1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_32 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
3.72 - - - - - 2.74 - - - - - 2.62 - - - - - - - - - - - - -
4.28 -2.71 -2.29 -2.21 - -1.16 - - -2.28 -1.79 -1.33 - -1.46 -2.29 -1.85 -2.4 -1.09 -2.31 -0.52 - - 0.18 - -1.69 -0.78 -1.8
4.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.16 - - - - -
3.74 - - - - - - - - 3.66 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.96 -1.18 0.31 - -0.53 - - -0.47 0.91 1.32 1.71 1.48 0.74 -1.02 - - -1.23 - -1.5 - -0.83 - -0.8 -1.53 - -2.01
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.92 1.0 -0.58 1.08 0.7 - 0.87 -0.7 0.4 - - 1.09 -0.19 - - - - 0.06 0.93 0.04 -0.25 - - - - -1.16
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.94 -0.74 -0.99 -0.91 0.07 2.43 0.12 - -0.86 -1.03 -0.98 - 1.04 - - -1.0 -0.75 -1.58 1.03 -1.36 - 0.45 -1.65 - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.73 1.33 2.97 - 1.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.64 - -
2.01 0.48 0.68 -0.17 -0.46 -0.32 0.2 0.05 0.19 0.38 0.47 -0.32 0.7 0.14 -0.82 0.38 0.16 -0.57 -0.69 -1.49 -2.51 - 0.11 -1.11 -3.06 -0.84
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.52 1.04 1.02 - - - 1.0 0.68 0.92 - 2.36 2.47 - - - - - - - - - - - - - -
3.09 - - - - - - - - - 2.06 2.19 2.53 - - - - - - - - - - - - 1.59
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.44 - -0.25 - -0.35 - - 1.38 -0.21 -0.34 1.34 -0.14 - 1.74 - - - -0.84 - - - -0.51 - - - 0.32
2.4 0.81 0.32 0.74 0.37 -0.08 0.85 0.7 -0.22 0.39 0.9 0.69 1.94 - -2.79 -3.72 -4.42 -4.01 -4.73 -4.98 -4.59 -2.39 - -3.76 -3.72 -2.82
2.66 0.68 0.07 0.01 0.15 0.23 0.77 0.8 -0.01 0.55 1.02 1.51 1.57 - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.99 1.39 - - 1.33 1.15 - - 2.13 1.02 2.1 - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.1 - - - - - - - - 3.14 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.52 - 1.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.11 - 3.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.19 -1.93 -4.06 -3.98 2.82 - - - - - - - - - - - - -4.6 -4.07 -4.38 - - - -3.46 - -
3.09 -0.86 -1.76 -2.1 2.08 -0.02 -3.55 -3.74 - - -3.8 -3.67 -1.91 3.09 -2.32 -0.06 -3.79 -4.3 - -1.5 -3.43 - -4.42 - -3.4 -1.94
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.01 1.83 1.7 - - - - - - - - - - - - - - - 1.63 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.