Heatmap: Cluster_78 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g006562.1.1 (Solyc00g006562.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g007180.1.1 (Solyc00g007180.1)
- - - - - 2.83 - - - - - - - 4.18 - - - - - - - - - 3.12 - - - - - - - - - -
Solyc00g029500.1.1 (Solyc00g029500.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g096465.1.1 (Solyc00g096465.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g010790.1.1 (Solyc01g010790.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g014440.1.1 (Solyc01g014440.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g020185.1.1 (Solyc01g020185.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g060288.1.1 (Solyc01g060288.1)
- - - - - - - - - - - - - 4.61 - - - - - - - - - - - - - 2.24 2.29 - - - - -
Solyc02g005000.1.1 (Solyc02g005000.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.56 - - - - - - - 2.63 0.8 1.19 3.59 - - - -
Solyc02g030360.2.1 (Solyc02g030360.2)
- - - - - 0.99 - - - - - - 3.03 4.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g036373.1.1 (Solyc02g036373.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g069480.2.1 (Solyc02g069480.2)
- - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g078770.1.1 (Solyc02g078770.1)
- - - - 4.7 3.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g090550.1.1 (Solyc02g090550.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc03g058957.1.1 (Solyc03g058957.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g071840.1.1 (Solyc03g071840.1)
- - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g078495.1.1 (Solyc03g078495.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g095380.2.1 (Solyc03g095380.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g096280.1.1 (Solyc03g096280.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g113650.2.1 (Solyc03g113650.2)
- - - - 4.42 3.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g017753.1.1 (Solyc04g017753.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g018173.1.1 (Solyc04g018173.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g025067.1.1 (Solyc04g025067.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g049222.1.1 (Solyc04g049222.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g051153.1.1 (Solyc04g051153.1)
- - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g077700.1.1 (Solyc04g077700.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g013963.1.1 (Solyc05g013963.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g014654.1.1 (Solyc05g014654.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g016007.1.1 (Solyc05g016007.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g016510.1.1 (Solyc05g016510.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g016723.1.1 (Solyc05g016723.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g017780.1.1 (Solyc05g017780.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g018483.1.1 (Solyc05g018483.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g024385.1.1 (Solyc05g024385.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g026427.1.1 (Solyc05g026427.1)
- - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g042115.1.1 (Solyc05g042115.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g042175.1.1 (Solyc05g042175.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g049905.1.1 (Solyc05g049905.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc06g009825.1.1 (Solyc06g009825.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g033880.1.1 (Solyc06g033880.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g036020.1.1 (Solyc06g036020.1)
- - - - - 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.58 - - - - - -
Solyc06g036220.2.1 (Solyc06g036220.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g048875.1.1 (Solyc06g048875.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g053875.1.1 (Solyc06g053875.1)
- - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g016010.2.1 (Solyc07g016010.2)
- - - - - - - - 3.39 - - - 3.19 - - - 3.44 - - 1.83 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g018245.1.1 (Solyc07g018245.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g020807.1.1 (Solyc07g020807.1)
- - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g020850.1.1 (Solyc07g020850.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g032053.1.1 (Solyc07g032053.1)
- - - - 3.09 - - - - - - - 3.98 - - - - - - 2.77 - - - 1.55 - - - - - - - - - -
Solyc07g043715.1.1 (Solyc07g043715.1)
4.29 - - - - 0.54 - - - - - - 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g045455.1.1 (Solyc07g045455.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - -
Solyc08g008400.2.1 (Solyc08g008400.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - -
Solyc08g016723.1.1 (Solyc08g016723.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g041680.1.1 (Solyc08g041680.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g043165.1.1 (Solyc08g043165.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g045720.2.1 (Solyc08g045720.2)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g061255.1.1 (Solyc08g061255.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g061742.1.1 (Solyc08g061742.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g061776.1.1 (Solyc08g061776.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g062783.1.1 (Solyc08g062783.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g018210.1.1 (Solyc09g018210.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g055267.1.1 (Solyc09g055267.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g056410.2.1 (Solyc09g056410.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g058991.1.1 (Solyc09g058991.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g061625.1.1 (Solyc09g061625.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g064250.2.1 (Solyc09g064250.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g064260.1.1 (Solyc09g064260.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g065310.1.1 (Solyc09g065310.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g065615.1.1 (Solyc09g065615.1)
- - - - 4.26 1.71 - - - - - - - - - - - - - 2.89 - - - - - - - - 2.07 - - - - -
Solyc10g009495.1.1 (Solyc10g009495.1)
- - - - 4.29 3.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g012040.1.1 (Solyc10g012040.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g018145.1.1 (Solyc10g018145.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g018194.1.1 (Solyc10g018194.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g019207.1.1 (Solyc10g019207.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g024440.1.1 (Solyc10g024440.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g028540.2.1 (Solyc10g028540.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g038158.1.1 (Solyc10g038158.1)
- - - - - - - - - - 3.73 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.32 3.97 - - - - -
Solyc10g044585.1.1 (Solyc10g044585.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g047310.1.1 (Solyc10g047310.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g047743.1.1 (Solyc10g047743.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g048040.1.1 (Solyc10g048040.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g051393.1.1 (Solyc10g051393.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g076230.2.1 (Solyc10g076230.2)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g076247.1.1 (Solyc10g076247.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g018857.1.1 (Solyc11g018857.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g063690.2.1 (Solyc11g063690.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g068410.1.1 (Solyc11g068410.1)
- - - - 3.57 2.69 - - - - - - - - - - - - 3.97 - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g005095.1.1 (Solyc12g005095.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g019340.1.1 (Solyc12g019340.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g027587.1.1 (Solyc12g027587.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g027700.1.1 (Solyc12g027700.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g036905.1.1 (Solyc12g036905.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g049120.2.1 (Solyc12g049120.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g099050.1.1 (Solyc12g099050.1)
- - - - - 1.5 - - - 4.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.