Heatmap: Cluster_59 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
Ceric.01G035600.1 (Ceric.01G035600)
0.0 0.24 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.02G056900.1 (Ceric.02G056900)
0.25 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.03G033100.1 (Ceric.03G033100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.03G043100.1 (Ceric.03G043100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.03G045200.1 (Ceric.03G045200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.03G051500.1 (Ceric.03G051500)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14
Ceric.03G078500.1 (Ceric.03G078500)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.06G015000.1 (Ceric.06G015000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.07G006700.1 (Ceric.07G006700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.07G025100.1 (Ceric.07G025100)
1.47 1.03 0.36 2.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 1.22 0.61 0.0 1.35 0.37 0.4 0.0 0.0 1.02 0.0 1.0 0.42 0.78 1.05 0.19
Ceric.07G079700.1 (Ceric.07G079700)
0.0 0.04 0.01 0.04 0.0 0.0 0.13 0.0 0.06 0.11 0.0 0.04 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.16 0.05 0.2 0.36 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01
Ceric.08G031900.1 (Ceric.08G031900)
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.09G021800.1 (Ceric.09G021800)
0.0 9.27 2.68 0.0 0.0 1.6 1.64 0.0 1.34 1.46 0.0 14.39 0.0 1.09 4.96 0.0 0.0 3.09 3.11 1.91 2.9 0.0 0.0 8.12 3.1 0.74
Ceric.09G026800.1 (Ceric.09G026800)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.09G039400.1 (Ceric.09G039400)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.09G100400.1 (Ceric.09G100400)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 1.93 0.0 2.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.09G100500.1 (Ceric.09G100500)
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Ceric.10G058800.1 (Ceric.10G058800)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.11G053100.1 (Ceric.11G053100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.13G012300.1 (Ceric.13G012300)
2.11 0.0 0.0 6.47 0.0 0.0 0.0 0.0 2.78 0.81 0.0 4.04 6.4 2.35 2.3 0.0 0.0 6.0 0.0 1.85 17.51 0.0 3.23 0.0 0.0 2.36
Ceric.13G037900.1 (Ceric.13G037900)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.08 0.0 3.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.39 0.0
Ceric.13G046800.1 (Ceric.13G046800)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.13G074200.1 (Ceric.13G074200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0
Ceric.14G016100.1 (Ceric.14G016100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.14G016400.1 (Ceric.14G016400)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.15G023000.1 (Ceric.15G023000)
0.0 0.0 0.0 3.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.7 0.0 2.34 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.19G004800.1 (Ceric.19G004800)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z055200.1 (Ceric.1Z055200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0
Ceric.1Z159700.1 (Ceric.1Z159700)
0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z242700.1 (Ceric.1Z242700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.1Z278900.1 (Ceric.1Z278900)
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.23G046000.1 (Ceric.23G046000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Ceric.23G066100.1 (Ceric.23G066100)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
Ceric.25G022800.1 (Ceric.25G022800)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.25G028600.1 (Ceric.25G028600)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.29G018900.1 (Ceric.29G018900)
1.03 0.18 0.13 0.55 0.0 0.19 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.14 0.37 0.0
Ceric.31G068200.1 (Ceric.31G068200)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.32G053600.1 (Ceric.32G053600)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Ceric.32G057500.1 (Ceric.32G057500)
0.0 0.0 0.0 0.0 2.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.68 0.0 0.0 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.32G057600.1 (Ceric.32G057600)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.42 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.33G025200.1 (Ceric.33G025200)
0.58 0.52 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 1.26 0.36 1.72 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
Ceric.33G029700.1 (Ceric.33G029700)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.35G019300.1 (Ceric.35G019300)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.37G002600.1 (Ceric.37G002600)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.37G029200.1 (Ceric.37G029200)
0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.37G030800.1 (Ceric.37G030800)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)