1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
Ceric.01G004600.1 (Ceric.01G004600)
 1.53 51.38 7.25 6.27 5.54 1.77 0.98 1.03 2.26 2.01 2.21 2.03 2.05 0.71 3.28 0.53 6.28 0.16 0.27 2.56 0.53 4.1 0.88 4.8 4.9 0.3
0.87 29.13 2.51 2.29 0.37 0.77 1.05 0.44 0.53 0.5 0.0 0.8 0.54 0.02 1.1 0.3 0.43 0.03 0.11 0.93 0.72 0.51 0.47 0.22 1.7 0.18
Ceric.02G035700.1 (Ceric.02G035700)
 1.62 44.57 8.68 1.95 5.07 3.56 4.02 4.13 11.28 12.48 12.1 9.9 11.77 0.69 4.49 2.09 5.01 1.02 6.02 6.82 6.45 3.83 2.12 5.3 5.18 2.61
Ceric.02G061200.1 (Ceric.02G061200)
 7.01 150.54 10.63 10.34 4.14 0.31 0.8 1.07 4.15 3.3 2.55 6.13 5.19 1.78 4.09 0.0 3.22 0.15 0.6 4.02 2.24 1.72 0.89 1.91 2.99 0.2
Ceric.02G075300.1 (Ceric.02G075300)
 2.55 98.14 9.26 3.7 3.39 3.41 4.1 6.64 6.64 7.37 4.22 6.12 6.27 0.45 3.8 3.09 3.96 1.1 2.03 3.71 4.66 5.09 2.39 3.99 2.57 1.81
Ceric.02G086900.1 (Ceric.02G086900)
 0.37 11.75 1.06 0.97 0.2 0.09 0.24 0.11 0.28 0.2 0.37 0.18 0.24 0.01 0.45 0.06 0.18 0.02 0.16 0.21 0.12 0.18 0.07 0.14 0.26 0.13
Ceric.03G022500.1 (Ceric.03G022500)
 0.04 25.83 1.89 0.19 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 1.33 0.0 0.05 0.0 0.0 0.19 0.16 0.0 0.02 0.14 0.5 0.0
0.51 10.15 2.33 0.86 0.38 0.35 0.27 0.24 0.72 0.65 0.0 0.06 0.09 0.01 0.72 0.06 0.7 0.03 0.6 0.38 0.53 0.17 0.21 0.22 1.81 0.16
Ceric.03G097600.1 (Ceric.03G097600)
 0.15 21.5 1.86 0.37 0.47 0.1 0.2 0.27 0.44 0.46 1.28 1.51 1.47 0.05 1.0 0.01 0.46 0.14 0.21 1.09 0.46 0.3 0.14 0.54 0.72 0.06
0.0 4.44 0.22 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.03 0.03 0.0 0.03 0.02 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
1.69 41.29 3.0 3.19 0.0 0.0 0.04 0.02 0.09 0.27 0.0 0.02 0.0 0.06 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.32 0.0 0.0 0.03 0.6 0.01
Ceric.05G099000.1 (Ceric.05G099000)
 0.58 53.13 4.23 1.11 0.39 1.25 0.93 0.54 2.01 2.06 0.32 0.77 0.5 0.0 1.82 0.31 0.63 0.04 0.13 0.5 0.69 0.15 0.68 0.36 0.42 0.16
Ceric.06G003300.1 (Ceric.06G003300)
 3.81 61.75 6.47 5.46 8.33 1.54 1.36 1.41 2.5 2.98 3.17 1.69 1.96 0.23 2.1 0.87 7.71 0.11 0.32 1.87 1.03 3.42 1.2 6.12 1.39 0.77
1.69 38.78 5.29 3.1 0.68 0.26 0.45 0.43 1.25 1.22 1.78 1.04 0.9 0.03 1.14 0.03 1.03 0.17 0.11 1.07 0.51 0.24 0.03 1.07 0.84 0.05
Ceric.07G058100.1 (Ceric.07G058100)
 0.1 19.21 1.13 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.12 0.0 0.01 0.0 0.22 0.0
Ceric.07G067200.1 (Ceric.07G067200)
 1.17 27.93 7.07 5.59 8.28 3.68 3.75 2.74 5.79 5.76 4.4 5.84 5.62 0.51 3.46 2.58 8.11 0.66 2.99 4.22 2.73 4.69 2.39 6.43 3.93 3.13
Ceric.09G021100.1 (Ceric.09G021100)
 4.22 41.75 2.73 4.72 4.78 0.11 0.89 2.11 1.22 1.43 2.12 4.02 5.47 0.73 3.47 0.15 5.43 0.0 0.14 2.28 0.68 2.38 0.68 3.73 1.24 0.12
0.64 10.84 1.48 1.42 1.38 0.6 0.81 0.77 1.86 1.74 1.5 2.45 2.65 0.04 0.99 0.28 1.7 0.14 0.5 0.99 0.62 1.3 0.47 1.92 1.16 0.5
0.21 32.62 2.28 0.19 0.0 0.2 0.24 0.27 1.16 1.42 0.06 0.09 0.05 0.0 1.21 0.26 0.0 0.0 0.0 0.25 0.14 0.22 0.29 0.06 0.3 0.38
Ceric.12G028000.1 (Ceric.12G028000)
 0.14 15.17 1.59 0.46 0.48 0.12 0.13 0.05 0.13 0.41 0.03 0.12 0.12 0.11 0.97 0.02 0.3 0.05 0.09 0.16 0.23 0.07 0.04 0.49 0.52 0.28
0.94 11.96 2.93 1.74 1.88 0.32 0.33 0.23 1.18 1.58 0.56 1.04 0.46 0.4 0.99 0.93 2.15 0.07 0.47 0.79 0.1 0.84 0.6 1.49 0.51 0.34
Ceric.12G067200.1 (Ceric.12G067200)
 0.75 22.14 1.98 1.03 1.21 1.44 0.93 0.47 0.99 0.49 0.06 1.27 1.43 0.1 0.76 0.05 1.05 0.17 0.05 1.34 0.39 0.54 0.23 0.52 0.28 0.07
Ceric.13G000600.1 (Ceric.13G000600)
 0.69 23.56 6.39 2.95 3.96 2.21 2.41 2.01 3.49 3.81 4.78 4.83 5.37 0.28 2.26 1.42 4.22 0.28 1.44 2.36 1.12 2.0 0.83 5.04 1.97 2.48
Ceric.13G011300.1 (Ceric.13G011300)
 1.05 37.99 3.62 3.1 1.94 0.91 0.92 0.79 1.26 1.44 0.97 2.19 1.45 0.21 1.19 0.33 1.96 0.2 0.18 1.05 0.32 0.79 0.21 1.45 0.5 0.18
Ceric.13G051700.1 (Ceric.13G051700)
 1.0 37.92 6.54 2.8 4.07 2.18 2.63 2.47 3.86 3.91 2.97 1.89 1.99 0.76 5.1 2.31 3.92 0.69 1.81 2.81 2.15 4.09 2.04 4.12 2.43 2.45
Ceric.14G037100.1 (Ceric.14G037100)
 10.01 190.59 23.06 9.34 20.84 7.13 7.58 3.93 15.82 12.54 9.82 6.9 6.45 1.21 7.77 3.23 22.61 0.96 3.08 8.96 9.9 16.92 8.28 12.83 5.77 2.84
Ceric.15G066200.1 (Ceric.15G066200)
 0.35 37.2 3.39 1.61 1.24 0.3 0.57 0.12 0.39 0.46 0.21 1.08 0.81 0.14 1.08 0.13 1.0 0.08 0.22 0.55 0.79 0.39 0.09 0.63 0.74 0.05
Ceric.16G079800.1 (Ceric.16G079800)
 0.89 21.86 1.04 1.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.63 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.16 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0
Ceric.17G007800.1 (Ceric.17G007800)
 0.23 10.22 1.21 0.96 0.11 0.23 0.15 0.21 0.17 0.27 0.02 0.06 0.02 0.01 0.44 0.04 0.07 0.02 0.25 0.27 0.57 0.16 0.02 0.07 0.58 0.03
Ceric.17G051200.1 (Ceric.17G051200)
 3.03 52.91 6.16 7.43 5.36 3.1 3.81 4.2 4.32 3.88 4.32 4.11 4.85 0.25 4.05 0.62 5.04 1.09 3.45 4.47 4.97 1.96 0.63 5.28 3.59 0.4
Ceric.17G058800.1 (Ceric.17G058800)
 0.41 13.65 1.3 2.14 0.4 0.3 0.37 0.28 0.44 0.4 0.83 0.74 0.71 0.03 0.38 0.04 0.39 0.13 0.18 0.54 0.39 0.17 0.11 0.44 0.22 0.07
Ceric.17G069200.1 (Ceric.17G069200)
 5.22 36.91 5.78 4.28 0.56 0.4 0.31 0.2 0.74 1.01 0.41 0.8 0.53 0.0 2.32 0.07 0.71 0.0 0.0 0.16 0.73 0.09 0.29 0.15 1.56 0.0
Ceric.19G004300.1 (Ceric.19G004300)
 0.0 12.53 0.92 0.2 0.46 0.0 0.0 0.15 0.46 0.8 0.25 0.63 0.53 0.03 0.35 0.24 0.19 0.3 0.13 0.51 0.05 0.1 0.12 0.34 0.0 0.13
Ceric.1Z011200.1 (Ceric.1Z011200)
 7.34 76.97 10.04 5.5 9.19 3.37 4.41 4.2 5.9 4.63 1.7 8.48 8.67 1.5 8.58 3.1 6.78 4.55 4.21 10.75 10.66 11.99 4.46 4.69 11.96 3.77
Ceric.1Z087500.1 (Ceric.1Z087500)
 0.11 4.72 0.43 0.08 0.0 0.12 0.09 0.04 0.16 0.07 0.27 0.05 0.1 0.0 0.17 0.08 0.0 0.0 0.03 0.08 0.11 0.08 0.0 0.09 0.08 0.06
Ceric.1Z097900.1 (Ceric.1Z097900)
 0.24 60.37 4.47 1.54 0.0 0.26 0.14 0.13 0.56 0.34 0.0 0.91 0.16 0.0 1.26 0.63 0.0 0.26 0.26 0.28 0.6 0.0 0.11 0.29 0.51 0.09
Ceric.1Z141500.1 (Ceric.1Z141500)
 0.7 13.86 2.44 1.56 0.41 0.09 0.17 0.31 0.29 0.39 0.42 0.4 0.32 0.01 0.48 0.04 0.35 0.11 0.07 0.22 0.18 0.1 0.12 0.44 0.25 0.05
Ceric.1Z211500.1 (Ceric.1Z211500)
 0.27 7.41 0.77 0.32 0.32 0.05 0.11 0.02 0.19 0.17 0.21 0.29 0.27 0.04 0.42 0.01 0.27 0.0 0.05 0.2 0.1 0.1 0.0 0.17 0.39 0.01
Ceric.1Z268800.1 (Ceric.1Z268800)
 0.0 6.11 0.6 0.16 0.0 0.16 0.26 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.21 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.24 0.11
Ceric.1Z326500.1 (Ceric.1Z326500)
 0.1 23.3 1.83 0.49 0.56 0.25 0.07 0.14 0.22 0.15 0.0 0.24 0.2 0.0 0.41 0.02 0.53 0.0 0.05 0.28 0.49 0.07 0.0 0.08 0.14 0.02
Ceric.20G047700.1 (Ceric.20G047700)
 1.16 18.41 1.85 2.45 2.28 0.77 0.6 0.51 0.9 0.64 0.12 0.39 0.28 0.41 1.04 0.46 2.53 0.3 0.42 1.48 0.6 1.53 0.15 4.17 1.36 0.3
Ceric.21G001900.1 (Ceric.21G001900)
 5.58 62.55 11.53 10.21 8.29 3.06 2.95 4.22 4.18 4.12 6.04 2.64 3.2 0.72 4.58 1.46 7.25 0.15 2.42 4.01 2.65 2.42 1.94 5.83 3.6 6.22
Ceric.21G009800.1 (Ceric.21G009800)
 4.3 68.38 12.42 14.18 15.51 6.98 6.86 5.86 4.47 4.56 6.72 16.71 16.98 1.56 7.1 4.64 15.08 1.25 2.33 4.51 2.67 6.18 1.8 10.65 7.44 3.28
0.15 19.89 2.06 1.59 0.32 0.54 0.12 0.34 0.13 0.13 0.1 0.72 0.58 0.08 1.01 0.12 0.35 0.0 0.03 0.15 0.3 0.17 0.26 0.34 0.19 0.4
Ceric.21G086900.1 (Ceric.21G086900)
 3.22 107.83 10.55 6.7 2.2 2.17 1.95 2.36 5.0 4.6 6.65 2.48 3.04 0.73 5.13 0.61 2.04 1.96 4.94 9.07 7.29 2.92 0.39 3.72 3.22 0.38
Ceric.22G055400.1 (Ceric.22G055400)
 2.71 74.27 13.82 4.13 6.17 2.44 3.31 3.39 8.35 8.12 11.93 7.37 10.48 1.06 9.23 3.12 6.48 1.84 5.29 5.73 6.46 7.23 4.98 8.02 3.75 7.2
Ceric.23G073600.1 (Ceric.23G073600)
 0.02 5.68 0.52 0.99 0.0 0.03 0.11 0.19 0.04 0.1 0.0 0.03 0.03 0.0 0.37 0.02 0.0 0.03 0.18 0.22 0.2 0.0 0.02 0.08 0.48 0.01
Ceric.24G056200.1 (Ceric.24G056200)
 4.81 66.23 11.49 5.94 13.15 11.57 11.69 5.11 14.3 14.47 12.56 18.08 21.66 1.12 5.48 5.07 14.3 0.98 2.66 6.14 5.11 7.58 4.07 12.06 5.38 3.34
Ceric.25G007300.1 (Ceric.25G007300)
 2.2 126.72 7.97 3.08 4.84 1.41 1.9 2.78 4.29 3.01 1.79 6.06 7.14 1.4 4.76 1.1 5.25 1.26 0.21 4.75 1.58 8.63 0.69 5.27 8.4 0.51
Ceric.25G065300.1 (Ceric.25G065300)
 0.2 10.72 0.74 0.36 0.11 0.13 0.21 0.16 0.4 0.25 0.06 0.33 0.38 0.03 0.55 0.07 0.18 0.05 0.16 0.27 0.27 0.33 0.04 0.12 0.2 0.07
Ceric.25G075500.1 (Ceric.25G075500)
 1.32 43.47 5.21 3.79 5.56 2.63 2.7 2.2 3.74 3.74 5.73 3.85 4.48 0.84 4.83 2.51 5.15 0.65 1.63 2.49 1.71 2.95 1.72 5.1 2.34 2.36
2.08 57.35 4.79 5.29 0.23 4.7 1.97 1.37 2.39 1.59 0.34 1.85 1.33 0.75 6.1 4.44 0.21 0.97 2.73 2.76 1.45 1.48 0.66 0.93 8.32 2.24
Ceric.26G051200.1 (Ceric.26G051200)
 0.29 20.56 1.72 1.99 0.03 0.01 0.01 0.03 0.1 0.19 0.0 0.02 0.03 0.01 1.41 0.0 0.04 0.0 0.16 0.07 0.26 0.0 0.02 0.02 0.17 0.01
Ceric.26G051500.1 (Ceric.26G051500)
 1.04 41.94 3.56 0.5 0.45 0.81 0.63 0.2 1.05 0.98 0.0 0.45 0.93 0.76 3.39 0.41 0.45 0.59 1.5 1.35 2.48 0.75 0.41 0.81 3.13 1.11
3.81 42.73 3.46 3.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.73 0.94 0.88 0.04 1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.27 0.0 0.05 0.04 0.45 0.01
Ceric.27G042900.1 (Ceric.27G042900)
 0.79 34.6 4.63 3.14 4.5 2.0 1.8 1.27 2.49 2.21 1.71 5.03 5.12 0.55 2.72 1.05 5.14 1.12 2.4 2.37 1.37 2.72 0.87 4.46 2.34 0.84
Ceric.27G063800.1 (Ceric.27G063800)
 0.84 19.83 2.34 2.88 1.47 1.14 0.95 0.71 1.17 0.98 1.3 1.25 1.07 0.16 1.28 0.43 1.48 0.17 0.47 0.96 0.48 0.89 0.32 1.19 1.02 0.62
Ceric.28G016200.1 (Ceric.28G016200)
 2.14 34.48 3.29 4.63 5.71 1.4 1.03 1.88 2.6 2.64 1.39 3.53 3.78 0.57 1.81 0.57 5.94 0.62 0.71 1.89 0.58 2.18 0.46 5.9 1.29 0.31
Ceric.28G030700.1 (Ceric.28G030700)
 0.45 20.21 3.46 2.08 1.51 2.21 1.76 2.42 1.46 1.29 0.69 1.23 1.43 0.16 1.64 2.3 1.11 0.2 1.2 1.05 0.93 1.04 0.71 0.98 3.43 1.44
Ceric.32G020900.1 (Ceric.32G020900)
 1.75 43.68 4.04 2.88 4.48 1.05 1.22 1.42 2.59 2.68 3.31 3.21 3.49 0.49 1.78 0.4 3.35 0.6 0.7 2.32 1.11 1.65 0.35 4.03 0.89 0.51
0.48 11.17 1.31 1.93 0.13 0.01 0.09 0.36 0.09 0.05 0.31 0.76 0.81 0.04 0.45 0.0 0.1 0.01 0.01 0.15 0.06 0.16 0.0 0.09 0.49 0.0
Ceric.37G024600.1 (Ceric.37G024600)
 0.33 8.78 0.99 0.31 0.28 0.0 0.32 0.12 0.95 0.69 0.1 0.28 0.22 0.04 0.51 0.26 0.33 0.18 0.17 0.44 0.52 0.0 0.15 0.37 0.37 0.08
2.11 33.81 7.39 4.54 0.0 0.04 0.04 0.0 0.09 0.12 0.0 0.04 0.04 0.0 1.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 1.23 0.0 0.0 0.03 0.07 0.04
1.0 21.57 3.65 1.95 4.52 1.61 1.56 2.01 2.23 1.84 2.11 2.53 3.2 0.24 1.84 1.02 3.98 0.26 1.54 2.62 2.42 3.05 0.66 4.09 2.47 1.26

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)