Heatmap: Cluster_124 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Gametophyte
Male Gametophyte
Hermaphrodite Gametophyte
Gametophyte; Antheridiogen added at D-3
Sporophyte
Seedling, sporophyte
Seedling, 24h of 2\,4-D treatment
Seedling, 48h of 2\,4-D treatment
Whole plant
Whole plant, 2\,4-D Auxin
Callus
Differentiating Callus
Proliferating Callus
Bulbil
Leaf
Leaf (without leaf tip)
Leaf Tip
Root
Root (without root tip)
Root Tip
Differentiated root
Shoot Apex
Shoot
Shoot Tip
Vegetative Frond
Frond
Ceric.01G088800.1 (Ceric.01G088800)
0.0 1.0 0.48 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.06 0.05 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.03 0.06 0.02
0.0 1.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
Ceric.02G029600.1 (Ceric.02G029600)
0.0 0.32 1.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.02G072500.1 (Ceric.02G072500)
0.23 1.0 0.46 0.22 0.0 0.02 0.19 0.11 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.09 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.02G087500.1 (Ceric.02G087500)
0.44 0.47 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Ceric.03G064600.1 (Ceric.03G064600)
0.03 1.0 0.52 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.01 0.09 0.04 0.08 0.02 0.01 0.01 0.33 0.0
0.01 1.0 0.48 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.04 0.04 0.04 0.08 0.09 0.0 0.05 0.03 0.02 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02
0.0 1.0 0.76 0.0 0.0 0.11 0.15 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.21 0.0 0.04 0.04 0.0 0.02 0.0 0.17 0.0 0.0
Ceric.04G065500.1 (Ceric.04G065500)
0.05 1.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0
Ceric.04G069600.1 (Ceric.04G069600)
0.07 0.85 1.0 0.14 0.24 0.18 0.32 0.24 0.5 0.53 0.47 0.18 0.35 0.02 0.18 0.22 0.22 0.09 0.27 0.57 0.27 0.19 0.08 0.2 0.24 0.1
Ceric.04G093700.1 (Ceric.04G093700)
0.14 1.0 1.0 0.2 0.15 0.06 0.09 0.07 0.3 0.31 0.68 0.28 0.57 0.01 0.06 0.04 0.13 0.07 0.17 0.46 0.47 0.09 0.09 0.13 0.09 0.15
0.16 0.75 1.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.1 0.0 0.0 0.18 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.27 0.25 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
Ceric.05G024700.1 (Ceric.05G024700)
0.1 0.92 1.0 0.34 0.05 0.0 0.05 0.12 0.14 0.23 0.0 0.08 0.11 0.0 0.07 0.02 0.02 0.0 0.0 0.09 0.25 0.0 0.14 0.02 0.0 0.03
Ceric.05G082200.1 (Ceric.05G082200)
0.04 0.91 1.0 0.04 0.04 0.04 0.07 0.04 0.24 0.21 0.73 0.32 0.67 0.02 0.04 0.02 0.05 0.03 0.12 0.66 0.28 0.06 0.04 0.13 0.06 0.03
0.01 1.0 0.76 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.04 0.22 0.16 0.35 0.01 0.05 0.01 0.02 0.07 0.05 0.16 0.2 0.06 0.04 0.06 0.02 0.02
Ceric.06G015500.1 (Ceric.06G015500)
0.01 1.0 0.76 0.14 0.14 0.09 0.09 0.07 0.04 0.03 0.26 0.43 0.46 0.01 0.04 0.02 0.11 0.02 0.02 0.16 0.06 0.01 0.01 0.11 0.0 0.01
0.04 1.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.07 0.13 0.18 0.46 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.44 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01
Ceric.08G001500.1 (Ceric.08G001500)
0.02 0.84 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.01 0.11 0.18 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03 0.01
Ceric.08G013800.1 (Ceric.08G013800)
0.0 1.0 0.88 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.08G036600.1 (Ceric.08G036600)
0.12 1.0 0.75 0.37 0.12 0.06 0.05 0.06 0.18 0.16 0.36 0.46 0.42 0.01 0.06 0.05 0.11 0.0 0.04 0.05 0.05 0.09 0.05 0.13 0.05 0.04
Ceric.08G044200.1 (Ceric.08G044200)
0.0 0.63 1.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.36 0.16 0.71 0.0 0.25 0.0 0.14 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
Ceric.08G057200.1 (Ceric.08G057200)
0.11 1.0 0.45 0.15 0.03 0.06 0.06 0.1 0.16 0.15 0.1 0.07 0.07 0.01 0.09 0.08 0.03 0.01 0.09 0.03 0.09 0.07 0.06 0.04 0.08 0.13
Ceric.10G060200.1 (Ceric.10G060200)
0.03 0.97 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.1
Ceric.10G080600.1 (Ceric.10G080600)
0.66 0.77 1.0 0.47 0.03 0.0 0.05 0.02 0.81 0.94 0.0 0.06 0.03 0.0 0.06 0.0 0.03 0.03 0.0 0.25 0.29 0.0 0.18 0.02 0.02 0.33
Ceric.10G081300.1 (Ceric.10G081300)
0.03 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.11G016300.1 (Ceric.11G016300)
0.15 0.71 1.0 0.15 0.0 0.03 0.08 0.1 0.09 0.15 0.26 0.08 0.34 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.04 0.32 0.83 0.0 0.02 0.01 0.02 0.08
Ceric.11G023300.1 (Ceric.11G023300)
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
Ceric.11G061400.1 (Ceric.11G061400)
0.04 0.78 1.0 0.03 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.76 0.29 0.65 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.42 0.33 0.16 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 1.0 0.76 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.24 0.22 0.13 0.03 0.13 0.01 0.06 0.01 0.1 0.04 0.12 0.09 0.4 0.07 0.03 0.22 0.05 0.1
Ceric.12G004800.1 (Ceric.12G004800)
0.0 0.83 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Ceric.12G053500.1 (Ceric.12G053500)
0.0 0.73 1.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.05 0.37 1.0 0.18 0.07 0.06 0.24 0.2 0.24 0.28 0.01 0.05 0.05 0.04 0.12 0.1 0.07 0.42 0.09 0.19 0.7 0.12 0.29 0.11 0.01 0.06
Ceric.12G066300.1 (Ceric.12G066300)
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.66 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.08 1.0 0.98 0.06 0.02 0.07 0.16 0.09 0.18 0.21 0.22 0.06 0.11 0.01 0.04 0.07 0.02 0.14 0.01 0.65 0.12 0.03 0.04 0.09 0.02 0.01
Ceric.13G058400.1 (Ceric.13G058400)
0.0 1.0 0.55 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.14 0.14 0.18 0.05 0.07 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.08 0.01 0.05 0.09 0.08
Ceric.13G058500.1 (Ceric.13G058500)
0.01 1.0 0.5 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.08 0.08 0.12 0.03 0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.01 0.03 0.08 0.03
Ceric.13G058700.1 (Ceric.13G058700)
0.01 1.0 0.65 0.01 0.0 0.01 0.06 0.09 0.16 0.15 0.12 0.24 0.22 0.05 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.15 0.07 0.02 0.06 0.17 0.04
Ceric.13G058800.1 (Ceric.13G058800)
0.01 1.0 0.79 0.01 0.0 0.02 0.09 0.15 0.17 0.23 0.19 0.27 0.3 0.09 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.14 0.02 0.14 0.17 0.04
Ceric.13G058900.1 (Ceric.13G058900)
0.01 1.0 0.58 0.02 0.0 0.02 0.01 0.02 0.02 0.03 0.21 0.2 0.2 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.04 0.12 0.02
Ceric.13G059000.1 (Ceric.13G059000)
0.01 1.0 0.66 0.02 0.0 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.11 0.09 0.11 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.02 0.16 0.02
Ceric.13G061000.1 (Ceric.13G061000)
0.01 1.0 0.59 0.05 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.04 0.02 0.0 0.06 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 0.05 0.01 0.0 0.02 0.05 0.01
0.02 1.0 0.48 0.12 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.03 0.06 0.06 0.07 0.0 0.04 0.04 0.01 0.01 0.01 0.08 0.03 0.01 0.0 0.02 0.08 0.0
Ceric.14G013100.1 (Ceric.14G013100)
0.1 1.0 0.64 0.18 0.1 0.03 0.05 0.01 0.1 0.16 0.19 0.13 0.18 0.06 0.16 0.01 0.12 0.06 0.04 0.17 0.24 0.09 0.06 0.1 0.13 0.09
Ceric.15G057300.1 (Ceric.15G057300)
0.07 1.0 0.46 0.06 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.05 0.05 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0
Ceric.16G034200.1 (Ceric.16G034200)
0.01 1.0 0.8 0.02 0.02 0.11 0.14 0.11 0.29 0.21 0.68 0.11 0.16 0.01 0.02 0.12 0.01 0.01 0.15 0.43 0.22 0.02 0.05 0.06 0.01 0.08
Ceric.16G046800.1 (Ceric.16G046800)
0.02 1.0 0.68 0.09 0.11 0.09 0.08 0.04 0.13 0.12 0.38 0.26 0.26 0.02 0.05 0.05 0.11 0.01 0.01 0.06 0.02 0.06 0.04 0.14 0.02 0.05
Ceric.16G058900.1 (Ceric.16G058900)
0.0 1.0 0.6 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.48 1.0 0.02 0.0 0.01 0.04 0.07 0.02 0.05 0.01 0.03 0.02 0.02 0.09 0.0 0.0 0.15 0.06 0.0 0.06 0.16 0.0 0.12 0.04 0.0
Ceric.19G050300.1 (Ceric.19G050300)
0.02 1.0 0.71 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.24 0.27 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.11 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
Ceric.1Z215500.1 (Ceric.1Z215500)
0.53 0.48 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Ceric.20G040000.1 (Ceric.20G040000)
0.38 1.0 0.72 0.57 0.03 0.4 0.26 0.11 0.58 0.31 0.02 0.13 0.11 0.07 0.21 0.11 0.03 0.09 0.16 0.38 0.31 0.09 0.23 0.05 0.05 0.18
0.0 1.0 0.34 0.0 0.0 0.05 0.08 0.02 0.0 0.02 0.07 0.04 0.04 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.43 0.08 0.0 0.03 0.0 0.03 0.06 0.0
0.0 0.8 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.07 0.2 0.14 0.47 0.38 0.0 0.07 0.0 0.12 0.16 0.0 0.62 0.76 0.15 0.07 0.3 0.32 0.04
0.0 1.0 0.36 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.14 0.2 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.04 0.0 0.01 0.03
Ceric.22G013300.1 (Ceric.22G013300)
0.08 0.72 1.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.02 0.05 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.13 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01
Ceric.22G013400.1 (Ceric.22G013400)
0.04 0.61 1.0 0.14 0.0 0.02 0.01 0.02 0.04 0.09 0.0 0.03 0.0 0.05 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.13 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01
Ceric.22G013500.1 (Ceric.22G013500)
0.01 0.59 0.84 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.14 0.1 0.0 0.02 0.02 0.0 0.04 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 1.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.06
Ceric.22G013700.1 (Ceric.22G013700)
0.05 0.83 1.0 0.14 0.0 0.02 0.0 0.02 0.39 0.09 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.49 0.0 0.06 0.05 0.05 0.04
Ceric.22G013800.1 (Ceric.22G013800)
0.09 0.81 1.0 0.03 0.0 0.13 0.04 0.02 0.65 0.27 0.0 0.05 0.03 0.0 0.06 0.02 0.0 0.02 0.02 0.03 0.97 0.0 0.13 0.01 0.01 0.12
Ceric.23G011700.1 (Ceric.23G011700)
0.13 0.04 1.0 0.15 0.03 0.03 0.05 0.06 0.09 0.14 0.0 0.02 0.02 0.01 0.09 0.0 0.03 0.03 0.05 0.04 0.08 0.01 0.05 0.04 0.12 0.01
0.0 0.77 1.0 0.0 0.04 0.15 0.05 0.06 0.02 0.01 0.8 0.07 0.21 0.03 0.05 0.1 0.04 0.01 0.0 0.31 0.01 0.05 0.0 0.04 0.11 0.0
Ceric.24G034000.1 (Ceric.24G034000)
0.09 1.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.04 0.16 0.21 0.11 0.13 0.18 0.0 0.0 0.14 0.06 0.12 0.26 0.26 0.0 0.07 0.0 0.05
Ceric.24G070500.1 (Ceric.24G070500)
0.12 1.0 0.59 0.12 0.0 0.05 0.04 0.14 0.02 0.07 0.01 0.01 0.03 0.0 0.11 0.0 0.0 0.07 0.2 0.08 0.3 0.0 0.0 0.03 0.06 0.01
Ceric.27G035200.1 (Ceric.27G035200)
0.19 0.01 1.0 0.0 0.0 0.03 0.21 0.18 0.14 0.29 0.0 0.06 0.06 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.04 0.0 0.09 0.02 0.0
Ceric.29G029000.1 (Ceric.29G029000)
0.01 1.0 0.38 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.11 0.02 0.06 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0
0.12 1.0 0.8 0.23 0.03 0.0 0.0 0.17 0.0 0.12 0.09 0.16 0.2 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.02 0.08 0.09 0.0 0.03 0.05 0.0 0.05
Ceric.31G050900.1 (Ceric.31G050900)
0.08 0.88 1.0 0.11 0.17 0.18 0.18 0.21 0.47 0.45 0.59 0.45 0.54 0.06 0.17 0.25 0.15 0.13 0.3 0.65 0.25 0.16 0.16 0.15 0.13 0.15
0.01 1.0 0.55 0.01 0.14 0.06 0.04 0.03 0.12 0.11 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.14 0.01 0.01 0.22 0.02 0.15 0.06 0.25 0.02 0.02
Ceric.32G073100.1 (Ceric.32G073100)
0.11 0.85 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.21 0.0 0.15 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.18 0.24 0.0
Ceric.33G033700.1 (Ceric.33G033700)
0.22 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.05 0.02 0.13 0.0 0.03 0.0 0.04 0.01
0.1 0.64 1.0 0.23 0.16 0.18 0.27 0.13 0.31 0.3 0.36 0.21 0.28 0.03 0.08 0.08 0.16 0.12 0.26 0.48 0.2 0.17 0.12 0.21 0.07 0.17
Ceric.37G031500.1 (Ceric.37G031500)
0.0 0.9 1.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
Ceric.39G018700.1 (Ceric.39G018700)
0.0 1.0 0.67 0.01 0.03 0.11 0.07 0.04 0.01 0.01 0.29 0.12 0.11 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.14 0.03 0.04
Ceric.39G019200.1 (Ceric.39G019200)
0.03 1.0 0.35 0.06 0.02 0.24 0.06 0.02 0.02 0.04 0.19 0.31 0.36 0.15 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.07 0.01 0.01 0.14 0.05 0.03
Ceric.39G019300.1 (Ceric.39G019300)
0.05 1.0 0.53 0.15 0.0 0.13 0.06 0.06 0.01 0.02 0.24 0.22 0.29 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.01 0.02 0.06 0.04 0.12
Ceric.39G019400.1 (Ceric.39G019400)
0.04 1.0 0.42 0.16 0.0 0.06 0.03 0.04 0.0 0.01 0.18 0.14 0.11 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.08 0.05 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)