 0.33 0.25 0.32 0.38 0.09 0.44 0.19 0.04 3.46 0.06 0.76 0.02 0.44 0.24 0.18 0.2 0.03 0.94 0.52 0.01
0.35 1.86 0.36 2.68 0.0 0.03 0.0 0.06 0.02 0.01 0.0 0.04 0.04 0.07 1.58 0.0 0.02 0.0 0.12 0.06 0.04 0.0 0.01 0.06 0.59 0.01
Ceric.1Z214400.1 (Ceric.1Z214400)
 5.57 2.79 4.48 7.14 0.26 0.92 0.71 1.38 0.6 1.1 0.0 0.65 0.54 0.7 6.9 0.0 0.17 0.11 0.44 2.5 2.21 0.64 0.55 1.0 2.01 0.74
Ceric.21G010600.1 (Ceric.21G010600)
 4.71 8.03 4.55 23.88 9.63 7.61 1.33 3.56 1.76 1.88 4.11 5.81 5.45 1.74 11.02 1.6 9.96 0.26 9.7 5.14 5.1 1.4 1.43 3.62 9.26 2.24
Ceric.21G073600.1 (Ceric.21G073600)
 34.35 320.97 23.3 19.14 0.51 0.08 0.08 0.15 0.0 0.39 0.13 0.08 0.09 0.36 122.53 0.0 0.97 0.0 0.0 0.93 3.68 1.84 0.07 0.06 3.85 0.0
Ceric.22G009300.1 (Ceric.22G009300)
 1.48 0.04 0.16 13.89 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.47 6.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.03 0.0 0.0 0.03 0.14 0.0
Ceric.23G060000.1 (Ceric.23G060000)
 3.56 1.73 2.67 6.43 0.47 0.12 0.15 0.38 0.19 0.28 0.74 0.55 0.72 0.1 4.05 0.1 0.42 0.03 0.14 0.59 0.41 0.72 0.21 0.28 2.02 0.06
Ceric.24G033500.1 (Ceric.24G033500)
 0.07 12.22 1.2 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.09 0.0 0.0 4.26 0.0 0.0 0.08 0.0 0.03 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.89 0.08 74.69 0.0 0.0 0.29 0.37 0.43 0.18 0.31 0.29 0.66 0.0 23.18 0.0 0.0 0.56 1.19 0.14 0.33 0.0 0.0 0.08 0.86 0.03
12.49 14.89 4.83 16.57 1.55 0.58 0.78 0.4 2.12 1.8 0.76 2.5 2.23 0.2 8.98 0.39 1.94 0.11 0.11 1.64 1.05 0.97 0.46 2.82 2.8 0.67
Ceric.29G001900.1 (ATOEP16-S)
 224.76 34.99 18.33 473.73 10.29 7.29 0.23 1.12 2.69 1.74 1.11 1.66 1.82 11.83 184.15 1.37 11.64 0.33 5.5 21.28 7.43 6.46 0.81 10.03 12.85 1.22
Ceric.30G070600.1 (Ceric.30G070600)
 10.41 1.19 3.12 31.9 4.21 2.15 0.45 0.31 0.3 0.26 0.36 0.7 0.2 1.55 8.14 0.0 3.14 0.17 1.09 1.82 1.66 0.49 0.11 2.58 1.36 0.0
Ceric.31G068300.1 (Ceric.31G068300)
 0.08 10.24 0.9 0.06 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 2.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.04 1.13 0.0
Ceric.33G005500.1 (Ceric.33G005500)
 2.97 0.19 0.61 8.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 3.43 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.12 0.02
Ceric.33G008100.1 (Ceric.33G008100)
 1.5 1.14 2.39 7.71 0.31 0.62 1.05 2.01 0.79 0.82 0.37 0.57 0.29 0.1 3.8 0.5 0.29 0.05 0.0 0.3 0.53 0.26 0.37 0.33 1.15 0.45
1.2 0.7 1.7 4.61 0.43 0.47 0.35 0.31 0.2 0.23 0.59 0.78 0.6 0.03 2.28 0.07 0.55 0.01 0.03 0.18 0.04 0.13 0.08 0.18 0.68 0.03
Ceric.34G013200.1 (Ceric.34G013200)
 0.15 4.57 0.39 0.16 0.0 0.02 0.04 0.14 0.18 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 1.22 0.03 0.03 0.13 0.01 0.04 0.05 0.0 0.03 0.07 0.0 0.01
3.88 0.74 0.18 6.45 0.18 0.28 0.31 0.12 0.64 0.74 0.07 0.18 0.12 0.19 2.85 0.26 0.36 0.0 0.01 0.27 0.09 0.22 0.37 1.02 0.08 0.05
50.62 8.19 10.38 71.92 7.35 1.29 2.59 1.23 2.47 2.15 6.65 2.45 4.33 0.5 45.75 0.16 5.93 0.0 0.12 2.67 1.05 1.72 0.23 3.2 14.72 0.01
Ceric.36G047700.1 (Ceric.36G047700)
 0.0 4.44 0.45 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.04
Ceric.36G047800.1 (Ceric.36G047800)
 0.02 4.96 0.36 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.91 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.11 0.0 0.0 0.0 0.46 0.08
267.7 1.54 1.25 519.1 0.0 1.08 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.47 133.92 0.0 0.0 0.0 1.06 16.29 2.43 1.0 0.0 0.0 20.92 0.0
88.42 1.04 0.9 149.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.1 72.27 0.0 0.0 0.0 0.35 7.73 0.0 0.0 0.0 0.0 11.51 0.0
Ceric.38G004100.1 (Ceric.38G004100)
 3.35 0.13 0.09 17.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.38G065300.1 (Ceric.38G065300)
 10.05 3.04 1.8 25.64 4.58 1.17 0.86 0.87 1.76 1.33 1.86 4.23 2.81 0.8 11.77 0.45 3.77 0.28 1.2 3.17 0.72 2.02 0.34 2.79 0.81 0.53
1088.18 30.87 7.13 2188.99 4.62 5.51 7.12 7.51 5.12 13.16 4.55 10.22 11.2 40.76 808.61 0.0 7.21 5.34 8.59 84.28 41.17 10.23 2.27 7.51 217.88 0.05

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)