Heatmap: Cluster_313 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots
Roots (Meristematic zone)
Roots (Differentiation zone)
Roots (Elongation zone)
Hypocotyl
Leaves
Meristem (Vegetative)
Apical Meristem
Floral Buds
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Style (1d before flowering)
Style (1d after flowering)
Style+pollen (1d after flowering)
Pollen (Germinated)
Pollen (Mature/Ungerminated)
Fruits (Breaker stage)
Fruits (Mature green)
Pericarp/Exocarp (4d Post Anthesis)
Pericarp (5d Post Anthesis)
Pericarp (7d Post Anthesis)
Pericarp (10d Post Anthesis)
Pericarp
Seeds (5d Post Anthesis)
Seeds (7d Post Anthesis)
Seeds (10d Post Anthesis)
Septum/Seed (4d Post Anthesis)
Septum (7d Post Anthesis)
Septum (10d Post Anthesis)
Seedling (Leaves)
Seedling (Roots)
Solyc01g005600.3.1 (Solyc01g005600.3)
1.09 -1.31 0.41 -0.16 -0.02 -0.1 0.23 -0.47 -0.06 0.46 -0.53 -0.79 -0.24 -0.76 0.5 0.67 0.53 -0.64 -1.75 0.22 -0.57 -0.03 -0.38 -0.17 0.01 0.12 -0.34 -0.17 -0.06 -0.04 -0.07 0.12 -0.45 1.04
Solyc01g098430.3.1 (Solyc01g098430.3)
0.97 -0.73 0.88 -0.2 0.32 -0.06 1.39 -0.77 -0.5 0.38 -0.77 -0.92 -0.45 -0.98 0.09 0.31 0.34 -6.51 -7.68 0.53 0.14 -0.18 -0.38 -0.18 -0.17 1.24 -0.44 -0.25 -0.22 -0.41 -0.47 0.02 -1.86 0.88
Solyc01g103970.3.1 (Solyc01g103970.3)
0.94 -3.02 -1.77 -0.61 -0.84 -0.36 0.44 -1.83 -0.01 1.44 0.23 0.46 1.2 1.46 0.21 -0.39 -0.25 - - 0.68 -0.32 -0.89 -1.17 -1.04 -0.83 2.26 -1.21 -1.22 -0.98 -1.09 -0.91 -0.63 -2.45 0.65
Solyc01g104080.3.1 (Solyc01g104080.3)
0.18 -1.17 -0.39 -0.8 -0.22 -0.07 -0.59 -1.29 0.2 0.67 -0.51 -0.32 0.62 0.73 0.87 1.14 1.14 -2.74 -2.2 0.35 -0.35 -0.54 -0.89 -0.52 -0.36 1.52 -0.63 -0.39 -0.07 -0.48 -0.56 0.08 -1.55 0.46
Solyc02g078020.3.1 (Solyc02g078020.3)
1.64 -2.57 1.78 0.42 0.34 -0.53 0.18 -1.14 -0.8 0.08 -0.53 -1.82 -2.38 -2.56 -0.2 -1.21 -0.96 - - 1.39 0.46 -1.38 -2.03 -1.36 -0.99 2.12 -0.35 -0.07 -0.04 -1.07 -1.34 -0.88 -0.82 1.62
Solyc02g078470.3.1 (Solyc02g078470.3)
-0.12 -1.01 0.57 -0.27 0.28 -0.63 -1.28 -0.82 0.2 1.03 -0.76 -0.7 -0.06 -0.38 1.0 1.58 1.36 -5.36 -6.82 0.21 -0.24 -0.23 -0.31 -0.06 0.0 0.55 -0.28 -0.06 0.07 -0.34 -0.35 -0.08 -2.27 0.06
Solyc02g081590.3.1 (Solyc02g081590.3)
0.5 -2.73 -1.84 -3.71 0.1 0.31 -0.15 -1.07 -0.33 0.25 0.87 0.44 0.72 0.5 0.11 0.12 0.13 -8.17 -8.33 1.07 1.1 -0.56 -0.76 -0.61 -0.67 1.51 -0.29 -0.22 -0.34 -0.34 -0.4 -0.14 -1.03 0.87
Solyc02g082670.3.1 (Solyc02g082670.3)
1.55 -2.78 0.12 -0.72 0.7 -0.4 -0.91 -1.06 0.18 -0.43 -0.41 -0.36 -0.05 -0.3 -0.9 -1.11 -1.05 -8.64 -10.9 1.17 1.23 -0.56 -0.93 -0.47 -0.35 2.08 -0.66 -0.52 -0.19 -0.38 -0.43 0.31 -2.28 1.3
Solyc02g089605.1.1 (Solyc02g089605.1)
0.87 0.67 -0.48 -0.9 -1.01 -0.76 -0.48 -0.91 -0.01 -0.2 1.04 0.51 0.83 0.65 -0.74 -1.33 -1.28 -1.96 -1.83 0.17 1.46 -0.05 -0.06 -0.23 -0.06 -0.18 -0.24 -0.43 -0.26 -0.11 0.07 0.16 -2.08 1.07
Solyc02g093880.3.1 (Solyc02g093880.3)
0.3 -2.09 -0.79 -1.57 0.61 0.39 0.18 -0.84 0.27 0.07 0.42 0.52 0.99 0.95 0.44 0.45 0.56 -4.14 -2.75 0.69 0.47 -0.52 -0.45 -0.49 -0.72 0.68 -0.38 -0.38 -0.49 -0.57 -0.48 -0.37 -1.83 0.75
Solyc03g032055.1.1 (Solyc03g032055.1)
-0.45 -0.31 0.03 0.95 -0.04 -0.46 -0.05 -1.42 0.63 0.04 -0.6 -0.51 -0.36 -0.43 0.65 0.67 0.59 -6.73 -5.42 0.17 0.42 0.2 0.09 0.14 -0.03 0.51 0.02 -0.02 0.12 0.19 0.22 0.11 -0.79 0.12
Solyc03g034430.2.1 (Solyc03g034430.2)
0.33 0.17 0.47 0.58 1.08 -0.06 0.15 0.13 -0.61 -0.05 -0.42 -0.34 -0.34 -0.28 0.08 0.16 0.31 -4.72 -5.46 -0.08 0.14 0.03 0.11 0.18 0.19 0.47 0.1 0.01 0.02 -0.11 -0.15 -0.02 -0.76 -0.11
Solyc03g082880.1.1 (Solyc03g082880.1)
0.13 -1.88 -0.63 -1.76 1.65 0.03 -0.19 -2.43 0.2 -0.56 -0.46 -0.5 0.16 0.0 -0.2 0.48 -0.0 -6.37 -6.82 0.69 1.19 0.26 -0.62 -0.24 0.32 0.12 -0.1 0.09 0.44 0.43 0.18 0.61 -0.33 -0.43
Solyc03g096990.3.1 (Solyc03g096990.3)
0.93 -1.68 -0.67 -0.8 0.77 0.11 -0.98 -0.32 -0.21 -0.44 -0.46 -0.75 0.01 -0.46 -0.17 0.07 -0.05 -10.03 -9.34 1.43 0.81 -0.09 -0.28 -0.19 -0.06 1.6 -0.04 0.05 0.03 -0.08 -0.12 0.07 -1.23 0.55
Solyc03g113270.3.1 (Solyc03g113270.3)
1.37 -3.6 0.13 -1.85 0.47 -0.35 -3.65 -2.46 -1.38 0.07 -1.43 -2.43 -2.43 -2.8 -0.38 -0.41 -0.16 -10.37 -10.22 2.34 1.0 -0.7 -1.99 -1.1 -0.26 2.0 -2.08 -1.13 -0.58 -0.78 -1.22 0.62 -1.99 2.43
Solyc03g120730.3.1 (Solyc03g120730.3)
0.69 -0.63 -0.96 -1.66 -0.1 -0.21 0.75 -0.57 0.7 1.29 0.28 -0.58 0.8 -0.16 0.4 0.05 0.43 - - 0.36 -0.57 -0.65 -0.63 -0.66 -0.54 2.28 -0.73 -0.8 -0.71 -0.98 -0.57 -0.58 -3.71 0.36
Solyc04g012160.3.1 (Solyc04g012160.3)
0.81 -3.34 1.16 -1.76 -1.4 0.21 -12.49 -0.82 -3.0 0.46 -0.84 -3.15 -1.95 -4.14 0.42 1.59 2.58 -9.25 -10.3 2.32 0.06 -3.49 -4.36 -3.11 -1.66 2.33 -3.92 -3.05 -2.64 -3.97 -4.3 -2.37 -2.08 1.13
Solyc04g014670.3.1 (Solyc04g014670.3)
0.25 -0.12 0.23 1.03 -0.03 -0.43 -0.48 -0.15 -0.42 -0.04 -0.28 -0.37 -0.16 -0.6 0.78 1.08 1.0 -6.39 -6.23 0.48 -0.14 -0.03 -0.39 -0.05 0.06 -0.05 -0.05 -0.1 -0.1 0.14 0.1 0.16 -1.03 -0.07
Solyc04g057890.3.1 (Solyc04g057890.3)
-0.33 -0.71 0.91 -0.07 -0.51 -0.16 -1.37 -0.68 -0.28 0.55 -1.29 -1.36 -1.16 -1.19 0.95 0.8 0.89 -5.81 -6.96 1.76 0.24 -0.83 -1.41 -1.07 -0.53 1.69 -0.44 -0.02 0.44 -0.51 -0.69 0.1 -1.37 0.91
Solyc05g007970.3.1 (Solyc05g007970.3)
0.16 -0.27 0.97 0.36 0.05 0.08 -1.12 -0.45 -0.57 0.46 0.14 -0.06 0.49 0.05 0.48 0.51 0.68 -7.1 -10.49 0.2 0.15 -0.23 -0.44 -0.29 -0.17 0.89 -0.22 -0.23 -0.36 -0.04 0.0 0.12 -1.2 0.18
Solyc05g012010.3.1 (Solyc05g012010.3)
1.21 -2.12 0.99 -1.44 1.51 0.1 -0.25 -0.33 -0.49 -0.1 -0.53 0.15 -0.13 -0.41 -0.76 -1.2 -1.62 - -9.64 0.22 -0.37 -0.18 -0.97 -0.48 -0.22 2.03 -0.34 -0.01 0.03 -0.1 -0.28 0.14 -1.03 0.95
Solyc05g014120.1.1 (Solyc05g014120.1)
-0.52 -1.19 0.75 1.07 0.46 -1.9 -12.52 -1.82 -2.44 -0.76 -2.51 -3.35 -4.49 -6.01 2.09 2.42 2.14 -9.3 -11.21 2.03 -0.52 -2.85 -5.95 -3.49 -2.22 2.03 -3.5 -1.91 -1.19 -2.3 -3.43 -2.05 -0.78 -0.32
Solyc05g018760.2.1 (Solyc05g018760.2)
0.42 -1.3 0.27 -0.14 -0.72 -0.12 0.29 -1.24 0.29 0.31 0.12 -0.57 0.22 -0.42 0.31 0.28 0.82 -4.13 -2.98 1.17 0.52 -0.45 -1.24 -0.81 -0.49 2.03 -0.9 -0.69 -0.32 -0.6 -0.63 0.26 -1.12 0.41
Solyc05g052310.3.1 (Solyc05g052310.3)
0.02 -0.49 0.99 0.12 0.95 0.54 -0.43 0.07 -0.37 0.48 -0.52 -0.68 -0.53 -1.27 0.54 0.69 0.78 -9.48 -10.27 0.21 -0.44 -0.13 -0.41 -0.26 -0.1 1.04 -0.17 -0.08 -0.11 -0.12 -0.07 0.05 -1.43 0.27
Solyc05g055060.3.1 (Solyc05g055060.3)
0.98 -0.77 0.22 -0.81 -0.53 -0.02 -0.76 -0.71 -0.24 0.18 0.43 -0.11 1.08 0.33 0.63 0.99 1.09 -5.97 -6.24 0.15 -0.17 -0.47 -0.75 -0.62 -0.75 0.06 -0.43 -0.26 -0.24 -0.35 -0.22 -0.0 -0.69 1.15
Solyc05g055390.3.1 (Solyc05g055390.3)
1.58 -1.65 -0.31 -0.72 0.54 0.21 -0.01 -0.82 -0.17 0.06 0.21 0.32 1.07 0.32 -0.17 0.18 0.01 - - 0.54 0.49 -0.49 -1.0 -0.65 -0.72 0.61 -0.62 -0.63 -0.34 -0.62 -0.46 -0.15 -0.74 1.38
Solyc06g008520.3.1 (Solyc06g008520.3)
0.02 -0.78 0.0 -0.02 -1.35 -0.47 -0.58 -0.89 -0.2 0.77 0.13 0.11 0.28 -0.0 0.11 0.13 0.23 -2.07 -1.0 0.39 0.68 0.03 0.05 0.12 0.31 0.81 -0.04 -0.11 0.08 -0.11 -0.11 0.43 -0.64 0.26
Solyc06g008880.3.1 (Solyc06g008880.3)
0.89 -1.88 0.48 -1.38 0.08 0.01 -0.79 -1.16 -0.78 0.54 0.18 -0.67 0.55 -0.19 0.67 1.2 1.15 -9.37 - 0.69 -0.12 -0.43 -0.84 -0.6 -0.44 0.69 -0.65 -0.48 -0.32 -0.46 -0.45 -0.11 -1.19 1.54
Solyc06g051650.3.1 (Solyc06g051650.3)
0.06 -0.28 0.42 0.2 -0.55 -0.3 -0.3 0.07 -0.16 -0.31 -0.1 0.04 0.23 0.34 0.45 0.22 0.3 -1.79 -2.84 0.81 0.76 -0.09 -0.37 -0.23 -0.06 0.95 -0.28 -0.15 0.01 -0.24 -0.12 0.04 -1.16 0.19
Solyc06g053200.3.1 (Solyc06g053200.3)
0.83 -0.59 -0.4 0.06 -0.73 -0.27 0.17 -0.93 -0.23 0.48 0.3 0.4 -0.77 -0.54 -0.63 -0.84 -0.91 -6.29 -6.72 0.96 0.61 0.4 -0.15 0.24 0.52 1.07 -0.6 0.0 0.25 0.24 0.14 0.77 -0.75 0.0
Solyc06g061250.2.1 (Solyc06g061250.2)
0.78 -2.12 -0.07 -1.9 1.19 0.14 -2.77 -1.06 -0.29 0.64 0.73 0.32 1.33 0.81 0.72 0.46 0.77 - -9.99 -0.32 0.02 -1.18 -1.92 -1.49 -1.39 0.98 -1.59 -1.55 -1.48 -0.94 -1.11 0.13 -1.03 1.89
Solyc06g062790.3.1 (Solyc06g062790.3)
0.23 -0.92 -0.22 -1.2 0.66 0.02 -2.23 -0.26 0.15 0.9 -0.15 -0.63 0.61 0.17 0.35 0.98 0.83 -0.56 -0.71 0.01 -0.38 -0.2 -0.56 -0.4 -0.5 1.09 -0.1 -0.09 -0.17 -0.21 -0.13 -0.2 -2.42 0.44
Solyc06g071440.3.1 (Solyc06g071440.3)
1.45 -1.01 0.79 -0.33 -0.1 -0.22 -0.01 -0.46 0.24 0.5 -0.36 -0.51 -0.17 -0.56 0.42 0.4 0.38 -5.93 -8.44 -0.15 0.28 0.07 -0.67 -0.23 0.03 -0.22 -0.48 -0.12 -0.04 0.13 0.02 0.51 -0.97 0.95
Solyc06g071750.3.1 (Solyc06g071750.3)
-1.62 -1.65 -4.48 -3.19 -2.23 -3.5 -0.8 -4.08 -1.25 -1.81 -1.65 -1.28 -0.92 -0.41 -0.18 -0.47 -0.46 -7.97 -9.62 3.62 0.41 -0.5 -0.3 0.11 -0.03 2.46 -0.44 -0.05 -0.38 -0.61 -1.28 -0.9 -3.97 -1.44
Solyc06g072980.3.1 (Solyc06g072980.3)
1.01 -1.04 -1.16 -2.78 0.03 0.09 -0.09 -1.02 0.37 0.46 -0.32 -0.04 0.29 -0.43 -0.16 0.15 0.17 -4.51 -5.79 1.16 0.87 -0.35 -0.5 -0.43 -0.37 1.81 -0.26 -0.28 -0.31 -0.34 -0.31 -0.02 -2.02 0.95
Solyc07g019670.3.1 (Solyc07g019670.3)
0.08 -2.11 0.28 -2.04 -0.74 -0.99 -1.91 -2.42 0.24 0.95 -0.71 -2.4 -0.01 -1.36 0.58 1.04 0.92 -7.4 -6.67 1.41 0.52 -0.48 -1.32 -0.36 0.25 1.94 -0.38 0.16 0.47 -0.37 -0.7 0.55 -2.64 0.73
Solyc07g051850.3.1 (Solyc07g051850.3)
1.11 -0.59 0.74 -0.54 -0.58 -0.15 0.12 -1.36 -0.72 0.17 0.21 0.18 0.19 0.25 0.38 0.39 0.46 -5.58 -6.5 0.52 0.56 -0.12 -0.41 -0.24 -0.21 0.53 -0.37 -0.23 -0.01 -0.27 -0.14 0.02 -0.68 0.73
Solyc08g006705.1.1 (Solyc08g006705.1)
-0.53 0.06 0.5 -0.14 -1.59 -0.96 -0.2 -1.36 -0.27 -0.42 0.03 0.11 0.22 -0.13 -0.19 -0.17 0.1 0.42 -0.23 0.34 1.16 -0.11 0.05 -0.03 0.08 0.62 0.16 -0.04 0.06 -0.14 -0.1 0.32 -0.88 0.3
Solyc08g006970.3.1 (Solyc08g006970.3)
1.57 -1.9 1.19 -0.94 0.1 -0.04 -0.07 -0.72 -0.9 0.08 -0.72 -0.74 -1.35 -2.12 0.0 0.27 -0.11 - - 1.3 -0.35 -0.33 -0.65 -0.52 -0.2 1.75 -0.77 -0.55 -0.61 0.04 0.11 0.51 -1.04 1.16
Solyc08g014290.1.1 (Solyc08g014290.1)
-0.06 -0.4 0.25 -0.33 -0.15 -0.1 -0.44 -0.76 0.33 -0.13 0.51 0.3 -0.12 -0.57 0.1 -0.17 -0.35 -1.61 -3.72 0.59 0.57 -0.11 0.12 0.16 0.13 0.9 0.23 0.32 0.27 -0.08 -0.07 -0.09 -0.94 0.58
Solyc08g067470.3.1 (Solyc08g067470.3)
0.73 -0.75 -0.64 -1.56 0.62 0.43 -0.17 -0.41 -0.02 0.32 -0.08 -0.29 0.15 -0.26 0.43 0.36 0.39 - - 0.46 0.46 -0.1 -0.6 -0.36 -0.18 1.61 -0.41 -0.24 -0.09 -0.08 -0.09 0.25 -1.42 0.39
Solyc08g078203.1.1 (Solyc08g078203.1)
0.06 -2.23 -0.53 -0.89 0.41 0.13 1.02 -0.77 -0.29 -0.02 0.52 0.2 0.74 0.42 -0.5 -0.94 -0.54 -4.27 -3.86 0.3 0.75 -0.06 -0.04 0.02 -0.08 1.04 -0.15 -0.16 -0.23 -0.08 -0.01 0.13 0.08 0.52
Solyc09g014790.3.1 (Solyc09g014790.3)
0.55 -2.24 0.18 -1.18 -1.32 -0.63 -1.02 -1.05 -1.05 1.2 0.49 -0.0 1.65 1.43 0.97 1.05 1.27 0.39 -1.53 -0.32 -0.93 -1.45 -1.55 -1.44 -2.04 1.14 -0.98 -1.02 -0.97 -1.29 -1.77 -1.16 -1.8 0.83
Solyc09g020190.3.1 (Solyc09g020190.3)
0.9 -2.81 -0.35 -2.33 -2.0 -0.19 -0.64 - 0.01 -0.07 -0.67 -1.28 0.15 -0.33 0.85 0.91 0.85 -3.37 -3.47 1.65 0.64 -0.49 -1.38 -0.77 -0.33 2.09 -0.73 -0.41 0.03 -0.52 -0.57 0.3 -0.61 0.69
Solyc10g007000.3.1 (Solyc10g007000.3)
1.13 -0.99 -0.08 -1.8 -0.87 -0.59 0.36 -1.38 0.48 -0.04 -0.34 -1.11 0.59 -0.08 0.03 0.18 0.21 -5.35 -6.92 0.42 0.11 -0.32 -0.29 -0.29 -0.35 1.13 0.36 0.41 0.75 -0.01 -0.06 0.29 -3.57 1.27
Solyc10g007345.1.1 (Solyc10g007345.1)
-0.34 -0.27 -1.44 -0.6 -0.65 -0.9 0.79 -0.9 -0.11 -0.18 0.73 -0.45 1.05 0.32 0.61 0.1 0.33 -5.23 -3.56 0.17 1.45 -0.4 0.01 -0.26 -0.4 0.52 0.02 -0.16 -0.18 0.15 0.23 -0.09 -1.48 0.5
Solyc10g050230.2.1 (Solyc10g050230.2)
0.92 -0.02 0.43 0.74 0.17 0.08 -0.21 -0.24 -0.43 -0.29 0.2 0.32 0.25 0.32 -0.19 -0.4 -0.56 - - -0.16 0.2 -0.13 0.46 0.31 0.14 0.58 -0.08 -0.12 -0.36 -0.04 -0.04 -0.09 -2.4 0.69
Solyc10g084930.2.1 (Solyc10g084930.2)
0.51 -1.39 -0.04 -0.13 -0.7 -0.37 -0.48 -1.45 0.38 0.3 -0.54 -0.61 0.14 -0.38 0.72 0.68 0.6 -5.06 -5.79 1.11 0.67 -0.42 -0.82 -0.58 -0.37 2.04 -0.55 -0.29 -0.15 -0.45 -0.45 0.12 -2.92 0.64
Solyc11g005920.2.1 (Solyc11g005920.2)
1.12 0.21 -0.52 -0.9 -0.43 -0.3 0.36 -0.96 -0.09 -0.02 0.24 0.17 0.55 0.37 -0.12 -0.03 -0.04 -7.26 -4.92 0.89 0.44 -0.06 -0.44 -0.16 0.09 0.72 -0.5 -0.1 0.11 -0.27 -0.15 0.37 -2.44 0.83
Solyc11g012840.2.1 (Solyc11g012840.2)
0.99 -1.28 -0.0 -0.68 0.19 -0.09 0.24 -0.94 0.28 0.63 -0.86 -1.1 -0.24 -0.73 0.6 0.62 0.62 -10.36 -10.06 0.66 -0.0 -0.08 -0.72 -0.42 -0.17 1.58 -0.66 -0.31 -0.08 -0.03 -0.15 0.48 -1.41 0.66
Solyc11g017000.2.1 (Solyc11g017000.2)
0.36 -0.09 -1.3 -1.57 -0.13 0.04 0.55 -1.01 -0.41 -0.38 0.13 0.16 0.67 1.01 -0.72 -1.27 -1.03 - - 1.65 1.07 -0.55 -0.43 -0.43 -0.61 1.72 0.21 0.08 0.01 -0.34 -0.27 -0.2 -3.15 0.15
Solyc12g027760.1.1 (Solyc12g027760.1)
0.87 -0.31 0.69 -0.01 -1.85 -1.56 -0.95 -2.79 0.36 0.27 0.41 -0.11 0.58 0.35 0.31 0.34 0.32 - - 0.11 1.15 0.4 -0.51 -0.23 0.16 -0.79 -0.55 -0.07 0.44 0.17 0.5 0.73 -3.65 0.13
Solyc12g099510.2.1 (Solyc12g099510.2)
-0.15 -0.49 -0.4 0.43 -0.04 -0.11 -1.19 -0.78 -0.25 0.28 0.28 0.47 0.71 0.55 0.11 -0.07 0.16 -3.06 -1.04 1.11 1.19 -0.51 -0.22 -0.14 -0.25 0.7 -0.38 -0.38 -0.3 -0.58 -0.45 -0.32 -1.18 0.57

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.