Heatmap: Cluster_66 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.253	2.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.65	-	-	-	-	2.51	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000070.2	-0.16	1.53	-0.07	-0.22	-	0.84	-0.09	-	1.39	-0.39	2.45	2.38	-	-	-0.55	0.64	-	-0.45	-	-0.62	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000073.64	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000076.143	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.21	-	-	-	-	-	2.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000178.104	-	2.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.44	-	-	-	2.02	-	-	-	-	-	-	-	-	2.62
Cpa\|evm.model.tig00000190.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000219.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000361.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000443.1	-	2.12	-	-	-	1.77	1.88	-	-	-	3.41	1.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000443.24	-	-	-	1.07	-	-	1.32	-	-	1.0	3.38	2.81	-	0.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000488.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000492.169 (HK1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000514.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000571.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.71	-	-	-	3.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000600.23	-	-	-	0.31	-	-	-	1.19	0.22	-	2.77	0.34	2.21	-	-	0.37	-	0.88	1.68	-	-	-	-	-	1.18	-
Cpa\|evm.model.tig00000654.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000734.9	-0.87	-1.64	-1.53	-2.77	-1.75	-1.56	-1.13	-0.4	-0.71	-1.61	-1.12	-1.06	3.66	-1.69	-1.23	-1.53	-1.55	-1.53	-0.95	-1.77	-2.29	2.01	-0.58	-2.75	-1.64	-1.53
Cpa\|evm.model.tig00001000.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.53	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001127.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020557.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.64	2.65	-	-	-	-	-	-	-	-	2.86	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020564.66	2.16	-	-	-	-	-	-	-	2.15	1.91	2.96	-	2.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020608.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020616.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020629.53	-	0.6	-	-	0.36	-	2.53	2.07	-	0.38	0.43	0.58	3.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020697.26	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020713.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020734.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.69	3.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020805.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020816.117	1.48	-	-	0.27	1.48	-	-	0.22	2.22	0.15	2.93	1.89	-	-	-0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020855.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.52	-	4.31	-	-	1.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020911.26	-	-	0.85	-	-	-	-	-	-	-	3.11	0.94	3.57	-	-	-	0.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021015.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021017.35	2.13	-	-	2.52	-	-	-	-	-	-	3.37	-	-	0.26	0.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.43
Cpa\|evm.model.tig00021017.52	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.16	-	-	-	-	-	-	3.02	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021037.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021070.127	0.0	-	-	-	-	1.43	-0.13	1.93	-	0.77	-0.17	1.54	2.26	-0.3	-	-	-	0.78	1.34	-0.22	-0.57	-	-0.51	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021070.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021073.65	-	-	1.25	-	1.21	-	-	-	-	-	-	1.13	3.42	-	0.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.36	0.44
Cpa\|evm.model.tig00021181.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021248.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021275.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021339.10	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021462.36 (ATMND1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.98	-	-	-	2.64	-	-	1.98	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021493.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021494.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021501.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021579.5	-	-	-	-	-	-	0.95	2.15	0.93	1.84	1.87	-	2.77	-	-	-	-	-	0.87	0.86	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021582.38	2.23	-	-	-	-	-	0.59	-	1.6	-	-	-	4.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021586.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021687.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.4	-	2.92	-	2.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.