1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_69 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.02G043600.1 (Ceric.02G043600)
 0.17 0.0 0.0 0.0 0.03 0.14 0.1 0.0 0.33 0.02 0.0 0.47 0.37 0.25 8.25 0.0 0.01 2.08 14.58 0.14 0.65 0.0 0.0 1.6 4.7 0.04
Ceric.02G113600.1 (Ceric.02G113600)
 0.0 0.09 0.06 0.1 0.0 0.0 0.0 0.1 0.29 0.0 0.64 0.55 0.67 0.26 0.2 0.0 0.07 0.19 0.44 0.07 0.44 0.0 0.0 0.0 0.19 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.04G058200.1 (Ceric.04G058200)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.05G054600.1 (Ceric.05G054600)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.05G077400.1 (Ceric.05G077400)
 0.0 0.0 0.09 0.0 0.95 0.0 0.15 0.0 0.4 0.13 0.23 0.0 0.17 0.1 0.6 0.39 0.53 0.14 0.84 0.05 0.39 0.79 0.0 0.62 2.21 0.04
Ceric.06G032300.1 (Ceric.06G032300)
 0.0 0.2 0.27 0.0 0.23 0.4 0.31 0.0 0.14 0.26 0.0 0.12 0.12 0.0 0.32 0.28 0.08 0.49 0.85 0.04 0.28 0.19 0.08 0.0 0.39 0.12
Ceric.06G063100.1 (Ceric.06G063100)
 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 2.95 0.07 0.19 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.07G002200.1 (Ceric.07G002200)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.08G037500.1 (Ceric.08G037500)
 0.17 1.5 1.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 1.37 2.47 0.58 0.2 1.23 0.0 2.42 0.0 0.0 2.54 2.81 1.01 3.35 2.28 1.32 0.76 0.0 2.83
Ceric.08G046100.1 (Ceric.08G046100)
 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.09 0.01
Ceric.09G024500.1 (Ceric.09G024500)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.09G075300.1 (Ceric.09G075300)
 0.0 0.01 0.14 0.0 39.75 6.73 27.27 2.5 115.06 98.71 1.68 16.32 10.82 7.25 57.49 0.35 41.99 170.14 12.62 27.05 25.89 90.91 8.69 324.5 61.7 6.88
Ceric.09G075400.1 (Ceric.09G075400)
 0.0 0.01 0.14 0.0 40.56 4.33 7.1 2.97 0.0 0.0 1.04 4.69 5.5 0.25 40.81 1.06 38.08 104.17 10.53 37.89 34.13 88.83 11.56 256.83 69.97 24.25
Ceric.10G030900.1 (Ceric.10G030900)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.12 0.0 0.0 0.0 1.07 0.16 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
Ceric.11G021300.1 (Ceric.11G021300)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.58 0.64 2.41 0.96 0.16 0.03 1.6 0.03 0.0 1.01 1.11 0.27 0.67 0.0 0.08 0.03 0.09 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.28 2.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 3.33 1.21 0.07 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.12G012100.1 (Ceric.12G012100)
 0.0 1.16 14.03 0.0 0.83 0.0 0.17 12.8 0.0 1.08 0.0 7.64 7.07 7.41 24.31 0.04 1.11 0.0 19.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.25 0.12
Ceric.13G035900.1 (Ceric.13G035900)
 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.65 0.91 0.0 0.0 0.02 0.0 0.3 0.0 0.0 0.53 1.56 0.0 0.68 0.05 0.0 0.0 0.03 0.01
Ceric.16G080300.1 (Ceric.16G080300)
 50.8 118.31 148.14 109.57 92.82 78.59 99.37 77.64 28.72 16.39 144.29 35.64 43.53 0.0 146.64 95.03 91.15 4.23 223.17 75.83 37.76 149.99 10.42 130.16 194.94 89.1
Ceric.17G014200.1 (Ceric.17G014200)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.17G024400.1 (Ceric.17G024400)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.17G076000.1 (Ceric.17G076000)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 47.49 66.92 50.89 307.2 261.66 0.0 0.21 0.22 7.82 218.89 0.01 0.01 435.15 154.5 0.42 352.57 8.07 0.23 0.0 0.0 0.08
Ceric.1Z039000.1 (Ceric.1Z039000)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.1Z066500.1 (Ceric.1Z066500)
 0.0 0.0 0.12 0.0 46.06 8.7 16.75 2.54 46.55 45.62 2.99 8.12 7.75 7.84 40.6 2.54 48.12 163.85 10.94 46.49 35.43 94.36 15.8 301.6 88.11 30.7
Ceric.1Z066600.1 (Ceric.1Z066600)
 0.0 0.01 0.04 0.0 42.26 7.61 16.49 2.15 55.55 47.42 4.19 12.02 7.51 12.57 40.1 2.2 43.88 159.9 9.94 37.68 34.23 93.13 13.12 283.05 78.72 26.36
Ceric.1Z087000.1 (Ceric.1Z087000)
 0.0 11.75 4.55 0.0 0.0 0.17 0.96 0.39 11.42 16.26 5.62 1.73 4.8 0.05 8.52 0.04 0.0 2.07 9.91 0.97 54.57 0.81 0.19 0.04 0.11 12.15
Ceric.1Z087100.1 (Ceric.1Z087100)
 0.0 11.75 4.55 0.0 0.0 0.17 0.96 0.39 11.42 16.26 5.62 1.73 4.8 0.05 8.52 0.04 0.0 2.07 9.91 0.97 54.57 0.81 0.19 0.04 0.11 12.15
Ceric.1Z087200.1 (Ceric.1Z087200)
 0.0 11.75 4.55 0.0 0.0 0.17 0.96 0.39 11.42 16.26 5.62 1.73 4.8 0.05 8.52 0.04 0.0 2.07 9.91 0.97 54.57 0.81 0.19 0.04 0.11 12.15
Ceric.1Z087300.1 (Ceric.1Z087300)
 0.0 11.75 4.55 0.0 0.0 0.17 0.96 0.39 11.42 16.26 5.62 1.73 4.8 0.05 8.52 0.04 0.0 2.07 9.91 0.97 54.57 0.81 0.19 0.04 0.11 12.15
Ceric.1Z105900.1 (Ceric.1Z105900)
 0.0 0.0 0.11 0.0 66.31 63.0 78.34 10.61 102.67 106.81 0.0 93.63 58.08 0.0 214.66 12.08 69.39 0.54 53.64 7.01 20.92 6.61 10.97 152.04 29.07 1.52
Ceric.1Z152100.1 (Ceric.1Z152100)
 0.0 11.75 4.55 0.0 0.0 0.17 0.96 0.39 11.42 16.26 5.62 1.73 4.8 0.05 8.52 0.04 0.0 2.07 9.91 0.97 54.57 0.81 0.19 0.04 0.11 12.15
Ceric.1Z231000.1 (Ceric.1Z231000)
 0.33 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.16 0.0 0.23
Ceric.1Z237800.1 (Ceric.1Z237800)
 0.0 0.01 0.04 0.0 42.26 7.61 16.49 2.15 55.55 47.42 4.19 12.02 7.51 12.57 40.1 2.2 43.88 159.9 9.94 37.68 34.23 93.13 13.12 283.05 78.72 26.36
Ceric.1Z271600.1 (Ceric.1Z271600)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.1 0.0 0.0 0.39 0.96 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
8.89 5.23 11.59 0.27 0.0 0.0 0.0 1.03 5.3 2.67 1.59 0.0 0.0 0.0 7.38 0.58 0.66 0.0 1.87 5.4 19.92 4.37 6.17 0.0 13.68 5.16
Ceric.1Z327800.1 (Ceric.1Z327800)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z328000.1 (EIF2 GAMMA)
 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 5.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.02
Ceric.20G022800.1 (Ceric.20G022800)
 0.33 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.16 0.0 0.23
Ceric.20G034000.1 (Ceric.20G034000)
 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.38 0.0 0.17 2.47 0.0 0.0 0.8 0.51 0.41 4.47 0.0 2.82 0.0 0.0 0.44
Ceric.20G038300.1 (Ceric.20G038300)
 0.0 0.74 0.05 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.09 3.47 0.66 0.62 0.31 0.0 1.28 0.0 0.0 1.3 1.22 0.09 2.3 0.0 0.0 0.0 0.39 0.27
Ceric.22G031800.1 (Ceric.22G031800)
 0.38 0.0 0.01 0.34 1.84 12.93 6.39 4.96 0.04 0.83 0.0 0.78 0.35 0.0 7.89 1.86 4.39 0.0 22.06 1.7 0.0 4.75 0.0 8.11 0.48 2.82
0.0 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.35 0.06 0.13 0.0 0.0 0.06 0.07 0.0 0.76 0.0 0.0 0.06 0.29 0.02 4.49 0.0 0.04 0.0 1.99 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.15 0.02 1.14 0.0 0.0 0.0 0.57 0.01
Ceric.25G037000.1 (Ceric.25G037000)
 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.47 1.95 0.0 2.3 1.94 0.0 0.0 0.0 0.19 0.99 0.51 0.07 3.57 3.02 0.59 1.98 1.58 1.62 0.0 0.37 1.07
Ceric.25G062500.1 (Ceric.25G062500)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.27G051700.1 (Ceric.27G051700)
 0.33 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.16 0.0 0.23
Ceric.30G028100.1 (Ceric.30G028100)
 5.13 26.34 31.84 28.53 12.63 22.84 27.51 20.24 40.84 32.87 5.33 8.17 8.7 5.12 27.37 11.87 13.05 16.92 25.49 18.1 18.12 17.97 9.47 11.15 21.91 19.88
Ceric.31G063700.1 (Ceric.31G063700)
 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.08 0.0 0.2 0.39 0.93 0.29 0.74 0.71 0.0 0.34 0.0 0.08 0.6 0.17 0.41 0.73 0.42 0.14 0.9 0.0 0.57 0.26 0.1 0.11
Ceric.32G045300.1 (Ceric.32G045300)
 0.05 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.34 0.18 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.0 0.0 0.11 0.0 0.01
Ceric.39G048500.1 (Ceric.39G048500)
 0.0 0.09 0.18 0.0 0.0 1.71 0.65 0.54 1.17 1.01 0.0 0.5 0.32 0.06 0.57 0.24 0.0 0.35 0.99 0.5 1.39 0.0 0.07 0.0 2.62 0.18

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)