1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.09 0.18 1.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.04 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.37 0.21 0.03 0.22 1.0 0.04 0.08 0.14 0.09 0.0 0.06 0.27 0.06 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.56 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.2 0.24 0.35 0.31 0.45 0.64 0.43 0.51 0.32 0.28 0.19 0.15 0.31 0.15 1.0 0.07 0.15 0.13 0.13 0.06 0.12 0.13 0.13 0.23 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.17 0.07 0.0 0.0 0.0 1.0 0.12 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.56 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.34 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 1.0 0.17 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.34 1.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.2 0.0 0.0 0.19 0.0 0.16 0.17 1.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.12 0.13 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.25 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.1 0.13 0.15 0.16 0.12 0.09 0.08 0.13 0.27 0.36 0.34 0.17 0.08 0.27 1.0 0.16 0.05 0.02 0.04 0.01 0.22 0.01 0.35 0.31 0.28
0.0 0.28 0.25 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.32 0.48 0.0 0.39 0.0 0.52 0.0 0.81 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.15 0.15 0.14 0.17 0.14 0.2 0.13 0.11 0.12 0.13 0.12 0.08 0.17 0.24 1.0 0.23 0.18 0.13 0.12 0.09 0.12 0.08 0.28 0.24 0.19
0.05 0.0 0.01 0.03 0.03 0.05 0.05 0.03 0.06 0.14 0.18 0.14 0.02 0.12 0.08 1.0 0.04 0.02 0.0 0.02 0.04 0.01 0.06 0.05 0.03 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.33 0.09 1.0 0.23 0.14 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0
0.03 0.01 0.01 0.01 0.03 0.0 0.01 0.03 0.02 0.06 0.1 0.07 0.03 0.11 0.05 1.0 0.1 0.0 0.03 0.01 0.03 0.01 0.05 0.06 0.02 0.05
0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.04 0.04 0.08 0.21 0.23 0.36 0.04 0.04 0.06 0.07 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.14 0.03 0.12 0.0 0.08 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.26 0.27 0.3 0.24 0.11 0.15 0.65 0.63 0.14 0.14 0.1 0.13 0.41 0.09 1.0 0.34 0.07 0.52 0.44 0.15 0.12 0.0 0.0 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.18 0.09 0.69 0.56 0.4 0.1 0.09 0.09 0.0 0.0 0.12 0.0 1.0 0.0 0.06 0.07 0.07 0.34 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.41 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.13 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.11 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 1.0 0.13 0.0 0.26 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0
0.34 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.34 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.32 0.37 1.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.13 0.0 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.09 0.07 0.15 0.15 0.17 0.3 0.15 0.14 0.0 0.16 0.0 0.0 0.13 1.0 0.07 0.42 0.33 0.13 0.04 0.0 0.0 0.0 0.14 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)