Heatmap: Cluster_130 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc00g009146.1.1 (Solyc00g009146.1)
4.62 - - - - 3.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc00g032945.1.1 (Solyc00g032945.1)
- - - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - - - 4.57 - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g014534.1.1 (Solyc01g014534.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.86 4.53 - - 2.86 - -
Solyc01g018046.1.1 (Solyc01g018046.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - -
Solyc01g020370.1.1 (Solyc01g020370.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc01g049720.1.1 (Solyc01g049720.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - -
Solyc01g057858.1.1 (Solyc01g057858.1)
- - - - - - - - - - 4.75 - - 2.2 - - - - - - - - - - - - - - 1.31 - - - - -
Solyc01g067045.1.1 (Solyc01g067045.1)
- - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g014135.1.1 (Solyc02g014135.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g021107.1.1 (Solyc02g021107.1)
- - - - 1.06 0.46 - - - 0.35 - - -0.8 -0.52 - - -0.65 4.28 2.99 - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g043815.1.1 (Solyc02g043815.1)
- - - - 3.2 4.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g049101.1.1 (Solyc02g049101.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g049102.1.1 (Solyc02g049102.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g049103.1.1 (Solyc02g049103.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g049104.1.1 (Solyc02g049104.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc02g049106.1.1 (Solyc02g049106.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g033760.2.1 (Solyc03g033760.2)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g051620.2.1 (Solyc03g051620.2)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g051623.1.1 (Solyc03g051623.1)
- - - - 4.54 3.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g058650.1.1 (Solyc03g058650.1)
- - - - - 4.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.48 - - - - - -
Solyc03g058680.1.1 (Solyc03g058680.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc03g096750.1.1 (Solyc03g096750.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g015975.1.1 (Solyc04g015975.1)
- - - - - 2.67 - - - - - - - - - - - - - 4.79 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g017590.1.1 (Solyc04g017590.1)
- - - - - - - - - - 4.6 - - - - - - - - 1.73 2.69 - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g024480.1.1 (Solyc04g024480.1)
5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc04g048960.1.1 (Solyc04g048960.1)
1.5 1.49 1.98 - 4.44 -0.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.14 - - - - - -
Solyc04g050745.1.1 (Solyc04g050745.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g018065.1.1 (Solyc05g018065.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g021200.1.1 (Solyc05g021200.1)
- - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - - 3.74 - - - - - - - - 2.89 - - - - -
Solyc05g023640.1.1 (Solyc05g023640.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g023700.1.1 (Solyc05g023700.1)
1.95 - - -0.11 2.32 2.0 -0.54 - - - 0.35 - - - - - - - - 2.32 3.36 - - - - - - -1.12 1.34 - - - - -
Solyc05g041535.1.1 (Solyc05g041535.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g046195.1.1 (Solyc05g046195.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc05g049915.1.1 (Solyc05g049915.1)
- - - - - 1.86 - - - - 2.64 3.81 - - - - - - - - - - - - 0.62 - - 2.33 1.8 - - - - -
Solyc06g007457.1.1 (Solyc06g007457.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc06g036500.1.1 (Solyc06g036500.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g025410.1.1 (Solyc07g025410.1)
- - - - - 4.31 - - - - 3.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g025430.1.1 (Solyc07g025430.1)
- - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g025450.2.1 (Solyc07g025450.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g032370.1.1 (Solyc07g032370.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc07g041366.1.1 (Solyc07g041366.1)
- - - - 3.4 2.63 - - - - - - - - - - - 2.71 0.85 - - - - - - - - 0.46 2.02 - 1.82 - - -
Solyc08g007713.1.1 (Solyc08g007713.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g007714.1.1 (Solyc08g007714.1)
- - - - - - 3.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.22 - -
Solyc08g007716.1.1 (Solyc08g007716.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g014315.1.1 (Solyc08g014315.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g044332.1.1 (Solyc08g044332.1)
- - - - - 2.36 - - - - 2.59 - - - - - - - - - - - - - - - 3.19 2.73 2.83 - - - - -
Solyc08g047960.1.1 (Solyc08g047960.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g048010.1.1 (Solyc08g048010.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc08g062707.1.1 (Solyc08g062707.1)
- - - - 3.76 3.58 - - - - - - 2.4 - - - - - - - - - - - - - - - 1.67 - - - - -
Solyc09g011937.1.1 (Solyc09g011937.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g014973.1.1 (Solyc09g014973.1)
- - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g015375.1.1 (Solyc09g015375.1)
0.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.87 3.74 -0.51 - -2.33 -1.51 2.21 - 1.22 2.33 1.26 - -0.96 - 0.68
Solyc09g042480.2.1 (Solyc09g042480.2)
- - - - - - - - 4.16 - - - - - - - - - - - - - - 2.38 - - 3.45 - - - - - - -
Solyc09g042520.1.1 (Solyc09g042520.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g042573.1.1 (Solyc09g042573.1)
- - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g042577.1.1 (Solyc09g042577.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g055450.2.1 (Solyc09g055450.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc09g055807.1.1 (Solyc09g055807.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g031565.1.1 (Solyc10g031565.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g036640.2.1 (Solyc10g036640.2)
- - - - 4.69 3.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g036680.1.1 (Solyc10g036680.1)
- - - - 2.94 4.38 - - - - - - - - - - - - - - 2.46 - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g036730.1.1 (Solyc10g036730.1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g045080.1.1 (Solyc10g045080.1)
- 1.92 - - - 0.88 0.34 2.08 3.0 - - - 0.8 2.33 - - - - -0.02 - - - - - - - - 1.58 2.06 - - - - -
Solyc10g045090.2.1 (Solyc10g045090.2)
- - - - - 0.19 - - - 5.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc10g047560.2.1 (Solyc10g047560.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g017030.2.1 (Solyc11g017030.2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g027895.1.1 (Solyc11g027895.1)
- - - - - 2.54 - - - - 4.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g027940.2.1 (Solyc11g027940.2)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc11g051030.1.1 (Solyc11g051030.1)
2.84 2.97 - - - -0.43 - - - - - - - - 3.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.33
Solyc12g013595.1.1 (Solyc12g013595.1)
- - - - 2.39 2.59 - - - - 3.68 1.89 - - - - - - - - - - - 0.78 - - - - - - 2.17 - - -
Solyc12g027655.1.1 (Solyc12g027655.1)
- - - - 2.9 2.81 - - - - - - - - - - - - 2.88 - - - - - - - 3.6 - - - - - - -
Solyc12g035193.1.1 (Solyc12g035193.1)
- - - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g040818.1.1 (Solyc12g040818.1)
- - - - 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g049650.1.1 (Solyc12g049650.1)
- - 2.54 - 3.06 - - - - - 4.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Solyc12g094560.1.1 (Solyc12g094560.1)
- - - - 3.12 3.39 - - - - - - - - - - - - 3.45 - - - - - - - - - 1.96 - - - - -
Solyc12g096380.1.1 (Solyc12g096380.1)
- - - 3.48 - - - - - - - - - 4.1 - - - 2.52 - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.