Heatmap: Cluster_119 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
0.01 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.19 0.12 0.2 0.15 0.08 0.1 0.05 0.1 0.34 0.05 0.1 0.23 0.07 0.14 0.12 0.21 0.07 0.36 1.0 0.0
Ceric.03G092800.1 (Ceric.03G092800)
0.01 0.08 0.04 0.02 0.05 0.05 0.04 0.04 0.05 0.05 0.03 0.04 0.04 0.06 0.25 0.03 0.05 0.01 0.0 0.03 0.01 0.06 0.06 0.03 1.0 0.06
Ceric.03G095900.1 (Ceric.03G095900)
0.11 0.14 0.41 0.13 0.45 0.12 0.13 0.1 0.3 0.3 0.12 0.18 0.12 0.06 0.49 0.18 0.38 0.04 0.43 0.1 0.2 0.22 0.06 0.22 1.0 0.06
Ceric.04G062300.1 (Ceric.04G062300)
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Ceric.05G036500.1 (Ceric.05G036500)
0.0 0.33 0.05 0.0 0.41 0.02 0.03 0.02 0.1 0.1 0.0 0.11 0.01 0.02 0.32 0.02 0.39 0.03 0.0 0.06 0.01 0.04 0.02 0.34 1.0 0.0
Ceric.07G049100.1 (Ceric.07G049100)
0.04 0.36 0.03 0.06 0.24 0.01 0.02 0.01 0.33 0.26 0.0 0.03 0.02 0.15 0.72 0.11 0.29 0.84 0.86 0.71 0.54 0.46 0.07 0.7 1.0 0.04
Ceric.10G059700.1 (Ceric.10G059700)
0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.08 0.24 0.17 0.35 0.29 0.01 0.03 0.02 0.1 0.6 0.43 0.05 0.58 0.75 0.11 0.27 0.14 0.09 0.1 1.0 0.26
Ceric.11G025100.1 (Ceric.11G025100)
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Ceric.11G030700.1 (Ceric.11G030700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Ceric.12G038500.1 (Ceric.12G038500)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.73 0.01 0.0 0.06 0.04 0.0 0.01 0.05 0.0 0.02 1.0 0.0
0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.22 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 1.0 0.02
Ceric.13G023000.1 (Ceric.13G023000)
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.01 0.19 0.01 0.07 0.08 0.15 0.1 0.15 0.15 0.01 0.04 0.02 0.03 0.36 0.1 0.08 0.3 0.17 0.08 0.21 0.12 0.06 0.12 1.0 0.0
Ceric.13G050000.1 (Ceric.13G050000)
0.02 0.01 0.07 0.02 0.01 0.07 0.1 0.15 0.13 0.15 0.01 0.01 0.01 0.01 0.34 0.02 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 1.0 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.0
Ceric.13G066000.1 (Ceric.13G066000)
0.09 0.05 0.09 0.15 0.45 0.0 0.21 0.0 0.3 0.31 1.0 0.4 0.47 0.0 0.73 0.03 0.34 0.05 0.4 0.17 0.37 0.0 0.04 0.11 0.88 0.07
Ceric.13G096900.1 (Ceric.13G096900)
0.02 0.04 0.04 0.09 0.05 0.07 0.06 0.03 0.11 0.1 0.01 0.03 0.03 0.02 0.24 0.07 0.04 0.03 0.05 0.06 0.03 0.05 0.04 0.08 1.0 0.05
Ceric.14G023000.1 (Ceric.14G023000)
0.16 0.28 0.22 0.11 0.04 0.31 0.25 0.15 0.31 0.32 0.34 0.76 1.0 0.12 0.61 0.16 0.07 0.8 0.79 0.08 0.41 0.2 0.14 0.1 0.9 0.18
0.0 0.03 0.02 0.03 0.12 0.1 0.17 0.13 0.13 0.16 0.0 0.05 0.02 0.04 0.65 0.12 0.12 0.53 0.17 0.04 0.14 0.08 0.06 0.09 1.0 0.0
Ceric.18G013800.1 (Ceric.18G013800)
0.0 0.02 0.01 0.01 0.13 0.07 0.1 0.1 0.08 0.08 0.0 0.03 0.02 0.04 0.31 0.06 0.15 0.12 0.15 0.28 0.09 0.08 0.02 0.16 1.0 0.01
Ceric.18G049000.1 (Ceric.18G049000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Ceric.1Z033200.1 (Ceric.1Z033200)
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Ceric.1Z033500.1 (Ceric.1Z033500)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Ceric.1Z033700.1 (Ceric.1Z033700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Ceric.1Z033900.1 (Ceric.1Z033900)
0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.21 0.02 0.07 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.16 1.0 0.01
Ceric.1Z034100.1 (Ceric.1Z034100)
0.0 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.05 0.09 0.0 0.06 0.07 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.15 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0
Ceric.1Z069500.1 (Ceric.1Z069500)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.16 0.1 0.17 0.21 0.0 0.0 0.01 0.02 0.49 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.29 0.04
Ceric.1Z086700.1 (Ceric.1Z086700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Ceric.1Z095900.1 (Ceric.1Z095900)
0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04
Ceric.20G074400.1 (Ceric.20G074400)
0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01
0.0 0.01 0.0 0.01 0.22 0.09 0.16 0.15 0.12 0.12 0.01 0.25 0.15 0.18 0.44 0.3 0.2 1.0 0.71 0.11 0.22 0.23 0.07 0.22 0.65 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.61 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.19 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.19 1.0 0.0
0.02 0.34 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.35 0.05 0.0 0.73 0.07 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0
0.03 0.05 0.03 0.05 0.07 0.03 0.04 0.03 0.09 0.08 0.02 0.03 0.02 0.03 0.44 0.07 0.08 0.14 0.06 0.02 0.1 0.11 0.02 0.13 1.0 0.0
0.44 0.37 0.2 1.0 0.57 0.36 0.43 0.48 0.56 0.47 0.42 0.5 0.49 0.07 0.51 0.41 0.55 0.33 0.21 0.47 0.4 0.31 0.13 0.3 0.87 0.05
0.01 0.07 0.04 0.01 0.21 0.27 0.4 0.26 0.39 0.43 0.02 0.11 0.06 0.06 0.41 0.36 0.28 0.45 0.25 0.18 0.24 0.49 0.2 0.42 1.0 0.04
Ceric.26G056200.1 (Ceric.26G056200)
0.01 0.06 0.36 0.02 0.33 0.15 0.24 0.21 0.65 0.59 0.03 0.19 0.17 0.15 0.9 0.29 0.38 0.0 0.36 0.1 0.17 0.31 0.1 0.18 1.0 0.25
Ceric.26G064000.1 (Ceric.26G064000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.21 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.26 0.34 0.32 0.2 0.39 0.2 0.22 0.17 0.81 0.76 0.19 0.17 0.19 0.06 0.56 0.22 0.38 0.18 0.24 0.49 0.42 0.44 0.28 0.3 1.0 0.32
0.01 0.27 0.42 0.06 0.08 0.2 0.3 0.19 0.47 0.46 0.17 0.16 0.23 0.04 0.51 0.26 0.07 0.17 0.21 0.1 0.19 0.09 0.09 0.1 1.0 0.04
Ceric.27G068000.1 (Ceric.27G068000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.43 0.33 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Ceric.29G039000.1 (Ceric.29G039000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.0
Ceric.29G058400.1 (Ceric.29G058400)
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.04 0.03 0.0 0.52 0.0 0.02 0.12 0.01 0.03 0.06 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Ceric.29G086600.1 (Ceric.29G086600)
0.0 0.13 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.08 0.04 0.02 0.45 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
Ceric.29G086700.1 (Ceric.29G086700)
0.0 0.13 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.08 0.04 0.02 0.45 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 1.0 0.0
Ceric.31G058600.1 (Ceric.31G058600)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.15 0.12 0.22 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.36 0.04
Ceric.31G058800.1 (Ceric.31G058800)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.03 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.41 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Ceric.31G058900.1 (Ceric.31G058900)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.1 0.13 0.17 0.41 0.32 0.0 0.0 0.0 0.04 0.88 1.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.08 0.01 0.02 0.73 0.11
Ceric.32G001700.1 (Ceric.32G001700)
0.0 0.03 0.04 0.03 0.0 0.03 0.03 0.1 0.22 0.15 0.0 0.12 0.03 0.4 1.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.19 0.02 0.06 0.74 0.07
Ceric.32G029500.1 (Ceric.32G029500)
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.1 0.11 0.07 0.13 0.16 0.14 0.17 0.01 0.06 0.03 0.07 0.33 0.09 0.12 1.0 0.21 0.2 0.32 0.26 0.07 0.17 0.63 0.0
Ceric.33G053200.1 (Ceric.33G053200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Ceric.33G060800.1 (Ceric.33G060800)
0.14 0.01 0.12 0.27 0.02 0.15 0.24 0.2 0.52 0.43 0.02 0.04 0.06 0.1 0.56 0.09 0.02 0.1 0.27 0.11 0.41 0.23 0.11 0.1 1.0 0.04
0.03 0.2 0.43 0.16 0.36 0.13 0.14 0.08 0.39 0.38 0.1 0.12 0.07 0.04 0.64 0.2 0.33 0.11 0.1 0.1 0.12 0.18 0.09 0.38 1.0 0.09
0.1 0.2 0.21 0.12 0.16 0.16 0.21 0.25 0.26 0.27 0.13 0.18 0.16 0.04 0.25 0.14 0.17 0.13 0.19 0.2 0.32 0.3 0.09 0.2 1.0 0.11
Ceric.38G042000.1 (Ceric.38G042000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.43 0.43 0.31 0.37 0.35 0.0 0.04 0.01 0.16 0.43 0.45 0.23 1.0 0.56 0.34 0.16 0.11 0.11 0.13 0.64 0.12
0.0 0.11 0.03 0.0 0.03 0.04 0.07 0.06 0.05 0.07 0.01 0.01 0.01 0.02 0.24 0.1 0.03 0.21 0.08 0.03 0.08 0.08 0.02 0.03 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 1.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)