Heatmap: Cluster_12 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Gametophyte	Male Gametophyte	Hermaphrodite Gametophyte	Gametophyte; Antheridiogen added at D-3	Sporophyte	Seedling, sporophyte	Seedling, 24h of 2\,4-D treatment	Seedling, 48h of 2\,4-D treatment	Whole plant	Whole plant, 2\,4-D Auxin	Callus	Differentiating Callus	Proliferating Callus	Bulbil	Leaf	Leaf (without leaf tip)	Leaf Tip	Root	Root (without root tip)	Root Tip	Differentiated root	Shoot Apex	Shoot	Shoot Tip	Vegetative Frond	Frond
Ceric.01G126600.1 (Ceric.01G126600)	0.1	0.42	0.54	0.12	0.08	0.12	0.12	0.48	0.28	0.3	0.14	0.14	0.19	0.07	0.37	0.27	0.09	0.13	0.22	0.19	0.37	0.27	0.15	0.14	0.31	1.0
Ceric.04G042900.1 (RSR4)	0.15	0.32	0.56	0.27	0.2	0.24	0.22	0.78	0.15	0.14	0.31	0.37	0.38	0.12	0.37	0.34	0.2	0.08	0.2	0.3	0.22	0.2	0.29	0.18	0.29	1.0
Ceric.04G058700.1 (COL4)	0.07	0.35	0.93	0.1	0.22	0.18	0.16	0.57	0.15	0.1	0.02	0.21	0.17	0.15	0.29	0.35	0.2	0.02	0.2	0.08	0.08	0.21	0.12	0.1	0.21	1.0
Ceric.04G067100.1 (SPS1)	0.03	0.12	0.27	0.05	0.09	0.16	0.13	0.74	0.15	0.14	0.03	0.08	0.07	0.11	0.32	0.38	0.09	0.01	0.14	0.1	0.11	0.2	0.15	0.07	0.29	1.0
Ceric.04G087900.1 (RVE2)	0.01	0.21	0.41	0.02	0.09	0.06	0.04	0.52	0.08	0.08	0.04	0.22	0.17	0.14	0.3	0.32	0.1	0.07	0.11	0.06	0.11	0.6	0.08	0.07	0.26	1.0
Ceric.04G106300.1 (SCO1)	0.08	0.21	0.73	0.21	0.28	0.32	0.32	0.86	0.32	0.31	0.06	0.1	0.09	0.06	0.2	0.48	0.28	0.01	0.08	0.13	0.08	0.19	0.4	0.12	0.2	1.0
Ceric.05G087000.1 (Ceric.05G087000)	0.01	0.2	0.67	0.02	0.16	0.39	0.42	0.2	0.58	0.84	0.15	0.3	0.25	0.09	0.19	0.58	0.14	0.02	0.0	0.08	0.09	0.09	0.74	0.33	0.13	1.0
Ceric.06G036500.1 (PSBW)	0.09	0.32	0.57	0.09	0.25	0.29	0.26	0.34	0.37	0.38	0.1	0.17	0.11	0.05	0.63	0.54	0.25	0.03	0.1	0.22	0.31	0.34	0.95	0.14	0.6	1.0
Ceric.06G061900.1 (UGT85A3)	0.05	0.34	0.82	0.11	0.38	0.19	0.21	0.13	0.83	0.79	0.23	0.21	0.22	0.04	0.29	0.45	0.39	0.04	0.12	0.16	0.16	0.67	0.34	0.34	0.31	1.0
Ceric.07G018500.1 (Ceric.07G018500)	0.0	0.52	0.93	0.02	0.0	0.14	0.08	0.46	0.1	0.1	0.0	0.09	0.05	0.03	0.24	0.17	0.01	0.0	0.08	0.01	0.13	0.01	0.11	0.01	0.0	1.0
Ceric.07G044600.1 (SFD4)	0.05	0.17	0.72	0.08	0.21	0.12	0.12	0.38	0.14	0.16	0.15	0.09	0.09	0.04	0.15	0.31	0.22	0.03	0.12	0.14	0.16	0.27	0.4	0.15	0.3	1.0
Ceric.07G046400.1 (Ceric.07G046400)	0.03	0.27	0.63	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.05	0.03	0.01	0.13	0.01	0.01	0.05	0.02	0.0	0.01	0.18	0.12	0.05	0.08	1.0
Ceric.09G075500.1 (STI)	0.09	0.56	1.0	0.36	0.08	0.53	0.39	0.91	0.32	0.29	0.25	0.46	0.42	0.09	0.21	0.65	0.08	0.06	0.23	0.23	0.21	0.28	0.28	0.22	0.17	0.76
Ceric.10G081600.1 (Ceric.10G081600)	0.02	0.04	0.73	0.02	0.02	0.07	0.07	0.04	0.35	0.25	0.2	0.21	0.49	0.0	0.11	0.01	0.02	0.04	0.06	0.06	0.08	0.03	0.36	0.02	0.0	1.0
Ceric.12G001800.1 (HEMA1)	0.15	0.5	1.0	0.26	0.33	0.23	0.27	0.48	0.91	0.88	0.19	0.19	0.22	0.07	0.28	0.13	0.34	0.08	0.11	0.3	0.23	0.56	0.24	0.29	0.35	0.87
Ceric.12G013500.1 (CH1)	0.03	0.22	0.5	0.06	0.15	0.13	0.11	0.41	0.38	0.38	0.03	0.05	0.05	0.05	0.27	0.31	0.14	0.03	0.11	0.08	0.16	0.32	0.24	0.09	0.32	1.0
Ceric.12G017100.1 (Ceric.12G017100)	0.05	0.37	1.0	0.28	0.68	0.86	0.88	0.58	0.6	0.54	0.08	0.13	0.08	0.03	0.22	0.97	0.68	0.01	0.17	0.14	0.12	0.35	0.32	0.23	0.27	0.92
Ceric.12G082200.1 (SIGB)	0.12	0.58	0.72	0.21	0.32	0.42	0.42	0.23	1.0	0.98	0.29	0.2	0.22	0.06	0.28	0.19	0.32	0.04	0.17	0.24	0.31	0.54	0.34	0.29	0.53	0.89
Ceric.12G094300.1 (RCA)	0.01	0.04	0.11	0.02	0.03	0.04	0.02	0.72	0.04	0.03	0.0	0.02	0.01	0.08	0.15	0.3	0.03	0.0	0.01	0.01	0.04	0.08	0.12	0.0	0.2	1.0
Ceric.12G094700.1 (RCA)	0.01	0.04	0.13	0.03	0.06	0.08	0.06	0.87	0.11	0.09	0.0	0.02	0.01	0.05	0.15	0.48	0.07	0.0	0.02	0.02	0.02	0.07	0.15	0.01	0.24	1.0
Ceric.12G094800.1 (RCA)	0.01	0.04	0.13	0.03	0.06	0.08	0.06	0.87	0.11	0.09	0.0	0.02	0.01	0.05	0.15	0.48	0.07	0.0	0.02	0.02	0.02	0.07	0.15	0.01	0.24	1.0
Ceric.12G095400.1 (Ceric.12G095400)	0.06	0.66	0.87	0.08	0.27	0.26	0.33	0.22	0.34	0.38	0.07	0.09	0.07	0.04	0.27	0.4	0.28	0.04	0.15	0.21	0.46	0.17	0.73	0.12	0.15	1.0
Ceric.13G016200.1 (Ceric.13G016200)	0.06	0.38	0.73	0.22	0.19	0.23	0.24	0.61	0.37	0.35	0.14	0.19	0.24	0.07	0.28	0.48	0.2	0.06	0.23	0.14	0.23	0.25	0.27	0.12	0.18	1.0
Ceric.13G043200.1 (Ceric.13G043200)	0.02	0.29	1.0	0.28	0.45	0.31	0.34	0.28	0.77	0.66	0.17	0.51	0.31	0.04	0.22	0.35	0.48	0.01	0.17	0.1	0.03	0.11	0.12	0.34	0.19	0.93
Ceric.13G087600.1 (Ceric.13G087600)	0.0	0.03	0.93	0.0	0.01	0.0	0.01	0.03	0.05	0.12	0.06	0.01	0.01	0.01	0.09	0.0	0.01	0.03	0.28	0.01	0.03	0.12	0.32	0.04	0.07	1.0
Ceric.15G001700.1 (OSA1)	0.1	0.43	0.63	0.41	0.24	0.3	0.28	0.68	0.54	0.44	0.13	0.23	0.19	0.09	0.29	0.58	0.25	0.04	0.25	0.2	0.27	0.62	0.15	0.21	0.59	1.0
Ceric.15G070000.1 (STI)	0.02	0.35	0.95	0.09	0.27	0.32	0.34	0.54	0.67	0.68	0.24	0.4	0.25	0.11	0.26	0.65	0.26	0.01	0.14	0.17	0.14	0.57	0.24	0.94	0.32	1.0
Ceric.16G032300.1 (Ceric.16G032300)	0.09	0.29	1.0	0.07	0.26	0.47	0.18	0.23	0.49	0.29	0.01	0.05	0.06	0.04	0.25	0.19	0.29	0.0	0.0	0.01	0.02	0.2	0.5	0.05	0.28	0.92
Ceric.16G056100.1 (PSBR)	0.09	0.6	1.0	0.05	0.2	0.3	0.37	0.22	0.6	0.66	0.09	0.17	0.1	0.04	0.32	0.05	0.2	0.08	0.23	0.2	0.47	0.64	0.44	0.25	0.38	0.98
Ceric.16G061900.1 (GLK2)	0.08	0.82	1.0	0.18	0.08	0.18	0.21	0.34	0.34	0.34	0.35	0.44	0.43	0.04	0.18	0.42	0.08	0.11	0.18	0.1	0.28	0.24	0.07	0.12	0.21	0.84
Ceric.17G005800.1 (STO)	0.09	0.32	0.51	0.1	0.14	0.06	0.05	0.7	0.12	0.12	0.04	0.33	0.25	0.2	0.4	0.26	0.13	0.2	0.1	0.08	0.19	0.41	0.16	0.06	0.2	1.0
Ceric.17G046100.1 (PDK)	0.01	0.38	0.75	0.0	0.05	0.02	0.02	0.68	0.03	0.04	0.12	0.23	0.26	0.19	0.37	0.48	0.06	0.02	0.11	0.02	0.05	0.34	0.03	0.07	0.19	1.0
Ceric.19G039000.1 (FC2)	0.08	0.26	0.4	0.16	0.38	0.3	0.23	0.87	0.4	0.37	0.13	0.13	0.15	0.11	0.37	0.58	0.36	0.07	0.24	0.17	0.22	0.38	0.22	0.23	0.48	1.0
Ceric.1Z144700.1 (Ceric.1Z144700)	0.02	0.28	0.59	0.03	0.37	1.0	0.75	0.99	0.59	0.57	0.08	0.08	0.06	0.04	0.17	0.9	0.37	0.01	0.06	0.09	0.07	0.27	0.32	0.17	0.34	0.95
Ceric.20G010400.1 (SSI2)	0.08	0.47	0.62	0.11	0.39	0.42	0.33	0.72	0.72	0.66	0.15	0.4	0.4	0.08	0.43	0.81	0.39	0.06	0.16	0.41	0.27	0.4	0.54	0.25	0.58	1.0
Ceric.20G045600.1 (Ceric.20G045600)	0.09	0.24	0.6	0.27	0.43	0.27	0.32	0.16	1.0	1.0	0.44	0.37	0.38	0.03	0.25	0.28	0.45	0.04	0.13	0.31	0.3	0.46	0.45	0.45	0.34	0.97
Ceric.21G037000.1 (Ceric.21G037000)	0.08	0.59	1.0	0.04	0.0	0.17	0.13	0.12	0.18	0.25	0.0	0.01	0.01	0.03	0.16	0.05	0.01	0.02	0.14	0.04	0.12	0.03	0.16	0.02	0.18	0.9
Ceric.21G049500.1 (Ceric.21G049500)	0.01	0.3	1.0	0.07	0.28	0.73	0.85	0.73	0.48	0.52	0.07	0.06	0.05	0.0	0.1	0.93	0.27	0.0	0.14	0.06	0.03	0.04	0.13	0.18	0.11	0.81
Ceric.22G046200.1 (PORB)	0.19	0.46	0.49	0.3	0.27	0.45	0.35	0.55	0.38	0.33	0.04	0.18	0.1	0.07	0.27	0.49	0.28	0.03	0.11	0.13	0.17	0.54	0.25	0.24	0.41	1.0
Ceric.22G050700.1 (Ceric.22G050700)	0.0	0.27	1.0	0.1	0.15	0.19	0.32	0.24	0.44	0.5	0.04	0.1	0.05	0.01	0.02	0.23	0.14	0.0	0.05	0.03	0.02	0.01	0.02	0.07	0.02	0.74
Ceric.23G070300.1 (Ceric.23G070300)	0.1	0.44	1.0	0.46	0.72	0.56	0.5	0.6	0.73	0.73	0.2	0.35	0.37	0.12	0.4	0.65	0.66	0.05	0.24	0.25	0.22	0.41	0.36	0.4	0.23	0.87
Ceric.24G028300.1 (HCF173)	0.04	0.18	0.45	0.11	0.2	0.2	0.19	0.91	0.34	0.35	0.09	0.14	0.14	0.09	0.23	0.63	0.2	0.05	0.12	0.1	0.1	0.16	0.34	0.12	0.33	1.0
Ceric.24G060900.1 (PSBX)	0.12	0.39	0.63	0.1	0.18	0.28	0.29	0.36	0.54	0.56	0.02	0.08	0.05	0.06	0.66	0.51	0.19	0.03	0.06	0.13	0.33	0.28	0.97	0.08	0.41	1.0
Ceric.25G059600.1 (Ceric.25G059600)	0.03	0.27	0.68	0.03	0.06	0.08	0.07	0.33	0.11	0.12	0.05	0.13	0.09	0.12	0.45	0.32	0.06	0.05	0.07	0.08	0.2	0.37	0.48	0.04	0.34	1.0
Ceric.26G030900.1 (Ceric.26G030900)	0.01	0.51	0.65	0.05	0.0	0.08	0.02	1.0	0.07	0.07	0.0	0.02	0.01	0.07	0.16	0.06	0.0	0.0	0.0	0.14	0.04	0.15	0.12	0.0	0.14	0.89
Ceric.27G034600.1 (STI)	0.02	0.24	1.0	0.12	0.14	0.17	0.24	0.2	0.36	0.39	0.09	0.1	0.12	0.06	0.2	0.46	0.14	0.03	0.11	0.04	0.07	0.47	0.36	0.14	0.18	0.78
Ceric.27G058100.1 (CSK)	0.05	0.29	0.47	0.22	0.2	0.22	0.23	0.86	0.28	0.3	0.14	0.23	0.22	0.13	0.32	0.59	0.2	0.07	0.33	0.17	0.22	0.29	0.22	0.16	0.45	1.0
Ceric.28G001900.1 (RCA)	0.06	0.22	0.53	0.1	0.12	0.09	0.09	0.97	0.2	0.18	0.03	0.05	0.03	0.07	0.19	0.49	0.12	0.01	0.05	0.03	0.07	0.14	0.19	0.05	0.3	1.0
Ceric.28G020700.1 (PMI1)	0.01	0.47	1.0	0.02	0.14	0.59	0.64	0.66	0.49	0.47	0.02	0.04	0.02	0.02	0.17	0.68	0.13	0.03	0.18	0.02	0.19	0.06	0.21	0.13	0.09	0.99
Ceric.28G050500.1 (CLA)	0.09	0.43	0.94	0.24	0.47	0.33	0.34	0.24	0.66	0.67	0.17	0.15	0.14	0.05	0.29	0.55	0.46	0.03	0.13	0.34	0.21	0.52	0.66	0.32	0.38	1.0
Ceric.28G056300.1 (Ceric.28G056300)	0.06	0.46	0.37	0.3	0.16	0.26	0.26	0.9	0.37	0.39	0.11	0.18	0.21	0.06	0.24	0.39	0.18	0.02	0.16	0.16	0.19	0.17	0.2	0.25	0.42	1.0
Ceric.28G063700.1 (Ceric.28G063700)	0.09	0.43	0.75	0.48	0.44	0.46	0.55	0.3	0.82	0.83	0.16	0.32	0.24	0.08	0.19	0.4	0.42	0.03	0.12	0.3	0.21	0.26	0.52	0.36	0.34	1.0
Ceric.29G000200.1 (CCH)	0.04	0.33	0.51	0.23	0.3	0.26	0.27	0.43	0.53	0.46	0.04	0.12	0.08	0.06	0.21	0.47	0.29	0.01	0.1	0.16	0.12	0.39	0.22	0.15	0.35	1.0
Ceric.30G014900.1 (Ceric.30G014900)	0.0	0.1	0.3	0.0	0.01	0.37	0.38	0.91	0.41	0.39	0.0	0.01	0.01	0.04	0.18	0.83	0.01	0.0	0.01	0.01	0.09	0.07	0.23	0.01	0.31	1.0
Ceric.31G010300.1 (GRP2)	0.01	0.06	0.32	0.01	0.11	0.14	0.3	0.3	0.45	0.44	0.0	0.06	0.02	0.02	0.11	0.37	0.11	0.06	0.2	0.04	0.07	0.06	0.26	0.08	0.02	1.0
Ceric.31G052600.1 (Ceric.31G052600)	0.04	0.36	1.0	0.1	0.11	0.1	0.11	0.39	0.32	0.33	0.03	0.14	0.11	0.02	0.16	0.29	0.11	0.06	0.07	0.07	0.17	0.12	0.13	0.06	0.11	0.85
Ceric.32G032300.1 (Ceric.32G032300)	0.02	0.24	0.65	0.28	0.46	0.27	0.29	0.44	0.12	0.12	0.23	0.29	0.21	0.01	0.14	0.44	0.47	0.0	0.15	0.1	0.05	0.04	0.05	0.32	0.13	1.0
Ceric.32G071300.1 (Ceric.32G071300)	0.12	0.3	0.71	0.32	0.02	0.06	0.18	0.43	0.35	0.48	0.03	0.05	0.05	0.01	0.16	0.43	0.01	0.04	0.23	0.06	0.21	0.03	0.13	0.02	0.04	1.0
Ceric.34G041100.1 (Ceric.34G041100)	0.04	0.23	0.45	0.11	0.2	0.25	0.26	0.86	0.33	0.35	0.11	0.19	0.17	0.16	0.25	0.87	0.19	0.05	0.11	0.24	0.09	0.2	0.17	0.17	0.2	1.0
Ceric.35G017200.1 (Ceric.35G017200)	0.01	0.29	0.83	0.02	0.17	0.43	0.44	0.56	0.41	0.43	0.04	0.13	0.08	0.08	0.24	0.73	0.17	0.06	0.21	0.1	0.19	0.21	0.35	0.12	0.09	1.0
Ceric.35G051800.1 (Ceric.35G051800)	0.12	0.38	1.0	0.21	0.18	0.2	0.17	0.38	0.28	0.27	0.06	0.08	0.06	0.05	0.19	0.37	0.18	0.03	0.12	0.11	0.15	0.32	0.24	0.13	0.28	0.91
Ceric.36G004000.1 (Ceric.36G004000)	0.08	0.46	0.98	0.23	0.1	0.46	0.34	0.38	0.33	0.32	0.01	0.06	0.03	0.07	0.24	0.34	0.11	0.01	0.05	0.03	0.18	0.54	0.56	0.13	0.58	1.0
Ceric.37G004500.1 (XTR4)	0.02	0.32	0.93	0.02	0.0	0.1	0.23	0.17	0.5	0.6	0.0	0.01	0.01	0.0	0.12	0.48	0.0	0.01	0.01	0.02	0.05	0.0	0.11	0.01	0.11	1.0
Ceric.37G013500.1 (Ceric.37G013500)	0.02	0.28	1.0	0.04	0.01	0.05	0.05	0.45	0.05	0.05	0.02	0.07	0.08	0.05	0.19	0.2	0.01	0.06	0.07	0.03	0.12	0.22	0.07	0.01	0.07	0.79
Ceric.37G050600.1 (ADS3)	0.02	0.09	0.52	0.04	0.2	0.11	0.11	0.22	0.32	0.32	0.1	0.1	0.08	0.03	0.16	0.22	0.2	0.02	0.03	0.08	0.04	0.16	0.27	0.12	0.18	1.0
Ceric.39G019500.1 (Ceric.39G019500)	0.02	0.88	1.0	0.1	0.0	0.05	0.03	0.01	0.06	0.11	0.07	0.08	0.08	0.1	0.09	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.0	0.21	0.05	0.09	0.94
Ceric.39G032200.1 (Ceric.39G032200)	0.01	0.1	0.27	0.02	0.02	0.07	0.05	0.49	0.12	0.11	0.1	0.12	0.2	0.07	0.3	0.43	0.02	0.03	0.14	0.05	0.04	0.07	0.09	0.03	0.29	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)