Heatmap: Cluster_113 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Gametophyte	Male Gametophyte	Hermaphrodite Gametophyte	Gametophyte; Antheridiogen added at D-3	Sporophyte	Seedling, sporophyte	Seedling, 24h of 2\,4-D treatment	Seedling, 48h of 2\,4-D treatment	Whole plant	Whole plant, 2\,4-D Auxin	Callus	Differentiating Callus	Proliferating Callus	Bulbil	Leaf	Leaf (without leaf tip)	Leaf Tip	Root	Root (without root tip)	Root Tip	Differentiated root	Shoot Apex	Shoot	Shoot Tip	Vegetative Frond	Frond
Ceric.01G013200.1 (BTR1)	0.02	1.0	0.13	0.05	0.08	0.06	0.18	0.15	0.15	0.14	0.14	0.15	0.21	0.03	0.06	0.02	0.09	0.06	0.05	0.2	0.12	0.15	0.03	0.12	0.03	0.03
Ceric.01G079900.1 (PI4K GAMMA 4)	0.06	1.0	0.15	0.1	0.13	0.07	0.08	0.09	0.17	0.18	0.08	0.1	0.1	0.02	0.1	0.1	0.13	0.03	0.1	0.13	0.11	0.14	0.08	0.14	0.09	0.05
Ceric.01G095700.1 (Ceric.01G095700)	0.04	1.0	0.11	0.17	0.13	0.02	0.03	0.04	0.09	0.05	0.04	0.1	0.06	0.01	0.02	0.0	0.1	0.02	0.0	0.05	0.0	0.02	0.0	0.13	0.01	0.0
Ceric.02G007700.1 (Ceric.02G007700)	0.02	1.0	0.14	0.04	0.17	0.02	0.03	0.01	0.07	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.16	0.0	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.09	0.05	0.01
Ceric.02G058300.1 (Ceric.02G058300)	0.03	1.0	0.12	0.02	0.05	0.05	0.05	0.02	0.07	0.07	0.05	0.04	0.03	0.0	0.04	0.03	0.07	0.0	0.02	0.02	0.0	0.01	0.04	0.06	0.02	0.01
Ceric.02G058400.1 (Ceric.02G058400)	0.02	1.0	0.13	0.08	0.09	0.07	0.08	0.03	0.09	0.09	0.03	0.03	0.03	0.0	0.04	0.03	0.09	0.0	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.07	0.02	0.02
Ceric.03G028000.1 (Ceric.03G028000)	0.03	1.0	0.1	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.05	0.1	0.07	0.0	0.04	0.0	0.03	0.0	0.01	0.05	0.1	0.03	0.01	0.05	0.07	0.0
Ceric.03G075700.1 (BPM4)	0.01	1.0	0.13	0.0	0.06	0.07	0.06	0.07	0.12	0.1	0.03	0.05	0.04	0.01	0.06	0.05	0.08	0.01	0.04	0.05	0.06	0.09	0.03	0.1	0.04	0.03
Ceric.03G095700.1 (Ceric.03G095700)	0.02	1.0	0.09	0.02	0.12	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.0	0.02	0.01	0.0	0.03	0.0	0.12	0.0	0.0	0.01	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.0
Ceric.04G010200.1 (Ceric.04G010200)	0.02	1.0	0.16	0.11	0.19	0.04	0.04	0.04	0.07	0.08	0.11	0.14	0.12	0.01	0.04	0.04	0.2	0.01	0.0	0.04	0.01	0.08	0.02	0.15	0.04	0.01
Ceric.04G040200.1 (Ceric.04G040200)	0.0	1.0	0.09	0.0	0.05	0.03	0.03	0.2	0.06	0.05	0.03	0.1	0.05	0.02	0.04	0.0	0.05	0.05	0.01	0.23	0.03	0.08	0.01	0.14	0.08	0.0
Ceric.04G070900.1 (AR192)	0.05	1.0	0.21	0.11	0.14	0.12	0.15	0.13	0.2	0.18	0.03	0.04	0.05	0.01	0.06	0.11	0.15	0.02	0.1	0.11	0.1	0.13	0.08	0.17	0.14	0.07
Ceric.04G106400.1 (SCL30A)	0.03	1.0	0.1	0.05	0.13	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.08	0.1	0.01	0.06	0.01	0.12	0.0	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.08	0.06	0.01
Ceric.05G097700.1 (Ceric.05G097700)	0.0	1.0	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.0	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.1	0.02	0.0
Ceric.06G006200.1 (Ceric.06G006200)	0.06	1.0	0.24	0.11	0.2	0.09	0.08	0.05	0.12	0.11	0.03	0.08	0.07	0.02	0.07	0.03	0.21	0.01	0.04	0.12	0.07	0.12	0.04	0.11	0.05	0.02
Ceric.07G019700.1 (Ceric.07G019700)	0.03	1.0	0.21	0.09	0.15	0.11	0.1	0.08	0.17	0.18	0.09	0.06	0.05	0.01	0.05	0.07	0.15	0.0	0.06	0.08	0.07	0.09	0.04	0.14	0.07	0.04
Ceric.07G038800.1 (Ceric.07G038800)	0.04	1.0	0.13	0.08	0.16	0.07	0.09	0.06	0.11	0.09	0.04	0.1	0.09	0.01	0.04	0.0	0.14	0.01	0.02	0.08	0.05	0.03	0.01	0.11	0.02	0.01
Ceric.07G077700.1 (Ceric.07G077700)	0.03	1.0	0.21	0.03	0.15	0.04	0.04	0.05	0.08	0.07	0.17	0.14	0.24	0.02	0.05	0.02	0.15	0.02	0.01	0.07	0.02	0.06	0.02	0.13	0.07	0.01
Ceric.10G015600.1 (Ceric.10G015600)	0.04	1.0	0.09	0.06	0.16	0.04	0.05	0.07	0.07	0.05	0.12	0.15	0.1	0.01	0.04	0.04	0.16	0.01	0.02	0.11	0.03	0.07	0.02	0.15	0.05	0.02
Ceric.12G067400.1 (Ceric.12G067400)	0.06	1.0	0.18	0.07	0.09	0.06	0.08	0.06	0.1	0.1	0.03	0.03	0.02	0.01	0.05	0.06	0.08	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.06	0.06	0.06	0.03
Ceric.14G039200.1 (Ceric.14G039200)	0.0	1.0	0.14	0.01	0.04	0.01	0.01	0.0	0.03	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.06	0.03	0.06	0.0	0.0	0.02	0.02	0.03	0.01	0.1	0.08	0.0
Ceric.14G070400.1 (Ceric.14G070400)	0.01	1.0	0.12	0.03	0.07	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.0	0.03	0.05	0.07	0.0	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.05	0.03	0.01
Ceric.15G003500.1 (Ceric.15G003500)	0.02	1.0	0.1	0.03	0.17	0.02	0.04	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02	0.02	0.0	0.05	0.01	0.16	0.0	0.0	0.03	0.01	0.1	0.01	0.12	0.05	0.01
Ceric.18G043700.1 (Ceric.18G043700)	0.02	1.0	0.14	0.03	0.11	0.06	0.07	0.05	0.08	0.08	0.03	0.12	0.09	0.01	0.05	0.04	0.11	0.01	0.04	0.07	0.05	0.08	0.03	0.09	0.09	0.05
Ceric.18G055200.1 (Ceric.18G055200)	0.02	1.0	0.13	0.04	0.1	0.05	0.07	0.03	0.13	0.13	0.03	0.04	0.05	0.01	0.06	0.04	0.1	0.0	0.01	0.04	0.02	0.06	0.05	0.09	0.04	0.04
Ceric.18G081800.1 (Ceric.18G081800)	0.03	1.0	0.11	0.04	0.16	0.03	0.03	0.03	0.05	0.05	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.16	0.01	0.03	0.03	0.02	0.05	0.01	0.11	0.02	0.0
Ceric.1Z028400.1 (ARFA1F)	0.02	1.0	0.09	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.09	0.05	0.06	0.01	0.05	0.0	0.06	0.01	0.02	0.04	0.05	0.05	0.01	0.06	0.05	0.0
Ceric.1Z043900.1 (Ceric.1Z043900)	0.06	1.0	0.11	0.08	0.18	0.05	0.06	0.05	0.11	0.1	0.07	0.1	0.07	0.01	0.05	0.02	0.17	0.02	0.02	0.14	0.08	0.15	0.04	0.12	0.09	0.02
Ceric.1Z091600.1 (Ceric.1Z091600)	0.06	1.0	0.16	0.09	0.16	0.05	0.05	0.04	0.1	0.09	0.1	0.01	0.02	0.01	0.06	0.03	0.15	0.01	0.03	0.03	0.02	0.06	0.03	0.07	0.08	0.03
Ceric.1Z143500.1 (Ceric.1Z143500)	0.02	1.0	0.13	0.05	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.08	0.03	0.09	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.0	0.02
Ceric.1Z328100.1 (BTR1)	0.03	1.0	0.12	0.03	0.12	0.06	0.21	0.11	0.1	0.1	0.13	0.13	0.14	0.01	0.06	0.02	0.12	0.03	0.06	0.18	0.1	0.12	0.03	0.17	0.05	0.02
Ceric.24G078200.1 (CYP707A3)	0.01	1.0	0.19	0.06	0.14	0.05	0.05	0.05	0.08	0.1	0.02	0.06	0.05	0.01	0.08	0.05	0.13	0.01	0.05	0.06	0.05	0.09	0.03	0.12	0.09	0.03
Ceric.25G042200.1 (Ceric.25G042200)	0.04	1.0	0.12	0.09	0.11	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.06	0.02	0.14	0.01	0.15	0.04	0.0
Ceric.27G008000.1 (Ceric.27G008000)	0.07	1.0	0.18	0.17	0.12	0.08	0.08	0.04	0.08	0.12	0.01	0.07	0.06	0.0	0.04	0.02	0.12	0.0	0.0	0.04	0.02	0.07	0.03	0.08	0.04	0.03
Ceric.27G058000.1 (Ceric.27G058000)	0.03	1.0	0.25	0.15	0.21	0.06	0.08	0.06	0.1	0.09	0.09	0.13	0.13	0.01	0.05	0.02	0.2	0.01	0.02	0.08	0.05	0.06	0.03	0.12	0.1	0.02
Ceric.29G039200.1 (Ceric.29G039200)	0.02	1.0	0.09	0.04	0.11	0.03	0.04	0.02	0.06	0.06	0.02	0.03	0.03	0.0	0.03	0.01	0.12	0.0	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.08	0.03	0.02
Ceric.31G022900.1 (Ceric.31G022900)	0.0	1.0	0.09	0.01	0.05	0.02	0.04	0.11	0.04	0.05	0.02	0.13	0.16	0.0	0.03	0.01	0.05	0.02	0.02	0.16	0.02	0.03	0.01	0.07	0.01	0.0
Ceric.33G026900.1 (Ceric.33G026900)	0.04	1.0	0.14	0.05	0.14	0.03	0.02	0.04	0.05	0.05	0.08	0.06	0.05	0.01	0.06	0.02	0.13	0.0	0.01	0.06	0.03	0.1	0.02	0.09	0.07	0.01
Ceric.33G040700.1 (Ceric.33G040700)	0.01	1.0	0.12	0.02	0.08	0.03	0.03	0.03	0.08	0.08	0.05	0.05	0.04	0.01	0.05	0.04	0.08	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.08	0.02	0.01
Ceric.34G029500.1 (Ceric.34G029500)	0.0	1.0	0.11	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.01	0.09	0.0	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01
Ceric.34G068600.1 (Ceric.34G068600)	0.03	1.0	0.2	0.03	0.2	0.03	0.03	0.01	0.04	0.03	0.0	0.01	0.0	0.01	0.04	0.02	0.2	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.03	0.0
Ceric.39G003400.1 (Ceric.39G003400)	0.02	1.0	0.1	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.06	0.08	0.01	0.06	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.1	0.03	0.04	0.03	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)