Heatmap: Cluster_90 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g007330.2.1 (Solyc00g007330.2)
- - - - - - - - - - - - 4.3 - - - - - 0.76 - - - - - - - - 2.94 2.31 - - - - -
Solyc00g024370.1.1 (Solyc00g024370.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g032035.1.1 (Solyc00g032035.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g065630.2.1 (Solyc00g065630.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g143773.1.1 (Solyc00g143773.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g201165.1.1 (Solyc00g201165.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc01g010797.1.1 (Solyc01g010797.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.86 - - - - - 3.26 2.88 - - - - 3.29
Solyc01g015030.1.1 (Solyc01g015030.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.89 - - - 4.26 - - - - -
Solyc01g034140.1.1 (Solyc01g034140.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g057820.1.1 (Solyc01g057820.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g059845.1.1 (Solyc01g059845.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g066660.1.1 (Solyc01g066660.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g100235.1.1 (Solyc01g100235.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g106490.2.1 (Solyc01g106490.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g032177.1.1 (Solyc02g032177.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g031960.1.1 (Solyc03g031960.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - -
Solyc03g051693.1.1 (Solyc03g051693.1)
- - - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.65 - - - - - - - - -
Solyc03g063166.1.1 (Solyc03g063166.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g097888.1.1 (Solyc03g097888.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g117800.3.1 (Solyc03g117800.3)
-4.07 -5.28 -2.27 -1.93 -1.94 1.21 -4.58 0.41 1.91 0.2 -3.82 -5.4 -0.66 -1.41 -0.43 -0.72 0.85 -6.1 -7.23 1.24 -1.84 -2.6 -4.51 -1.54 -1.55 3.75 -2.25 -2.0 -3.3 -1.67 -1.04 -3.63 0.5 -1.13
Solyc04g018035.1.1 (Solyc04g018035.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g051063.1.1 (Solyc04g051063.1)
- - - - - - 0.56 - 1.06 4.04 - - - - - - - 1.6 3.1 - 0.99 - - - - - - -1.23 - - - - - -
Solyc05g014620.2.1 (Solyc05g014620.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g015570.1.1 (Solyc05g015570.1)
- - - - 4.88 2.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g015690.1.1 (Solyc05g015690.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g016490.1.1 (Solyc05g016490.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g041400.1.1 (Solyc05g041400.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g050480.1.1 (Solyc06g050480.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g021100.1.1 (Solyc07g021100.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g052275.1.1 (Solyc07g052275.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g063470.1.1 (Solyc07g063470.1)
1.36 -0.46 - - - 4.05 - - - - - - - - - 0.46 0.45 2.48 - -0.11 -0.3 - - - - - - - - - - - 1.78 -0.79
Solyc08g041668.1.1 (Solyc08g041668.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g045860.1.1 (Solyc08g045860.1)
- - - - - 2.69 - - - - - - - - - - - - - 4.78 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g060813.1.1 (Solyc08g060813.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.92 - - - 3.24 4.38 - - - - -
Solyc08g061037.1.1 (Solyc08g061037.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.4 4.0 - 2.82 2.48 - -
Solyc08g061340.1.1 (Solyc08g061340.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g061771.1.1 (Solyc08g061771.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g062440.2.1 (Solyc08g062440.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.7 - - - - 4.39 -
Solyc08g063097.1.1 (Solyc08g063097.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc09g011680.1.1 (Solyc09g011680.1)
- - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g015063.1.1 (Solyc09g015063.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g020153.1.1 (Solyc09g020153.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g055790.1.1 (Solyc09g055790.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - -
Solyc09g056225.1.1 (Solyc09g056225.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09
Solyc09g056320.1.1 (Solyc09g056320.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g066380.2.1 (Solyc09g066380.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g074663.1.1 (Solyc09g074663.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g074667.1.1 (Solyc09g074667.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g082535.1.1 (Solyc09g082535.1)
- - - - 4.05 - - - 4.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g050327.1.1 (Solyc10g050327.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g081840.2.1 (Solyc10g081840.2)
0.11 -2.77 -1.51 -6.05 -0.64 2.28 0.4 -1.91 0.62 1.98 0.41 -2.28 1.76 0.68 -1.65 -1.65 -1.46 -3.56 -3.8 -2.17 -1.51 -2.27 -2.87 -2.35 -2.54 - -1.65 -1.3 -1.0 -2.42 -2.33 -1.59 -3.45 3.14
Solyc11g028270.1.1 (Solyc11g028270.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g050931.1.1 (Solyc11g050931.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g051000.1.1 (Solyc11g051000.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g063665.1.1 (Solyc11g063665.1)
- - - - - - - - - - - - - 4.38 - - - - - - - - - - - - 3.72 - - - - - - -
Solyc12g017437.1.1 (Solyc12g017437.1)
- - - - 4.88 2.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g040240.1.1 (Solyc12g040240.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g044645.1.1 (Solyc12g044645.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g049610.1.1 (Solyc12g049610.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g077546.1.1 (Solyc12g077546.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.