Heatmap: Cluster_82 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
Ceric.01G052500.1 (Ceric.01G052500)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.01G086100.1 (Ceric.01G086100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.02G040300.1 (Ceric.02G040300)
0.44 29.48 4.33 0.45 0.0 0.0 0.24 0.46 0.36 0.75 0.0 3.43 0.81 0.0 3.56 0.32 0.35 0.0 0.31 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
Ceric.02G078200.1 (Ceric.02G078200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.03G046200.1 (Ceric.03G046200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.03G081400.1 (Ceric.03G081400)
0.17 0.34 0.06 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.04G013000.1 (Ceric.04G013000)
0.0 0.0 0.0 0.13 0.3 0.1 0.11 0.07 0.51 0.03 0.39 0.39 0.4 0.0 1.25 0.02 0.5 0.0 0.13 0.07 0.0 0.0 0.03 0.26 0.0 0.01
Ceric.05G012800.1 (Ceric.05G012800)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27
Ceric.05G064800.1 (Ceric.05G064800)
0.0 0.32 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.29 0.0 0.0 0.35 0.0 0.18 0.29 0.0 2.44 0.4 0.0 0.0 0.0 0.1 3.09 0.51 5.75 0.2 3.77 0.2
Ceric.06G091500.1 (Ceric.06G091500)
0.06 3.92 2.29 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.33 0.0 0.0 0.31 0.0
Ceric.07G014500.1 (Ceric.07G014500)
0.13 0.46 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.07G040200.1 (Ceric.07G040200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.15 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.0 0.06 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Ceric.09G034700.1 (Ceric.09G034700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.01
Ceric.10G062200.1 (Ceric.10G062200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.10G081000.1 (Ceric.10G081000)
0.0 4874.03 318.15 0.0 0.0 1.81 0.0 0.0 1.25 14.26 0.0 1.0 0.0 0.0 446.48 0.0 0.0 0.0 0.0 24.44 16.53 0.0 3.13 0.0 0.0 0.0
Ceric.11G058500.1 (Ceric.11G058500)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.12G057600.1 (Ceric.12G057600)
0.0 24.93 3.12 0.06 0.24 0.41 0.2 1.58 0.12 0.25 0.32 0.47 0.28 0.19 3.71 0.0 0.16 0.05 0.04 0.61 0.37 0.1 0.02 0.1 0.21 0.0
Ceric.13G089200.1 (Ceric.13G089200)
0.0 0.0 10.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.14G014800.1 (Ceric.14G014800)
0.0 0.07 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.14G031700.1 (Ceric.14G031700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.15G025900.1 (Ceric.15G025900)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.69 11.02 0.0 0.0 7.31 0.3 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 1.01 6.72 0.54 0.0 0.79 0.1 2.59 0.02 0.04 0.0 0.05 0.04 0.0 5.03 17.35 0.0 0.23 6.08 0.15 2.3 0.03 0.9 0.02 0.31 0.11
Ceric.15G075600.1 (Ceric.15G075600)
0.84 1.79 1.52 3.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 1.43 0.42 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 1.18 0.0
Ceric.17G062200.1 (Ceric.17G062200)
0.45 0.75 0.25 2.03 0.0 0.76 0.0 0.25 1.33 0.65 0.0 0.0 0.3 0.0 0.35 0.0 0.95 0.0 0.17 0.66 0.0 0.47 0.0 0.37 0.49 0.04
Ceric.18G024500.1 (Ceric.18G024500)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.19G002200.1 (Ceric.19G002200)
0.71 14.22 1.23 0.25 0.58 0.0 0.0 0.0 0.36 0.46 1.29 0.0 0.91 0.0 1.94 0.0 0.19 0.0 0.34 0.33 1.19 0.0 0.2 0.0 0.0 0.02
Ceric.1Z038200.1 (Ceric.1Z038200)
12.22 2.06 3.46 10.69 0.0 0.0 0.0 1.8 0.0 0.0 0.0 0.47 0.94 0.0 1.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.37 0.0 0.0 0.0 3.1 0.0
Ceric.1Z075500.1 (Ceric.1Z075500)
0.13 0.02 0.59 0.34 0.0 0.15 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0
Ceric.1Z075600.1 (Ceric.1Z075600)
0.0 0.0 0.33 0.38 0.0 0.06 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.11 0.0
Ceric.1Z075900.1 (Ceric.1Z075900)
0.07 0.02 0.78 0.76 0.0 0.0 0.02 0.04 0.5 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 2.04 0.0
3.58 14.34 12.98 9.99 0.87 5.25 9.8 15.24 11.55 12.55 1.1 2.83 2.5 0.15 3.56 2.66 0.78 1.72 2.33 0.99 7.38 1.25 4.31 1.04 3.25 6.99
Ceric.1Z153000.1 (Ceric.1Z153000)
5.22 17.27 32.35 13.7 0.0 2.33 3.74 0.92 10.09 8.87 4.04 4.69 9.05 0.08 4.25 0.0 0.0 0.45 3.64 14.2 13.18 1.3 0.28 0.25 1.58 0.22
Ceric.1Z175400.1 (Ceric.1Z175400)
0.14 0.0 0.95 1.13 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
Ceric.1Z178000.1 (Ceric.1Z178000)
0.16 0.0 0.84 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z178300.1 (Ceric.1Z178300)
0.06 0.02 0.71 0.1 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0
Ceric.1Z185500.1 (Ceric.1Z185500)
1.18 8.9 8.25 7.97 0.54 2.89 6.14 10.71 4.84 5.26 0.4 1.59 1.97 0.16 2.88 1.26 0.18 0.86 1.04 0.67 5.94 0.75 3.0 0.12 1.56 3.89
Ceric.1Z223600.1 (Ceric.1Z223600)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.59 0.0 0.0 0.09 0.25 0.01
Ceric.1Z279200.1 (Ceric.1Z279200)
0.29 14.55 29.5 0.0 0.0 1.53 1.57 0.0 0.99 0.01 0.0 0.0 0.01 1.45 8.31 0.0 0.0 0.0 0.4 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 1.18 0.06
Ceric.1Z279300.1 (Ceric.1Z279300)
0.0 1.01 1.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.24 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z300800.1 (Ceric.1Z300800)
0.0 0.0 0.0 3.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.17 0.55 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Ceric.1Z317900.1 (Ceric.1Z317900)
0.72 0.73 0.73 2.07 0.0 0.2 0.28 0.27 0.68 0.74 0.6 0.25 0.31 0.02 0.27 0.04 0.0 0.06 0.14 0.22 0.6 0.03 0.0 0.01 0.22 0.01
Ceric.1Z322100.1 (Ceric.1Z322100)
0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
Ceric.20G026300.1 (Ceric.20G026300)
0.0 0.92 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.0 1.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.21G029300.1 (Ceric.21G029300)
58.81 2.79 6.34 65.85 21.11 15.62 16.0 31.49 14.73 10.75 4.23 10.47 11.61 0.0 6.7 5.39 18.26 0.25 16.66 4.78 18.58 1.36 1.03 11.9 2.4 0.71
Ceric.21G061900.1 (Ceric.21G061900)
1.31 1.32 5.65 4.27 0.0 0.11 0.12 0.56 0.76 1.0 0.56 0.38 0.0 0.15 1.45 0.08 0.09 0.55 0.07 0.5 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39
Ceric.22G029300.1 (Ceric.22G029300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.22G074100.1 (Ceric.22G074100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.23G044700.1 (Ceric.23G044700)
27.96 15.32 8.7 19.68 2.34 0.0 0.0 5.16 0.88 0.0 0.0 4.81 7.36 0.0 0.83 0.0 2.35 0.0 0.0 1.48 0.96 5.83 0.0 6.09 4.06 0.0
0.54 0.29 0.18 0.35 0.55 0.06 0.0 0.06 1.3 1.4 0.38 0.33 0.2 0.04 0.41 0.04 0.54 0.11 0.14 0.63 0.0 0.34 0.23 0.47 1.13 0.03
Ceric.24G064400.1 (Ceric.24G064400)
0.0 1.09 1.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.25G008900.1 (Ceric.25G008900)
391.72 2.54 3.51 554.84 0.0 112.84 122.65 246.51 189.41 124.84 0.0 17.44 21.52 8.86 24.6 0.0 0.0 426.83 9.89 10.45 91.23 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0
Ceric.27G001900.1 (Ceric.27G001900)
3.26 1.21 8.51 0.0 5.22 2.11 7.01 2.92 3.56 7.14 2.5 0.0 0.45 0.0 5.29 6.23 6.19 0.0 1.8 1.2 1.0 3.98 2.0 3.24 9.05 0.0
11.5 7.07 37.15 11.04 4.07 3.18 2.11 2.69 4.98 6.48 5.07 25.61 17.12 0.93 7.75 0.0 3.56 1.65 7.37 9.55 3.93 2.32 0.91 4.13 1.32 1.54
21.38 13.44 28.42 78.52 4.58 3.18 3.06 3.48 10.59 9.28 3.44 4.5 4.58 0.5 10.87 2.34 4.39 5.1 7.41 6.15 15.05 5.09 1.02 4.94 14.4 0.31
Ceric.29G010600.1 (Ceric.29G010600)
0.36 8.3 3.44 0.91 3.54 2.5 5.17 4.55 6.8 4.45 1.04 5.63 4.3 0.54 5.15 2.78 3.63 1.69 7.29 1.89 1.56 0.73 1.06 5.37 6.14 0.82
Ceric.30G005000.1 (Ceric.30G005000)
0.0 1.08 18.82 0.0 0.0 1.81 2.13 15.13 0.0 4.11 0.0 1.44 0.0 0.0 26.23 0.0 0.0 0.0 0.0 1.77 3.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.30G005100.1 (Ceric.30G005100)
0.0 1.08 18.82 0.0 0.0 1.81 2.13 15.13 0.0 4.11 0.0 1.44 0.0 0.0 26.23 0.0 0.0 0.0 0.0 1.77 3.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.30G005200.1 (Ceric.30G005200)
0.0 1.08 18.82 0.0 0.0 1.81 2.13 15.13 0.0 4.11 0.0 1.44 0.0 0.0 26.23 0.0 0.0 0.0 0.0 1.77 3.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.32G009000.1 (Ceric.32G009000)
0.64 27.24 5.26 0.41 4.6 2.32 2.94 3.43 6.83 5.47 4.53 2.71 4.46 0.65 7.95 3.15 4.72 0.82 2.64 2.73 2.16 2.45 2.81 3.83 3.89 2.52
Ceric.32G040900.1 (Ceric.32G040900)
0.0 0.0 5.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.99 0.0
Ceric.34G022700.1 (Ceric.34G022700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.37G030000.1 (Ceric.37G030000)
0.01 0.41 0.37 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
Ceric.37G030300.1 (Ceric.37G030300)
0.52 0.38 0.79 1.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.04 0.1 0.0 0.0
Ceric.38G000900.1 (Ceric.38G000900)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.38G061000.1 (Ceric.38G061000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.39G032600.1 (Ceric.39G032600)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.39G056100.1 (Ceric.39G056100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)