Heatmap: Cluster_61 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000137.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.6	-	-	2.11	-	2.53	1.91	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000137.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000142.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000144.202	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000215.78	0.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.47	1.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000219.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000403.45	-	0.4	-	-	-	-	-	-	0.94	-	-	-	-	2.16	3.2	-	1.79	-	1.74	0.44	-0.12	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000404.51 (ORF158)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000430.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000448.80 (ORF158)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000489.23	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000492.115	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.19	0.78	-	1.93	0.63	0.26	1.23	2.35	0.26	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000492.63	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000586.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.74	-	-	-	-	3.66	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000607.11	2.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.39	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000630.24	-	-	0.1	-	-	-	1.12	0.83	-0.0	-0.18	-	-0.02	-	-	1.62	1.55	-	-	-0.2	-	2.3	-0.38	0.79	-	1.67	-0.63
Cpa\|evm.model.tig00000946.5	-	-	-	2.0	-	-	-	1.26	1.03	-	1.98	-	-	-	2.79	-	-	-	-	-	2.43	-	0.38	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001220.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.16	-	-	-	3.02	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020562.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.58	-	1.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020562.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020562.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020562.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.51	-	3.87	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020563.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.86	-	-	-	-	3.24	-	2.1	-	-	-	-	-	3.11	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020675.48 (ORF158)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020676.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020770.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020824.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.26	0.54	2.21	-0.28	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020825.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.41	-	-	4.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020908.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020911.17	-	-	-	1.83	1.45	-	-	-	-	-	-	1.86	-	-	3.82	-	-	1.0	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020934.18 (ORF158)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021038.102	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021105.17	-	-	-	-	1.54	-	-	-	-	-	-	1.95	-	2.19	2.59	-	1.81	1.3	-	-	-	1.44	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021168.39	-3.38	-3.5	-	-	-0.21	-	-	-2.19	-3.09	-0.57	-0.76	0.34	0.14	-0.81	2.63	0.53	-0.54	-3.67	-0.7	-0.34	2.23	1.37	-1.59	-0.97	0.81	-0.45
Cpa\|evm.model.tig00021326.19	-	1.09	-	0.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.68	2.63	1.91	0.81	-	-	-	1.64	-	1.46	0.74	0.17	-
Cpa\|evm.model.tig00021326.51	-	3.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.15	-	-	-	-	-	2.46	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021332.31	-	-	-	-	-	-	1.58	-	-	1.01	-	-	1.52	2.74	2.87	-	-	-	1.05	1.04	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021358.4 (ORF158)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021374.28 (ORF158)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021572.15	-0.16	-0.77	-0.78	-	-	0.47	-	-0.8	-0.89	-	-	-0.92	-	2.1	2.54	-1.03	1.16	0.11	1.62	1.04	0.13	-	-	-1.11	-1.63	-
Cpa\|evm.model.tig00021687.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021742.30	-	0.91	-	-	-	1.34	-	-	-	-	-	-	-	-	3.07	-	2.88	-	-	1.0	-	1.93	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021746.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.