Heatmap: Cluster_100 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Gametophyte	Male Gametophyte	Hermaphrodite Gametophyte	Gametophyte; Antheridiogen added at D-3	Sporophyte	Seedling, sporophyte	Seedling, 24h of 2\,4-D treatment	Seedling, 48h of 2\,4-D treatment	Whole plant	Whole plant, 2\,4-D Auxin	Callus	Differentiating Callus	Proliferating Callus	Bulbil	Leaf	Leaf (without leaf tip)	Leaf Tip	Root	Root (without root tip)	Root Tip	Differentiated root	Shoot Apex	Shoot	Shoot Tip	Vegetative Frond	Frond
Ceric.01G028500.1 (PSBJ)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.79	0.0	0.0	0.3	0.03	0.02	0.03	0.15	0.06	0.0	1.0	0.0
Ceric.01G033300.1 (HTA10)	0.21	0.27	0.28	0.21	0.31	0.41	0.4	0.49	0.5	0.45	0.47	0.99	1.0	0.08	0.76	0.24	0.33	0.18	0.26	0.38	0.39	0.2	0.13	0.36	0.23	0.21
Ceric.01G057700.1 (Ceric.01G057700)	0.13	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02	0.02	0.0
Ceric.01G106200.1 (PSBJ)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.03	0.15	0.0	0.0	1.0	0.0
Ceric.02G014100.1 (PB)	0.06	0.02	0.03	0.02	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.09	1.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.01	0.08	0.0	0.1	0.0
Ceric.02G014200.1 (RBCL)	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.03	0.1	0.06	1.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.01
Ceric.02G014800.1 (PSBJ)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.79	0.0	0.0	0.3	0.03	0.02	0.03	0.15	0.06	0.0	1.0	0.0
Ceric.03G100100.1 (Ceric.03G100100)	0.28	0.03	0.01	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	1.0	0.61	0.05	0.0	0.05	0.0	0.1	0.0	0.13	0.24	0.0	0.11	0.02
Ceric.04G053600.1 (HTB4)	0.32	0.08	0.11	0.25	0.63	0.06	0.07	0.11	0.28	0.22	0.28	1.0	0.94	0.03	0.56	0.01	0.59	0.07	0.0	0.36	0.03	0.38	0.11	0.25	0.1	0.0
Ceric.05G043100.1 (Ceric.05G043100)	0.19	0.07	0.07	0.08	0.15	0.01	0.01	0.0	0.2	0.23	0.09	0.0	0.05	0.16	1.0	0.04	0.13	0.1	0.02	0.04	0.0	0.23	0.12	0.11	0.37	0.04
Ceric.05G043800.1 (YCF5)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Ceric.05G050400.1 (PSBJ)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.79	0.0	0.0	0.3	0.03	0.02	0.03	0.15	0.06	0.0	1.0	0.0
Ceric.05G101000.1 (HIS1-3)	0.54	0.17	0.04	0.31	0.17	0.04	0.04	0.07	0.11	0.16	0.53	0.27	0.19	0.05	1.0	0.0	0.22	0.03	0.0	0.21	0.02	0.08	0.04	0.19	0.07	0.0
Ceric.06G011800.1 (HTB4)	0.87	0.34	0.25	0.99	1.0	0.35	0.36	0.05	0.93	0.78	0.0	0.0	0.06	0.07	0.67	0.07	0.96	0.0	0.0	0.52	0.0	0.37	0.16	0.43	0.19	0.02
Ceric.06G075200.1 (Ceric.06G075200)	0.29	0.09	0.1	0.09	0.23	0.07	0.05	0.07	0.22	0.19	0.05	1.0	0.46	0.02	0.89	0.0	0.21	0.01	0.01	0.3	0.04	0.2	0.1	0.16	0.21	0.0
Ceric.07G092500.1 (NDHJ)	0.14	0.0	0.04	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.02	0.12	0.05	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.03	0.03	0.34	0.03
Ceric.08G041700.1 (HTA6)	0.58	0.7	0.1	1.0	0.46	0.19	0.16	0.14	0.52	0.47	0.23	0.56	0.26	0.05	0.51	0.0	0.51	0.02	0.0	0.14	0.04	0.22	0.07	0.55	0.15	0.0
Ceric.08G041800.1 (HTA7)	0.17	0.01	0.0	0.02	0.03	0.01	0.05	0.0	0.04	0.04	0.02	0.17	0.16	0.01	1.0	0.01	0.01	0.03	0.0	0.03	0.01	0.03	0.05	0.02	0.03	0.03
Ceric.08G067800.1 (Ceric.08G067800)	1.0	0.13	0.2	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.42	0.05	0.0	0.03	0.26	0.64	0.0	0.0	0.03	0.0	0.05	0.02	0.0	0.35	0.0	0.11	0.01
Ceric.09G005600.1 (HTA6)	0.31	1.0	0.19	0.26	0.35	0.08	0.11	0.13	0.27	0.22	0.14	0.48	0.49	0.07	0.59	0.02	0.37	0.03	0.05	0.13	0.09	0.2	0.07	0.2	0.38	0.05
Ceric.09G009300.1 (ATPA)	0.2	0.09	0.06	0.05	0.02	0.01	0.0	0.01	0.14	0.19	0.02	0.01	0.0	0.06	1.0	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.01	0.16	0.02
Ceric.09G048400.1 (Ceric.09G048400)	0.3	0.05	0.07	0.04	0.04	0.03	0.03	0.04	0.06	0.08	0.09	0.01	0.01	0.05	1.0	0.06	0.04	0.03	0.06	0.08	0.01	0.02	0.12	0.05	0.23	0.02
Ceric.09G048700.1 (PB)	0.22	0.06	0.1	0.03	0.01	0.0	0.0	0.01	0.05	0.07	0.06	0.0	0.0	0.22	1.0	0.02	0.01	0.05	0.0	0.02	0.01	0.02	0.25	0.01	0.25	0.01
Ceric.10G015500.1 (Ceric.10G015500)	0.26	0.06	0.07	0.15	0.42	0.12	0.11	0.14	0.18	0.24	0.09	0.51	0.39	0.07	1.0	0.04	0.31	0.02	0.05	0.2	0.09	0.38	0.12	0.21	0.35	0.2
Ceric.12G022100.1 (HTB4)	0.56	0.03	0.19	0.02	0.19	0.0	0.02	0.0	0.04	0.07	0.14	0.55	0.46	0.01	1.0	0.0	0.16	0.05	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.05	0.0	0.0
Ceric.12G022300.1 (Ceric.12G022300)	0.21	0.05	0.03	0.08	0.02	0.0	0.02	0.03	0.08	0.03	0.07	0.32	0.24	0.1	1.0	0.0	0.12	0.04	0.01	0.14	0.0	0.21	0.04	0.23	0.09	0.0
Ceric.12G065600.1 (Ceric.12G065600)	0.33	0.12	0.02	0.15	0.0	0.0	0.0	0.03	0.04	0.03	0.0	1.0	0.32	0.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.11	0.0	0.13	0.0	0.0
Ceric.14G025000.1 (Ceric.14G025000)	0.49	0.03	0.01	0.1	0.0	0.0	0.1	0.13	0.09	0.14	0.37	0.73	0.6	0.02	1.0	0.0	0.12	0.0	0.02	0.12	0.0	0.0	0.0	0.12	0.06	0.0
Ceric.16G070100.1 (HTA10)	0.05	0.14	0.05	0.03	0.11	0.02	0.01	0.02	0.05	0.04	0.03	0.22	0.13	0.01	1.0	0.0	0.14	0.01	0.0	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.0
Ceric.17G067800.1 (HIS1-3)	0.82	0.15	0.03	0.2	0.46	0.03	0.02	0.02	0.08	0.24	0.68	0.13	0.18	0.06	1.0	0.01	0.38	0.03	0.0	0.08	0.05	0.16	0.03	0.15	0.2	0.01
Ceric.18G042300.1 (HTA7)	0.34	0.18	0.18	0.38	1.0	0.06	0.13	0.1	0.22	0.26	0.12	0.86	0.49	0.04	0.74	0.0	0.95	0.06	0.0	0.1	0.02	0.33	0.08	0.36	0.07	0.0
Ceric.19G072300.1 (Ceric.19G072300)	0.16	0.33	0.48	0.1	0.11	0.07	0.05	0.1	0.25	0.26	0.14	0.27	0.26	0.09	1.0	0.1	0.16	0.03	0.12	0.27	0.09	0.22	0.11	0.26	0.12	0.09
Ceric.1Z018800.1 (PSBE)	0.43	0.13	0.1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.04	0.12	0.0	0.0	0.4	1.0	0.02	0.0	0.11	0.02	0.03	0.05	0.12	0.29	0.02	0.55	0.01
Ceric.1Z109800.1 (PSBG)	0.02	0.02	0.01	0.0	0.0	0.04	0.02	0.02	0.07	0.04	0.04	0.0	0.0	0.01	1.0	0.09	0.0	0.06	0.03	0.04	0.02	0.04	0.12	0.05	0.08	0.01
Ceric.1Z161900.1 (ATPE)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Ceric.1Z190800.1 (Ceric.1Z190800)	0.22	0.01	0.01	0.2	0.04	0.0	0.0	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.09	0.1	1.0	0.02	0.04	0.07	0.03	0.09	0.05	0.12	0.04	0.09	0.16	0.0
Ceric.1Z195900.1 (Ceric.1Z195900)	0.25	0.0	0.0	0.27	0.0	0.13	0.0	0.07	0.11	0.0	0.44	0.34	0.0	0.0	1.0	0.1	0.05	0.0	0.0	0.08	0.06	0.0	0.0	0.15	0.62	0.05
Ceric.1Z220900.1 (Ceric.1Z220900)	0.14	0.01	0.01	0.03	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.09	0.01	0.02	0.03	1.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.03	0.13	0.0
Ceric.1Z237400.1 (Ceric.1Z237400)	0.14	0.01	0.01	0.03	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.09	0.01	0.02	0.03	1.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.03	0.13	0.0
Ceric.1Z237500.1 (Ceric.1Z237500)	0.66	0.0	0.33	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.17	1.0	0.08	0.0	0.22	0.0	0.11	0.0	0.85	0.0	0.0	0.67	0.0
Ceric.1Z237600.1 (Ceric.1Z237600)	0.62	0.15	0.19	0.15	0.0	0.0	0.12	0.0	0.06	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.03	0.09	0.0	0.02	0.04	0.0	0.03	0.09	0.28	0.04
Ceric.1Z240000.1 (Ceric.1Z240000)	0.14	0.01	0.01	0.03	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.09	0.01	0.02	0.03	1.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.03	0.13	0.0
Ceric.1Z255000.1 (Ceric.1Z255000)	0.66	0.0	0.33	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.17	1.0	0.08	0.0	0.22	0.0	0.11	0.0	0.85	0.0	0.0	0.67	0.0
Ceric.1Z255100.1 (Ceric.1Z255100)	0.62	0.15	0.19	0.15	0.0	0.0	0.12	0.0	0.06	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.03	0.09	0.0	0.02	0.04	0.0	0.03	0.09	0.28	0.04
Ceric.1Z262200.1 (Ceric.1Z262200)	0.66	0.0	0.33	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.17	1.0	0.08	0.0	0.22	0.0	0.11	0.0	0.85	0.0	0.0	0.67	0.0
Ceric.1Z273600.1 (Ceric.1Z273600)	0.77	0.0	0.0	0.34	0.63	0.0	0.0	0.14	0.11	0.12	0.0	0.0	0.6	0.59	1.0	0.0	0.21	0.14	0.0	0.27	0.0	0.0	0.17	0.0	0.49	0.0
Ceric.1Z273900.1 (Ceric.1Z273900)	0.43	0.04	0.02	0.12	0.06	0.03	0.0	0.0	0.07	0.02	0.02	0.04	0.02	0.13	1.0	0.02	0.03	0.1	0.0	0.08	0.0	0.12	0.04	0.01	0.17	0.01
Ceric.1Z275500.1 (Ceric.1Z275500)	0.77	0.0	0.0	0.34	0.63	0.0	0.0	0.14	0.11	0.12	0.0	0.0	0.6	0.59	1.0	0.0	0.21	0.14	0.0	0.27	0.0	0.0	0.17	0.0	0.49	0.0
Ceric.1Z280000.1 (NAD4)	0.0	0.0	0.08	0.14	0.19	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.88	0.0	0.97	0.04	0.09	0.0	0.02	0.19	0.0	0.0	0.02	0.01	0.46	0.01
Ceric.1Z284300.1 (Ceric.1Z284300)	0.66	0.0	0.33	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.17	1.0	0.08	0.0	0.22	0.0	0.11	0.0	0.85	0.0	0.0	0.67	0.0
Ceric.1Z308800.1 (Ceric.1Z308800)	0.66	0.0	0.33	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.17	1.0	0.08	0.0	0.22	0.0	0.11	0.0	0.85	0.0	0.0	0.67	0.0
Ceric.1Z308900.1 (Ceric.1Z308900)	0.62	0.15	0.19	0.15	0.0	0.0	0.12	0.0	0.06	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.03	0.09	0.0	0.02	0.04	0.0	0.03	0.09	0.28	0.04
Ceric.27G025200.1 (Ceric.27G025200)	0.41	0.07	0.07	0.3	0.24	0.02	0.01	0.02	0.09	0.22	0.08	0.38	0.21	0.04	1.0	0.0	0.19	0.01	0.01	0.07	0.0	0.15	0.05	0.11	0.14	0.0
Ceric.27G026100.1 (Ceric.27G026100)	0.24	0.21	0.04	0.16	0.22	0.02	0.01	0.05	0.08	0.11	0.09	0.82	0.37	0.03	1.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.11	0.01	0.18	0.03	0.19	0.12	0.0
Ceric.27G029400.1 (Ceric.27G029400)	0.26	0.01	0.03	0.12	0.52	0.01	0.05	0.03	0.11	0.2	0.1	0.26	0.2	0.04	1.0	0.0	0.4	0.05	0.01	0.17	0.0	0.22	0.04	0.37	0.1	0.01
Ceric.29G005300.1 (ATPA)	0.11	0.07	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.11	0.04	0.0	0.01	0.01	1.0	0.06	0.02	0.0	0.03	0.02	0.01	0.04	0.11	0.02	0.29	0.01
Ceric.29G085800.1 (HTB4)	0.33	0.07	0.06	0.08	0.02	0.01	0.02	0.07	0.09	0.06	0.19	1.0	0.55	0.08	0.4	0.0	0.03	0.05	0.0	0.08	0.03	0.05	0.04	0.01	0.04	0.0
Ceric.30G057000.1 (Ceric.30G057000)	0.2	0.07	0.03	0.1	0.12	0.03	0.02	0.05	0.13	0.12	0.04	0.57	0.32	0.0	1.0	0.0	0.13	0.03	0.0	0.15	0.02	0.1	0.02	0.11	0.03	0.0
Ceric.33G022800.1 (PSBJ)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.79	0.0	0.0	0.3	0.03	0.02	0.03	0.15	0.06	0.0	1.0	0.0
Ceric.35G054300.1 (Ceric.35G054300)	0.05	0.0	0.0	0.04	0.04	0.01	0.01	0.06	0.02	0.06	0.05	0.11	0.02	0.01	1.0	0.01	0.02	0.05	0.03	0.06	0.0	0.07	0.0	0.07	0.08	0.0
Ceric.37G035900.1 (HTA6)	0.32	0.44	0.18	0.22	0.89	0.17	0.19	0.25	0.33	0.46	0.13	0.81	0.46	0.1	1.0	0.0	0.93	0.17	0.0	0.28	0.02	0.34	0.09	0.6	0.13	0.0
Ceric.37G036300.1 (HTA6)	0.41	0.22	0.09	0.44	0.49	0.09	0.29	0.23	1.0	0.96	0.43	0.73	0.41	0.0	0.63	0.05	0.44	0.16	0.06	0.33	0.69	0.07	0.22	0.35	0.14	0.06
Ceric.37G036400.1 (HTA7)	0.21	0.03	0.07	0.16	0.24	0.04	0.07	0.06	0.07	0.15	0.44	0.5	0.31	0.01	1.0	0.0	0.24	0.0	0.01	0.09	0.0	0.17	0.04	0.28	0.08	0.0
Ceric.38G007100.1 (PSBJ)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.79	0.0	0.0	0.3	0.03	0.02	0.03	0.15	0.06	0.0	1.0	0.0
Ceric.38G007300.1 (PSBE)	0.43	0.13	0.1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.04	0.12	0.0	0.0	0.4	1.0	0.02	0.0	0.11	0.02	0.03	0.05	0.12	0.29	0.02	0.55	0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)