Heatmap: Cluster_49 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.44	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000057.149	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000093.188	0.65	1.44	-0.43	1.3	0.02	0.36	1.35	-0.61	-1.69	0.64	-1.76	0.52	0.12	-1.75	-0.51	-2.86	-2.55	0.34	-1.79	-2.83	0.7	-0.05	0.79	-	-1.38	-0.7
Cpa\|evm.model.tig00000093.75	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000144.197	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000145.30	-	-	-	-	3.58	-	-	-	3.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000147.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000180.12	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000262.30	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000276.1	-	-	-	4.26	2.78	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000293.25	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000342.68	1.07	-1.45	-0.8	0.05	2.11	1.64	-1.02	-0.82	0.03	0.51	0.48	1.39	0.38	-1.2	-	-0.89	0.17	-1.62	-0.39	-	0.15	-	-0.11	-1.13	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000455.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000492.170	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000607.8	-	-	-	4.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.65	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000658.19	-	-	-	-	4.05	-	-	-	-	-	-	3.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000692.54	-	1.98	-	-	3.63	-	-	-	-	-	-	-	-	2.73	1.63	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000704.1	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000983.9	-	-	-1.79	-	4.2	-	-1.59	-	-	-1.88	-	-	-	-	-	-	-	-2.38	-0.23	-	-	-0.73	2.15	-	-0.62	-
Cpa\|evm.model.tig00001049.18	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001071.5	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001307.12	-	-	-	-	3.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.44	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001333.8	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001365.8	-3.12	-0.77	0.12	-0.31	2.1	2.0	2.04	0.75	0.15	-3.15	-2.46	-2.96	-	-3.41	-	-	-	-2.34	-1.99	-	-1.16	-3.45	-	0.55	2.35	-2.97
Cpa\|evm.model.tig00001420.10	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001497.5	-1.34	-0.15	1.47	1.93	1.86	2.51	0.21	-	-0.91	-	-0.08	-0.95	-0.64	-0.4	-	-1.15	-1.07	0.42	-	-0.42	-1.03	-	-	-0.43	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020545.2	-	-	-	-	3.68	-	-	-	-	-	3.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020598.3	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020608.10	-	-	-	-	2.45	2.8	2.76	2.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020608.13	-	1.12	-	1.49	2.66	-	1.55	1.75	-	-	-	1.63	-	-	-	-	-	-	2.41	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020611.14	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020801.106	-	-	-	-	4.09	-	2.32	-	1.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020801.26	-	-	-	-	3.64	-	-	-	-	-	3.75	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020801.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020851.21	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020878.14	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020904.19 (SMD1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020908.16	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020909.18	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020918.20	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021015.2	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021036.75	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021037.13	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021116.7	-	-	-	3.79	-0.12	-	-	-	-	2.24	-	-	-	-	-	-	2.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021137.15	-	-	-	3.08	3.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.14	2.33	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021493.72	1.79	-1.22	0.3	-3.36	2.47	-1.14	-1.07	-0.08	-1.77	-1.0	-0.71	2.14	-0.72	-2.44	-0.46	1.65	-	-1.07	-0.08	-4.7	-2.19	-	-3.45	-	-0.0	-3.29
Cpa\|evm.model.tig00021572.36	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021586.3	-	-	0.02	-	-	2.62	2.95	1.91	0.84	1.32	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-0.3	-	-	-	-	-	0.21
Cpa\|evm.model.tig00021616.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021616.7	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021745.27	-	-	-	3.99	-	-	-	-	-	-	-2.05	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021763.3	-	-	-	-	4.59	-	0.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.